RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000479554.5

ATG4B-218, Transcript of autophagy related 4B cysteine peptidase, humanhuman

TSL 4

Gene ATG4B, Length 556 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATG4B-218ENST00000479554 UBASH3AP57075 661 aa14.62□□□□□ -0.07
ATG4B-218ENST00000479554 ARF5P84085 180 aa14.62□□□□□ -0.07
ATG4B-218ENST00000479554 SPATS2Q86XZ4 545 aaKnown RBP14.62□□□□□ -0.07
ATG4B-218ENST00000479554 PHF13Q86YI8 300 aaPredicted RBP14.62□□□□□ -0.07
ATG4B-218ENST00000479554 SPC24Q8NBT2 197 aa14.62□□□□□ -0.07
ATG4B-218ENST00000479554 C3orf20Q8ND61 904 aa14.62□□□□□ -0.07
ATG4B-218ENST00000479554 TBC1D31Q96DN5 1066 aa14.62□□□□□ -0.07
ATG4B-218ENST00000479554 CNDP2Q96KP4 475 aaKnown RBP14.62□□□□□ -0.07
ATG4B-218ENST00000479554 ERGIC2Q96RQ1 377 aa14.62□□□□□ -0.07
ATG4B-218ENST00000479554 MYOCQ99972 504 aa14.62□□□□□ -0.07
ATG4B-218ENST00000479554 HDAC8Q9BY41 377 aa14.62□□□□□ -0.07
ATG4B-218ENST00000479554 XPO4Q9C0E2 1151 aaKnown RBP14.62□□□□□ -0.07
ATG4B-218ENST00000479554 OSBPL2Q9H1P3 480 aa14.62□□□□□ -0.07
ATG4B-218ENST00000479554 CCDC86Q9H6F5 360 aaKnown RBP14.62□□□□□ -0.07
ATG4B-218ENST00000479554 FCF1Q9Y324 198 aaKnown RBP14.62□□□□□ -0.07
ATG4B-218ENST00000479554 WASF2Q9Y6W5 498 aa14.62□□□□□ -0.07
ATG4B-218ENST00000479554 NBEAQ8NFP9 2946 aa14.62□□□□□ -0.07
ATG4B-218ENST00000479554 ITPR1Q14643 2758 aa14.62□□□□□ -0.07
ATG4B-218ENST00000479554 LAMA5O15230 3695 aa14.61□□□□□ -0.07
ATG4B-218ENST00000479554 RNF103O00237 685 aa14.61□□□□□ -0.07
ATG4B-218ENST00000479554 SLC31A1O15431 190 aa14.61□□□□□ -0.07
ATG4B-218ENST00000479554 ZNF821O75541 412 aaPredicted RBP14.61□□□□□ -0.07
ATG4B-218ENST00000479554 LRIG2O94898 1065 aa14.61□□□□□ -0.07
ATG4B-218ENST00000479554 PRLRP16471 622 aa14.61□□□□□ -0.07
ATG4B-218ENST00000479554 RHOQP17081 205 aa14.61□□□□□ -0.07
ATG4B-218ENST00000479554 GPD1P21695 349 aa14.61□□□□□ -0.07
ATG4B-218ENST00000479554 AKT2P31751 481 aa14.61□□□□□ -0.07
ATG4B-218ENST00000479554 RFC1P35251 1148 aaPredicted RBP14.61□□□□□ -0.07
ATG4B-218ENST00000479554 ACVRL1P37023 503 aa14.61□□□□□ -0.07
ATG4B-218ENST00000479554 RXRGP48443 463 aa14.61□□□□□ -0.07
ATG4B-218ENST00000479554 CCNHP51946 323 aaPredicted RBP14.61□□□□□ -0.07
