RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000468253.1

NPHP4-206, Transcript of nephrocystin 4, humanhuman

TSL 2

Gene NPHP4, Length 781 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NPHP4-206ENST00000468253 CTSLP07711 333 aa20.36■□□□□ 0.85
NPHP4-206ENST00000468253 ACSL1P33121 698 aa20.36■□□□□ 0.85
NPHP4-206ENST00000468253 PTGER3P43115 390 aa20.36■□□□□ 0.85
NPHP4-206ENST00000468253 PSMD8P48556 350 aa20.36■□□□□ 0.85
NPHP4-206ENST00000468253 CSNK1DP48730 415 aa20.36■□□□□ 0.85
NPHP4-206ENST00000468253 DNA2P51530 1060 aa20.36■□□□□ 0.85
NPHP4-206ENST00000468253 RAD51Q06609 339 aa20.36■□□□□ 0.85
NPHP4-206ENST00000468253 NSUN2Q08J23 767 aaKnown RBP eCLIP20.36■□□□□ 0.85
NPHP4-206ENST00000468253 KIF5AQ12840 1032 aa20.36■□□□□ 0.85
NPHP4-206ENST00000468253 IFI16Q16666 785 aaKnown RBP20.36■□□□□ 0.85
NPHP4-206ENST00000468253 ARSIQ5FYB1 569 aa20.36■□□□□ 0.85
NPHP4-206ENST00000468253 WDR45BQ5MNZ6 344 aa20.36■□□□□ 0.85
NPHP4-206ENST00000468253 ZFYVE27Q5T4F4 411 aa20.36■□□□□ 0.85
NPHP4-206ENST00000468253 PEAR1Q5VY43 1037 aaPredicted RBP20.36■□□□□ 0.85
NPHP4-206ENST00000468253 LYSMD4Q5XG99 296 aa20.36■□□□□ 0.85
NPHP4-206ENST00000468253 KIAA1328Q86T90 577 aa20.36■□□□□ 0.85
NPHP4-206ENST00000468253 SLC41A1Q8IVJ1 513 aa20.36■□□□□ 0.85
NPHP4-206ENST00000468253 AADATQ8N5Z0 425 aa20.36■□□□□ 0.85
NPHP4-206ENST00000468253 CHST14Q8NCH0 376 aa20.36■□□□□ 0.85
NPHP4-206ENST00000468253 ACRBPQ8NEB7 543 aa20.36■□□□□ 0.85
NPHP4-206ENST00000468253 UBE2Q2Q8WVN8 375 aa20.36■□□□□ 0.85
NPHP4-206ENST00000468253 HINFPQ9BQA5 517 aa20.36■□□□□ 0.85
NPHP4-206ENST00000468253 HDAC8Q9BY41 377 aa20.36■□□□□ 0.85
NPHP4-206ENST00000468253 PILRBQ9UKJ0 227 aa20.36■□□□□ 0.85
NPHP4-206ENST00000468253 WASF2Q9Y6W5 498 aa20.36■□□□□ 0.85
NPHP4-206ENST00000468253 CHD5Q8TDI0 1954 aa20.35■□□□□ 0.85
NPHP4-206ENST00000468253 A0A1W2PP55 124 aa20.35■□□□□ 0.85
NPHP4-206ENST00000468253 LRRC72A6NJI9 287 aa20.35■□□□□ 0.85
NPHP4-206ENST00000468253 C3orf70A6NLC5 250 aaPredicted RBP20.35■□□□□ 0.85
NPHP4-206ENST00000468253 DFFAO00273 331 aa20.35■□□□□ 0.85
NPHP4-206ENST00000468253 RNASEH2AO75792 299 aaKnown RBP20.35■□□□□ 0.85
