RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000486388.5

UBP1-210, Transcript of upstream binding protein 1, human

TSL 3

Gene UBP1, Length 928 nt, Biotype processed transcript.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
UBP1-210	ENST00000486388	MAGEC1	O60732	1142 aa		4.91	□□□□□ -1.62
UBP1-210	ENST00000486388	CUTA	O60888	179 aa		4.91	□□□□□ -1.62
UBP1-210	ENST00000486388	SEMA7A	O75326	666 aa		4.91	□□□□□ -1.62
UBP1-210	ENST00000486388	PAGE1	O75459	146 aa		4.91	□□□□□ -1.62
UBP1-210	ENST00000486388	RFPL3	O75679	317 aa		4.91	□□□□□ -1.62
UBP1-210	ENST00000486388	BPNT1	O95861	308 aa		4.91	□□□□□ -1.62
UBP1-210	ENST00000486388	PENK	P01210	267 aa	Predicted RBP	4.91	□□□□□ -1.62
UBP1-210	ENST00000486388	PF4	P02776	101 aa		4.91	□□□□□ -1.62
UBP1-210	ENST00000486388	HMBS	P08397	361 aa		4.91	□□□□□ -1.62
UBP1-210	ENST00000486388	CISD3	P0C7P0	127 aa		4.91	□□□□□ -1.62
UBP1-210	ENST00000486388	POLR2E	P19388	210 aa	Known RBP	4.91	□□□□□ -1.62
UBP1-210	ENST00000486388	ACTN2	P35609	894 aa		4.91	□□□□□ -1.62
UBP1-210	ENST00000486388	NNMT	P40261	264 aa		4.91	□□□□□ -1.62
UBP1-210	ENST00000486388	SLC11A2	P49281	568 aa		4.91	□□□□□ -1.62
UBP1-210	ENST00000486388	ETF1	P62495	437 aa	Known RBP	4.91	□□□□□ -1.62
UBP1-210	ENST00000486388	DLG4	P78352	724 aa		4.91	□□□□□ -1.62
UBP1-210	ENST00000486388	EFEMP1	Q12805	493 aa		4.91	□□□□□ -1.62
UBP1-210	ENST00000486388	ENPP2	Q13822	863 aa		4.91	□□□□□ -1.62
UBP1-210	ENST00000486388	SLBP	Q14493	270 aa	Known RBP eCLIP	4.91	□□□□□ -1.62
UBP1-210	ENST00000486388	SMAD1	Q15797	465 aa	Known RBP	4.91	□□□□□ -1.62
UBP1-210	ENST00000486388	GEN1	Q17RS7	908 aa		4.91	□□□□□ -1.62
UBP1-210	ENST00000486388	KIF19	Q2TAC6	998 aa		4.91	□□□□□ -1.62
UBP1-210	ENST00000486388	TCERG1L	Q5VWI1	586 aa		4.91	□□□□□ -1.62
UBP1-210	ENST00000486388	RNF219	Q5W0B1	726 aa	Predicted RBP	4.91	□□□□□ -1.62
UBP1-210	ENST00000486388	ZNF776	Q68DI1	518 aa	Predicted RBP	4.91	□□□□□ -1.62
UBP1-210	ENST00000486388	CNNM4	Q6P4Q7	775 aa		4.91	□□□□□ -1.62
UBP1-210	ENST00000486388	DHRS13	Q6UX07	377 aa		4.91	□□□□□ -1.62
UBP1-210	ENST00000486388	CCDC186	Q7Z3E2	898 aa		4.91	□□□□□ -1.62
UBP1-210	ENST00000486388	IRF2BP1	Q8IU81	584 aa		4.91	□□□□□ -1.62
UBP1-210	ENST00000486388	CREG2	Q8IUH2	290 aa		4.91	□□□□□ -1.62
UBP1-210	ENST00000486388	DENND1C	Q8IV53	801 aa		4.91	□□□□□ -1.62
