RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000439720.3

RABGEF1-203, Transcript of RAB guanine nucleotide exchange factor 1, humanhuman

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Gene RABGEF1, Length 3,065 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RABGEF1-203ENST00000439720 HSPBP1Q9NZL4 362 aa8.52□□□□□ -1.04
RABGEF1-203ENST00000439720 KCND2Q9NZV8 630 aa8.52□□□□□ -1.04
RABGEF1-203ENST00000439720 TBC1D14Q9P2M4 693 aa8.52□□□□□ -1.04
RABGEF1-203ENST00000439720 NXF1Q9UBU9 619 aaKnown RBP8.52□□□□□ -1.04
RABGEF1-203ENST00000439720 SEPT3Q9UH03 358 aa8.52□□□□□ -1.04
RABGEF1-203ENST00000439720 AGTPBP1Q9UPW5 1226 aa8.52□□□□□ -1.04
RABGEF1-203ENST00000439720 FRMPD3Q5JV73 1810 aa8.52□□□□□ -1.05
RABGEF1-203ENST00000439720 F8VP50 259 aa8.52□□□□□ -1.05
RABGEF1-203ENST00000439720 MSH4O15457 936 aa8.52□□□□□ -1.05
RABGEF1-203ENST00000439720 MSI1O43347 362 aaKnown RBP8.52□□□□□ -1.05
RABGEF1-203ENST00000439720 C1QAP02745 245 aa8.52□□□□□ -1.05
RABGEF1-203ENST00000439720 CSE1LP55060 971 aaKnown RBP8.52□□□□□ -1.05
RABGEF1-203ENST00000439720 KRT76Q01546 638 aa8.52□□□□□ -1.05
RABGEF1-203ENST00000439720 TRPC3Q13507 836 aa8.52□□□□□ -1.05
RABGEF1-203ENST00000439720 NHSL2Q5HYW2 709 aa8.52□□□□□ -1.05
RABGEF1-203ENST00000439720 N4BP2L1Q5TBK1 243 aaPredicted RBP8.52□□□□□ -1.05
RABGEF1-203ENST00000439720 XXYLT1Q8NBI6 393 aa8.52□□□□□ -1.05
RABGEF1-203ENST00000439720 SUN5Q8TC36 379 aa8.52□□□□□ -1.05
RABGEF1-203ENST00000439720 PCDHAC1Q9H158 963 aa8.52□□□□□ -1.05
RABGEF1-203ENST00000439720 NOL6Q9H6R4 1146 aaKnown RBP8.52□□□□□ -1.05
RABGEF1-203ENST00000439720 MRPL47Q9HD33 250 aaKnown RBP8.52□□□□□ -1.05
RABGEF1-203ENST00000439720 POLE4Q9NR33 117 aa8.52□□□□□ -1.05
RABGEF1-203ENST00000439720 C20orf96Q9NUD7 363 aaPredicted RBP8.52□□□□□ -1.05
RABGEF1-203ENST00000439720 DNMT3BQ9UBC3 853 aaKnown RBP8.52□□□□□ -1.05
RABGEF1-203ENST00000439720 DGKBQ9Y6T7 804 aa8.52□□□□□ -1.05
RABGEF1-203ENST00000439720 HMX2A2RU54 273 aa8.52□□□□□ -1.05
RABGEF1-203ENST00000439720 SOCS2O14508 198 aa8.52□□□□□ -1.05
RABGEF1-203ENST00000439720 ACOT8O14734 319 aa8.52□□□□□ -1.05
RABGEF1-203ENST00000439720 PMM2O15305 246 aa8.52□□□□□ -1.05
RABGEF1-203ENST00000439720 CST8O60676 142 aa8.52□□□□□ -1.05
RABGEF1-203ENST00000439720 SERPINE1P05121 402 aa8.52□□□□□ -1.05
RABGEF1-203ENST00000439720 TSHRP16473 764 aa8.52□□□□□ -1.05
RABGEF1-203ENST00000439720 POLR2EP19388 210 aaKnown RBP8.52□□□□□ -1.05
RABGEF1-203ENST00000439720 MATN1P21941 496 aa8.52□□□□□ -1.05
RABGEF1-203ENST00000439720 EEF1DP29692 281 aaKnown RBP8.52□□□□□ -1.05
RABGEF1-203ENST00000439720 CASP2P42575 452 aa8.52□□□□□ -1.05
RABGEF1-203ENST00000439720 CDKN2BP42772 138 aa8.52□□□□□ -1.05
RABGEF1-203ENST00000439720 YAP1P46937 504 aaKnown RBP8.52□□□□□ -1.05
RABGEF1-203ENST00000439720 CLK3P49761 638 aaKnown RBP8.52□□□□□ -1.05
RABGEF1-203ENST00000439720 VAC14Q08AM6 782 aa8.52□□□□□ -1.05
RABGEF1-203ENST00000439720 SMTNL2Q2TAL5 461 aa8.52□□□□□ -1.05
RABGEF1-203ENST00000439720 TKFCQ3LXA3 575 aa8.52□□□□□ -1.05
RABGEF1-203ENST00000439720 COL13A1Q5TAT6 717 aaPredicted RBP8.52□□□□□ -1.05
RABGEF1-203ENST00000439720 ZNF354CQ86Y25 554 aa8.52□□□□□ -1.05
RABGEF1-203ENST00000439720 CBWD2Q8IUF1 395 aa8.52□□□□□ -1.05
RABGEF1-203ENST00000439720 MAPK15Q8TD08 544 aa8.52□□□□□ -1.05
RABGEF1-203ENST00000439720 ADAMTS16Q8TE57 1224 aa8.52□□□□□ -1.05
