RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000485532.1

PRAME-212, Transcript of preferentially expressed antigen in melanoma, humanhuman

TSL 3

Gene PRAME, Length 709 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRAME-212ENST00000485532 FBXL19Q6PCT2 694 aa12.9□□□□□ -0.34
PRAME-212ENST00000485532 LRRC31Q6UY01 552 aa12.9□□□□□ -0.34
PRAME-212ENST00000485532 DPY19L3Q6ZPD9 716 aa12.9□□□□□ -0.34
PRAME-212ENST00000485532 BNIPLQ7Z465 357 aa12.9□□□□□ -0.34
PRAME-212ENST00000485532 SETD3Q86TU7 594 aaPredicted RBP12.9□□□□□ -0.34
PRAME-212ENST00000485532 IQCHQ86VS3 1027 aa12.9□□□□□ -0.34
PRAME-212ENST00000485532 DRC7Q8IY82 874 aa12.9□□□□□ -0.34
PRAME-212ENST00000485532 SLC25A45Q8N413 288 aa12.9□□□□□ -0.34
PRAME-212ENST00000485532 OXR1Q8N573 874 aa12.9□□□□□ -0.34
PRAME-212ENST00000485532 TMEM145Q8NBT3 493 aa12.9□□□□□ -0.34
PRAME-212ENST00000485532 OR13H1Q8NG92 308 aa12.9□□□□□ -0.34
PRAME-212ENST00000485532 KLHDC7BQ96G42 594 aa12.9□□□□□ -0.34
PRAME-212ENST00000485532 C1orf74Q96LT6 269 aa12.9□□□□□ -0.34
PRAME-212ENST00000485532 PCMTD1Q96MG8 357 aaPredicted RBP12.9□□□□□ -0.34
PRAME-212ENST00000485532 DCBLD2Q96PD2 775 aa12.9□□□□□ -0.34
PRAME-212ENST00000485532 BBC3Q96PG8 261 aaPredicted RBP12.9□□□□□ -0.34
PRAME-212ENST00000485532 METTL5Q9NRN9 209 aaKnown RBP12.9□□□□□ -0.34
PRAME-212ENST00000485532 FAM207AQ9NSI2 230 aaPredicted RBP12.9□□□□□ -0.34
PRAME-212ENST00000485532 IL36AQ9UHA7 158 aa12.9□□□□□ -0.34
PRAME-212ENST00000485532 TPX2Q9ULW0 747 aaKnown RBP12.9□□□□□ -0.34
PRAME-212ENST00000485532 FARP1Q9Y4F1 1045 aaPredicted RBP12.9□□□□□ -0.34
PRAME-212ENST00000485532 WASF2Q9Y6W5 498 aa12.9□□□□□ -0.34
PRAME-212ENST00000485532 F8VZ95 297 aa12.89□□□□□ -0.35
PRAME-212ENST00000485532 SIGLEC6O43699 453 aa12.89□□□□□ -0.35
PRAME-212ENST00000485532 ZMPSTE24O75844 475 aa12.89□□□□□ -0.35
PRAME-212ENST00000485532 PCDH8O95206 1070 aa12.89□□□□□ -0.35
PRAME-212ENST00000485532 F9P00740 461 aa12.89□□□□□ -0.35
PRAME-212ENST00000485532 GYPCP04921 128 aa12.89□□□□□ -0.35
PRAME-212ENST00000485532 THEGLP0DJG4 465 aa12.89□□□□□ -0.35
PRAME-212ENST00000485532 MYF5P13349 255 aa12.89□□□□□ -0.35
PRAME-212ENST00000485532 ACVRL1P37023 503 aa12.89□□□□□ -0.35
PRAME-212ENST00000485532 SCNN1AP37088 669 aa12.89□□□□□ -0.35
PRAME-212ENST00000485532 DNA2P51530 1060 aa12.89□□□□□ -0.35
PRAME-212ENST00000485532 SEMG2Q02383 582 aa12.89□□□□□ -0.35
PRAME-212ENST00000485532 CCDC173Q0VFZ6 552 aa12.89□□□□□ -0.35
PRAME-212ENST00000485532 FGL2Q14314 439 aa12.89□□□□□ -0.35
PRAME-212ENST00000485532 CDO1Q16878 200 aa12.89□□□□□ -0.35
PRAME-212ENST00000485532 C15orf59Q2T9L4 293 aaPredicted RBP12.89□□□□□ -0.35
PRAME-212ENST00000485532 PROX2Q3B8N5 592 aa12.89□□□□□ -0.35
PRAME-212ENST00000485532 ZNF542PQ5EBM4 170 aa12.89□□□□□ -0.35
PRAME-212ENST00000485532 FIGNQ5HY92 759 aa12.89□□□□□ -0.35
PRAME-212ENST00000485532 KDM7AQ6ZMT4 941 aa12.89□□□□□ -0.35
PRAME-212ENST00000485532 GCNT7Q6ZNI0 430 aa12.89□□□□□ -0.35
PRAME-212ENST00000485532 ERN2Q76MJ5 926 aaKnown RBP12.89□□□□□ -0.35
PRAME-212ENST00000485532 HORMAD1Q86X24 394 aa12.89□□□□□ -0.35
PRAME-212ENST00000485532 TMIEQ8NEW7 156 aa12.89□□□□□ -0.35
PRAME-212ENST00000485532 NEK11Q8NG66 645 aa12.89□□□□□ -0.35
PRAME-212ENST00000485532 SLC30A5Q8TAD4 765 aa12.89□□□□□ -0.35
PRAME-212ENST00000485532 EPS8L1Q8TE68 723 aa12.89□□□□□ -0.35
