RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000400183.6

USP25-204, Transcript of ubiquitin specific peptidase 25, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene USP25, Length 5,341 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP25-204ENST00000400183 AADACL2Q6P093 401 aa18.72■□□□□ 0.59
USP25-204ENST00000400183 USP50Q70EL3 339 aaPredicted RBP18.72■□□□□ 0.59
USP25-204ENST00000400183 ALLCQ8N6M5 410 aa18.72■□□□□ 0.59
USP25-204ENST00000400183 PCDH20Q8N6Y1 951 aaKnown RBP18.72■□□□□ 0.59
USP25-204ENST00000400183 PTGR2Q8N8N7 351 aaPredicted RBP18.72■□□□□ 0.59
USP25-204ENST00000400183 SLITRK2Q9H156 845 aa18.72■□□□□ 0.59
USP25-204ENST00000400183 CDT1Q9H211 546 aa18.72■□□□□ 0.59
USP25-204ENST00000400183 FAM198AQ9UFP1 575 aa18.72■□□□□ 0.59
USP25-204ENST00000400183 ZMYND8Q9ULU4 1186 aaPredicted RBP18.72■□□□□ 0.59
USP25-204ENST00000400183 CCNB1P14635 433 aa18.72■□□□□ 0.59
USP25-204ENST00000400183 PAX3P23760 479 aa18.72■□□□□ 0.59
USP25-204ENST00000400183 INO80DQ53TQ3 878 aaPredicted RBP18.72■□□□□ 0.59
USP25-204ENST00000400183 ZNF276Q8N554 614 aa18.72■□□□□ 0.59
USP25-204ENST00000400183 GLIS3Q8NEA6 775 aa18.72■□□□□ 0.59
USP25-204ENST00000400183 ACP6Q9NPH0 428 aa18.72■□□□□ 0.59
USP25-204ENST00000400183 BCL9O00512 1426 aa18.72■□□□□ 0.59
USP25-204ENST00000400183 SGTAO43765 313 aa18.72■□□□□ 0.59
USP25-204ENST00000400183 CXCR2P25025 360 aa18.72■□□□□ 0.59
USP25-204ENST00000400183 SHC3Q92529 594 aa18.72■□□□□ 0.59
USP25-204ENST00000400183 ELMO1Q92556 727 aa18.72■□□□□ 0.59
USP25-204ENST00000400183 AHCYL2Q96HN2 611 aaKnown RBP18.72■□□□□ 0.59
USP25-204ENST00000400183 ZYG11BQ9C0D3 744 aa18.72■□□□□ 0.59
USP25-204ENST00000400183 FAM237AA0A1B0GTK4 181 aa18.71■□□□□ 0.59
USP25-204ENST00000400183 KPNA5O15131 536 aa18.71■□□□□ 0.59
USP25-204ENST00000400183 MRPS22P82650 360 aaKnown RBP18.71■□□□□ 0.59
USP25-204ENST00000400183 CXCL17Q6UXB2 119 aa18.71■□□□□ 0.59
USP25-204ENST00000400183 ZNF670Q9BS34 389 aa18.71■□□□□ 0.59
USP25-204ENST00000400183 RNF208Q9H0X6 261 aa18.71■□□□□ 0.59
USP25-204ENST00000400183 ETAA1Q9NY74 926 aa18.71■□□□□ 0.59
USP25-204ENST00000400183 MEIS2O14770 477 aa18.71■□□□□ 0.59
USP25-204ENST00000400183 STX11O75558 287 aa18.71■□□□□ 0.59
USP25-204ENST00000400183 TSPAN19P0C672 248 aa18.71■□□□□ 0.59
USP25-204ENST00000400183 TTPAP49638 278 aa18.71■□□□□ 0.59
USP25-204ENST00000400183 ATP12AP54707 1039 aa18.71■□□□□ 0.59
USP25-204ENST00000400183 CSNK2BP67870 215 aa18.71■□□□□ 0.59
USP25-204ENST00000400183 IRGCQ6NXR0 463 aa18.71■□□□□ 0.59
USP25-204ENST00000400183 KRT77Q7Z794 578 aa18.71■□□□□ 0.59
USP25-204ENST00000400183 PALB2Q86YC2 1186 aa18.71■□□□□ 0.59
USP25-204ENST00000400183 SLC41A1Q8IVJ1 513 aa18.71■□□□□ 0.59
USP25-204ENST00000400183 ZNF655Q8N720 491 aaPredicted RBP18.71■□□□□ 0.59
USP25-204ENST00000400183 DCUN1D5Q9BTE7 237 aa18.71■□□□□ 0.59
USP25-204ENST00000400183 C2CD2Q9Y426 696 aa18.71■□□□□ 0.59
USP25-204ENST00000400183 NCANO14594 1321 aa18.71■□□□□ 0.59
USP25-204ENST00000400183 ABHD2P08910 425 aa18.71■□□□□ 0.59
USP25-204ENST00000400183 ENO2P09104 434 aaPredicted RBP18.71■□□□□ 0.59
USP25-204ENST00000400183 TNFRSF8P28908 595 aa18.71■□□□□ 0.59
USP25-204ENST00000400183 CHKAP35790 457 aa18.71■□□□□ 0.59
USP25-204ENST00000400183 C16orf72Q14CZ0 275 aa18.71■□□□□ 0.59
