RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000482056.2

C9orf3-218, Transcript of chromosome 9 open reading frame 3, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene C9orf3, Length 1,951 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C9orf3-218ENST00000482056 AMHP03971 560 aa15.58■□□□□ 0.08
C9orf3-218ENST00000482056 SLC35E2BP0CK96 405 aa15.58■□□□□ 0.08
C9orf3-218ENST00000482056 CLCNKBP51801 687 aa15.58■□□□□ 0.08
C9orf3-218ENST00000482056 NAGLUP54802 743 aa15.58■□□□□ 0.08
C9orf3-218ENST00000482056 LRRC36Q1X8D7 754 aa15.58■□□□□ 0.08
C9orf3-218ENST00000482056 OLFML2BQ68BL8 750 aa15.58■□□□□ 0.08
C9orf3-218ENST00000482056 NXNQ6DKJ4 435 aa15.58■□□□□ 0.08
C9orf3-218ENST00000482056 ZFP1Q6P2D0 407 aa15.58■□□□□ 0.08
C9orf3-218ENST00000482056 OTOP3Q7RTS5 596 aa15.58■□□□□ 0.08
C9orf3-218ENST00000482056 SLC41A1Q8IVJ1 513 aa15.58■□□□□ 0.08
C9orf3-218ENST00000482056 ACVR1CQ8NER5 493 aa15.58■□□□□ 0.08
C9orf3-218ENST00000482056 GABPB2Q8TAK5 448 aaPredicted RBP15.58■□□□□ 0.08
C9orf3-218ENST00000482056 TUBGCP5Q96RT8 1024 aa15.58■□□□□ 0.08
C9orf3-218ENST00000482056 WDR55Q9H6Y2 383 aaPredicted RBP15.58■□□□□ 0.08
C9orf3-218ENST00000482056 CATSPERBQ9H7T0 1116 aa15.58■□□□□ 0.08
C9orf3-218ENST00000482056 MRM3Q9HC36 420 aaKnown RBP15.58■□□□□ 0.08
C9orf3-218ENST00000482056 CSNK1G1Q9HCP0 422 aa15.58■□□□□ 0.08
C9orf3-218ENST00000482056 FAM105AQ9NUU6 356 aa15.58■□□□□ 0.08
C9orf3-218ENST00000482056 VPS28Q9UK41 221 aa15.58■□□□□ 0.08
C9orf3-218ENST00000482056 A0A087X1B8 175 aa15.57■□□□□ 0.08
C9orf3-218ENST00000482056 SORBS2O94875 1100 aaKnown RBP15.57■□□□□ 0.08
C9orf3-218ENST00000482056 ODC1P11926 461 aa15.57■□□□□ 0.08
C9orf3-218ENST00000482056 PEX2P28328 305 aa15.57■□□□□ 0.08
C9orf3-218ENST00000482056 EPHA3P29320 983 aa15.57■□□□□ 0.08
C9orf3-218ENST00000482056 AVPR1AP37288 418 aa15.57■□□□□ 0.08
C9orf3-218ENST00000482056 GLRBP48167 497 aa15.57■□□□□ 0.08
C9orf3-218ENST00000482056 MMEL1Q495T6 779 aa15.57■□□□□ 0.08
C9orf3-218ENST00000482056 SFT2D3Q587I9 215 aa15.57■□□□□ 0.08
C9orf3-218ENST00000482056 BHLHA9Q7RTU4 235 aa15.57■□□□□ 0.08
C9orf3-218ENST00000482056 MFN1Q8IWA4 741 aa15.57■□□□□ 0.08
C9orf3-218ENST00000482056 DSELQ8IZU8 1212 aa15.57■□□□□ 0.08