NPHP4-206ENST00000468253 SEMA4FO95754 770 aa20.35■□□□□ 0.85
NPHP4-206ENST00000468253 DRD3P35462 400 aa20.35■□□□□ 0.85
NPHP4-206ENST00000468253 CCNHP51946 323 aaPredicted RBP20.35■□□□□ 0.85
NPHP4-206ENST00000468253 CREB5Q02930 508 aa20.35■□□□□ 0.85
NPHP4-206ENST00000468253 CYP2U1Q7Z449 544 aa20.35■□□□□ 0.85
NPHP4-206ENST00000468253 RABEPKQ7Z6M1 372 aa20.35■□□□□ 0.85
NPHP4-206ENST00000468253 FAM124AQ86V42 546 aa20.35■□□□□ 0.85
NPHP4-206ENST00000468253 CACUL1Q86Y37 369 aa20.35■□□□□ 0.85
NPHP4-206ENST00000468253 LRRC8AQ8IWT6 810 aa20.35■□□□□ 0.85
NPHP4-206ENST00000468253 PQLC3Q8N755 202 aa20.35■□□□□ 0.85
NPHP4-206ENST00000468253 CEP76Q8TAP6 659 aa20.35■□□□□ 0.85
NPHP4-206ENST00000468253 MAK16Q9BXY0 300 aaKnown RBP20.35■□□□□ 0.85
NPHP4-206ENST00000468253 CPEB1Q9BZB8 566 aaKnown RBP20.35■□□□□ 0.85
NPHP4-206ENST00000468253 SEMA4GQ9NTN9 838 aa20.35■□□□□ 0.85
NPHP4-206ENST00000468253 SBDSQ9Y3A5 250 aaKnown RBP eCLIP20.35■□□□□ 0.85
NPHP4-206ENST00000468253 SPAG17Q6Q759 2223 aa20.34■□□□□ 0.85
NPHP4-206ENST00000468253 MAFKO60675 156 aa20.34■□□□□ 0.85
NPHP4-206ENST00000468253 LEFTY1O75610 366 aa20.34■□□□□ 0.85
NPHP4-206ENST00000468253 PALMO75781 387 aa20.34■□□□□ 0.85
NPHP4-206ENST00000468253 ZFXP17010 805 aaPredicted RBP20.34■□□□□ 0.85
NPHP4-206ENST00000468253 GJC1P36383 396 aa20.34■□□□□ 0.85
NPHP4-206ENST00000468253 MPLP40238 635 aa20.34■□□□□ 0.85
NPHP4-206ENST00000468253 SPEM2Q0P670 501 aa20.34■□□□□ 0.85
NPHP4-206ENST00000468253 GRM3Q14832 879 aa20.34■□□□□ 0.85
NPHP4-206ENST00000468253 TAZQ16635 292 aa20.34■□□□□ 0.85
NPHP4-206ENST00000468253 ODF2Q5BJF6 829 aa20.34■□□□□ 0.85
NPHP4-206ENST00000468253 RAB11FIP1Q6WKZ4 1283 aaPredicted RBP20.34■□□□□ 0.85
NPHP4-206ENST00000468253 LEKR1Q6ZMV7 388 aa20.34■□□□□ 0.85
NPHP4-206ENST00000468253 DAAM2Q86T65 1068 aa20.34■□□□□ 0.85
NPHP4-206ENST00000468253 RCOR2Q8IZ40 523 aa20.34■□□□□ 0.85
NPHP4-206ENST00000468253 RNF10Q8N5U6 811 aaKnown RBP20.34■□□□□ 0.85
NPHP4-206ENST00000468253 OR2T34Q8NGX1 318 aa20.34■□□□□ 0.85
NPHP4-206ENST00000468253 KIAA1524Q8TCG1 905 aa20.34■□□□□ 0.85
NPHP4-206ENST00000468253 HCAR2Q8TDS4 363 aa20.34■□□□□ 0.85
NPHP4-206ENST00000468253 FATE1Q969F0 183 aa20.34■□□□□ 0.85
