RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000415055.2

PTPRK-210, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type K, humanhuman

TSL 5

Gene PTPRK, Length 782 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Nucleus, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRK-210ENST00000415055 MSH4O15457 936 aa4.9□□□□□ -1.63
PTPRK-210ENST00000415055 TSPAN1O60635 241 aa4.9□□□□□ -1.63
PTPRK-210ENST00000415055 ATG13O75143 517 aa4.9□□□□□ -1.63
PTPRK-210ENST00000415055 CYP7B1O75881 506 aa4.9□□□□□ -1.63
PTPRK-210ENST00000415055 AKAP3O75969 853 aa4.9□□□□□ -1.63
PTPRK-210ENST00000415055 B3GAT3O94766 335 aa4.9□□□□□ -1.63
PTPRK-210ENST00000415055 FSBPO95073 299 aa4.9□□□□□ -1.63
PTPRK-210ENST00000415055 TRIM16O95361 564 aa4.9□□□□□ -1.63
PTPRK-210ENST00000415055 IL18BPO95998 194 aa4.9□□□□□ -1.63
PTPRK-210ENST00000415055 FTLP02792 175 aaPredicted RBP4.9□□□□□ -1.63
PTPRK-210ENST00000415055 CFIP05156 583 aa4.9□□□□□ -1.63
PTPRK-210ENST00000415055 THP07101 528 aa4.9□□□□□ -1.63
PTPRK-210ENST00000415055 TKTP29401 623 aaKnown RBP4.9□□□□□ -1.63
PTPRK-210ENST00000415055 AXLP30530 894 aa4.9□□□□□ -1.63
PTPRK-210ENST00000415055 GRK6P43250 576 aa4.9□□□□□ -1.63
PTPRK-210ENST00000415055 MAP2K6P52564 334 aa4.9□□□□□ -1.63
PTPRK-210ENST00000415055 SESN2P58004 480 aaPredicted RBP4.9□□□□□ -1.63
PTPRK-210ENST00000415055 GRSF1Q12849 480 aaKnown RBP eCLIP4.9□□□□□ -1.63
PTPRK-210ENST00000415055 BIRC3Q13489 604 aa4.9□□□□□ -1.63
PTPRK-210ENST00000415055 ICAM4Q14773 271 aa4.9□□□□□ -1.63
PTPRK-210ENST00000415055 RAB39AQ14964 217 aa4.9□□□□□ -1.63
PTPRK-210ENST00000415055 KARSQ15046 597 aaKnown RBP4.9□□□□□ -1.63
PTPRK-210ENST00000415055 CDSNQ15517 529 aa4.9□□□□□ -1.63
PTPRK-210ENST00000415055 C3orf36Q3SXR2 165 aa4.9□□□□□ -1.63
PTPRK-210ENST00000415055 CCDC157Q569K6 752 aa4.9□□□□□ -1.63
PTPRK-210ENST00000415055 ANO5Q75V66 913 aa4.9□□□□□ -1.63
PTPRK-210ENST00000415055 RTL10Q7L3V2 364 aa4.9□□□□□ -1.63
PTPRK-210ENST00000415055 DTX3Q8N9I9 347 aa4.9□□□□□ -1.63
PTPRK-210ENST00000415055 TEX19Q8NA77 164 aa4.9□□□□□ -1.63
PTPRK-210ENST00000415055 VPS37AQ8NEZ2 397 aa4.9□□□□□ -1.63
PTPRK-210ENST00000415055 EXOC6Q8TAG9 804 aa4.9□□□□□ -1.63
PTPRK-210ENST00000415055 MDM1Q8TC05 714 aa4.9□□□□□ -1.63
PTPRK-210ENST00000415055 TCP11Q8WWU5 503 aa4.9□□□□□ -1.63
PTPRK-210ENST00000415055 RUFY2Q8WXA3 655 aa4.9□□□□□ -1.63
PTPRK-210ENST00000415055 CCDC51Q96ER9 411 aa4.9□□□□□ -1.63
PTPRK-210ENST00000415055 YTHDC1Q96MU7 727 aaKnown RBP4.9□□□□□ -1.63
PTPRK-210ENST00000415055 CCDC43Q96MW1 224 aaKnown RBP4.9□□□□□ -1.63
PTPRK-210ENST00000415055 CLIC6Q96NY7 704 aa4.9□□□□□ -1.63
PTPRK-210ENST00000415055 GTPBP2Q9BX10 602 aaKnown RBP4.9□□□□□ -1.63
PTPRK-210ENST00000415055 NUSAP1Q9BXS6 441 aaKnown RBP4.9□□□□□ -1.63
PTPRK-210ENST00000415055 TPSD1Q9BZJ3 242 aa4.9□□□□□ -1.63
PTPRK-210ENST00000415055 IL25Q9H293 177 aa4.9□□□□□ -1.63
PTPRK-210ENST00000415055 C6orf50Q9HD87 102 aa4.9□□□□□ -1.63
PTPRK-210ENST00000415055 RBM28Q9NW13 759 aaKnown RBP4.9□□□□□ -1.63
PTPRK-210ENST00000415055 BARHL2Q9NY43 387 aa4.9□□□□□ -1.63
PTPRK-210ENST00000415055 MTRRQ9UBK8 725 aa4.9□□□□□ -1.63
PTPRK-210ENST00000415055 PCDHGB6Q9Y5F9 930 aa4.9□□□□□ -1.63
PTPRK-210ENST00000415055 INSL5Q9Y5Q6 135 aa4.9□□□□□ -1.63
PTPRK-210ENST00000415055 MGAQ8IWI9 3026 aa4.9□□□□□ -1.63
