RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000479480.5

CTPS1-208, Transcript of CTP synthase 1, humanhuman

TSL 5

Gene CTPS1, Length 777 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTPS1-208ENST00000479480 ARID1BQ8NFD5 2236 aaPredicted RBP8.64□□□□□ -1.03
CTPS1-208ENST00000479480 MYLKQ15746 1914 aa8.63□□□□□ -1.03
CTPS1-208ENST00000479480 A0A0D9SEW6 157 aa8.63□□□□□ -1.03
CTPS1-208ENST00000479480 BECN2A8MW95 431 aa8.63□□□□□ -1.03
CTPS1-208ENST00000479480 B8ZZF3 427 aa8.63□□□□□ -1.03
CTPS1-208ENST00000479480 ALOX15BO15296 676 aa8.63□□□□□ -1.03
CTPS1-208ENST00000479480 P4HA2O15460 535 aa8.63□□□□□ -1.03
CTPS1-208ENST00000479480 SIAH2O43255 324 aa8.63□□□□□ -1.03
CTPS1-208ENST00000479480 SPINT1O43278 529 aa8.63□□□□□ -1.03
CTPS1-208ENST00000479480 EFSO43281 561 aa8.63□□□□□ -1.03
CTPS1-208ENST00000479480 THAP12O43422 761 aa8.63□□□□□ -1.03
CTPS1-208ENST00000479480 PCDH8O95206 1070 aa8.63□□□□□ -1.03
CTPS1-208ENST00000479480 ADCY5O95622 1261 aa8.63□□□□□ -1.03
CTPS1-208ENST00000479480 HNRNPA2B1P22626 353 aaKnown RBP8.63□□□□□ -1.03
CTPS1-208ENST00000479480 AKT2P31751 481 aa8.63□□□□□ -1.03
CTPS1-208ENST00000479480 CCR1P32246 355 aa8.63□□□□□ -1.03
CTPS1-208ENST00000479480 OXCT1P55809 520 aa8.63□□□□□ -1.03
CTPS1-208ENST00000479480 TMPRSS3P57727 454 aa8.63□□□□□ -1.03
CTPS1-208ENST00000479480 ERVPABLB-1P60509 514 aa8.63□□□□□ -1.03
CTPS1-208ENST00000479480 RHDQ02161 417 aa8.63□□□□□ -1.03
CTPS1-208ENST00000479480 NME3Q13232 169 aa8.63□□□□□ -1.03
CTPS1-208ENST00000479480 PDCLQ13371 301 aa8.63□□□□□ -1.03
CTPS1-208ENST00000479480 DRAP1Q14919 205 aaPredicted RBP8.63□□□□□ -1.03
CTPS1-208ENST00000479480 ISXQ2M1V0 245 aa8.63□□□□□ -1.03
CTPS1-208ENST00000479480 RABGAP1LQ5R372 815 aa8.63□□□□□ -1.03
CTPS1-208ENST00000479480 OTUD1Q5VV17 481 aaPredicted RBP8.63□□□□□ -1.03
CTPS1-208ENST00000479480 BROXQ5VW32 411 aa8.63□□□□□ -1.03
CTPS1-208ENST00000479480 KIAA1614Q5VZ46 1190 aa8.63□□□□□ -1.03
CTPS1-208ENST00000479480 TTI2Q6NXR4 508 aa8.63□□□□□ -1.03
CTPS1-208ENST00000479480 NEK5Q6P3R8 708 aa8.63□□□□□ -1.03
CTPS1-208ENST00000479480 GUSBP11Q6P575 273 aa8.63□□□□□ -1.03
CTPS1-208ENST00000479480 CRTC1Q6UUV9 634 aa8.63□□□□□ -1.03
CTPS1-208ENST00000479480 ERN2Q76MJ5 926 aaKnown RBP8.63□□□□□ -1.03
CTPS1-208ENST00000479480 TRIM59Q8IWR1 403 aa8.63□□□□□ -1.03
CTPS1-208ENST00000479480 LSMEM2Q8N112 164 aa8.63□□□□□ -1.03
CTPS1-208ENST00000479480 FAM181AQ8N9Y4 354 aa8.63□□□□□ -1.03
CTPS1-208ENST00000479480 ATP11CQ8NB49 1132 aa8.63□□□□□ -1.03
CTPS1-208ENST00000479480 TMIEQ8NEW7 156 aa8.63□□□□□ -1.03
CTPS1-208ENST00000479480 IFI44Q8TCB0 444 aa8.63□□□□□ -1.03
CTPS1-208ENST00000479480 KCNE4Q8WWG9 221 aa8.63□□□□□ -1.03
CTPS1-208ENST00000479480 SMARCE1Q969G3 411 aa8.63□□□□□ -1.03
CTPS1-208ENST00000479480 WBP1Q96G27 269 aa8.63□□□□□ -1.03
CTPS1-208ENST00000479480 ATXN7L3BQ96GX2 97 aa8.63□□□□□ -1.03
CTPS1-208ENST00000479480 DHTKD1Q96HY7 919 aaPredicted RBP8.63□□□□□ -1.03
CTPS1-208ENST00000479480 CEP63Q96MT8 703 aa8.63□□□□□ -1.03
CTPS1-208ENST00000479480 SLC46A1Q96NT5 459 aa8.63□□□□□ -1.03
CTPS1-208ENST00000479480 SCAND2PQ9GZW5 306 aaPredicted RBP8.63□□□□□ -1.03
CTPS1-208ENST00000479480 ABCG4Q9H172 646 aa8.63□□□□□ -1.03
CTPS1-208ENST00000479480 DNAJC28Q9NX36 388 aa8.63□□□□□ -1.03
