RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000414963.2

SF3B1-204, Transcript of splicing factor 3b subunit 1, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene SF3B1, Length 651 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SF3B1-204ENST00000414963 MORF4L2Q15014 288 aa14.48□□□□□ -0.09
SF3B1-204ENST00000414963 E2F5Q15329 346 aa14.48□□□□□ -0.09
SF3B1-204ENST00000414963 TRADDQ15628 312 aa14.48□□□□□ -0.09
SF3B1-204ENST00000414963 SLC14A2Q15849 920 aa14.48□□□□□ -0.09
SF3B1-204ENST00000414963 KCTD19Q17RG1 926 aaPredicted RBP14.48□□□□□ -0.09
SF3B1-204ENST00000414963 RALGPS1Q5JS13 557 aa14.48□□□□□ -0.09
SF3B1-204ENST00000414963 RNASEH2BQ5TBB1 312 aaKnown RBP14.48□□□□□ -0.09
SF3B1-204ENST00000414963 NUDT18Q6ZVK8 323 aa14.48□□□□□ -0.09
SF3B1-204ENST00000414963 HOOK3Q86VS8 718 aa14.48□□□□□ -0.09
SF3B1-204ENST00000414963 SH2D3CQ8N5H7 860 aa14.48□□□□□ -0.09
SF3B1-204ENST00000414963 ARRDC2Q8TBH0 407 aa14.48□□□□□ -0.09
SF3B1-204ENST00000414963 USP33Q8TEY7 942 aa14.48□□□□□ -0.09
SF3B1-204ENST00000414963 CPT1BQ92523 772 aa14.48□□□□□ -0.09
SF3B1-204ENST00000414963 ART4Q93070 314 aa14.48□□□□□ -0.09
SF3B1-204ENST00000414963 IMP4Q96G21 291 aaKnown RBP14.48□□□□□ -0.09
SF3B1-204ENST00000414963 P2RY13Q9BPV8 354 aa14.48□□□□□ -0.09
SF3B1-204ENST00000414963 GORASP1Q9BQQ3 440 aa14.48□□□□□ -0.09
SF3B1-204ENST00000414963 CINPQ9BW66 212 aaPredicted RBP14.48□□□□□ -0.09
SF3B1-204ENST00000414963 TRIM31Q9BZY9 425 aa14.48□□□□□ -0.09
SF3B1-204ENST00000414963 POLR1EQ9GZS1 481 aaKnown RBP14.48□□□□□ -0.09
SF3B1-204ENST00000414963 EPC1Q9H2F5 836 aa14.48□□□□□ -0.09
SF3B1-204ENST00000414963 NT5MQ9NPB1 228 aa14.48□□□□□ -0.09
SF3B1-204ENST00000414963 EIF2B3Q9NR50 452 aaKnown RBP14.48□□□□□ -0.09
SF3B1-204ENST00000414963 LHX3Q9UBR4 397 aa14.48□□□□□ -0.09
SF3B1-204ENST00000414963 RSPH14Q9UHP6 348 aa14.48□□□□□ -0.09
SF3B1-204ENST00000414963 SLC25A13Q9UJS0 675 aa14.48□□□□□ -0.09
SF3B1-204ENST00000414963 RAB21Q9UL25 225 aa14.48□□□□□ -0.09
SF3B1-204ENST00000414963 FARP1Q9Y4F1 1045 aaPredicted RBP14.48□□□□□ -0.09
SF3B1-204ENST00000414963 ACTL7AQ9Y615 435 aa14.48□□□□□ -0.09
SF3B1-204ENST00000414963 EYSQ5T1H1 3165 aa14.48□□□□□ -0.09
SF3B1-204ENST00000414963 TBC1D3BA6NDS4 549 aa14.47□□□□□ -0.09
