RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000424082.6

RALGPS1-208, Transcript of Ral GEF with PH domain and SH3 binding motif 1, humanhuman

TSL 2 BASIC

Gene RALGPS1, Length 2,362 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RALGPS1-208ENST00000424082 MATKP42679 507 aa18.59■□□□□ 0.57
RALGPS1-208ENST00000424082 STT3AP46977 705 aa18.59■□□□□ 0.57
RALGPS1-208ENST00000424082 BCAT1P54687 386 aa18.59■□□□□ 0.57
RALGPS1-208ENST00000424082 PLOD1Q02809 727 aaPredicted RBP18.59■□□□□ 0.57
RALGPS1-208ENST00000424082 POU5F1BQ06416 359 aa18.59■□□□□ 0.57
RALGPS1-208ENST00000424082 ARHGAP17Q68EM7 881 aa18.59■□□□□ 0.57
RALGPS1-208ENST00000424082 Q6ZNX1 250 aa18.59■□□□□ 0.57
RALGPS1-208ENST00000424082 TMEM135Q86UB9 458 aa18.59■□□□□ 0.57
RALGPS1-208ENST00000424082 APOL2Q9BQE5 337 aa18.59■□□□□ 0.57
RALGPS1-208ENST00000424082 CAAP1Q9H8G2 361 aa18.59■□□□□ 0.57
RALGPS1-208ENST00000424082 PLGRKTQ9HBL7 147 aa18.59■□□□□ 0.57
RALGPS1-208ENST00000424082 RRN3Q9NYV6 651 aa18.59■□□□□ 0.57
RALGPS1-208ENST00000424082 IGSF9Q9P2J2 1179 aa18.59■□□□□ 0.57
RALGPS1-208ENST00000424082 SQORQ9Y6N5 450 aa18.59■□□□□ 0.57
RALGPS1-208ENST00000424082 TADA2AO75478 443 aa18.59■□□□□ 0.57
RALGPS1-208ENST00000424082 GRIA4P48058 902 aa18.59■□□□□ 0.57
RALGPS1-208ENST00000424082 IKBKEQ14164 716 aa18.59■□□□□ 0.57
RALGPS1-208ENST00000424082 ARL13AQ5H913 290 aaPredicted RBP18.59■□□□□ 0.57
RALGPS1-208ENST00000424082 CERCAMQ5T4B2 595 aa18.59■□□□□ 0.57
RALGPS1-208ENST00000424082 ZNF618Q5T7W0 954 aa18.59■□□□□ 0.57
RALGPS1-208ENST00000424082 OTUD1Q5VV17 481 aaPredicted RBP18.59■□□□□ 0.57
RALGPS1-208ENST00000424082 IFNLR1Q8IU57 520 aaPredicted RBP18.59■□□□□ 0.57
RALGPS1-208ENST00000424082 SMYD1Q8NB12 490 aa18.59■□□□□ 0.57
RALGPS1-208ENST00000424082 SLC2A14Q8TDB8 520 aa18.59■□□□□ 0.57
RALGPS1-208ENST00000424082 TMA16Q96EY4 203 aaKnown RBP18.59■□□□□ 0.57
RALGPS1-208ENST00000424082 NPAS2Q99743 824 aa18.59■□□□□ 0.57
RALGPS1-208ENST00000424082 OSBPL11Q9BXB4 747 aa18.59■□□□□ 0.57
RALGPS1-208ENST00000424082 ACE2Q9BYF1 805 aaPredicted RBP18.59■□□□□ 0.57
RALGPS1-208ENST00000424082 ZBTB26Q9HCK0 441 aa18.59■□□□□ 0.57
RALGPS1-208ENST00000424082 SNTG2Q9NY99 539 aa18.59■□□□□ 0.57
RALGPS1-208ENST00000424082 ZNHIT2Q9UHR6 403 aa18.59■□□□□ 0.57