C9orf3-218ENST00000482056 FSTL5Q8N475 847 aaPredicted RBP15.57■□□□□ 0.08
C9orf3-218ENST00000482056 AFAP1L2Q8N4X5 818 aa15.57■□□□□ 0.08
C9orf3-218ENST00000482056 CATSPER1Q8NEC5 780 aa15.57■□□□□ 0.08
C9orf3-218ENST00000482056 IPMKQ8NFU5 416 aa15.57■□□□□ 0.08
C9orf3-218ENST00000482056 ZSCAN18Q8TBC5 510 aaPredicted RBP15.57■□□□□ 0.08
C9orf3-218ENST00000482056 DPF3Q92784 378 aa15.57■□□□□ 0.08
C9orf3-218ENST00000482056 MYLPFQ96A32 169 aa15.57■□□□□ 0.08
C9orf3-218ENST00000482056 GAD1Q99259 594 aa15.57■□□□□ 0.08
C9orf3-218ENST00000482056 SH3GL3Q99963 347 aa15.57■□□□□ 0.08
C9orf3-218ENST00000482056 NUF2Q9BZD4 464 aa15.57■□□□□ 0.08
C9orf3-218ENST00000482056 Q9H521 79 aa15.57■□□□□ 0.08
C9orf3-218ENST00000482056 GLOD4Q9HC38 313 aa15.57■□□□□ 0.08
C9orf3-218ENST00000482056 PSMD13Q9UNM6 376 aa15.57■□□□□ 0.08
C9orf3-218ENST00000482056 FNDC1Q4ZHG4 1894 aaPredicted RBP15.57■□□□□ 0.08
C9orf3-218ENST00000482056 FAM95CA0A1B0GW59 222 aa15.56■□□□□ 0.08
C9orf3-218ENST00000482056 CCDC78A2IDD5 438 aa15.56■□□□□ 0.08
C9orf3-218ENST00000482056 GRID2O43424 1007 aa15.56■□□□□ 0.08
C9orf3-218ENST00000482056 NPHS1O60500 1241 aa15.56■□□□□ 0.08
C9orf3-218ENST00000482056 RNASEH1O60930 286 aaKnown RBP15.56■□□□□ 0.08
C9orf3-218ENST00000482056 AHSGP02765 367 aa15.56■□□□□ 0.08
C9orf3-218ENST00000482056 SLC12A2P55011 1212 aa15.56■□□□□ 0.08
C9orf3-218ENST00000482056 MRPS6P82932 125 aaKnown RBP15.56■□□□□ 0.08
C9orf3-218ENST00000482056 ROR2Q01974 943 aaKnown RBP15.56■□□□□ 0.08
C9orf3-218ENST00000482056 ART3Q13508 389 aa15.56■□□□□ 0.08
C9orf3-218ENST00000482056 GRAMD1BQ3KR37 738 aa15.56■□□□□ 0.08
C9orf3-218ENST00000482056 BRMS1LQ5PSV4 323 aa15.56■□□□□ 0.08
C9orf3-218ENST00000482056 TIGD7Q6NT04 549 aaPredicted RBP15.56■□□□□ 0.08
C9orf3-218ENST00000482056 BEND5Q7L4P6 421 aa15.56■□□□□ 0.08
C9orf3-218ENST00000482056 TMEM126BQ8IUX1 230 aa15.56■□□□□ 0.08
C9orf3-218ENST00000482056 GALNT15Q8N3T1 639 aa15.56■□□□□ 0.08
C9orf3-218ENST00000482056 CNTD1Q8N815 330 aa15.56■□□□□ 0.08
C9orf3-218ENST00000482056 DQX1Q8TE96 717 aaKnown RBP15.56■□□□□ 0.08
C9orf3-218ENST00000482056 FICDQ9BVA6 458 aa15.56■□□□□ 0.08
C9orf3-218ENST00000482056 EFCAB1Q9HAE3 211 aa15.56■□□□□ 0.08
C9orf3-218ENST00000482056 DMAP1Q9NPF5 467 aaPredicted RBP15.56■□□□□ 0.08