SF3B1-204ENST00000414963 ERI2A8K979 691 aaKnown RBP14.47□□□□□ -0.09
SF3B1-204ENST00000414963 K7ERQ8 282 aa14.47□□□□□ -0.09
SF3B1-204ENST00000414963 PSMD3O43242 534 aa14.47□□□□□ -0.09
SF3B1-204ENST00000414963 SMAD6O43541 496 aaKnown RBP14.47□□□□□ -0.09
SF3B1-204ENST00000414963 ZNF821O75541 412 aaPredicted RBP14.47□□□□□ -0.09
SF3B1-204ENST00000414963 ANXA9O76027 345 aa14.47□□□□□ -0.09
SF3B1-204ENST00000414963 APODP05090 189 aa14.47□□□□□ -0.09
SF3B1-204ENST00000414963 BMP1P13497 986 aa14.47□□□□□ -0.09
SF3B1-204ENST00000414963 PSMB4P28070 264 aa14.47□□□□□ -0.09
SF3B1-204ENST00000414963 SOX9P48436 509 aa14.47□□□□□ -0.09
SF3B1-204ENST00000414963 NUMBP49757 651 aa14.47□□□□□ -0.09
SF3B1-204ENST00000414963 CALCOCO2Q13137 446 aa14.47□□□□□ -0.09
SF3B1-204ENST00000414963 CBLBQ13191 982 aa14.47□□□□□ -0.09
SF3B1-204ENST00000414963 PRPSAP1Q14558 356 aa14.47□□□□□ -0.09
SF3B1-204ENST00000414963 PTPRNQ16849 979 aa14.47□□□□□ -0.09
SF3B1-204ENST00000414963 IZUMO3Q5VZ72 239 aa14.47□□□□□ -0.09
SF3B1-204ENST00000414963 KCTD11Q693B1 232 aa14.47□□□□□ -0.09
SF3B1-204ENST00000414963 NAIF1Q69YI7 327 aaPredicted RBP14.47□□□□□ -0.09
SF3B1-204ENST00000414963 HIBCHQ6NVY1 386 aaPredicted RBP14.47□□□□□ -0.09
SF3B1-204ENST00000414963 ZDHHC24Q6UX98 284 aa14.47□□□□□ -0.09
SF3B1-204ENST00000414963 CCNI2Q6ZMN8 369 aaPredicted RBP14.47□□□□□ -0.09
SF3B1-204ENST00000414963 PPIL6Q8IXY8 311 aa14.47□□□□□ -0.09
SF3B1-204ENST00000414963 NAT8LQ8N9F0 302 aa14.47□□□□□ -0.09
SF3B1-204ENST00000414963 ATP11CQ8NB49 1132 aa14.47□□□□□ -0.09
SF3B1-204ENST00000414963 TSEN2Q8NCE0 465 aaKnown RBP14.47□□□□□ -0.09
SF3B1-204ENST00000414963 KCNV2Q8TDN2 545 aa14.47□□□□□ -0.09
SF3B1-204ENST00000414963 DGCR8Q8WYQ5 773 aaKnown RBP eCLIP14.47□□□□□ -0.09
SF3B1-204ENST00000414963 MYO19Q96H55 970 aa14.47□□□□□ -0.09
SF3B1-204ENST00000414963 HINFPQ9BQA5 517 aa14.47□□□□□ -0.09
SF3B1-204ENST00000414963 PARD6BQ9BYG5 372 aa14.47□□□□□ -0.09
SF3B1-204ENST00000414963 DPH5Q9H2P9 285 aa14.47□□□□□ -0.09
SF3B1-204ENST00000414963 FBRSL1Q9HCM7 1045 aaKnown RBP14.47□□□□□ -0.09
SF3B1-204ENST00000414963 VPS45Q9NRW7 570 aa14.47□□□□□ -0.09
SF3B1-204ENST00000414963 ZDHHC18Q9NUE0 388 aa14.47□□□□□ -0.09
SF3B1-204ENST00000414963 ANAPC5Q9UJX4 755 aa14.47□□□□□ -0.09
