RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000485459.5

RABGGTB-210, Transcript of Rab geranylgeranyltransferase subunit beta, humanhuman

TSL 5

Gene RABGGTB, Length 788 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RABGGTB-210ENST00000485459 ZDHHC7Q9NXF8 308 aa4.54□□□□□ -1.68
RABGGTB-210ENST00000485459 TERF2IPQ9NYB0 399 aa4.54□□□□□ -1.68
RABGGTB-210ENST00000485459 RCE1Q9Y256 329 aa4.54□□□□□ -1.68
RABGGTB-210ENST00000485459 RAPGEF2Q9Y4G8 1499 aa4.54□□□□□ -1.68
RABGGTB-210ENST00000485459 PDS5BQ9NTI5 1447 aa4.54□□□□□ -1.68
RABGGTB-210ENST00000485459 LRPPRCP42704 1394 aaKnown RBP4.53□□□□□ -1.68
RABGGTB-210ENST00000485459 DHX29Q7Z478 1369 aaKnown RBP4.53□□□□□ -1.68
RABGGTB-210ENST00000485459 KIF7Q2M1P5 1343 aa4.53□□□□□ -1.68
RABGGTB-210ENST00000485459 PRSS44E7EML9 344 aa4.53□□□□□ -1.68
RABGGTB-210ENST00000485459 MS4A18H0YCH9 400 aa4.53□□□□□ -1.68
RABGGTB-210ENST00000485459 VWA5AO00534 786 aa4.53□□□□□ -1.68
RABGGTB-210ENST00000485459 KRT38O76015 456 aa4.53□□□□□ -1.68
RABGGTB-210ENST00000485459 LCATP04180 440 aa4.53□□□□□ -1.68
RABGGTB-210ENST00000485459 PRSS2P07478 247 aa4.53□□□□□ -1.68
RABGGTB-210ENST00000485459 LYL1P12980 280 aa4.53□□□□□ -1.68
RABGGTB-210ENST00000485459 UNGP13051 313 aaPredicted RBP4.53□□□□□ -1.68
RABGGTB-210ENST00000485459 U2AF2P26368 475 aaKnown RBP eCLIP4.53□□□□□ -1.683e-10■■□□□ 13.3
RABGGTB-210ENST00000485459 TNNT3P45378 269 aaPredicted RBP4.53□□□□□ -1.68
RABGGTB-210ENST00000485459 GTF2A1P52655 376 aaPredicted RBP4.53□□□□□ -1.68
RABGGTB-210ENST00000485459 TRAF1Q13077 416 aa4.53□□□□□ -1.68
RABGGTB-210ENST00000485459 TIGD6Q17RP2 521 aa4.53□□□□□ -1.68
RABGGTB-210ENST00000485459 INO80DQ53TQ3 878 aaPredicted RBP4.53□□□□□ -1.68
RABGGTB-210ENST00000485459 RUNDC3AQ59EK9 446 aa4.53□□□□□ -1.68
RABGGTB-210ENST00000485459 PRAMEF19Q5SWL8 479 aa4.53□□□□□ -1.68
RABGGTB-210ENST00000485459 TMEM268Q5VZI3 342 aa4.53□□□□□ -1.68
RABGGTB-210ENST00000485459 HEPHL1Q6MZM0 1159 aa4.53□□□□□ -1.68
RABGGTB-210ENST00000485459 SCN4BQ8IWT1 228 aa4.53□□□□□ -1.68
RABGGTB-210ENST00000485459 C2CD4CQ8TF44 421 aa4.53□□□□□ -1.68
RABGGTB-210ENST00000485459 POF1BQ8WVV4 589 aa4.53□□□□□ -1.68
RABGGTB-210ENST00000485459 EVI5LQ96CN4 794 aa4.53□□□□□ -1.68
RABGGTB-210ENST00000485459 APOLD1Q96LR9 279 aa4.53□□□□□ -1.68
