RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000460170.2

PTPRU-205, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type U, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene PTPRU, Length 5,337 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRU-205ENST00000460170 PSEN1P49768 467 aa14.94□□□□□ -0.02
PTPRU-205ENST00000460170 PSME3P61289 254 aa14.94□□□□□ -0.02
PTPRU-205ENST00000460170 BCL2L1Q07817 233 aa14.94□□□□□ -0.02
PTPRU-205ENST00000460170 SQLEQ14534 574 aa14.94□□□□□ -0.02
PTPRU-205ENST00000460170 INSCQ1MX18 579 aa14.94□□□□□ -0.02
PTPRU-205ENST00000460170 TEX44Q53QW1 395 aa14.94□□□□□ -0.02
PTPRU-205ENST00000460170 ZNF516Q92618 1163 aa14.94□□□□□ -0.02
PTPRU-205ENST00000460170 FCRL2Q96LA5 508 aaPredicted RBP14.94□□□□□ -0.02
PTPRU-205ENST00000460170 C12orf42Q96LP6 360 aa14.94□□□□□ -0.02
PTPRU-205ENST00000460170 C9orf16Q9BUW7 83 aa14.94□□□□□ -0.02
PTPRU-205ENST00000460170 GIMAP4Q9NUV9 329 aa14.94□□□□□ -0.02
PTPRU-205ENST00000460170 ARFGEF2Q9Y6D5 1785 aa14.93□□□□□ -0.02
PTPRU-205ENST00000460170 MFSD11O43934 449 aa14.93□□□□□ -0.02
PTPRU-205ENST00000460170 HOXD13P35453 343 aa14.93□□□□□ -0.02
PTPRU-205ENST00000460170 CERCAMQ5T4B2 595 aa14.93□□□□□ -0.02
PTPRU-205ENST00000460170 QKIQ96PU8 341 aaKnown RBP eCLIP14.93□□□□□ -0.02
PTPRU-205ENST00000460170 KCTD15Q96SI1 283 aaPredicted RBP14.93□□□□□ -0.02
PTPRU-205ENST00000460170 YME1L1Q96TA2 773 aa14.93□□□□□ -0.02
PTPRU-205ENST00000460170 CIPCQ9C0C6 399 aa14.93□□□□□ -0.02
PTPRU-205ENST00000460170 SEMA6AQ9H2E6 1030 aa14.93□□□□□ -0.02
PTPRU-205ENST00000460170 PLA2G4CQ9UP65 541 aa14.93□□□□□ -0.02
PTPRU-205ENST00000460170 TNPO3Q9Y5L0 923 aaKnown RBP14.93□□□□□ -0.02
PTPRU-205ENST00000460170 GSC2O15499 205 aa14.93□□□□□ -0.02
PTPRU-205ENST00000460170 FGFR1P11362 822 aa14.93□□□□□ -0.02
PTPRU-205ENST00000460170 ATP6V1C1P21283 382 aa14.93□□□□□ -0.02
PTPRU-205ENST00000460170 USP4Q13107 963 aa14.93□□□□□ -0.02
PTPRU-205ENST00000460170 CAMK2GQ13555 558 aaPredicted RBP14.93□□□□□ -0.02
PTPRU-205ENST00000460170 STXBP5Q5T5C0 1151 aa14.93□□□□□ -0.02
PTPRU-205ENST00000460170 FBXL18Q96ME1 805 aa14.93□□□□□ -0.02
PTPRU-205ENST00000460170 RRAGCQ9HB90 399 aa14.93□□□□□ -0.02
PTPRU-205ENST00000460170 ZNF180Q9UJW8 692 aa14.93□□□□□ -0.02
