RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000488380.5

NISCH-212, Transcript of nischarin, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC

Gene NISCH, Length 3,168 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NISCH-212ENST00000488380 LRRC39Q96DD0 335 aa13.68□□□□□ -0.22
NISCH-212ENST00000488380 CDCA5Q96FF9 252 aa13.68□□□□□ -0.22
NISCH-212ENST00000488380 SNRNP25Q9BV90 132 aaKnown RBP13.68□□□□□ -0.22
NISCH-212ENST00000488380 NT5C1AQ9BXI3 368 aa13.68□□□□□ -0.22
NISCH-212ENST00000488380 ILKAPQ9H0C8 392 aaPredicted RBP13.68□□□□□ -0.22
NISCH-212ENST00000488380 ASB7Q9H672 318 aa13.68□□□□□ -0.22
NISCH-212ENST00000488380 TRPC7Q9HCX4 862 aa13.68□□□□□ -0.22
NISCH-212ENST00000488380 ADARB2Q9NS39 739 aaKnown RBP13.68□□□□□ -0.22
NISCH-212ENST00000488380 MFHAS1Q9Y4C4 1052 aa13.68□□□□□ -0.22
NISCH-212ENST00000488380 PCDHB12Q9Y5F1 795 aa13.68□□□□□ -0.22
NISCH-212ENST00000488380 AKAP10O43572 662 aa13.68□□□□□ -0.22
NISCH-212ENST00000488380 CNTFP26441 200 aa13.68□□□□□ -0.22
NISCH-212ENST00000488380 CCR10P46092 362 aa13.68□□□□□ -0.22
NISCH-212ENST00000488380 ITGA7Q13683 1181 aa13.68□□□□□ -0.22
NISCH-212ENST00000488380 FAM187BQ17R55 369 aa13.68□□□□□ -0.22
NISCH-212ENST00000488380 METTL21CQ5VZV1 264 aa13.68□□□□□ -0.22
NISCH-212ENST00000488380 TIFABQ6ZNK6 161 aa13.68□□□□□ -0.22
NISCH-212ENST00000488380 C16orf70Q9BSU1 422 aa13.68□□□□□ -0.22
NISCH-212ENST00000488380 NFKBIZQ9BYH8 718 aa13.68□□□□□ -0.22
NISCH-212ENST00000488380 VRTNQ9H8Y1 702 aa13.68□□□□□ -0.22
NISCH-212ENST00000488380 CYP3A43Q9HB55 503 aa13.68□□□□□ -0.22
NISCH-212ENST00000488380 CDHR5Q9HBB8 845 aa13.68□□□□□ -0.22
NISCH-212ENST00000488380 SNTG2Q9NY99 539 aa13.68□□□□□ -0.22
NISCH-212ENST00000488380 SAC3D1A6NKF1 404 aa13.67□□□□□ -0.22
NISCH-212ENST00000488380 PAPSS1O43252 624 aaPredicted RBP13.67□□□□□ -0.22
NISCH-212ENST00000488380 VAPBO95292 243 aa13.67□□□□□ -0.22
NISCH-212ENST00000488380 ERVK-10P10266 1014 aa13.67□□□□□ -0.22
NISCH-212ENST00000488380 ATICP31939 592 aa13.67□□□□□ -0.22
NISCH-212ENST00000488380 CTBSQ01459 385 aa13.67□□□□□ -0.22
NISCH-212ENST00000488380 GNA12Q03113 381 aa13.67□□□□□ -0.22
NISCH-212ENST00000488380 CYP2A13Q16696 494 aa13.67□□□□□ -0.22
NISCH-212ENST00000488380 FAM47CQ5HY64 1035 aa13.67□□□□□ -0.22
NISCH-212ENST00000488380 MARCH8Q5T0T0 291 aa13.67□□□□□ -0.22
NISCH-212ENST00000488380 C6orf183Q5T699 404 aa13.67□□□□□ -0.22
NISCH-212ENST00000488380 SEL1L3Q68CR1 1132 aa13.67□□□□□ -0.22
NISCH-212ENST00000488380 CARM1Q86X55 608 aa13.67□□□□□ -0.22
NISCH-212ENST00000488380 ACMSDQ8TDX5 336 aa13.67□□□□□ -0.22
NISCH-212ENST00000488380 C17orf50Q8WW18 174 aa13.67□□□□□ -0.22
NISCH-212ENST00000488380 ZNF597Q96LX8 424 aa13.67□□□□□ -0.22
NISCH-212ENST00000488380 EIF2AQ9BY44 585 aaKnown RBP13.67□□□□□ -0.22
NISCH-212ENST00000488380 GID8Q9NWU2 228 aa13.67□□□□□ -0.22
NISCH-212ENST00000488380 MAGED2Q9UNF1 606 aaPredicted RBP13.67□□□□□ -0.22
NISCH-212ENST00000488380 GPC6Q9Y625 555 aaPredicted RBP13.67□□□□□ -0.22
NISCH-212ENST00000488380 CXCL11O14625 94 aa13.67□□□□□ -0.22
NISCH-212ENST00000488380 NOL3O60936 208 aaKnown RBP13.67□□□□□ -0.22
NISCH-212ENST00000488380 GNAO1P09471 354 aa13.67□□□□□ -0.22
NISCH-212ENST00000488380 CD247P20963 164 aa13.67□□□□□ -0.22
NISCH-212ENST00000488380 TUBA4AP68366 448 aa13.67□□□□□ -0.22
NISCH-212ENST00000488380 RBP5P82980 135 aa13.67□□□□□ -0.22