RABGGTB-210ENST00000485459 MYCBPQ99417 103 aaPredicted RBP4.53□□□□□ -1.68
RABGGTB-210ENST00000485459 KLQ9UEF7 1012 aa4.53□□□□□ -1.68
RABGGTB-210ENST00000485459 PLEKHB1Q9UF11 243 aaPredicted RBP4.53□□□□□ -1.68
RABGGTB-210ENST00000485459 RPS6KL1Q9Y6S9 549 aa4.53□□□□□ -1.68
RABGGTB-210ENST00000485459 TRIP12Q14669 1992 aaPredicted RBP4.53□□□□□ -1.68
RABGGTB-210ENST00000485459 CFAP65Q6ZU64 1925 aaKnown RBP4.52□□□□□ -1.69
RABGGTB-210ENST00000485459 PRDM2Q13029 1718 aa4.52□□□□□ -1.69
RABGGTB-210ENST00000485459 MAPK8IP3Q9UPT6 1336 aa4.52□□□□□ -1.69
RABGGTB-210ENST00000485459 FANCD2Q9BXW9 1451 aa4.52□□□□□ -1.69
RABGGTB-210ENST00000485459 C11orf97A0A1B0GVM6 126 aaPredicted RBP4.52□□□□□ -1.69
RABGGTB-210ENST00000485459 I6L893 689 aaPredicted RBP4.52□□□□□ -1.69
RABGGTB-210ENST00000485459 ACOT8O14734 319 aa4.52□□□□□ -1.69
RABGGTB-210ENST00000485459 SEPT4O43236 478 aa4.52□□□□□ -1.69
RABGGTB-210ENST00000485459 STRNO43815 780 aa4.52□□□□□ -1.69
RABGGTB-210ENST00000485459 CHN1P15882 459 aa4.52□□□□□ -1.69
RABGGTB-210ENST00000485459 PRKCHP24723 683 aa4.52□□□□□ -1.69
RABGGTB-210ENST00000485459 RFC1P35251 1148 aaPredicted RBP4.52□□□□□ -1.69
RABGGTB-210ENST00000485459 SKIV2L2P42285 1042 aaKnown RBP4.52□□□□□ -1.69
RABGGTB-210ENST00000485459 PPP3CCP48454 512 aa4.52□□□□□ -1.69
RABGGTB-210ENST00000485459 CLCNKBP51801 687 aa4.52□□□□□ -1.69
RABGGTB-210ENST00000485459 RPS6KA3P51812 740 aa4.52□□□□□ -1.69
RABGGTB-210ENST00000485459 RBM5P52756 815 aaKnown RBP eCLIP4.52□□□□□ -1.69
RABGGTB-210ENST00000485459 PMS2P54278 862 aa4.52□□□□□ -1.69
RABGGTB-210ENST00000485459 DSC1Q08554 894 aa4.52□□□□□ -1.69
RABGGTB-210ENST00000485459 TRIM14Q14142 442 aa4.52□□□□□ -1.69
RABGGTB-210ENST00000485459 NFATC4Q14934 902 aa4.52□□□□□ -1.69
RABGGTB-210ENST00000485459 DUSP6Q16828 381 aa4.52□□□□□ -1.69
RABGGTB-210ENST00000485459 NADSYN1Q6IA69 706 aa4.52□□□□□ -1.69
RABGGTB-210ENST00000485459 TMEM71Q6P5X7 295 aa4.52□□□□□ -1.69
RABGGTB-210ENST00000485459 Q6ZSV7 163 aa4.52□□□□□ -1.69
RABGGTB-210ENST00000485459 SYT13Q7L8C5 426 aa4.52□□□□□ -1.69
RABGGTB-210ENST00000485459 GALNT7Q86SF2 657 aa4.52□□□□□ -1.69
RABGGTB-210ENST00000485459 HSCBQ8IWL3 235 aa4.52□□□□□ -1.69
RABGGTB-210ENST00000485459 DCP1BQ8IZD4 617 aaKnown RBP4.52□□□□□ -1.69
RABGGTB-210ENST00000485459 PTGR2Q8N8N7 351 aaPredicted RBP4.52□□□□□ -1.69