PRAME-212ENST00000485532 CALN1Q9BXU9 219 aa12.89□□□□□ -0.35
PRAME-212ENST00000485532 ATP13A1Q9HD20 1204 aa12.89□□□□□ -0.35
PRAME-212ENST00000485532 DYRK4Q9NR20 520 aa12.89□□□□□ -0.35
PRAME-212ENST00000485532 NDFIP2Q9NV92 336 aa12.89□□□□□ -0.35
PRAME-212ENST00000485532 NOCTQ9UK39 431 aaKnown RBP12.89□□□□□ -0.35
PRAME-212ENST00000485532 FCF1Q9Y324 198 aaKnown RBP12.89□□□□□ -0.35
PRAME-212ENST00000485532 UCHL5Q9Y5K5 329 aaKnown RBP eCLIP12.89□□□□□ -0.352e-53■□□□□ 8.1
PRAME-212ENST00000485532 FAM72CH0Y354 149 aa12.88□□□□□ -0.35
PRAME-212ENST00000485532 FFAR2O15552 330 aa12.88□□□□□ -0.35
PRAME-212ENST00000485532 TLX3O43711 291 aaPredicted RBP12.88□□□□□ -0.35
PRAME-212ENST00000485532 GFPT2O94808 682 aa12.88□□□□□ -0.35
PRAME-212ENST00000485532 CD160O95971 181 aa12.88□□□□□ -0.35
PRAME-212ENST00000485532 PRNPP04156 253 aa12.88□□□□□ -0.35
PRAME-212ENST00000485532 C1SP09871 688 aa12.88□□□□□ -0.35
PRAME-212ENST00000485532 GIMD1P0DJR0 217 aa12.88□□□□□ -0.35
PRAME-212ENST00000485532 CKMT2P17540 419 aa12.88□□□□□ -0.35
PRAME-212ENST00000485532 CHRNB2P17787 502 aa12.88□□□□□ -0.35
PRAME-212ENST00000485532 DGKAP23743 735 aa12.88□□□□□ -0.35
PRAME-212ENST00000485532 ITPKBP27987 946 aa12.88□□□□□ -0.35
PRAME-212ENST00000485532 GKP32189 559 aa12.88□□□□□ -0.35
PRAME-212ENST00000485532 HNF1BP35680 557 aa12.88□□□□□ -0.35
PRAME-212ENST00000485532 NUDT1P36639 197 aa12.88□□□□□ -0.35
PRAME-212ENST00000485532 SERPINH1P50454 418 aaKnown RBP12.88□□□□□ -0.35
PRAME-212ENST00000485532 ARF5P84085 180 aa12.88□□□□□ -0.35
PRAME-212ENST00000485532 OVGP1Q12889 678 aa12.88□□□□□ -0.35
PRAME-212ENST00000485532 MAPK8IP2Q13387 824 aaPredicted RBP12.88□□□□□ -0.35
PRAME-212ENST00000485532 C6orf118Q5T5N4 469 aa12.88□□□□□ -0.35
PRAME-212ENST00000485532 FAM72AQ5TYM5 149 aa12.88□□□□□ -0.35
PRAME-212ENST00000485532 FAM72DQ6L9T8 149 aa12.88□□□□□ -0.35
PRAME-212ENST00000485532 LEKR1Q6ZMV7 388 aa12.88□□□□□ -0.35
PRAME-212ENST00000485532 FAM72BQ86X60 149 aa12.88□□□□□ -0.35
PRAME-212ENST00000485532 SLC22A18ASQ8N1D0 253 aa12.88□□□□□ -0.35
PRAME-212ENST00000485532 OR6K2Q8NGY2 324 aa12.88□□□□□ -0.35
PRAME-212ENST00000485532 JOSD2Q8TAC2 188 aa12.88□□□□□ -0.35
PRAME-212ENST00000485532 CCDC114Q96M63 670 aa12.88□□□□□ -0.35
PRAME-212ENST00000485532 HAPLN3Q96S86 360 aa12.88□□□□□ -0.35
PRAME-212ENST00000485532 STK33Q9BYT3 514 aa12.88□□□□□ -0.35
PRAME-212ENST00000485532 TM6SF2Q9BZW4 377 aa12.88□□□□□ -0.35
PRAME-212ENST00000485532 ZYG11BQ9C0D3 744 aa12.88□□□□□ -0.35
PRAME-212ENST00000485532 SCUBE2Q9NQ36 999 aa12.88□□□□□ -0.35
PRAME-212ENST00000485532 IMPACTQ9P2X3 320 aa12.88□□□□□ -0.35
PRAME-212ENST00000485532 CHD5Q8TDI0 1954 aa12.88□□□□□ -0.35
PRAME-212ENST00000485532 FASNP49327 2511 aaKnown RBP12.88□□□□□ -0.35
PRAME-212ENST00000485532 SMG1Q96Q15 3661 aaKnown RBP12.87□□□□□ -0.35
PRAME-212ENST00000485532 A0A087WV48 116 aa12.87□□□□□ -0.35
PRAME-212ENST00000485532 A0A1W2PQJ5 194 aa12.87□□□□□ -0.35
PRAME-212ENST00000485532 ILVBLA1L0T0 632 aa12.87□□□□□ -0.35
PRAME-212ENST00000485532 POM121BA6NF01 834 aa12.87□□□□□ -0.35
PRAME-212ENST00000485532 RAD51BO15315 384 aa12.87□□□□□ -0.35
PRAME-212ENST00000485532 MAGEC1O60732 1142 aa12.87□□□□□ -0.35
PRAME-212ENST00000485532 LSM8O95777 96 aaKnown RBP12.87□□□□□ -0.35
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 23.2 ms