RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000402738.5

HERC3-202, Transcript of HECT and RLD domain containing E3 ubiquitin protein ligase 3, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene HERC3, Length 4,974 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERC3-202ENST00000402738 G3V2T6 193 aa9.91□□□□□ -0.82
HERC3-202ENST00000402738 CYP7B1O75881 506 aa9.91□□□□□ -0.82
HERC3-202ENST00000402738 GABBR2O75899 941 aa9.91□□□□□ -0.82
HERC3-202ENST00000402738 NOL4O94818 638 aa9.91□□□□□ -0.82
HERC3-202ENST00000402738 SLITRK3O94933 977 aa9.91□□□□□ -0.82
HERC3-202ENST00000402738 NPR3P17342 541 aa9.91□□□□□ -0.82
HERC3-202ENST00000402738 TAL1P17542 331 aaPredicted RBP9.91□□□□□ -0.82
HERC3-202ENST00000402738 WARSP23381 471 aaKnown RBP9.91□□□□□ -0.82
HERC3-202ENST00000402738 PSMB4P28070 264 aa9.91□□□□□ -0.82
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HERC3-202ENST00000402738 PFKFB4Q16877 469 aa9.91□□□□□ -0.82
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HERC3-202ENST00000402738 IL27RAQ6UWB1 636 aa9.91□□□□□ -0.82
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HERC3-202ENST00000402738 TPK1Q9H3S4 243 aa9.91□□□□□ -0.82
HERC3-202ENST00000402738 CCNB1IP1Q9NPC3 277 aa9.91□□□□□ -0.82
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HERC3-202ENST00000402738 ENOPH1Q9UHY7 261 aa9.91□□□□□ -0.82
HERC3-202ENST00000402738 KIAA1257Q9ULG3 409 aa9.91□□□□□ -0.82
HERC3-202ENST00000402738 U3KQV3 271 aa9.91□□□□□ -0.82
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HERC3-202ENST00000402738 H0Y858 1186 aa9.9□□□□□ -0.82
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HERC3-202ENST00000402738 POLR2EP19388 210 aaKnown RBP9.9□□□□□ -0.82
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HERC3-202ENST00000402738 TUBA3EQ6PEY2 450 aa9.9□□□□□ -0.82
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HERC3-202ENST00000402738 SMARCAD1Q9H4L7 1026 aa9.9□□□□□ -0.82
HERC3-202ENST00000402738 NT5MQ9NPB1 228 aa9.9□□□□□ -0.82
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HERC3-202ENST00000402738 RBM22Q9NW64 420 aaKnown RBP eCLIP9.9□□□□□ -0.82
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HERC3-202ENST00000402738 ZC3H4Q9UPT8 1303 aaKnown RBP9.9□□□□□ -0.82
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HERC3-202ENST00000402738 S100A3P33764 101 aa9.9□□□□□ -0.82
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HERC3-202ENST00000402738 MAD2L1Q13257 205 aaPredicted RBP9.9□□□□□ -0.82
HERC3-202ENST00000402738 USP39Q53GS9 565 aaKnown RBP9.9□□□□□ -0.82
HERC3-202ENST00000402738 ATAD3BQ5T9A4 648 aa9.9□□□□□ -0.82
HERC3-202ENST00000402738 TUBA1AQ71U36 451 aa9.9□□□□□ -0.82
HERC3-202ENST00000402738 WDR49Q8IV35 697 aa9.9□□□□□ -0.82
HERC3-202ENST00000402738 DCPSQ96C86 337 aaKnown RBP9.9□□□□□ -0.82
HERC3-202ENST00000402738 PNPLA8Q9NP80 782 aa9.9□□□□□ -0.82
HERC3-202ENST00000402738 PRMT7Q9NVM4 692 aaPredicted RBP9.9□□□□□ -0.82
HERC3-202ENST00000402738 ZSCAN32Q9NX65 697 aa9.9□□□□□ -0.82
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HERC3-202ENST00000402738 SPTLC1O15269 473 aa9.9□□□□□ -0.82
HERC3-202ENST00000402738 ZBTB24O43167 697 aaPredicted RBP9.9□□□□□ -0.82
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HERC3-202ENST00000402738 CD4P01730 458 aa9.9□□□□□ -0.82
HERC3-202ENST00000402738 ARHGEF7Q14155 803 aa9.9□□□□□ -0.82
HERC3-202ENST00000402738 ERICH5Q6P6B1 374 aa9.9□□□□□ -0.82
HERC3-202ENST00000402738 PIWIL4Q7Z3Z4 852 aaKnown RBP9.9□□□□□ -0.82
HERC3-202ENST00000402738 P2RY8Q86VZ1 359 aa9.9□□□□□ -0.82
HERC3-202ENST00000402738 SAMD3Q8N6K7 520 aa9.9□□□□□ -0.82
HERC3-202ENST00000402738 CRISPLD1Q9H336 500 aa9.9□□□□□ -0.82
HERC3-202ENST00000402738 SH3BP4Q9P0V3 963 aa9.9□□□□□ -0.82
HERC3-202ENST00000402738 POLIQ9UNA4 740 aa9.9□□□□□ -0.82
HERC3-202ENST00000402738 RNF17Q9BXT8 1623 aaKnown RBP9.9□□□□□ -0.83
HERC3-202ENST00000402738 EML1O00423 815 aa9.9□□□□□ -0.83
HERC3-202ENST00000402738 OR6B1O95007 311 aa9.9□□□□□ -0.83
HERC3-202ENST00000402738 FECHP22830 423 aa9.9□□□□□ -0.83
HERC3-202ENST00000402738 DSG3P32926 999 aa9.9□□□□□ -0.83
HERC3-202ENST00000402738 CRHR1P34998 444 aa9.9□□□□□ -0.83
HERC3-202ENST00000402738 CENPAP49450 140 aa9.9□□□□□ -0.83
HERC3-202ENST00000402738 ENTPD1P49961 510 aa9.9□□□□□ -0.83
HERC3-202ENST00000402738 C15orf59Q2T9L4 293 aaPredicted RBP9.9□□□□□ -0.83
HERC3-202ENST00000402738 SDE2Q6IQ49 451 aa9.9□□□□□ -0.83
HERC3-202ENST00000402738 EFCAB12Q6NXP0 572 aa9.9□□□□□ -0.83
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