RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000428918.1

CDH23-AS1-201, CDH23 antisense RNA 1, humanhuman

TSL 2 BASIC

Gene CDH23-AS1, Length 378 nt, Biotype antisense RNA.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDH23-AS1-201ENST00000428918 NEU3Q9UQ49 428 aa16.54■□□□□ 0.24
CDH23-AS1-201ENST00000428918 DMTF1Q9Y222 760 aa16.54■□□□□ 0.24
CDH23-AS1-201ENST00000428918 SLCO1B1Q9Y6L6 691 aa16.54■□□□□ 0.24
CDH23-AS1-201ENST00000428918 NUMA1Q14980 2115 aa16.54■□□□□ 0.24
CDH23-AS1-201ENST00000428918 KRIT1O00522 736 aa16.53■□□□□ 0.24
CDH23-AS1-201ENST00000428918 SH3BP5O60239 455 aa16.53■□□□□ 0.24
CDH23-AS1-201ENST00000428918 MAGEC1O60732 1142 aa16.53■□□□□ 0.24
CDH23-AS1-201ENST00000428918 RNGTTO60942 597 aaKnown RBP16.53■□□□□ 0.24
CDH23-AS1-201ENST00000428918 PCDH8O95206 1070 aa16.53■□□□□ 0.24
CDH23-AS1-201ENST00000428918 IGSF6O95976 241 aa16.53■□□□□ 0.24
CDH23-AS1-201ENST00000428918 GYPCP04921 128 aa16.53■□□□□ 0.24
CDH23-AS1-201ENST00000428918 CD59P13987 128 aa16.53■□□□□ 0.24
CDH23-AS1-201ENST00000428918 CASP14P31944 242 aa16.53■□□□□ 0.24
CDH23-AS1-201ENST00000428918 RHOAP61586 193 aa16.53■□□□□ 0.24
CDH23-AS1-201ENST00000428918 FOXC1Q12948 553 aa16.53■□□□□ 0.24
CDH23-AS1-201ENST00000428918 STAT4Q14765 748 aa16.53■□□□□ 0.24
CDH23-AS1-201ENST00000428918 ACAP1Q15027 740 aa16.53■□□□□ 0.24
CDH23-AS1-201ENST00000428918 INAVAQ3KP66 663 aa16.53■□□□□ 0.24
CDH23-AS1-201ENST00000428918 ARTNQ5T4W7 220 aa16.53■□□□□ 0.24
CDH23-AS1-201ENST00000428918 HGSNATQ68CP4 663 aa16.53■□□□□ 0.24
CDH23-AS1-201ENST00000428918 NEK5Q6P3R8 708 aa16.53■□□□□ 0.24
CDH23-AS1-201ENST00000428918 PIP4P1Q86T03 277 aa16.53■□□□□ 0.24
CDH23-AS1-201ENST00000428918 TRIM69Q86WT6 500 aa16.53■□□□□ 0.24
CDH23-AS1-201ENST00000428918 RNF214Q8ND24 703 aa16.53■□□□□ 0.24
CDH23-AS1-201ENST00000428918 OR2AP1Q8NGE2 309 aa16.53■□□□□ 0.24
CDH23-AS1-201ENST00000428918 FAM131CQ96AQ9 280 aa16.53■□□□□ 0.24
CDH23-AS1-201ENST00000428918 LRIG1Q96JA1 1093 aa16.53■□□□□ 0.24
CDH23-AS1-201ENST00000428918 GDAP1L1Q96MZ0 367 aa16.53■□□□□ 0.24
CDH23-AS1-201ENST00000428918 SNRNP25Q9BV90 132 aaKnown RBP16.53■□□□□ 0.24
CDH23-AS1-201ENST00000428918 DEF6Q9H4E7 631 aa16.53■□□□□ 0.24
CDH23-AS1-201ENST00000428918 IL21RQ9HBE5 538 aa16.53■□□□□ 0.24