ATG4B-218ENST00000479554 NEK3P51956 506 aa14.61□□□□□ -0.07
ATG4B-218ENST00000479554 HDAC4P56524 1084 aa14.61□□□□□ -0.07
ATG4B-218ENST00000479554 GEMIN4P57678 1058 aaKnown RBP14.61□□□□□ -0.07
ATG4B-218ENST00000479554 CARD16Q5EG05 197 aa14.61□□□□□ -0.07
ATG4B-218ENST00000479554 DNAJC24Q6P3W2 148 aa14.61□□□□□ -0.07
ATG4B-218ENST00000479554 DHRS13Q6UX07 377 aa14.61□□□□□ -0.07
ATG4B-218ENST00000479554 NLRP14Q86W24 1093 aa14.61□□□□□ -0.07
ATG4B-218ENST00000479554 HORMAD1Q86X24 394 aa14.61□□□□□ -0.07
ATG4B-218ENST00000479554 PROSER1Q86XN7 944 aa14.61□□□□□ -0.07
ATG4B-218ENST00000479554 EID2Q8N6I1 236 aa14.61□□□□□ -0.07
ATG4B-218ENST00000479554 CCDC185Q8N715 623 aa14.61□□□□□ -0.07
ATG4B-218ENST00000479554 CENPIQ92674 756 aaPredicted RBP14.61□□□□□ -0.07
ATG4B-218ENST00000479554 KLK6Q92876 244 aa14.61□□□□□ -0.07
ATG4B-218ENST00000479554 KLHDC7BQ96G42 594 aa14.61□□□□□ -0.07
ATG4B-218ENST00000479554 HEPHQ9BQS7 1158 aa14.61□□□□□ -0.07
ATG4B-218ENST00000479554 TM6SF2Q9BZW4 377 aa14.61□□□□□ -0.07
ATG4B-218ENST00000479554 RETREG1Q9H6L5 497 aa14.61□□□□□ -0.07
ATG4B-218ENST00000479554 NDFIP2Q9NV92 336 aa14.61□□□□□ -0.07
ATG4B-218ENST00000479554 TMEM248Q9NWD8 314 aa14.61□□□□□ -0.07
ATG4B-218ENST00000479554 DNAI1Q9UI46 699 aa14.61□□□□□ -0.07
ATG4B-218ENST00000479554 HPCAL4Q9UM19 191 aa14.61□□□□□ -0.07
ATG4B-218ENST00000479554 CA5BQ9Y2D0 317 aa14.61□□□□□ -0.07
ATG4B-218ENST00000479554 PKD1L2Q7Z442 2459 aa14.61□□□□□ -0.07
ATG4B-218ENST00000479554 PLXNB3Q9ULL4 1909 aa14.6□□□□□ -0.07
ATG4B-218ENST00000479554 ANKRD11Q6UB99 2663 aaPredicted RBP14.6□□□□□ -0.07
ATG4B-218ENST00000479554 CXorf51AA0A1B0GTR3 108 aa14.6□□□□□ -0.07
ATG4B-218ENST00000479554 ANKRD62A6NC57 917 aa14.6□□□□□ -0.07
ATG4B-218ENST00000479554 FAM72CH0Y354 149 aa14.6□□□□□ -0.07
ATG4B-218ENST00000479554 RAMP2O60895 175 aa14.6□□□□□ -0.07
ATG4B-218ENST00000479554 PCDH8O95206 1070 aa14.6□□□□□ -0.07
ATG4B-218ENST00000479554 CAPNS1P04632 268 aa14.6□□□□□ -0.07
ATG4B-218ENST00000479554 PLEKP08567 350 aaPredicted RBP14.6□□□□□ -0.07
ATG4B-218ENST00000479554 THEGLP0DJG4 465 aa14.6□□□□□ -0.07
ATG4B-218ENST00000479554 HNRNPA2B1P22626 353 aaKnown RBP14.6□□□□□ -0.07
ATG4B-218ENST00000479554 ITGB7P26010 798 aa14.6□□□□□ -0.07