NPHP4-206ENST00000468253 PPP1R16AQ96I34 528 aa20.34■□□□□ 0.85
NPHP4-206ENST00000468253 GDAP1L1Q96MZ0 367 aa20.34■□□□□ 0.85
NPHP4-206ENST00000468253 TSGA13Q96PP4 275 aa20.34■□□□□ 0.85
NPHP4-206ENST00000468253 OSBPL1AQ9BXW6 950 aa20.34■□□□□ 0.85
NPHP4-206ENST00000468253 SP110Q9HB58 689 aa20.34■□□□□ 0.85
NPHP4-206ENST00000468253 SERGEFQ9UGK8 458 aa20.34■□□□□ 0.85
NPHP4-206ENST00000468253 ADGRG1Q9Y653 693 aa20.34■□□□□ 0.85
NPHP4-206ENST00000468253 LRRD1A4D1F6 860 aa20.33■□□□□ 0.85
NPHP4-206ENST00000468253 ZRANB2O95218 330 aaKnown RBP eCLIP20.33■□□□□ 0.85
NPHP4-206ENST00000468253 IGSF6O95976 241 aa20.33■□□□□ 0.85
NPHP4-206ENST00000468253 MX2P20592 715 aa20.33■□□□□ 0.85
NPHP4-206ENST00000468253 ITPKAP23677 461 aa20.33■□□□□ 0.85
NPHP4-206ENST00000468253 RENBPP51606 427 aa20.33■□□□□ 0.85
NPHP4-206ENST00000468253 CCR5P51681 352 aa20.33■□□□□ 0.85
NPHP4-206ENST00000468253 NAP1L1P55209 391 aaKnown RBP20.33■□□□□ 0.85
NPHP4-206ENST00000468253 RHOAP61586 193 aa20.33■□□□□ 0.85
NPHP4-206ENST00000468253 GALNT2Q10471 571 aa20.33■□□□□ 0.85
NPHP4-206ENST00000468253 CNTN1Q12860 1018 aa20.33■□□□□ 0.85
NPHP4-206ENST00000468253 NCBP2-AS2Q69YL0 99 aa20.33■□□□□ 0.85
NPHP4-206ENST00000468253 NEK5Q6P3R8 708 aa20.33■□□□□ 0.85
NPHP4-206ENST00000468253 TP53INP2Q8IXH6 220 aa20.33■□□□□ 0.85
NPHP4-206ENST00000468253 KATNAL2Q8IYT4 538 aa20.33■□□□□ 0.85
NPHP4-206ENST00000468253 DEFB119Q8N690 84 aa20.33■□□□□ 0.85
NPHP4-206ENST00000468253 PIGKQ92643 395 aa20.33■□□□□ 0.85
NPHP4-206ENST00000468253 HSPA12BQ96MM6 686 aa20.33■□□□□ 0.85
NPHP4-206ENST00000468253 PSKH2Q96QS6 385 aa20.33■□□□□ 0.85
NPHP4-206ENST00000468253 TM6SF2Q9BZW4 377 aa20.33■□□□□ 0.85
NPHP4-206ENST00000468253 PARD6AQ9NPB6 346 aa20.33■□□□□ 0.85
NPHP4-206ENST00000468253 DYRK4Q9NR20 520 aa20.33■□□□□ 0.85
NPHP4-206ENST00000468253 LHX3Q9UBR4 397 aa20.33■□□□□ 0.85
NPHP4-206ENST00000468253 SEPT3Q9UH03 358 aa20.33■□□□□ 0.85
NPHP4-206ENST00000468253 EVLQ9UI08 416 aaPredicted RBP20.33■□□□□ 0.85
NPHP4-206ENST00000468253 HYOU1Q9Y4L1 999 aa20.33■□□□□ 0.85
NPHP4-206ENST00000468253 PCDHA3Q9Y5H8 950 aa20.33■□□□□ 0.85
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 44.9 ms