RALGPS1-208ENST00000424082 SLC39A10Q9ULF5 831 aa18.59■□□□□ 0.57
RALGPS1-208ENST00000424082 MYRFQ9Y2G1 1151 aa18.59■□□□□ 0.57
RALGPS1-208ENST00000424082 TDRKHQ9Y2W6 561 aaKnown RBP18.59■□□□□ 0.57
RALGPS1-208ENST00000424082 SH3GLB1Q9Y371 365 aa18.59■□□□□ 0.57
RALGPS1-208ENST00000424082 PLXNA1Q9UIW2 1896 aa18.58■□□□□ 0.57
RALGPS1-208ENST00000424082 PLXNB2O15031 1838 aa18.58■□□□□ 0.56
RALGPS1-208ENST00000424082 SH3PXD2BA1X283 911 aa18.58■□□□□ 0.56
RALGPS1-208ENST00000424082 CCDC78A2IDD5 438 aa18.58■□□□□ 0.56
RALGPS1-208ENST00000424082 TRIM38O00635 465 aa18.58■□□□□ 0.56
RALGPS1-208ENST00000424082 PIGNO95427 931 aa18.58■□□□□ 0.56
RALGPS1-208ENST00000424082 GLRBP48167 497 aa18.58■□□□□ 0.56
RALGPS1-208ENST00000424082 NDST2P52849 883 aa18.58■□□□□ 0.56
RALGPS1-208ENST00000424082 CCNA1P78396 465 aa18.58■□□□□ 0.56
RALGPS1-208ENST00000424082 CBX3Q13185 183 aa18.58■□□□□ 0.56
RALGPS1-208ENST00000424082 KYAT1Q16773 422 aa18.58■□□□□ 0.56
RALGPS1-208ENST00000424082 SLC25A52Q3SY17 297 aa18.58■□□□□ 0.56
RALGPS1-208ENST00000424082 ZBTB8BQ8NAP8 495 aaPredicted RBP18.58■□□□□ 0.56
RALGPS1-208ENST00000424082 SLC7A14Q8TBB6 771 aa18.58■□□□□ 0.56
RALGPS1-208ENST00000424082 DRC3Q9H069 523 aa18.58■□□□□ 0.56
RALGPS1-208ENST00000424082 TASP1Q9H6P5 420 aa18.58■□□□□ 0.56
RALGPS1-208ENST00000424082 CHRAC1Q9NRG0 131 aa18.58■□□□□ 0.56
RALGPS1-208ENST00000424082 OLAHQ9NV23 265 aa18.58■□□□□ 0.56
RALGPS1-208ENST00000424082 ARHGEF38Q9NXL2 777 aa18.58■□□□□ 0.56
RALGPS1-208ENST00000424082 BFARQ9NZS9 450 aa18.58■□□□□ 0.56
RALGPS1-208ENST00000424082 RCOR3Q9P2K3 495 aaPredicted RBP18.58■□□□□ 0.56
RALGPS1-208ENST00000424082 GJD2Q9UKL4 321 aa18.58■□□□□ 0.56
RALGPS1-208ENST00000424082 TFEBP19484 476 aa18.57■□□□□ 0.56
RALGPS1-208ENST00000424082 NME3Q13232 169 aa18.57■□□□□ 0.56
RALGPS1-208ENST00000424082 MPP3Q13368 585 aa18.57■□□□□ 0.56
RALGPS1-208ENST00000424082 NXNQ6DKJ4 435 aa18.57■□□□□ 0.56
RALGPS1-208ENST00000424082 NT5DC4Q86YG4 428 aa18.57■□□□□ 0.56
RALGPS1-208ENST00000424082 LINC01465Q8N7H1 131 aa18.57■□□□□ 0.56
RALGPS1-208ENST00000424082 CNTD1Q8N815 330 aa18.57■□□□□ 0.56
RALGPS1-208ENST00000424082 TRPC4APQ8TEL6 797 aa18.57■□□□□ 0.56
RALGPS1-208ENST00000424082 VPS39Q96JC1 886 aa18.57■□□□□ 0.56