USP25-204ENST00000400183 DGUOKQ16854 277 aa18.71■□□□□ 0.59
USP25-204ENST00000400183 SPANXN2Q5MJ10 180 aa18.71■□□□□ 0.59
USP25-204ENST00000400183 AFTPHQ6ULP2 937 aa18.71■□□□□ 0.59
USP25-204ENST00000400183 COMMD2Q86X83 199 aa18.71■□□□□ 0.59
USP25-204ENST00000400183 PHF13Q86YI8 300 aaPredicted RBP18.71■□□□□ 0.59
USP25-204ENST00000400183 COPS5Q92905 334 aa18.71■□□□□ 0.59
USP25-204ENST00000400183 ZNF558Q96NG5 402 aa18.71■□□□□ 0.59
USP25-204ENST00000400183 ARHGEF3Q9NR81 526 aa18.71■□□□□ 0.59
USP25-204ENST00000400183 FBXO6Q9NRD1 293 aaPredicted RBP18.71■□□□□ 0.59
USP25-204ENST00000400183 RNF19AQ9NV58 838 aa18.71■□□□□ 0.59
USP25-204ENST00000400183 DAPK2Q9UIK4 370 aa18.71■□□□□ 0.59
USP25-204ENST00000400183 TRIM17Q9Y577 477 aa18.71■□□□□ 0.59
USP25-204ENST00000400183 MSCO60682 206 aa18.71■□□□□ 0.59
USP25-204ENST00000400183 MLYCDO95822 493 aa18.71■□□□□ 0.59
USP25-204ENST00000400183 CRADDP78560 199 aa18.71■□□□□ 0.59
USP25-204ENST00000400183 ZNF618Q5T7W0 954 aa18.71■□□□□ 0.59
USP25-204ENST00000400183 C16orf62Q7Z3J2 963 aa18.71■□□□□ 0.59
USP25-204ENST00000400183 MOSPD2Q8NHP6 518 aa18.71■□□□□ 0.59
USP25-204ENST00000400183 LNX1Q8TBB1 728 aaPredicted RBP18.71■□□□□ 0.59
USP25-204ENST00000400183 AGAP11Q8TF27 550 aa18.71■□□□□ 0.59
USP25-204ENST00000400183 DNAJC19Q96DA6 116 aa18.71■□□□□ 0.59
USP25-204ENST00000400183 MTFMTQ96DP5 389 aaKnown RBP18.71■□□□□ 0.59
USP25-204ENST00000400183 ZNF184Q99676 751 aaPredicted RBP18.71■□□□□ 0.59
USP25-204ENST00000400183 PAIP1Q9H074 479 aaKnown RBP18.71■□□□□ 0.59
USP25-204ENST00000400183 TRAV19A0A0A6YYK7 116 aa18.7■□□□□ 0.58
USP25-204ENST00000400183 ADCY6O43306 1168 aa18.7■□□□□ 0.58
USP25-204ENST00000400183 ITGAVP06756 1048 aa18.7■□□□□ 0.58
USP25-204ENST00000400183 BBS12Q6ZW61 710 aa18.7■□□□□ 0.58
USP25-204ENST00000400183 CAMK1DQ8IU85 385 aa18.7■□□□□ 0.58
USP25-204ENST00000400183 ACO2Q99798 780 aaKnown RBP18.7■□□□□ 0.58
USP25-204ENST00000400183 LRRC19Q9H756 370 aa18.7■□□□□ 0.58
USP25-204ENST00000400183 DDX18Q9NVP1 670 aaKnown RBP18.7■□□□□ 0.58
USP25-204ENST00000400183 BTNL10A8MVZ5 291 aa18.7■□□□□ 0.58
USP25-204ENST00000400183 MRPS6P82932 125 aaKnown RBP18.7■□□□□ 0.58
USP25-204ENST00000400183 PPIDQ08752 370 aaKnown RBP18.7■□□□□ 0.58
USP25-204ENST00000400183 BHLHE22Q8NFJ8 381 aaPredicted RBP18.7■□□□□ 0.58
USP25-204ENST00000400183 ACMSDQ8TDX5 336 aa18.7■□□□□ 0.58
USP25-204ENST00000400183 SEMA6AQ9H2E6 1030 aa18.7■□□□□ 0.58
USP25-204ENST00000400183 PRDM12Q9H4Q4 367 aa18.7■□□□□ 0.58
USP25-204ENST00000400183 HES2Q9Y543 173 aa18.7■□□□□ 0.58
USP25-204ENST00000400183 OR6A2O95222 327 aa18.7■□□□□ 0.58
USP25-204ENST00000400183 HDCP19113 662 aa18.7■□□□□ 0.58
USP25-204ENST00000400183 CCR4P51679 360 aa18.7■□□□□ 0.58
USP25-204ENST00000400183 RHBDL3P58872 404 aa18.7■□□□□ 0.58
USP25-204ENST00000400183 TIMM50Q3ZCQ8 353 aa18.7■□□□□ 0.58
USP25-204ENST00000400183 PLPPR4Q7Z2D5 763 aa18.7■□□□□ 0.58
USP25-204ENST00000400183 VGLL2Q8N8G2 317 aa18.7■□□□□ 0.58
USP25-204ENST00000400183 GRIN3AQ8TCU5 1115 aa18.7■□□□□ 0.58
USP25-204ENST00000400183 CXorf40AQ8TE69 158 aa18.7■□□□□ 0.58
USP25-204ENST00000400183 TRIM8Q9BZR9 551 aa18.7■□□□□ 0.58
USP25-204ENST00000400183 A0A0U1RQJ8 604 aa18.7■□□□□ 0.58
USP25-204ENST00000400183 SMIM10L2AP0DMW4 78 aa18.7■□□□□ 0.58
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 68.4 ms