CDH23-AS1-201ENST00000428918 GDF3Q9NR23 364 aa16.53■□□□□ 0.24
CDH23-AS1-201ENST00000428918 FNDC3AQ9Y2H6 1198 aaKnown RBP16.53■□□□□ 0.24
CDH23-AS1-201ENST00000428918 ACTL7AQ9Y615 435 aa16.53■□□□□ 0.24
CDH23-AS1-201ENST00000428918 SPAARA0A1B0GVQ0 90 aa16.52■□□□□ 0.24
CDH23-AS1-201ENST00000428918 WASH4PA8MWX3 477 aa16.52■□□□□ 0.24
CDH23-AS1-201ENST00000428918 RASA4BC9J798 803 aa16.52■□□□□ 0.24
CDH23-AS1-201ENST00000428918 FLRT2O43155 660 aa16.52■□□□□ 0.24
CDH23-AS1-201ENST00000428918 RASA4O43374 803 aa16.52■□□□□ 0.24
CDH23-AS1-201ENST00000428918 LATO43561 262 aa16.52■□□□□ 0.24
CDH23-AS1-201ENST00000428918 GJB3O75712 270 aa16.52■□□□□ 0.24
CDH23-AS1-201ENST00000428918 GSRP00390 522 aa16.52■□□□□ 0.24
CDH23-AS1-201ENST00000428918 ITGB7P26010 798 aa16.52■□□□□ 0.24
CDH23-AS1-201ENST00000428918 MIPP30301 263 aa16.52■□□□□ 0.24
CDH23-AS1-201ENST00000428918 ZNF135P52742 658 aaPredicted RBP16.52■□□□□ 0.24
CDH23-AS1-201ENST00000428918 PIGHQ14442 188 aaPredicted RBP16.52■□□□□ 0.24
CDH23-AS1-201ENST00000428918 CCDC122Q5T0U0 273 aa16.52■□□□□ 0.24
CDH23-AS1-201ENST00000428918 PIP5KL1Q5T9C9 394 aa16.52■□□□□ 0.24
CDH23-AS1-201ENST00000428918 SPECC1LQ69YQ0 1117 aa16.52■□□□□ 0.24
CDH23-AS1-201ENST00000428918 PSTKQ8IV42 348 aaKnown RBP16.52■□□□□ 0.24
CDH23-AS1-201ENST00000428918 PLPP6Q8IY26 295 aa16.52■□□□□ 0.24
CDH23-AS1-201ENST00000428918 UMODL1-AS1Q8N2C9 162 aa16.52■□□□□ 0.24
CDH23-AS1-201ENST00000428918 OR6K2Q8NGY2 324 aa16.52■□□□□ 0.24
CDH23-AS1-201ENST00000428918 ARRDC3Q96B67 414 aa16.52■□□□□ 0.24
CDH23-AS1-201ENST00000428918 HMCESQ96FZ2 354 aa16.52■□□□□ 0.24
CDH23-AS1-201ENST00000428918 OSBPL1AQ9BXW6 950 aa16.52■□□□□ 0.24
CDH23-AS1-201ENST00000428918 HDAC8Q9BY41 377 aa16.52■□□□□ 0.24
CDH23-AS1-201ENST00000428918 THAP2Q9H0W7 228 aa16.52■□□□□ 0.24
CDH23-AS1-201ENST00000428918 ZWILCHQ9H900 591 aa16.52■□□□□ 0.24
CDH23-AS1-201ENST00000428918 PCDHGB2Q9Y5G2 931 aa16.52■□□□□ 0.24
CDH23-AS1-201ENST00000428918 WASF2Q9Y6W5 498 aa16.52■□□□□ 0.24
CDH23-AS1-201ENST00000428918 A0A1W2PQU0 124 aa16.51■□□□□ 0.23
CDH23-AS1-201ENST00000428918 ARHGAP42A6NI28 874 aa16.51■□□□□ 0.23
CDH23-AS1-201ENST00000428918 PRAMEF26H0Y7S4 382 aa16.51■□□□□ 0.23
CDH23-AS1-201ENST00000428918 NEMP1O14524 444 aa16.51■□□□□ 0.23
CDH23-AS1-201ENST00000428918 LRCH4O75427 683 aa16.51■□□□□ 0.23