C9orf3-218ENST00000482056 ENTPD7Q9NQZ7 604 aa15.56■□□□□ 0.08
C9orf3-218ENST00000482056 XPR1Q9UBH6 696 aa15.56■□□□□ 0.08
C9orf3-218ENST00000482056 DTNAQ9Y4J8 743 aa15.56■□□□□ 0.08
C9orf3-218ENST00000482056 H3BNX3 289 aa15.56■□□□□ 0.08
C9orf3-218ENST00000482056 MATN3O15232 486 aa15.56■□□□□ 0.08
C9orf3-218ENST00000482056 TADA2AO75478 443 aa15.56■□□□□ 0.08
C9orf3-218ENST00000482056 VAPBO95292 243 aa15.56■□□□□ 0.08
C9orf3-218ENST00000482056 VCLP18206 1134 aa15.56■□□□□ 0.08
C9orf3-218ENST00000482056 AQP4P55087 323 aa15.56■□□□□ 0.08
C9orf3-218ENST00000482056 MAP2K5Q13163 448 aa15.56■□□□□ 0.08
C9orf3-218ENST00000482056 FLOT2Q14254 428 aa15.56■□□□□ 0.08
C9orf3-218ENST00000482056 POU6F1Q14863 301 aa15.56■□□□□ 0.08
C9orf3-218ENST00000482056 RARS2Q5T160 578 aaKnown RBP15.56■□□□□ 0.08
C9orf3-218ENST00000482056 OGFRL1Q5TC84 451 aaPredicted RBP15.56■□□□□ 0.08
C9orf3-218ENST00000482056 ARMC3Q5W041 872 aa15.56■□□□□ 0.08
C9orf3-218ENST00000482056 RNF111Q6ZNA4 994 aa15.56■□□□□ 0.08
C9orf3-218ENST00000482056 PGAM4Q8N0Y7 254 aa15.56■□□□□ 0.08
C9orf3-218ENST00000482056 PQLC1Q8N2U9 271 aa15.56■□□□□ 0.08
C9orf3-218ENST00000482056 TMEM151AQ8N4L1 468 aa15.56■□□□□ 0.08
C9orf3-218ENST00000482056 ZC3H8Q8N5P1 291 aaKnown RBP eCLIP15.56■□□□□ 0.08
C9orf3-218ENST00000482056 EFCAB3Q8N7B9 438 aa15.56■□□□□ 0.08
C9orf3-218ENST00000482056 ZFAND2BQ8WV99 257 aa15.56■□□□□ 0.08
C9orf3-218ENST00000482056 LENG1Q96BZ8 264 aaPredicted RBP15.56■□□□□ 0.08
C9orf3-218ENST00000482056 ELMO2Q96JJ3 720 aa15.56■□□□□ 0.08
C9orf3-218ENST00000482056 PPP1R36Q96LQ0 422 aa15.56■□□□□ 0.08
C9orf3-218ENST00000482056 HAPLN3Q96S86 360 aa15.56■□□□□ 0.08
C9orf3-218ENST00000482056 DDX50Q9BQ39 737 aaKnown RBP15.56■□□□□ 0.08
C9orf3-218ENST00000482056 MRPL57Q9BQC6 102 aaKnown RBP15.56■□□□□ 0.08
C9orf3-218ENST00000482056 FSD1LQ9BXM9 530 aa15.56■□□□□ 0.08
C9orf3-218ENST00000482056 PRKD2Q9BZL6 878 aa15.56■□□□□ 0.08
C9orf3-218ENST00000482056 TRIM4Q9C037 500 aa15.56■□□□□ 0.08
C9orf3-218ENST00000482056 SIK2Q9H0K1 926 aa15.56■□□□□ 0.08
C9orf3-218ENST00000482056 MRPL46Q9H2W6 279 aaKnown RBP15.56■□□□□ 0.08
C9orf3-218ENST00000482056 CHST12Q9NRB3 414 aa15.56■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 88.1 ms