RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000475558.5

SHQ1-207, Transcript of SHQ1, H/ACA ribonucleoprotein assembly factor, humanhuman

TSL 5

Gene SHQ1, Length 666 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SHQ1-207ENST00000475558 USP29Q9HBJ7 922 aa7.17□□□□□ -1.26
SHQ1-207ENST00000475558 TRPC7Q9HCX4 862 aa7.17□□□□□ -1.26
SHQ1-207ENST00000475558 ZNF334Q9HCZ1 680 aaPredicted RBP7.17□□□□□ -1.26
SHQ1-207ENST00000475558 KLHL11Q9NVR0 708 aa7.17□□□□□ -1.26
SHQ1-207ENST00000475558 GPATCH2LQ9NWQ4 482 aa7.17□□□□□ -1.26
SHQ1-207ENST00000475558 CALCOCO1Q9P1Z2 691 aa7.17□□□□□ -1.26
SHQ1-207ENST00000475558 KIAA1522Q9P206 1035 aaPredicted RBP7.17□□□□□ -1.26
SHQ1-207ENST00000475558 NUDT5Q9UKK9 219 aa7.17□□□□□ -1.26
SHQ1-207ENST00000475558 ANGPTL2Q9UKU9 493 aa7.17□□□□□ -1.26
SHQ1-207ENST00000475558 AGO1Q9UL18 857 aaKnown RBP7.17□□□□□ -1.26
SHQ1-207ENST00000475558 SHOC2Q9UQ13 582 aa7.17□□□□□ -1.26
SHQ1-207ENST00000475558 TBC1D30Q9Y2I9 924 aa7.17□□□□□ -1.26
SHQ1-207ENST00000475558 SDK1Q7Z5N4 2213 aa7.17□□□□□ -1.26
SHQ1-207ENST00000475558 USP24Q9UPU5 2620 aa7.16□□□□□ -1.26
SHQ1-207ENST00000475558 FAM208BQ5VWN6 2430 aa7.16□□□□□ -1.26
SHQ1-207ENST00000475558 CFAP47Q6ZTR5 3102 aa7.16□□□□□ -1.26
SHQ1-207ENST00000475558 C2orf78A6NCI8 922 aa7.16□□□□□ -1.26
SHQ1-207ENST00000475558 E7EVH7 732 aa7.16□□□□□ -1.26
SHQ1-207ENST00000475558 FAM72CH0Y354 149 aa7.16□□□□□ -1.26
SHQ1-207ENST00000475558 DNALI1O14645 258 aaPredicted RBP7.16□□□□□ -1.26
SHQ1-207ENST00000475558 MSI1O43347 362 aaKnown RBP7.16□□□□□ -1.26
SHQ1-207ENST00000475558 PPFIA2O75334 1257 aa7.16□□□□□ -1.26
SHQ1-207ENST00000475558 ANXA9O76027 345 aa7.16□□□□□ -1.26
SHQ1-207ENST00000475558 LUC7L3O95232 432 aaKnown RBP7.16□□□□□ -1.26
SHQ1-207ENST00000475558 ADH1BP00325 375 aa7.16□□□□□ -1.26
SHQ1-207ENST00000475558 HMBSP08397 361 aa7.16□□□□□ -1.26
SHQ1-207ENST00000475558 GSTA2P09210 222 aa7.16□□□□□ -1.26
SHQ1-207ENST00000475558 CHRNB1P11230 501 aa7.16□□□□□ -1.26
SHQ1-207ENST00000475558 MLNP12872 115 aa7.16□□□□□ -1.26
SHQ1-207ENST00000475558 CEBPBP17676 345 aa7.16□□□□□ -1.26
SHQ1-207ENST00000475558 PSMC3P17980 439 aa7.16□□□□□ -1.26