PTPRK-210ENST00000415055 KIAA1549LQ6ZVL6 1849 aa4.9□□□□□ -1.63
PTPRK-210ENST00000415055 TNRC6BQ9UPQ9 1833 aaKnown RBP4.9□□□□□ -1.63
PTPRK-210ENST00000415055 CREBBPQ92793 2442 aa4.89□□□□□ -1.63
PTPRK-210ENST00000415055 NOTCH2Q04721 2471 aa4.89□□□□□ -1.63
PTPRK-210ENST00000415055 ARHGEF37A1IGU5 675 aa4.89□□□□□ -1.63
PTPRK-210ENST00000415055 hCG_1984214I3L0E3 225 aa4.89□□□□□ -1.63
PTPRK-210ENST00000415055 ASAP2O43150 1006 aa4.89□□□□□ -1.63
PTPRK-210ENST00000415055 B4GALT5O43286 388 aa4.89□□□□□ -1.63
PTPRK-210ENST00000415055 TRAPPC3O43617 180 aa4.89□□□□□ -1.63
PTPRK-210ENST00000415055 SEC24AO95486 1093 aa4.89□□□□□ -1.63
PTPRK-210ENST00000415055 APBB3O95704 486 aa4.89□□□□□ -1.63
PTPRK-210ENST00000415055 ARF4P18085 180 aaPredicted RBP4.89□□□□□ -1.63
PTPRK-210ENST00000415055 DDIT3P35638 169 aa4.89□□□□□ -1.63
PTPRK-210ENST00000415055 PIK3CBP42338 1070 aa4.89□□□□□ -1.63
PTPRK-210ENST00000415055 PRIM2P49643 509 aa4.89□□□□□ -1.63
PTPRK-210ENST00000415055 HMGA2P52926 109 aa4.89□□□□□ -1.63
PTPRK-210ENST00000415055 MLLT6P55198 1093 aaPredicted RBP4.89□□□□□ -1.63
PTPRK-210ENST00000415055 PSMC5P62195 406 aa4.89□□□□□ -1.63
PTPRK-210ENST00000415055 RAB1AP62820 205 aa4.89□□□□□ -1.63
PTPRK-210ENST00000415055 NKX6-1P78426 367 aaPredicted RBP4.89□□□□□ -1.63
PTPRK-210ENST00000415055 IL13RA1P78552 427 aa4.89□□□□□ -1.63
PTPRK-210ENST00000415055 ROR1Q01973 937 aa4.89□□□□□ -1.63
PTPRK-210ENST00000415055 TWF1Q12792 350 aa4.89□□□□□ -1.63
PTPRK-210ENST00000415055 LMAN2Q12907 356 aa4.89□□□□□ -1.63
PTPRK-210ENST00000415055 TFDP1Q14186 410 aa4.89□□□□□ -1.63
PTPRK-210ENST00000415055 EMC2Q15006 297 aa4.89□□□□□ -1.63
PTPRK-210ENST00000415055 PTPAQ15257 358 aa4.89□□□□□ -1.63
PTPRK-210ENST00000415055 MAPRE1Q15691 268 aaKnown RBP4.89□□□□□ -1.63
PTPRK-210ENST00000415055 ITPRIPL2Q3MIP1 535 aa4.89□□□□□ -1.63
PTPRK-210ENST00000415055 USP39Q53GS9 565 aaKnown RBP4.89□□□□□ -1.63
PTPRK-210ENST00000415055 XKR9Q5GH70 373 aa4.89□□□□□ -1.63
PTPRK-210ENST00000415055 GLRA4Q5JXX5 417 aa4.89□□□□□ -1.63
PTPRK-210ENST00000415055 KANK2Q63ZY3 851 aa4.89□□□□□ -1.63
PTPRK-210ENST00000415055 TLDC1Q6P9B6 456 aa4.89□□□□□ -1.63
PTPRK-210ENST00000415055 SLC27A1Q6PCB7 646 aa4.89□□□□□ -1.63
PTPRK-210ENST00000415055 APOA5Q6Q788 366 aa4.89□□□□□ -1.63
PTPRK-210ENST00000415055 GAREM2Q75VX8 874 aa4.89□□□□□ -1.63
PTPRK-210ENST00000415055 CIR1Q86X95 450 aaPredicted RBP4.89□□□□□ -1.63
PTPRK-210ENST00000415055 ARID3BQ8IVW6 561 aaPredicted RBP4.89□□□□□ -1.63
PTPRK-210ENST00000415055 ZNF713Q8N859 430 aaPredicted RBP4.89□□□□□ -1.63
PTPRK-210ENST00000415055 PNPLA1Q8N8W4 532 aa4.89□□□□□ -1.63
PTPRK-210ENST00000415055 RDM1Q8NG50 284 aa4.89□□□□□ -1.63
PTPRK-210ENST00000415055 ZNF461Q8TAF7 563 aa4.89□□□□□ -1.63
PTPRK-210ENST00000415055 CCDC12Q8WUD4 166 aaPredicted RBP4.89□□□□□ -1.63
PTPRK-210ENST00000415055 TRIM63Q969Q1 353 aa4.89□□□□□ -1.63
PTPRK-210ENST00000415055 MBD6Q96DN6 1003 aa4.89□□□□□ -1.63
PTPRK-210ENST00000415055 RSPRY1Q96DX4 576 aa4.89□□□□□ -1.63
PTPRK-210ENST00000415055 TBATAQ96M53 351 aa4.89□□□□□ -1.63
PTPRK-210ENST00000415055 RIT2Q99578 217 aa4.89□□□□□ -1.63
PTPRK-210ENST00000415055 SCAND2PQ9GZW5 306 aaPredicted RBP4.89□□□□□ -1.63
PTPRK-210ENST00000415055 KLC2Q9H0B6 622 aa4.89□□□□□ -1.63
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 52.8 ms