CDH23-AS1-201ENST00000428918 TMCC1O94876 653 aa16.51■□□□□ 0.23
CDH23-AS1-201ENST00000428918 POP4O95707 220 aaKnown RBP16.51■□□□□ 0.23
CDH23-AS1-201ENST00000428918 PMLP29590 882 aa16.51■□□□□ 0.23
CDH23-AS1-201ENST00000428918 PCK1P35558 622 aa16.51■□□□□ 0.23
CDH23-AS1-201ENST00000428918 ARL4AP40617 200 aa16.51■□□□□ 0.23
CDH23-AS1-201ENST00000428918 CTSKP43235 329 aa16.51■□□□□ 0.23
CDH23-AS1-201ENST00000428918 SSR1P43307 286 aaKnown RBP16.51■□□□□ 0.23
CDH23-AS1-201ENST00000428918 ARRB1P49407 418 aaPredicted RBP16.51■□□□□ 0.23
CDH23-AS1-201ENST00000428918 NDST2P52849 883 aa16.51■□□□□ 0.23
CDH23-AS1-201ENST00000428918 BNC1Q01954 994 aa16.51■□□□□ 0.23
CDH23-AS1-201ENST00000428918 TRIP6Q15654 476 aaKnown RBP16.51■□□□□ 0.23
CDH23-AS1-201ENST00000428918 INO80DQ53TQ3 878 aaPredicted RBP16.51■□□□□ 0.23
CDH23-AS1-201ENST00000428918 ALKBH5Q6P6C2 394 aaKnown RBP16.51■□□□□ 0.23
CDH23-AS1-201ENST00000428918 HORMAD1Q86X24 394 aa16.51■□□□□ 0.23
CDH23-AS1-201ENST00000428918 ORAI3Q9BRQ5 295 aa16.51■□□□□ 0.23
CDH23-AS1-201ENST00000428918 TRIM7Q9C029 511 aa16.51■□□□□ 0.23
CDH23-AS1-201ENST00000428918 EBF2Q9HAK2 575 aa16.51■□□□□ 0.23
CDH23-AS1-201ENST00000428918 UBA2Q9UBT2 640 aaPredicted RBP16.51■□□□□ 0.23
CDH23-AS1-201ENST00000428918 IP6K2Q9UHH9 426 aa16.51■□□□□ 0.23
CDH23-AS1-201ENST00000428918 ANAPC7Q9UJX3 599 aa16.51■□□□□ 0.23
CDH23-AS1-201ENST00000428918 CACNA1AO00555 2505 aa16.51■□□□□ 0.23
CDH23-AS1-201ENST00000428918 A0A087X0T9 212 aa16.5■□□□□ 0.23
CDH23-AS1-201ENST00000428918 H0Y8X5 98 aa16.5■□□□□ 0.23
CDH23-AS1-201ENST00000428918 H3BRJ5 948 aa16.5■□□□□ 0.23
CDH23-AS1-201ENST00000428918 KCNK3O14649 394 aa16.5■□□□□ 0.23
CDH23-AS1-201ENST00000428918 SLC31A1O15431 190 aa16.5■□□□□ 0.23
CDH23-AS1-201ENST00000428918 YKT6O15498 198 aa16.5■□□□□ 0.23
CDH23-AS1-201ENST00000428918 ZNF821O75541 412 aaPredicted RBP16.5■□□□□ 0.23
CDH23-AS1-201ENST00000428918 FAM228BP0C875 321 aa16.5■□□□□ 0.23
CDH23-AS1-201ENST00000428918 ADRB3P13945 408 aa16.5■□□□□ 0.23
CDH23-AS1-201ENST00000428918 AKT2P31751 481 aa16.5■□□□□ 0.23
CDH23-AS1-201ENST00000428918 SERINC3Q13530 473 aa16.5■□□□□ 0.23
CDH23-AS1-201ENST00000428918 CA9Q16790 459 aa16.5■□□□□ 0.23
CDH23-AS1-201ENST00000428918 BOLA3Q53S33 107 aa16.5■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 18.3 ms