RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000420768.1

TOP3BP1-201, Transcript of DNA topoisomerase III beta pseudogene 1, humanhuman

BASIC

Gene TOP3BP1, Length 1,380 nt, Biotype processed pseudogene.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TOP3BP1-201ENST00000420768 PSMB4P28070 264 aa17.21■□□□□ 0.35
TOP3BP1-201ENST00000420768 CTHP32929 405 aa17.21■□□□□ 0.35
TOP3BP1-201ENST00000420768 CTSOP43234 321 aaPredicted RBP17.21■□□□□ 0.35
TOP3BP1-201ENST00000420768 MAGEA6P43360 314 aa17.21■□□□□ 0.35
TOP3BP1-201ENST00000420768 ITKQ08881 620 aa17.21■□□□□ 0.35
TOP3BP1-201ENST00000420768 MORF4L2Q15014 288 aa17.21■□□□□ 0.35
TOP3BP1-201ENST00000420768 KCTD19Q17RG1 926 aaPredicted RBP17.21■□□□□ 0.35
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TOP3BP1-201ENST00000420768 CPT1BQ92523 772 aa17.2■□□□□ 0.34
TOP3BP1-201ENST00000420768 ART4Q93070 314 aa17.2■□□□□ 0.34
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TOP3BP1-201ENST00000420768 RAB21Q9UL25 225 aa17.2■□□□□ 0.34
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TOP3BP1-201ENST00000420768 C19orf67A6NJJ6 358 aa17.19■□□□□ 0.34
TOP3BP1-201ENST00000420768 MUSKO15146 869 aa17.19■□□□□ 0.34
TOP3BP1-201ENST00000420768 ATP9BO43861 1147 aa17.19■□□□□ 0.34
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TOP3BP1-201ENST00000420768 HLTFQ14527 1009 aaKnown RBP eCLIP17.19■□□□□ 0.34
TOP3BP1-201ENST00000420768 KCNJ11Q14654 390 aa17.19■□□□□ 0.34
TOP3BP1-201ENST00000420768 TRADDQ15628 312 aa17.19■□□□□ 0.34
TOP3BP1-201ENST00000420768 TPSAB1Q15661 275 aa17.19■□□□□ 0.34
TOP3BP1-201ENST00000420768 FAXCQ5TGI0 409 aa17.19■□□□□ 0.34
TOP3BP1-201ENST00000420768 PLPP6Q8IY26 295 aa17.19■□□□□ 0.34
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TOP3BP1-201ENST00000420768 RPL10LQ96L21 214 aaKnown RBP17.19■□□□□ 0.34
TOP3BP1-201ENST00000420768 MRGPRX3Q96LB0 322 aa17.19■□□□□ 0.34
TOP3BP1-201ENST00000420768 NUDCD1Q96RS6 583 aa17.19■□□□□ 0.34
TOP3BP1-201ENST00000420768 LHX3Q9UBR4 397 aa17.19■□□□□ 0.34
TOP3BP1-201ENST00000420768 SORCS3Q9UPU3 1222 aa17.19■□□□□ 0.34
TOP3BP1-201ENST00000420768 DOCK4Q8N1I0 1966 aa17.19■□□□□ 0.34
TOP3BP1-201ENST00000420768 DOCK8Q8NF50 2099 aa17.18■□□□□ 0.34
TOP3BP1-201ENST00000420768 K7ERQ8 282 aa17.18■□□□□ 0.34
TOP3BP1-201ENST00000420768 NPC1O15118 1278 aa17.18■□□□□ 0.34
TOP3BP1-201ENST00000420768 SMAD6O43541 496 aaKnown RBP17.18■□□□□ 0.34
TOP3BP1-201ENST00000420768 NARSO43776 548 aaKnown RBP17.18■□□□□ 0.34
TOP3BP1-201ENST00000420768 AP2A1O95782 977 aa17.18■□□□□ 0.34
TOP3BP1-201ENST00000420768 GSRP00390 522 aa17.18■□□□□ 0.34
TOP3BP1-201ENST00000420768 APRTP07741 180 aa17.18■□□□□ 0.34
TOP3BP1-201ENST00000420768 CR2P20023 1033 aa17.18■□□□□ 0.34
TOP3BP1-201ENST00000420768 LMAN1P49257 510 aa17.18■□□□□ 0.34
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TOP3BP1-201ENST00000420768 MAXP61244 160 aa17.18■□□□□ 0.34
TOP3BP1-201ENST00000420768 VSNL1P62760 191 aa17.18■□□□□ 0.34
TOP3BP1-201ENST00000420768 SARNPP82979 210 aaKnown RBP17.18■□□□□ 0.34
TOP3BP1-201ENST00000420768 PTPRNQ16849 979 aa17.18■□□□□ 0.34
TOP3BP1-201ENST00000420768 ACCSLQ4AC99 568 aa17.18■□□□□ 0.34
TOP3BP1-201ENST00000420768 FAM182AQ5T1J6 154 aa17.18■□□□□ 0.34
TOP3BP1-201ENST00000420768 NAIF1Q69YI7 327 aaPredicted RBP17.18■□□□□ 0.34
TOP3BP1-201ENST00000420768 C22orf39Q6P5X5 142 aa17.18■□□□□ 0.34
TOP3BP1-201ENST00000420768 ZDHHC24Q6UX98 284 aa17.18■□□□□ 0.34
TOP3BP1-201ENST00000420768 PPP1R21Q6ZMI0 780 aa17.18■□□□□ 0.34
TOP3BP1-201ENST00000420768 CCNI2Q6ZMN8 369 aaPredicted RBP17.18■□□□□ 0.34
TOP3BP1-201ENST00000420768 ARRDC2Q8TBH0 407 aa17.18■□□□□ 0.34
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