RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000428026.6

PTPRU-204, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type U, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene PTPRU, Length 5,550 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRU-204ENST00000428026 TBCBQ99426 244 aa14.66□□□□□ -0.06
PTPRU-204ENST00000428026 ADGRE3Q9BY15 652 aa14.66□□□□□ -0.06
PTPRU-204ENST00000428026 CNTNAP2Q9UHC6 1331 aa14.66□□□□□ -0.06
PTPRU-204ENST00000428026 CNPP09543 421 aaKnown RBP14.66□□□□□ -0.06
PTPRU-204ENST00000428026 NUDT17P0C025 328 aa14.66□□□□□ -0.06
PTPRU-204ENST00000428026 MBL2P11226 248 aaPredicted RBP14.66□□□□□ -0.06
PTPRU-204ENST00000428026 PSMB4P28070 264 aa14.66□□□□□ -0.06
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PTPRU-204ENST00000428026 ACTL7BQ9Y614 415 aa14.66□□□□□ -0.06
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PTPRU-204ENST00000428026 SPATA6LQ8N4H0 392 aa14.66□□□□□ -0.06
PTPRU-204ENST00000428026 FAM13CQ8NE31 585 aa14.66□□□□□ -0.06
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PTPRU-204ENST00000428026 TRIM38O00635 465 aa14.65□□□□□ -0.06
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PTPRU-204ENST00000428026 IL12AP29459 219 aa14.65□□□□□ -0.06
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PTPRU-204ENST00000428026 TRIM48Q8IWZ4 208 aa14.65□□□□□ -0.06
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PTPRU-204ENST00000428026 SPAG4Q9NPE6 437 aa14.65□□□□□ -0.06
PTPRU-204ENST00000428026 PNPLA3Q9NST1 481 aa14.65□□□□□ -0.06
PTPRU-204ENST00000428026 GMPPBQ9Y5P6 360 aa14.65□□□□□ -0.06
PTPRU-204ENST00000428026 CCDC182A6NF36 153 aa14.65□□□□□ -0.06
PTPRU-204ENST00000428026 PRR5-ARHGAP8B1AHC4 643 aa14.65□□□□□ -0.06
PTPRU-204ENST00000428026 PABPC1P11940 636 aaKnown RBP14.65□□□□□ -0.06
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PTPRU-204ENST00000428026 SPIRE1Q08AE8 756 aa14.65□□□□□ -0.06
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PTPRU-204ENST00000428026 ZNF671Q8TAW3 534 aa14.65□□□□□ -0.06
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PTPRU-204ENST00000428026 SORCS3Q9UPU3 1222 aa14.65□□□□□ -0.06
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PTPRU-204ENST00000428026 ZNF222Q9UK12 451 aa14.65□□□□□ -0.06
PTPRU-204ENST00000428026 C15orf38-AP3S2A0A0A6YYH1 394 aa14.65□□□□□ -0.06
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PTPRU-204ENST00000428026 AMPD2Q01433 879 aa14.65□□□□□ -0.06
PTPRU-204ENST00000428026 TTC23Q5W5X9 447 aa14.65□□□□□ -0.06
PTPRU-204ENST00000428026 ARPINQ7Z6K5 226 aa14.65□□□□□ -0.06
PTPRU-204ENST00000428026 AMER2Q8N7J2 671 aa14.65□□□□□ -0.06
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PTPRU-204ENST00000428026 SLC12A3P55017 1021 aa14.64□□□□□ -0.07
PTPRU-204ENST00000428026 PTSQ03393 145 aa14.64□□□□□ -0.07
PTPRU-204ENST00000428026 CARTPTQ16568 116 aa14.64□□□□□ -0.07
PTPRU-204ENST00000428026 FBXO47Q5MNV8 452 aa14.64□□□□□ -0.07
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PTPRU-204ENST00000428026 TRMT13Q9NUP7 481 aaKnown RBP14.64□□□□□ -0.07
PTPRU-204ENST00000428026 DDX43Q9NXZ2 648 aaKnown RBP14.64□□□□□ -0.07
PTPRU-204ENST00000428026 BTRCQ9Y297 605 aa14.64□□□□□ -0.07
PTPRU-204ENST00000428026 DPPA5A6NC42 116 aa14.64□□□□□ -0.07
PTPRU-204ENST00000428026 TSPAN9O75954 239 aa14.64□□□□□ -0.07
PTPRU-204ENST00000428026 MAMLD1Q13495 774 aa14.64□□□□□ -0.07
PTPRU-204ENST00000428026 MTX3Q5HYI7 312 aa14.64□□□□□ -0.07
PTPRU-204ENST00000428026 ALLCQ8N6M5 410 aa14.64□□□□□ -0.07
PTPRU-204ENST00000428026 KIFC1Q9BW19 673 aa14.64□□□□□ -0.07
PTPRU-204ENST00000428026 PRKAG3Q9UGI9 489 aa14.64□□□□□ -0.07
PTPRU-204ENST00000428026 SLC25A13Q9UJS0 675 aa14.64□□□□□ -0.07
PTPRU-204ENST00000428026 SPACA6W5XKT8 324 aa14.64□□□□□ -0.07
PTPRU-204ENST00000428026 ATP6AP2A0A1C7CYW4 349 aa14.64□□□□□ -0.07
PTPRU-204ENST00000428026 BUD23O43709 281 aaKnown RBP14.64□□□□□ -0.07
PTPRU-204ENST00000428026 ATP6AP2O75787 350 aa14.64□□□□□ -0.07
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