SF3B1-204ENST00000414963 DUSP12Q9UNI6 340 aa14.47□□□□□ -0.09
SF3B1-204ENST00000414963 SHOC2Q9UQ13 582 aa14.47□□□□□ -0.09
SF3B1-204ENST00000414963 AAR2Q9Y312 384 aaKnown RBP14.47□□□□□ -0.09
SF3B1-204ENST00000414963 PIAS3Q9Y6X2 628 aa14.47□□□□□ -0.09
SF3B1-204ENST00000414963 COL4A2P08572 1712 aa14.46□□□□□ -0.09
SF3B1-204ENST00000414963 ESYT3A0FGR9 886 aa14.46□□□□□ -0.09
SF3B1-204ENST00000414963 NPC1O15118 1278 aa14.46□□□□□ -0.09
SF3B1-204ENST00000414963 NARSO43776 548 aaKnown RBP14.46□□□□□ -0.09
SF3B1-204ENST00000414963 SUN1O94901 812 aa14.46□□□□□ -0.09
SF3B1-204ENST00000414963 MMP2P08253 660 aa14.46□□□□□ -0.09
SF3B1-204ENST00000414963 TPSB2P20231 275 aa14.46□□□□□ -0.09
SF3B1-204ENST00000414963 NNMTP40261 264 aa14.46□□□□□ -0.09
SF3B1-204ENST00000414963 CARSP49589 748 aaKnown RBP14.46□□□□□ -0.09
SF3B1-204ENST00000414963 STK19P49842 368 aaPredicted RBP14.46□□□□□ -0.09
SF3B1-204ENST00000414963 ITGA8P53708 1063 aa14.46□□□□□ -0.09
SF3B1-204ENST00000414963 KDSRQ06136 332 aa14.46□□□□□ -0.09
SF3B1-204ENST00000414963 NIPAL4Q0D2K0 466 aa14.46□□□□□ -0.09
SF3B1-204ENST00000414963 KCNJ11Q14654 390 aa14.46□□□□□ -0.09
SF3B1-204ENST00000414963 TPSAB1Q15661 275 aa14.46□□□□□ -0.09
SF3B1-204ENST00000414963 ELF2Q15723 593 aa14.46□□□□□ -0.09
SF3B1-204ENST00000414963 SLC44A4Q53GD3 710 aa14.46□□□□□ -0.09
SF3B1-204ENST00000414963 TMEM196Q5HYL7 178 aa14.46□□□□□ -0.09
SF3B1-204ENST00000414963 DGKKQ5KSL6 1271 aa14.46□□□□□ -0.09
SF3B1-204ENST00000414963 FAM182AQ5T1J6 154 aa14.46□□□□□ -0.09
SF3B1-204ENST00000414963 PRPF39Q86UA1 669 aaKnown RBP14.46□□□□□ -0.09
SF3B1-204ENST00000414963 PCDH20Q8N6Y1 951 aaKnown RBP14.46□□□□□ -0.09
SF3B1-204ENST00000414963 MCUQ8NE86 351 aa14.46□□□□□ -0.09
SF3B1-204ENST00000414963 FRS2Q8WU20 508 aa14.46□□□□□ -0.09
SF3B1-204ENST00000414963 UCMAQ8WVF2 138 aa14.46□□□□□ -0.09
SF3B1-204ENST00000414963 OXNAD1Q96HP4 312 aaPredicted RBP14.46□□□□□ -0.09
SF3B1-204ENST00000414963 RPL10LQ96L21 214 aaKnown RBP14.46□□□□□ -0.09
SF3B1-204ENST00000414963 NUDCD1Q96RS6 583 aa14.46□□□□□ -0.09
SF3B1-204ENST00000414963 SEMA3CQ99985 751 aa14.46□□□□□ -0.09
SF3B1-204ENST00000414963 FOXP3Q9BZS1 431 aa14.46□□□□□ -0.09
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 52.8 ms