NISCH-212ENST00000488380 TNFAIP2Q03169 654 aa13.67□□□□□ -0.22
NISCH-212ENST00000488380 RALGDSQ12967 914 aa13.67□□□□□ -0.22
NISCH-212ENST00000488380 ZNF484Q5JVG2 852 aa13.67□□□□□ -0.22
NISCH-212ENST00000488380 TMEM26Q6ZUK4 368 aa13.67□□□□□ -0.22
NISCH-212ENST00000488380 HERC6Q8IVU3 1022 aa13.67□□□□□ -0.22
NISCH-212ENST00000488380 C7orf31Q8N865 590 aa13.67□□□□□ -0.22
NISCH-212ENST00000488380 ITGB1BP2Q9UKP3 347 aa13.67□□□□□ -0.22
NISCH-212ENST00000488380 KCNH4Q9UQ05 1017 aa13.67□□□□□ -0.22
NISCH-212ENST00000488380 TMED5Q9Y3A6 229 aa13.67□□□□□ -0.22
NISCH-212ENST00000488380 FIS1Q9Y3D6 152 aa13.67□□□□□ -0.22
NISCH-212ENST00000488380 APOL1O14791 398 aa13.67□□□□□ -0.22
NISCH-212ENST00000488380 BMXP51813 675 aa13.67□□□□□ -0.22
NISCH-212ENST00000488380 GBE1Q04446 702 aa13.67□□□□□ -0.22
NISCH-212ENST00000488380 SPIDRQ14159 915 aa13.67□□□□□ -0.22
NISCH-212ENST00000488380 NEDD8Q15843 81 aa13.67□□□□□ -0.22
NISCH-212ENST00000488380 RGS21Q2M5E4 152 aa13.67□□□□□ -0.22
NISCH-212ENST00000488380 TRIM16LQ309B1 348 aa13.67□□□□□ -0.22
NISCH-212ENST00000488380 ZNF362Q5T0B9 420 aaPredicted RBP13.67□□□□□ -0.22
NISCH-212ENST00000488380 LAYNQ6UX15 382 aa13.67□□□□□ -0.22
NISCH-212ENST00000488380 SLC7A5P1Q8MH63 180 aa13.67□□□□□ -0.22
NISCH-212ENST00000488380 PLD6Q8N2A8 252 aaKnown RBP13.67□□□□□ -0.22
NISCH-212ENST00000488380 FAM49AQ9H0Q0 323 aaPredicted RBP13.67□□□□□ -0.22
NISCH-212ENST00000488380 POLR1BQ9H9Y6 1135 aa13.67□□□□□ -0.22
NISCH-212ENST00000488380 ZSWIM8A7E2V4 1837 aa13.66□□□□□ -0.22
NISCH-212ENST00000488380 HTRA2O43464 458 aaPredicted RBP13.66□□□□□ -0.22
NISCH-212ENST00000488380 TPST1O60507 370 aa13.66□□□□□ -0.22
NISCH-212ENST00000488380 TIPRLO75663 272 aa13.66□□□□□ -0.22
NISCH-212ENST00000488380 OXSR1O95747 527 aaPredicted RBP13.66□□□□□ -0.22
NISCH-212ENST00000488380 GLDCP23378 1020 aa13.66□□□□□ -0.22
NISCH-212ENST00000488380 MAP4P27816 1152 aaKnown RBP13.66□□□□□ -0.22
NISCH-212ENST00000488380 NME3Q13232 169 aa13.66□□□□□ -0.22
NISCH-212ENST00000488380 DPYSQ14117 519 aa13.66□□□□□ -0.22
NISCH-212ENST00000488380 STILQ15468 1287 aa13.66□□□□□ -0.22
NISCH-212ENST00000488380 ZNF618Q5T7W0 954 aa13.66□□□□□ -0.22
NISCH-212ENST00000488380 RWDD4Q6NW29 188 aaKnown RBP13.66□□□□□ -0.22
NISCH-212ENST00000488380 SIX6OS1Q8N1H7 587 aa13.66□□□□□ -0.22
NISCH-212ENST00000488380 HM13Q8TCT9 377 aa13.66□□□□□ -0.22
NISCH-212ENST00000488380 TRPC4APQ8TEL6 797 aa13.66□□□□□ -0.22
NISCH-212ENST00000488380 NDRG1Q92597 394 aaKnown RBP13.66□□□□□ -0.22
NISCH-212ENST00000488380 AGAP3Q96P47 875 aa13.66□□□□□ -0.22
NISCH-212ENST00000488380 FAM32AQ9Y421 112 aaKnown RBP13.66□□□□□ -0.22
NISCH-212ENST00000488380 MYO18AQ92614 2054 aaKnown RBP13.66□□□□□ -0.22
NISCH-212ENST00000488380 RNF103-CHMP3A0A140T963 221 aa13.66□□□□□ -0.22
NISCH-212ENST00000488380 KDM1AO60341 852 aa13.66□□□□□ -0.22
NISCH-212ENST00000488380 CLIC3O95833 236 aa13.66□□□□□ -0.22
NISCH-212ENST00000488380 ZNF182P17025 639 aaPredicted RBP13.66□□□□□ -0.22
NISCH-212ENST00000488380 GTF2A2P52657 109 aa13.66□□□□□ -0.22
NISCH-212ENST00000488380 AARS2Q5JTZ9 985 aaKnown RBP13.66□□□□□ -0.22
NISCH-212ENST00000488380 STXBP5Q5T5C0 1151 aa13.66□□□□□ -0.22
NISCH-212ENST00000488380 TBC1D15Q8TC07 691 aa13.66□□□□□ -0.22
NISCH-212ENST00000488380 APBA2Q99767 749 aa13.66□□□□□ -0.22
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 26.8 ms