ATG4B-218ENST00000479554 C1QBPQ07021 282 aaKnown RBP14.6□□□□□ -0.07
ATG4B-218ENST00000479554 BNIP3Q12983 259 aa14.6□□□□□ -0.07
ATG4B-218ENST00000479554 SMAD1Q15797 465 aaKnown RBP14.6□□□□□ -0.07
ATG4B-218ENST00000479554 ZNF284Q2VY69 593 aa14.6□□□□□ -0.07
ATG4B-218ENST00000479554 FAM72AQ5TYM5 149 aa14.6□□□□□ -0.07
ATG4B-218ENST00000479554 SFMBT2Q5VUG0 894 aa14.6□□□□□ -0.07
ATG4B-218ENST00000479554 FAM72DQ6L9T8 149 aa14.6□□□□□ -0.07
ATG4B-218ENST00000479554 WDR59Q6PJI9 974 aa14.6□□□□□ -0.07
ATG4B-218ENST00000479554 MON1BQ7L1V2 547 aa14.6□□□□□ -0.07
ATG4B-218ENST00000479554 APTXQ7Z2E3 356 aaKnown RBP14.6□□□□□ -0.07
ATG4B-218ENST00000479554 FAM72BQ86X60 149 aa14.6□□□□□ -0.07
ATG4B-218ENST00000479554 TMEM145Q8NBT3 493 aa14.6□□□□□ -0.07
ATG4B-218ENST00000479554 ARHGEF2Q92974 986 aaKnown RBP14.6□□□□□ -0.07
ATG4B-218ENST00000479554 NTAN1Q96AB6 310 aa14.6□□□□□ -0.07
ATG4B-218ENST00000479554 AGPAT1Q99943 283 aa14.6□□□□□ -0.07
ATG4B-218ENST00000479554 MAGEH1Q9H213 219 aa14.6□□□□□ -0.07
ATG4B-218ENST00000479554 ZDHHC6Q9H6R6 413 aa14.6□□□□□ -0.07
ATG4B-218ENST00000479554 FZD3Q9NPG1 666 aa14.6□□□□□ -0.07
ATG4B-218ENST00000479554 IMPACTQ9P2X3 320 aa14.6□□□□□ -0.07
ATG4B-218ENST00000479554 NEU3Q9UQ49 428 aa14.6□□□□□ -0.07
ATG4B-218ENST00000479554 PCDHGA1Q9Y5H4 931 aa14.6□□□□□ -0.07
ATG4B-218ENST00000479554 ACTL7AQ9Y615 435 aa14.6□□□□□ -0.07
ATG4B-218ENST00000479554 FAM149AA5PLN7 773 aa14.59□□□□□ -0.07
ATG4B-218ENST00000479554 LRRC10BA6NIK2 292 aa14.59□□□□□ -0.07
ATG4B-218ENST00000479554 SIGLEC16A6NMB1 481 aa14.59□□□□□ -0.07
ATG4B-218ENST00000479554 TAF4O00268 1085 aa14.59□□□□□ -0.07
ATG4B-218ENST00000479554 CCP110O43303 1012 aa14.59□□□□□ -0.07
ATG4B-218ENST00000479554 RFPL3O75679 317 aa14.59□□□□□ -0.07
ATG4B-218ENST00000479554 CD160O95971 181 aa14.59□□□□□ -0.07
ATG4B-218ENST00000479554 ADRB3P13945 408 aa14.59□□□□□ -0.07
ATG4B-218ENST00000479554 L1CAMP32004 1257 aa14.59□□□□□ -0.07
ATG4B-218ENST00000479554 DNAJC3Q13217 504 aa14.59□□□□□ -0.07
ATG4B-218ENST00000479554 POLD3Q15054 466 aaPredicted RBP14.59□□□□□ -0.07
ATG4B-218ENST00000479554 FILIP1LQ4L180 1135 aa14.59□□□□□ -0.07
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 34.8 ms