CTPS1-208ENST00000479480 NLGN3Q9NZ94 848 aa8.63□□□□□ -1.03
CTPS1-208ENST00000479480 VPS51Q9UID3 782 aa8.63□□□□□ -1.03
CTPS1-208ENST00000479480 MAN1B1Q9UKM7 699 aa8.63□□□□□ -1.03
CTPS1-208ENST00000479480 SATB2Q9UPW6 733 aa8.63□□□□□ -1.03
CTPS1-208ENST00000479480 HS3ST2Q9Y278 367 aa8.63□□□□□ -1.03
CTPS1-208ENST00000479480 ACTL7AQ9Y615 435 aa8.63□□□□□ -1.03
CTPS1-208ENST00000479480 HS3ST3A1Q9Y663 406 aa8.63□□□□□ -1.03
CTPS1-208ENST00000479480 MGAQ8IWI9 3026 aa8.63□□□□□ -1.03
CTPS1-208ENST00000479480 KALRNO60229 2985 aa8.63□□□□□ -1.03
CTPS1-208ENST00000479480 CPED1A4D0V7 1026 aa8.62□□□□□ -1.03
CTPS1-208ENST00000479480 DRGXA6NNA5 263 aa8.62□□□□□ -1.03
CTPS1-208ENST00000479480 M0QYT0 321 aa8.62□□□□□ -1.03
CTPS1-208ENST00000479480 CLDN11O75508 207 aa8.62□□□□□ -1.03
CTPS1-208ENST00000479480 LEFTY1O75610 366 aa8.62□□□□□ -1.03
CTPS1-208ENST00000479480 SMC2O95347 1197 aa8.62□□□□□ -1.03
CTPS1-208ENST00000479480 CSF2P04141 144 aa8.62□□□□□ -1.03
CTPS1-208ENST00000479480 ERBB2P04626 1255 aa8.62□□□□□ -1.03
CTPS1-208ENST00000479480 GP1BAP07359 652 aa8.62□□□□□ -1.03
CTPS1-208ENST00000479480 SLC2A3P11169 496 aa8.62□□□□□ -1.03
CTPS1-208ENST00000479480 SLC9A1P19634 815 aa8.62□□□□□ -1.03
CTPS1-208ENST00000479480 VARSP26640 1264 aaKnown RBP8.62□□□□□ -1.03
CTPS1-208ENST00000479480 CDH4P55283 916 aa8.62□□□□□ -1.03
CTPS1-208ENST00000479480 STX17P56962 302 aa8.62□□□□□ -1.03
CTPS1-208ENST00000479480 EIF2B5Q13144 721 aaKnown RBP8.62□□□□□ -1.03
CTPS1-208ENST00000479480 C1orf61Q13536 156 aa8.62□□□□□ -1.03
CTPS1-208ENST00000479480 AGERQ15109 404 aa8.62□□□□□ -1.03
CTPS1-208ENST00000479480 CDKN3Q16667 212 aa8.62□□□□□ -1.03
CTPS1-208ENST00000479480 HS1BP3Q53T59 392 aa8.62□□□□□ -1.03
CTPS1-208ENST00000479480 C3orf38Q5JPI3 329 aa8.62□□□□□ -1.03
CTPS1-208ENST00000479480 PERM1Q5SV97 790 aa8.62□□□□□ -1.03
CTPS1-208ENST00000479480 TTC39BQ5VTQ0 682 aaPredicted RBP8.62□□□□□ -1.03
CTPS1-208ENST00000479480 KLHL10Q6JEL2 608 aa8.62□□□□□ -1.03
CTPS1-208ENST00000479480 DPY19L3Q6ZPD9 716 aa8.62□□□□□ -1.03
CTPS1-208ENST00000479480 FAM183BPQ6ZVS7 135 aa8.62□□□□□ -1.03
CTPS1-208ENST00000479480 EFL1Q7Z2Z2 1120 aaKnown RBP8.62□□□□□ -1.03
CTPS1-208ENST00000479480 PASD1Q8IV76 773 aa8.62□□□□□ -1.03
CTPS1-208ENST00000479480 OR7D4Q8NG98 312 aa8.62□□□□□ -1.03
CTPS1-208ENST00000479480 GRIN3AQ8TCU5 1115 aa8.62□□□□□ -1.03
CTPS1-208ENST00000479480 MAPK15Q8TD08 544 aa8.62□□□□□ -1.03
CTPS1-208ENST00000479480 SNRNP27Q8WVK2 155 aaKnown RBP8.62□□□□□ -1.03
CTPS1-208ENST00000479480 ZNF592Q92610 1267 aa8.62□□□□□ -1.03
CTPS1-208ENST00000479480 VOPP1Q96AW1 172 aa8.62□□□□□ -1.03
CTPS1-208ENST00000479480 PPP1R13BQ96KQ4 1090 aa8.62□□□□□ -1.03
CTPS1-208ENST00000479480 PPP1R9BQ96SB3 815 aa8.62□□□□□ -1.03
CTPS1-208ENST00000479480 KLF6Q99612 283 aaPredicted RBP8.62□□□□□ -1.03
CTPS1-208ENST00000479480 HDAC8Q9BY41 377 aa8.62□□□□□ -1.03
CTPS1-208ENST00000479480 SLC17A9Q9BYT1 436 aa8.62□□□□□ -1.03
CTPS1-208ENST00000479480 DPH1Q9BZG8 443 aa8.62□□□□□ -1.03
CTPS1-208ENST00000479480 MUC3BQ9H195 1237 aa8.62□□□□□ -1.03
CTPS1-208ENST00000479480 TCEAL2Q9H3H9 227 aaPredicted RBP8.62□□□□□ -1.03
CTPS1-208ENST00000479480 GPR27Q9NS67 375 aa8.62□□□□□ -1.03
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