UBP1-210	ENST00000486388	C12orf56	Q8IXR9	622 aa		4.91	□□□□□ -1.62
UBP1-210	ENST00000486388	AHI1	Q8N157	1196 aa		4.91	□□□□□ -1.62
UBP1-210	ENST00000486388	CPXM2	Q8N436	756 aa		4.91	□□□□□ -1.62
UBP1-210	ENST00000486388	ZNF276	Q8N554	614 aa		4.91	□□□□□ -1.62
UBP1-210	ENST00000486388	OXR1	Q8N573	874 aa		4.91	□□□□□ -1.62
UBP1-210	ENST00000486388	C12orf29	Q8N999	325 aa		4.91	□□□□□ -1.62
UBP1-210	ENST00000486388	PARD3B	Q8TEW8	1205 aa		4.91	□□□□□ -1.62
UBP1-210	ENST00000486388	HPS3	Q969F9	1004 aa		4.91	□□□□□ -1.62
UBP1-210	ENST00000486388	ANAPC16	Q96DE5	110 aa		4.91	□□□□□ -1.62
UBP1-210	ENST00000486388	TMA16	Q96EY4	203 aa	Known RBP	4.91	□□□□□ -1.62
UBP1-210	ENST00000486388	FCRL3	Q96P31	734 aa	Predicted RBP	4.91	□□□□□ -1.62
UBP1-210	ENST00000486388	IPO9	Q96P70	1041 aa	Known RBP	4.91	□□□□□ -1.62
UBP1-210	ENST00000486388	OMD	Q99983	421 aa		4.91	□□□□□ -1.62
UBP1-210	ENST00000486388	C7orf25	Q9BPX7	421 aa		4.91	□□□□□ -1.62
UBP1-210	ENST00000486388	CYP3A43	Q9HB55	503 aa		4.91	□□□□□ -1.62
UBP1-210	ENST00000486388	CD248	Q9HCU0	757 aa		4.91	□□□□□ -1.62
UBP1-210	ENST00000486388	TM9SF3	Q9HD45	589 aa		4.91	□□□□□ -1.62
UBP1-210	ENST00000486388	SLC39A2	Q9NP94	309 aa		4.91	□□□□□ -1.62
UBP1-210	ENST00000486388	GDF3	Q9NR23	364 aa		4.91	□□□□□ -1.62
UBP1-210	ENST00000486388	AASDHPPT	Q9NRN7	309 aa		4.91	□□□□□ -1.62
UBP1-210	ENST00000486388	EXOC1	Q9NV70	894 aa		4.91	□□□□□ -1.62
UBP1-210	ENST00000486388	MTPAP	Q9NVV4	582 aa	Known RBP eCLIP	4.91	□□□□□ -1.62
UBP1-210	ENST00000486388	FBXO10	Q9UK96	956 aa		4.91	□□□□□ -1.62
UBP1-210	ENST00000486388	NUDT5	Q9UKK9	219 aa		4.91	□□□□□ -1.62
UBP1-210	ENST00000486388	CNOT6	Q9ULM6	557 aa	Known RBP	4.91	□□□□□ -1.62
UBP1-210	ENST00000486388	PRKAB1	Q9Y478	270 aa		4.91	□□□□□ -1.62
UBP1-210	ENST00000486388	CEP83	Q9Y592	693 aa		4.91	□□□□□ -1.62
UBP1-210	ENST00000486388	PCDHGA1	Q9Y5H4	931 aa		4.91	□□□□□ -1.62
UBP1-210	ENST00000486388	MORC2	Q9Y6X9	1032 aa	Predicted RBP	4.91	□□□□□ -1.62
UBP1-210	ENST00000486388	ACACA	Q13085	2346 aa		4.9	□□□□□ -1.62
UBP1-210	ENST00000486388	hCG_2014768	A0A024R1R8	64 aa		4.9	□□□□□ -1.63
UBP1-210	ENST00000486388	LRRIQ3	A6PVS8	624 aa	Predicted RBP	4.9	□□□□□ -1.63
UBP1-210	ENST00000486388	PLK4	O00444	970 aa		4.9	□□□□□ -1.63
UBP1-210	ENST00000486388	MDM4	O15151	490 aa		4.9	□□□□□ -1.63
