RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000442343.1

RPSAP40-201, Transcript of ribosomal protein SA pseudogene 40, humanhuman

BASIC

Gene RPSAP40, Length 891 nt, Biotype processed pseudogene.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPSAP40-201ENST00000442343 TPM1P09493 284 aa6.63□□□□□ -1.35
RPSAP40-201ENST00000442343 SFTPCP11686 197 aa6.63□□□□□ -1.35
RPSAP40-201ENST00000442343 GP1BBP13224 206 aa6.63□□□□□ -1.35
RPSAP40-201ENST00000442343 NUDT1P36639 197 aa6.63□□□□□ -1.35
RPSAP40-201ENST00000442343 MAP2K3P46734 347 aa6.63□□□□□ -1.35
RPSAP40-201ENST00000442343 CCR5P51681 352 aa6.63□□□□□ -1.35
RPSAP40-201ENST00000442343 EPHB1P54762 984 aa6.63□□□□□ -1.35
RPSAP40-201ENST00000442343 INHBCP55103 352 aa6.63□□□□□ -1.35
RPSAP40-201ENST00000442343 TNNC1P63316 161 aa6.63□□□□□ -1.35
RPSAP40-201ENST00000442343 COG7P83436 770 aa6.63□□□□□ -1.35
RPSAP40-201ENST00000442343 SPTBN1Q01082 2364 aaKnown RBP6.63□□□□□ -1.35
RPSAP40-201ENST00000442343 OVGP1Q12889 678 aa6.63□□□□□ -1.35
RPSAP40-201ENST00000442343 TUBB2AQ13885 445 aa6.63□□□□□ -1.35
RPSAP40-201ENST00000442343 HLTFQ14527 1009 aaKnown RBP eCLIP6.63□□□□□ -1.35
RPSAP40-201ENST00000442343 WDR72Q3MJ13 1102 aa6.63□□□□□ -1.35
RPSAP40-201ENST00000442343 FILIP1LQ4L180 1135 aa6.63□□□□□ -1.35
RPSAP40-201ENST00000442343 TMEM215Q68D42 235 aa6.63□□□□□ -1.35
RPSAP40-201ENST00000442343 LAYNQ6UX15 382 aa6.63□□□□□ -1.35
RPSAP40-201ENST00000442343 ATG14Q6ZNE5 492 aa6.63□□□□□ -1.35
RPSAP40-201ENST00000442343 SV2AQ7L0J3 742 aa6.63□□□□□ -1.35
RPSAP40-201ENST00000442343 IQCHQ86VS3 1027 aa6.63□□□□□ -1.35
RPSAP40-201ENST00000442343 SFR1Q86XK3 245 aa6.63□□□□□ -1.35
RPSAP40-201ENST00000442343 FAM217AQ8IXS0 508 aa6.63□□□□□ -1.35
RPSAP40-201ENST00000442343 FUKQ8N0W3 1084 aa6.63□□□□□ -1.35
RPSAP40-201ENST00000442343 C17orf53Q8N3J3 647 aaPredicted RBP6.63□□□□□ -1.35
RPSAP40-201ENST00000442343 KCT2Q8NC54 265 aa6.63□□□□□ -1.35
RPSAP40-201ENST00000442343 WFIKKN2Q8TEU8 576 aa6.63□□□□□ -1.35
RPSAP40-201ENST00000442343 P2RY11Q96G91 374 aa6.63□□□□□ -1.35
RPSAP40-201ENST00000442343 PLPPR2Q96GM1 343 aa6.63□□□□□ -1.35
RPSAP40-201ENST00000442343 SPENQ96T58 3664 aaKnown RBP6.63□□□□□ -1.35
RPSAP40-201ENST00000442343 SEMA3CQ99985 751 aa6.63□□□□□ -1.35