SHQ1-207ENST00000475558 FCARP24071 287 aa7.16□□□□□ -1.26
SHQ1-207ENST00000475558 GDI1P31150 447 aa7.16□□□□□ -1.26
SHQ1-207ENST00000475558 MAGEA6P43360 314 aa7.16□□□□□ -1.26
SHQ1-207ENST00000475558 PGFP49763 221 aa7.16□□□□□ -1.26
SHQ1-207ENST00000475558 CDR1P51861 262 aa7.16□□□□□ -1.26
SHQ1-207ENST00000475558 PLTPP55058 493 aa7.16□□□□□ -1.26
SHQ1-207ENST00000475558 EIF3BP55884 814 aaKnown RBP7.16□□□□□ -1.26
SHQ1-207ENST00000475558 SULT2A1Q06520 285 aa7.16□□□□□ -1.26
SHQ1-207ENST00000475558 IL10RBQ08334 325 aa7.16□□□□□ -1.26
SHQ1-207ENST00000475558 ADCY2Q08462 1091 aa7.16□□□□□ -1.26
SHQ1-207ENST00000475558 NSUN2Q08J23 767 aaKnown RBP eCLIP7.16□□□□□ -1.26
SHQ1-207ENST00000475558 AP1B1Q10567 949 aa7.16□□□□□ -1.26
SHQ1-207ENST00000475558 ILF2Q12905 390 aaKnown RBP7.16□□□□□ -1.26
SHQ1-207ENST00000475558 GPS1Q13098 491 aa7.16□□□□□ -1.26
SHQ1-207ENST00000475558 LRRC32Q14392 662 aa7.16□□□□□ -1.26
SHQ1-207ENST00000475558 GRM2Q14416 872 aa7.16□□□□□ -1.26
SHQ1-207ENST00000475558 PRKD1Q15139 912 aaPredicted RBP7.16□□□□□ -1.26
SHQ1-207ENST00000475558 SLC14A2Q15849 920 aa7.16□□□□□ -1.26
SHQ1-207ENST00000475558 SLC5A9Q2M3M2 681 aa7.16□□□□□ -1.26
SHQ1-207ENST00000475558 INO80DQ53TQ3 878 aaPredicted RBP7.16□□□□□ -1.26
SHQ1-207ENST00000475558 FAM78AQ5JUQ0 283 aa7.16□□□□□ -1.26
SHQ1-207ENST00000475558 PRSS36Q5K4E3 855 aa7.16□□□□□ -1.26
SHQ1-207ENST00000475558 FAM72AQ5TYM5 149 aa7.16□□□□□ -1.26
SHQ1-207ENST00000475558 PIK3R6Q5UE93 754 aa7.16□□□□□ -1.26
SHQ1-207ENST00000475558 AFMIDQ63HM1 303 aa7.16□□□□□ -1.26
SHQ1-207ENST00000475558 RAP1GAP2Q684P5 730 aa7.16□□□□□ -1.26
SHQ1-207ENST00000475558 FAM72DQ6L9T8 149 aa7.16□□□□□ -1.26
SHQ1-207ENST00000475558 RETSATQ6NUM9 610 aa7.16□□□□□ -1.26
SHQ1-207ENST00000475558 TTC27Q6P3X3 843 aa7.16□□□□□ -1.26
SHQ1-207ENST00000475558 CENPUQ71F23 418 aa7.16□□□□□ -1.26
SHQ1-207ENST00000475558 TRMT10CQ7L0Y3 403 aaKnown RBP7.16□□□□□ -1.26
SHQ1-207ENST00000475558 PID1Q7Z2X4 250 aa7.16□□□□□ -1.26
SHQ1-207ENST00000475558 ANKS1BQ7Z6G8 1248 aa7.16□□□□□ -1.26
SHQ1-207ENST00000475558 NLRP14Q86W24 1093 aa7.16□□□□□ -1.26
SHQ1-207ENST00000475558 FAM72BQ86X60 149 aa7.16□□□□□ -1.26