UBP1-210	ENST00000486388	VILL	O15195	856 aa		4.9	□□□□□ -1.63
UBP1-210	ENST00000486388	SPTLC2	O15270	562 aa		4.9	□□□□□ -1.63
UBP1-210	ENST00000486388	POLR2D	O15514	142 aa	Known RBP	4.9	□□□□□ -1.63
UBP1-210	ENST00000486388	IRAK2	O43187	625 aa		4.9	□□□□□ -1.63
UBP1-210	ENST00000486388	KLF4	O43474	513 aa		4.9	□□□□□ -1.63
UBP1-210	ENST00000486388	STX10	O60499	249 aa		4.9	□□□□□ -1.63
UBP1-210	ENST00000486388	PPP6R2	O75170	966 aa		4.9	□□□□□ -1.63
UBP1-210	ENST00000486388	BEST1	O76090	585 aa		4.9	□□□□□ -1.63
UBP1-210	ENST00000486388	MOCS3	O95396	460 aa		4.9	□□□□□ -1.63
UBP1-210	ENST00000486388	LATS1	O95835	1130 aa		4.9	□□□□□ -1.63
UBP1-210	ENST00000486388	ZBED1	O96006	694 aa		4.9	□□□□□ -1.63
UBP1-210	ENST00000486388	ASS1	P00966	412 aa	Known RBP	4.9	□□□□□ -1.63
UBP1-210	ENST00000486388	ESR1	P03372	595 aa		4.9	□□□□□ -1.63
UBP1-210	ENST00000486388	C4BPA	P04003	597 aa	Known RBP	4.9	□□□□□ -1.63
UBP1-210	ENST00000486388	HSP90AA1	P07900	732 aa	Known RBP	4.9	□□□□□ -1.63
UBP1-210	ENST00000486388	DLD	P09622	509 aa	Known RBP	4.9	□□□□□ -1.63
UBP1-210	ENST00000486388	CD58	P19256	250 aa		4.9	□□□□□ -1.63
UBP1-210	ENST00000486388	SYT1	P21579	422 aa		4.9	□□□□□ -1.63
UBP1-210	ENST00000486388	PRKCH	P24723	683 aa		4.9	□□□□□ -1.63
UBP1-210	ENST00000486388	RPL13	P26373	211 aa	Known RBP	4.9	□□□□□ -1.63
UBP1-210	ENST00000486388	CD38	P28907	300 aa		4.9	□□□□□ -1.63
UBP1-210	ENST00000486388	ACSL1	P33121	698 aa		4.9	□□□□□ -1.63
UBP1-210	ENST00000486388	TRHR	P34981	398 aa	Predicted RBP	4.9	□□□□□ -1.63
UBP1-210	ENST00000486388	CASP4	P49662	377 aa		4.9	□□□□□ -1.63
UBP1-210	ENST00000486388	VAMP7	P51809	220 aa		4.9	□□□□□ -1.63
UBP1-210	ENST00000486388	KIF11	P52732	1056 aa		4.9	□□□□□ -1.63
UBP1-210	ENST00000486388	COPA	P53621	1224 aa		4.9	□□□□□ -1.63
UBP1-210	ENST00000486388	UCN	P55089	124 aa		4.9	□□□□□ -1.63
UBP1-210	ENST00000486388	YWHAG	P61981	247 aa	Known RBP eCLIP	4.9	□□□□□ -1.63
UBP1-210	ENST00000486388	YWHAE	P62258	255 aa	Known RBP	4.9	□□□□□ -1.63
UBP1-210	ENST00000486388	IL9R	Q01113	521 aa		4.9	□□□□□ -1.63
UBP1-210	ENST00000486388	ILK	Q13418	452 aa		4.9	□□□□□ -1.63
UBP1-210	ENST00000486388	MPP2	Q14168	576 aa		4.9	□□□□□ -1.63
UBP1-210	ENST00000486388	INPP5A	Q14642	412 aa		4.9	□□□□□ -1.63
UBP1-210	ENST00000486388	NKG7	Q16617	165 aa		4.9	□□□□□ -1.63

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