RPSAP40-201ENST00000442343 CBWD1Q9BRT8 395 aa6.63□□□□□ -1.35
RPSAP40-201ENST00000442343 TUBB2BQ9BVA1 445 aa6.63□□□□□ -1.35
RPSAP40-201ENST00000442343 HSD3B7Q9H2F3 369 aa6.63□□□□□ -1.35
RPSAP40-201ENST00000442343 IKZF4Q9H2S9 585 aa6.63□□□□□ -1.35
RPSAP40-201ENST00000442343 DPEP3Q9H4B8 488 aa6.63□□□□□ -1.35
RPSAP40-201ENST00000442343 L2HGDHQ9H9P8 463 aa6.63□□□□□ -1.35
RPSAP40-201ENST00000442343 POLR1BQ9H9Y6 1135 aa6.63□□□□□ -1.35
RPSAP40-201ENST00000442343 ATP13A2Q9NQ11 1180 aa6.63□□□□□ -1.35
RPSAP40-201ENST00000442343 ASCL3Q9NQ33 180 aa6.63□□□□□ -1.35
RPSAP40-201ENST00000442343 STARD5Q9NSY2 213 aa6.63□□□□□ -1.35
RPSAP40-201ENST00000442343 PLK2Q9NYY3 685 aa6.63□□□□□ -1.35
RPSAP40-201ENST00000442343 CLIC5Q9NZA1 410 aa6.63□□□□□ -1.35
RPSAP40-201ENST00000442343 TJP2Q9UDY2 1190 aa6.63□□□□□ -1.35
RPSAP40-201ENST00000442343 SUN2Q9UH99 717 aa6.63□□□□□ -1.35
RPSAP40-201ENST00000442343 FZD4Q9ULV1 537 aa6.63□□□□□ -1.35
RPSAP40-201ENST00000442343 PLA2G4CQ9UP65 541 aa6.63□□□□□ -1.35
RPSAP40-201ENST00000442343 NCKAP1Q9Y2A7 1128 aa6.63□□□□□ -1.35
RPSAP40-201ENST00000442343 HEMK1Q9Y5R4 338 aaPredicted RBP6.63□□□□□ -1.35
RPSAP40-201ENST00000442343 CRYBG3Q68DQ2 2970 aa6.63□□□□□ -1.35
RPSAP40-201ENST00000442343 CELSR2Q9HCU4 2923 aa6.62□□□□□ -1.35
RPSAP40-201ENST00000442343 GOLGA8IPA6NC78 632 aa6.62□□□□□ -1.35
RPSAP40-201ENST00000442343 LRRC72A6NJI9 287 aa6.62□□□□□ -1.35
RPSAP40-201ENST00000442343 GOLGA8JA6NMD2 632 aa6.62□□□□□ -1.35
RPSAP40-201ENST00000442343 PYCARD-AS1I3L0S3 204 aa6.62□□□□□ -1.35
RPSAP40-201ENST00000442343 TLR4O00206 839 aa6.62□□□□□ -1.35
RPSAP40-201ENST00000442343 TPD52L2O43399 206 aaKnown RBP6.62□□□□□ -1.35
RPSAP40-201ENST00000442343 SUV39H1O43463 412 aa6.62□□□□□ -1.35
RPSAP40-201ENST00000442343 KLKB1P03952 638 aa6.62□□□□□ -1.35
RPSAP40-201ENST00000442343 WNT1P04628 370 aa6.62□□□□□ -1.35
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RPSAP40-201ENST00000442343 HARS2P49590 506 aaKnown RBP6.62□□□□□ -1.35
RPSAP40-201ENST00000442343 PGFP49763 221 aa6.62□□□□□ -1.35
RPSAP40-201ENST00000442343 GALCP54803 685 aa6.62□□□□□ -1.35
RPSAP40-201ENST00000442343 NXPH1P58417 271 aa6.62□□□□□ -1.35
RPSAP40-201ENST00000442343 ETF1P62495 437 aaKnown RBP6.62□□□□□ -1.35