RABGEF1-203ENST00000439720 MS4A4AQ96JQ5 239 aa8.52□□□□□ -1.05
RABGEF1-203ENST00000439720 SMAD5Q99717 465 aaKnown RBP8.52□□□□□ -1.05
RABGEF1-203ENST00000439720 DHX33Q9H6R0 707 aaKnown RBP8.52□□□□□ -1.05
RABGEF1-203ENST00000439720 SMOXQ9NWM0 555 aa8.52□□□□□ -1.05
RABGEF1-203ENST00000439720 PIH1D1Q9NWS0 290 aaKnown RBP8.52□□□□□ -1.05
RABGEF1-203ENST00000439720 ADA2Q9NZK5 511 aa8.52□□□□□ -1.05
RABGEF1-203ENST00000439720 ZC3H7BQ9UGR2 993 aaKnown RBP8.52□□□□□ -1.05
RABGEF1-203ENST00000439720 PFDN2Q9UHV9 154 aa8.52□□□□□ -1.05
RABGEF1-203ENST00000439720 ZSWIM8A7E2V4 1837 aa8.51□□□□□ -1.05
RABGEF1-203ENST00000439720 IGLV3-22A0A075B6J6 115 aa8.51□□□□□ -1.05
RABGEF1-203ENST00000439720 E2F8A0AVK6 867 aa8.51□□□□□ -1.05
RABGEF1-203ENST00000439720 SAC3D1A6NKF1 404 aa8.51□□□□□ -1.05
RABGEF1-203ENST00000439720 C2orf81A6NN90 581 aa8.51□□□□□ -1.05
RABGEF1-203ENST00000439720 H0YJX3 145 aa8.51□□□□□ -1.05
RABGEF1-203ENST00000439720 TOR1BO14657 336 aa8.51□□□□□ -1.05
RABGEF1-203ENST00000439720 AKAP10O43572 662 aa8.51□□□□□ -1.05
RABGEF1-203ENST00000439720 TIPRLO75663 272 aa8.51□□□□□ -1.05
RABGEF1-203ENST00000439720 GABBR2O75899 941 aa8.51□□□□□ -1.05
RABGEF1-203ENST00000439720 MAPTP10636 758 aaKnown RBP8.51□□□□□ -1.05
RABGEF1-203ENST00000439720 CTHP32929 405 aa8.51□□□□□ -1.05
RABGEF1-203ENST00000439720 TTKP33981 857 aa8.51□□□□□ -1.05
RABGEF1-203ENST00000439720 BMPR1AP36894 532 aa8.51□□□□□ -1.05
RABGEF1-203ENST00000439720 GMPRP36959 345 aa8.51□□□□□ -1.05
RABGEF1-203ENST00000439720 ARL1P40616 181 aaPredicted RBP8.51□□□□□ -1.05
RABGEF1-203ENST00000439720 RAD23AP54725 363 aa8.51□□□□□ -1.05
RABGEF1-203ENST00000439720 IFITM3Q01628 133 aa8.51□□□□□ -1.05
RABGEF1-203ENST00000439720 ART3Q13508 389 aa8.51□□□□□ -1.05
RABGEF1-203ENST00000439720 MAPK11Q15759 364 aa8.51□□□□□ -1.05
RABGEF1-203ENST00000439720 CCDC58Q4VC31 144 aa8.51□□□□□ -1.05
RABGEF1-203ENST00000439720 ALFQ53S48 1182 aa8.51□□□□□ -1.05
RABGEF1-203ENST00000439720 SIGIRRQ6IA17 410 aa8.51□□□□□ -1.05
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RABGEF1-203ENST00000439720 HERC6Q8IVU3 1022 aa8.51□□□□□ -1.05
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RABGEF1-203ENST00000439720 TFAP2CQ92754 450 aa8.51□□□□□ -1.05
RABGEF1-203ENST00000439720 MARK4Q96L34 752 aa8.51□□□□□ -1.05
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RABGEF1-203ENST00000439720 LOC105371267A0A1B0GV96 52 aa8.51□□□□□ -1.05
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RABGEF1-203ENST00000439720 ZNF839A8K0R7 811 aa8.51□□□□□ -1.05
RABGEF1-203ENST00000439720 CLDN25C9JDP6 229 aa8.51□□□□□ -1.05
RABGEF1-203ENST00000439720 TEX28O15482 410 aa8.51□□□□□ -1.05
RABGEF1-203ENST00000439720 ASNSP08243 561 aa8.51□□□□□ -1.05
RABGEF1-203ENST00000439720 ALOX5P09917 674 aa8.51□□□□□ -1.05
RABGEF1-203ENST00000439720 HSPA1AP0DMV8 641 aaKnown RBP8.51□□□□□ -1.05
RABGEF1-203ENST00000439720 HSPA1BP0DMV9 641 aaKnown RBP8.51□□□□□ -1.05
RABGEF1-203ENST00000439720 GABRB2P47870 512 aa8.51□□□□□ -1.05
RABGEF1-203ENST00000439720 FOXK1P85037 733 aa8.51□□□□□ -1.05
RABGEF1-203ENST00000439720 BFSP2Q13515 415 aa8.51□□□□□ -1.05
RABGEF1-203ENST00000439720 DPYSL3Q14195 570 aa8.51□□□□□ -1.05
RABGEF1-203ENST00000439720 PCLAFQ15004 111 aa8.51□□□□□ -1.05
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