RABGGTB-210ENST00000485459 CEP76Q8TAP6 659 aa4.52□□□□□ -1.69
RABGGTB-210ENST00000485459 BICD2Q8TD16 824 aa4.52□□□□□ -1.69
RABGGTB-210ENST00000485459 SLC35F5Q8WV83 523 aa4.52□□□□□ -1.69
RABGGTB-210ENST00000485459 FAR1Q8WVX9 515 aa4.52□□□□□ -1.69
RABGGTB-210ENST00000485459 ANKRD7Q92527 254 aa4.52□□□□□ -1.69
RABGGTB-210ENST00000485459 PHF21BQ96EK2 531 aa4.52□□□□□ -1.69
RABGGTB-210ENST00000485459 MPHOSPH6Q99547 160 aaKnown RBP4.52□□□□□ -1.69
RABGGTB-210ENST00000485459 TM6SF1Q9BZW5 370 aa4.52□□□□□ -1.69
RABGGTB-210ENST00000485459 UBA5Q9GZZ9 404 aa4.52□□□□□ -1.69
RABGGTB-210ENST00000485459 ABHD16BQ9H3Z7 469 aa4.52□□□□□ -1.69
RABGGTB-210ENST00000485459 DHDHQ9UQ10 334 aa4.52□□□□□ -1.69
RABGGTB-210ENST00000485459 BRD4O60885 1362 aaPredicted RBP4.52□□□□□ -1.69
RABGGTB-210ENST00000485459 ROCK2O75116 1388 aaKnown RBP4.52□□□□□ -1.69
RABGGTB-210ENST00000485459 IBTKQ9P2D0 1353 aaPredicted RBP4.52□□□□□ -1.69
RABGGTB-210ENST00000485459 C17orf102A2RUQ5 167 aa4.51□□□□□ -1.69
RABGGTB-210ENST00000485459 EME2A4GXA9 379 aaPredicted RBP4.51□□□□□ -1.69
RABGGTB-210ENST00000485459 E7EVH7 732 aa4.51□□□□□ -1.69
RABGGTB-210ENST00000485459 H0Y3Z8 333 aa4.51□□□□□ -1.69
RABGGTB-210ENST00000485459 CYP21A2P08686 494 aa4.51□□□□□ -1.69
RABGGTB-210ENST00000485459 MYZAPP0CAP1 466 aa4.51□□□□□ -1.69
RABGGTB-210ENST00000485459 FGF3P11487 239 aaPredicted RBP4.51□□□□□ -1.69
RABGGTB-210ENST00000485459 RFX5P48382 616 aaPredicted RBP4.51□□□□□ -1.69
RABGGTB-210ENST00000485459 CDH12P55289 794 aa4.51□□□□□ -1.69
RABGGTB-210ENST00000485459 Q0VFX4 171 aa4.51□□□□□ -1.69
RABGGTB-210ENST00000485459 CHAF1AQ13111 956 aaPredicted RBP4.51□□□□□ -1.69
RABGGTB-210ENST00000485459 UBE4AQ14139 1066 aa4.51□□□□□ -1.69
RABGGTB-210ENST00000485459 KEAP1Q14145 624 aa4.51□□□□□ -1.69
RABGGTB-210ENST00000485459 DCTN1Q14203 1278 aa4.51□□□□□ -1.69
RABGGTB-210ENST00000485459 SYTL3Q4VX76 610 aa4.51□□□□□ -1.69
RABGGTB-210ENST00000485459 CTR9Q6PD62 1173 aa4.51□□□□□ -1.69
RABGGTB-210ENST00000485459 C18orf65Q6ZTR6 163 aa4.51□□□□□ -1.69
RABGGTB-210ENST00000485459 ZNF367Q7RTV3 350 aa4.51□□□□□ -1.69
RABGGTB-210ENST00000485459 WDR5BQ86VZ2 330 aa4.51□□□□□ -1.69
RABGGTB-210ENST00000485459 EGFL6Q8IUX8 553 aa4.51□□□□□ -1.69
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 45.8 ms