RALGPS1-208ENST00000424082 RANBP9Q96S59 729 aa18.57■□□□□ 0.56
RALGPS1-208ENST00000424082 TMEM79Q9BSE2 394 aa18.57■□□□□ 0.56
RALGPS1-208ENST00000424082 OSBPL6Q9BZF3 934 aa18.57■□□□□ 0.56
RALGPS1-208ENST00000424082 ZDHHC2Q9UIJ5 367 aa18.57■□□□□ 0.56
RALGPS1-208ENST00000424082 CDYLQ9Y232 598 aa18.57■□□□□ 0.56
RALGPS1-208ENST00000424082 AP4S1Q9Y587 144 aa18.57■□□□□ 0.56
RALGPS1-208ENST00000424082 ZSWIM8A7E2V4 1837 aa18.57■□□□□ 0.56
RALGPS1-208ENST00000424082 TCAF2A6NFQ2 919 aa18.57■□□□□ 0.56
RALGPS1-208ENST00000424082 SNAI1O95863 264 aaPredicted RBP18.57■□□□□ 0.56
RALGPS1-208ENST00000424082 SBK3P0C264 359 aa18.57■□□□□ 0.56
RALGPS1-208ENST00000424082 ZNF286BP0CG31 522 aa18.57■□□□□ 0.56
RALGPS1-208ENST00000424082 PTPN3P26045 913 aa18.57■□□□□ 0.56
RALGPS1-208ENST00000424082 HK2P52789 917 aa18.57■□□□□ 0.56
RALGPS1-208ENST00000424082 NAGLUP54802 743 aa18.57■□□□□ 0.56
RALGPS1-208ENST00000424082 ADIGQ0VDE8 80 aa18.57■□□□□ 0.56
RALGPS1-208ENST00000424082 KCNMB4Q86W47 210 aa18.57■□□□□ 0.56
RALGPS1-208ENST00000424082 TMEM151AQ8N4L1 468 aa18.57■□□□□ 0.56
RALGPS1-208ENST00000424082 LRTOMTQ8WZ04 291 aa18.57■□□□□ 0.56
RALGPS1-208ENST00000424082 KATNBL1Q9H079 304 aa18.57■□□□□ 0.56
RALGPS1-208ENST00000424082 IARS2Q9NSE4 1012 aaKnown RBP18.57■□□□□ 0.56
RALGPS1-208ENST00000424082 PNPLA3Q9NST1 481 aa18.57■□□□□ 0.56
RALGPS1-208ENST00000424082 C20orf96Q9NUD7 363 aaPredicted RBP18.57■□□□□ 0.56
RALGPS1-208ENST00000424082 CDKN2AIPQ9NXV6 580 aaPredicted RBP18.57■□□□□ 0.56
RALGPS1-208ENST00000424082 GINS2Q9Y248 185 aa18.57■□□□□ 0.56
RALGPS1-208ENST00000424082 GTF3C5Q9Y5Q8 519 aaPredicted RBP18.57■□□□□ 0.56
RALGPS1-208ENST00000424082 FAM72CH0Y354 149 aa18.56■□□□□ 0.56
RALGPS1-208ENST00000424082 PHGDHO43175 533 aaKnown RBP18.56■□□□□ 0.56
RALGPS1-208ENST00000424082 AP2A1O95782 977 aa18.56■□□□□ 0.56
RALGPS1-208ENST00000424082 LGALS2P05162 132 aa18.56■□□□□ 0.56
RALGPS1-208ENST00000424082 C8BP07358 591 aa18.56■□□□□ 0.56
RALGPS1-208ENST00000424082 TPH1P17752 444 aa18.56■□□□□ 0.56
RALGPS1-208ENST00000424082 GRM5P41594 1212 aa18.56■□□□□ 0.56
RALGPS1-208ENST00000424082 ENTPD1P49961 510 aa18.56■□□□□ 0.56
RALGPS1-208ENST00000424082 TUBA4AP68366 448 aa18.56■□□□□ 0.56
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 50.5 ms