PTPRU-205ENST00000460170 DYRK1BQ9Y463 629 aa14.93□□□□□ -0.02
PTPRU-205ENST00000460170 ARIH2O95376 493 aa14.93□□□□□ -0.02
PTPRU-205ENST00000460170 FAXDC2Q96IV6 333 aa14.93□□□□□ -0.02
PTPRU-205ENST00000460170 TMEM106CQ9BVX2 250 aa14.93□□□□□ -0.02
PTPRU-205ENST00000460170 CDH19Q9H159 772 aa14.93□□□□□ -0.02
PTPRU-205ENST00000460170 C12orf65Q9H3J6 166 aaKnown RBP14.93□□□□□ -0.02
PTPRU-205ENST00000460170 CAB39LQ9H9S4 337 aa14.93□□□□□ -0.02
PTPRU-205ENST00000460170 DDX28Q9NUL7 540 aaKnown RBP14.93□□□□□ -0.02
PTPRU-205ENST00000460170 ZMYM5Q9UJ78 669 aa14.93□□□□□ -0.02
PTPRU-205ENST00000460170 HBS1LQ9Y450 684 aaKnown RBP14.93□□□□□ -0.02
PTPRU-205ENST00000460170 TGDSO95455 350 aa14.93□□□□□ -0.02
PTPRU-205ENST00000460170 WNT3AP56704 352 aa14.93□□□□□ -0.02
PTPRU-205ENST00000460170 CNTN1Q12860 1018 aa14.93□□□□□ -0.02
PTPRU-205ENST00000460170 TAF5Q15542 800 aa14.93□□□□□ -0.02
PTPRU-205ENST00000460170 ANKS1BQ7Z6G8 1248 aa14.93□□□□□ -0.02
PTPRU-205ENST00000460170 TRIM69Q86WT6 500 aa14.93□□□□□ -0.02
PTPRU-205ENST00000460170 ATG16L2Q8NAA4 619 aa14.93□□□□□ -0.02
PTPRU-205ENST00000460170 C7orf26Q96N11 449 aa14.93□□□□□ -0.02
PTPRU-205ENST00000460170 CNTNAP1P78357 1384 aa14.92□□□□□ -0.02
PTPRU-205ENST00000460170 CYP2A7P20853 494 aa14.92□□□□□ -0.02
PTPRU-205ENST00000460170 CD52P31358 61 aa14.92□□□□□ -0.02
PTPRU-205ENST00000460170 IL27RAQ6UWB1 636 aa14.92□□□□□ -0.02
PTPRU-205ENST00000460170 DNAJC14Q6Y2X3 702 aaPredicted RBP14.92□□□□□ -0.02
PTPRU-205ENST00000460170 C16orf59Q7L2K0 433 aa14.92□□□□□ -0.02
PTPRU-205ENST00000460170 STK32CQ86UX6 486 aa14.92□□□□□ -0.02
PTPRU-205ENST00000460170 TRPC4APQ8TEL6 797 aa14.92□□□□□ -0.02
PTPRU-205ENST00000460170 SLCO2A1Q92959 643 aa14.92□□□□□ -0.02
PTPRU-205ENST00000460170 PANX3Q96QZ0 392 aa14.92□□□□□ -0.02
PTPRU-205ENST00000460170 FZD8Q9H461 694 aa14.92□□□□□ -0.02
PTPRU-205ENST00000460170 LIMD1Q9UGP4 676 aa14.92□□□□□ -0.02
PTPRU-205ENST00000460170 CLCA2Q9UQC9 943 aa14.92□□□□□ -0.02
PTPRU-205ENST00000460170 IGSF6O95976 241 aa14.92□□□□□ -0.02
PTPRU-205ENST00000460170 PBLDP30039 288 aaPredicted RBP14.92□□□□□ -0.02
PTPRU-205ENST00000460170 ZNF280AP59817 542 aaPredicted RBP14.92□□□□□ -0.02
PTPRU-205ENST00000460170 MAXP61244 160 aa14.92□□□□□ -0.02