SHQ1-207ENST00000475558 ZNF683Q8IZ20 524 aa7.16□□□□□ -1.26
SHQ1-207ENST00000475558 LGI2Q8N0V4 545 aa7.16□□□□□ -1.26
SHQ1-207ENST00000475558 MREGQ8N565 214 aa7.16□□□□□ -1.26
SHQ1-207ENST00000475558 ATPAF2Q8N5M1 289 aa7.16□□□□□ -1.26
SHQ1-207ENST00000475558 FAM71DQ8N9W8 422 aa7.16□□□□□ -1.26
SHQ1-207ENST00000475558 FIBINQ8TAL6 211 aa7.16□□□□□ -1.26
SHQ1-207ENST00000475558 USP13Q92995 863 aaPredicted RBP7.16□□□□□ -1.26
SHQ1-207ENST00000475558 P2RY11Q96G91 374 aa7.16□□□□□ -1.26
SHQ1-207ENST00000475558 MSANTD3Q96H12 275 aa7.16□□□□□ -1.26
SHQ1-207ENST00000475558 ASB16Q96NS5 453 aa7.16□□□□□ -1.26
SHQ1-207ENST00000475558 SRPK1Q96SB4 655 aaKnown RBP7.16□□□□□ -1.26
SHQ1-207ENST00000475558 CYP2S1Q96SQ9 504 aa7.16□□□□□ -1.26
SHQ1-207ENST00000475558 TMEM121Q9BTD3 319 aa7.16□□□□□ -1.26
SHQ1-207ENST00000475558 NAT9Q9BTE0 207 aa7.16□□□□□ -1.26
SHQ1-207ENST00000475558 TRPV4Q9HBA0 871 aa7.16□□□□□ -1.26
SHQ1-207ENST00000475558 VPS45Q9NRW7 570 aa7.16□□□□□ -1.26
SHQ1-207ENST00000475558 GKN1Q9NS71 199 aa7.16□□□□□ -1.26
SHQ1-207ENST00000475558 SMARCAL1Q9NZC9 954 aa7.16□□□□□ -1.26
SHQ1-207ENST00000475558 IPO11Q9UI26 975 aaKnown RBP7.16□□□□□ -1.26
SHQ1-207ENST00000475558 VANGL2Q9ULK5 521 aa7.16□□□□□ -1.26
SHQ1-207ENST00000475558 R3HDM2Q9Y2K5 976 aaKnown RBP7.16□□□□□ -1.26
SHQ1-207ENST00000475558 SNX24Q9Y343 169 aa7.16□□□□□ -1.26
SHQ1-207ENST00000475558 CPQQ9Y646 472 aa7.16□□□□□ -1.26
SHQ1-207ENST00000475558 PIAS3Q9Y6X2 628 aa7.16□□□□□ -1.26
SHQ1-207ENST00000475558 TRIP11Q15643 1979 aa7.16□□□□□ -1.26
SHQ1-207ENST00000475558 CHURC1-FNTBB4DL54 471 aa7.15□□□□□ -1.26
SHQ1-207ENST00000475558 RASA4BC9J798 803 aa7.15□□□□□ -1.26
SHQ1-207ENST00000475558 H0Y626 953 aa7.15□□□□□ -1.26
SHQ1-207ENST00000475558 LEFTY2O00292 366 aa7.15□□□□□ -1.26
SHQ1-207ENST00000475558 ALOX15BO15296 676 aa7.15□□□□□ -1.26
SHQ1-207ENST00000475558 RASA4O43374 803 aa7.15□□□□□ -1.26
SHQ1-207ENST00000475558 KDELR3O43731 214 aa7.15□□□□□ -1.26
SHQ1-207ENST00000475558 OPA1O60313 960 aa7.15□□□□□ -1.26
SHQ1-207ENST00000475558 GDF9O60383 454 aa7.15□□□□□ -1.26
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 17 ms