RPSAP40-201ENST00000442343 TUBB4BP68371 445 aa6.62□□□□□ -1.35
RPSAP40-201ENST00000442343 GABREP78334 506 aa6.62□□□□□ -1.35
RPSAP40-201ENST00000442343 TBX2Q13207 712 aaPredicted RBP6.62□□□□□ -1.35
RPSAP40-201ENST00000442343 BMT2Q1RMZ1 405 aa6.62□□□□□ -1.35
RPSAP40-201ENST00000442343 ARL13BQ3SXY8 428 aa6.62□□□□□ -1.35
RPSAP40-201ENST00000442343 SLC45A4Q5BKX6 768 aa6.62□□□□□ -1.35
RPSAP40-201ENST00000442343 ZNF776Q68DI1 518 aaPredicted RBP6.62□□□□□ -1.35
RPSAP40-201ENST00000442343 MRM1Q6IN84 353 aaKnown RBP6.62□□□□□ -1.35
RPSAP40-201ENST00000442343 LRFN4Q6PJG9 635 aa6.62□□□□□ -1.35
RPSAP40-201ENST00000442343 THNSL2Q86YJ6 484 aa6.62□□□□□ -1.35
RPSAP40-201ENST00000442343 CNGA4Q8IV77 575 aa6.62□□□□□ -1.35
RPSAP40-201ENST00000442343 SYCP3Q8IZU3 236 aa6.62□□□□□ -1.35
RPSAP40-201ENST00000442343 CRYBG2Q8N1P7 616 aa6.62□□□□□ -1.35
RPSAP40-201ENST00000442343 PPM1KQ8N3J5 372 aa6.62□□□□□ -1.35
RPSAP40-201ENST00000442343 IL22RA1Q8N6P7 574 aa6.62□□□□□ -1.35
RPSAP40-201ENST00000442343 DDX51Q8N8A6 666 aaKnown RBP eCLIP6.62□□□□□ -1.35
RPSAP40-201ENST00000442343 MFSD2AQ8NA29 543 aa6.62□□□□□ -1.35
RPSAP40-201ENST00000442343 ZMIZ2Q8NF64 920 aa6.62□□□□□ -1.35
RPSAP40-201ENST00000442343 OR2T34Q8NGX1 318 aa6.62□□□□□ -1.35
RPSAP40-201ENST00000442343 DNAJC19Q96DA6 116 aa6.62□□□□□ -1.35
RPSAP40-201ENST00000442343 IQCDQ96DY2 449 aa6.62□□□□□ -1.35
RPSAP40-201ENST00000442343 PPP1R13BQ96KQ4 1090 aa6.62□□□□□ -1.35
RPSAP40-201ENST00000442343 SLC6A18Q96N87 628 aa6.62□□□□□ -1.35
RPSAP40-201ENST00000442343 PANX2Q96RD6 677 aa6.62□□□□□ -1.35
RPSAP40-201ENST00000442343 IRX2Q9BZI1 471 aaPredicted RBP6.62□□□□□ -1.35
RPSAP40-201ENST00000442343 CIPCQ9C0C6 399 aa6.62□□□□□ -1.35
RPSAP40-201ENST00000442343 XYLT2Q9H1B5 865 aa6.62□□□□□ -1.35
RPSAP40-201ENST00000442343 RSPH9Q9H1X1 276 aaPredicted RBP6.62□□□□□ -1.35
RPSAP40-201ENST00000442343 USP29Q9HBJ7 922 aa6.62□□□□□ -1.35
RPSAP40-201ENST00000442343 PRSS16Q9NQE7 514 aa6.62□□□□□ -1.35
RPSAP40-201ENST00000442343 OSER1Q9NX31 292 aa6.62□□□□□ -1.35
RPSAP40-201ENST00000442343 ANKMY1Q9P2S6 941 aa6.62□□□□□ -1.35
RPSAP40-201ENST00000442343 STK17AQ9UEE5 414 aa6.62□□□□□ -1.35
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