PTPRU-205ENST00000460170 HPCAP84074 193 aa14.92□□□□□ -0.02
PTPRU-205ENST00000460170 PIGWQ7Z7B1 504 aa14.92□□□□□ -0.02
PTPRU-205ENST00000460170 C11orf96Q7Z7L8 435 aa14.92□□□□□ -0.02
PTPRU-205ENST00000460170 SIAH1Q8IUQ4 282 aa14.92□□□□□ -0.02
PTPRU-205ENST00000460170 SUPV3L1Q8IYB8 786 aaKnown RBP eCLIP14.92□□□□□ -0.02
PTPRU-205ENST00000460170 DHRSXQ8N5I4 330 aa14.92□□□□□ -0.02
PTPRU-205ENST00000460170 B4GALNT2Q8NHY0 566 aa14.92□□□□□ -0.02
PTPRU-205ENST00000460170 OPTCQ9UBM4 332 aa14.92□□□□□ -0.02
PTPRU-205ENST00000460170 C5orf60A6NFR6 353 aa14.92□□□□□ -0.02
PTPRU-205ENST00000460170 TRAFD1O14545 582 aaPredicted RBP14.92□□□□□ -0.02
PTPRU-205ENST00000460170 WDR47O94967 919 aa14.92□□□□□ -0.02
PTPRU-205ENST00000460170 NAIF1Q69YI7 327 aaPredicted RBP14.92□□□□□ -0.02
PTPRU-205ENST00000460170 DCLRE1AQ6PJP8 1040 aa14.92□□□□□ -0.02
PTPRU-205ENST00000460170 GLOD4Q9HC38 313 aa14.92□□□□□ -0.02
PTPRU-205ENST00000460170 RGPD1P0DJD0 1748 aa14.92□□□□□ -0.02
PTPRU-205ENST00000460170 PIGRP01833 764 aa14.92□□□□□ -0.02
PTPRU-205ENST00000460170 CHI3L1P36222 383 aaPredicted RBP14.92□□□□□ -0.02
PTPRU-205ENST00000460170 BRCC3P46736 316 aa14.92□□□□□ -0.02
PTPRU-205ENST00000460170 DEFA1P59665 94 aa14.92□□□□□ -0.02
PTPRU-205ENST00000460170 DEFA3P59666 94 aa14.92□□□□□ -0.02
PTPRU-205ENST00000460170 AAGABQ6PD74 315 aa14.92□□□□□ -0.02
PTPRU-205ENST00000460170 SLC44A2Q8IWA5 706 aaPredicted RBP14.92□□□□□ -0.02
PTPRU-205ENST00000460170 SPATA6LQ8N4H0 392 aa14.92□□□□□ -0.02
PTPRU-205ENST00000460170 TMCO5AQ8N6Q1 288 aa14.92□□□□□ -0.02
PTPRU-205ENST00000460170 MCOLN3Q8TDD5 553 aa14.92□□□□□ -0.02
PTPRU-205ENST00000460170 RCN3Q96D15 328 aa14.92□□□□□ -0.02
PTPRU-205ENST00000460170 UGT2B28Q9BY64 529 aa14.92□□□□□ -0.02
PTPRU-205ENST00000460170 RGS14O43566 566 aa14.91□□□□□ -0.02
PTPRU-205ENST00000460170 STAU1O95793 577 aaKnown RBP14.91□□□□□ -0.02
PTPRU-205ENST00000460170 GRIK3Q13003 919 aa14.91□□□□□ -0.02
PTPRU-205ENST00000460170 CDC16Q13042 620 aa14.91□□□□□ -0.02
PTPRU-205ENST00000460170 BOP1Q14137 746 aaKnown RBP14.91□□□□□ -0.02
PTPRU-205ENST00000460170 SLC10A6Q3KNW5 377 aa14.91□□□□□ -0.02
PTPRU-205ENST00000460170 NOMO2Q5JPE7 1267 aa14.91□□□□□ -0.02
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 21.8 ms