RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000395788.3

C6orf48-208, Transcript of chromosome 6 open reading frame 48, humanhuman

APPRIS P1 TSL 2 BASIC

Gene C6orf48, Length 815 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C6orf48-208ENST00000395788 BTG3Q14201 252 aaPredicted RBP6.16□□□□□ -1.42
C6orf48-208ENST00000395788 LONRF1Q17RB8 773 aa6.16□□□□□ -1.42
C6orf48-208ENST00000395788 TEX44Q53QW1 395 aa6.16□□□□□ -1.42
C6orf48-208ENST00000395788 STEAP4Q687X5 459 aa6.16□□□□□ -1.42
C6orf48-208ENST00000395788 KCTD11Q693B1 232 aa6.16□□□□□ -1.42
C6orf48-208ENST00000395788 LRRC8BQ6P9F7 803 aa6.16□□□□□ -1.42
C6orf48-208ENST00000395788 ARHGEF18Q6ZSZ5 1173 aa6.16□□□□□ -1.42
C6orf48-208ENST00000395788 C14orf80Q86SX3 495 aa6.16□□□□□ -1.42
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C6orf48-208ENST00000395788 TCEAL8Q8IYN2 117 aa6.16□□□□□ -1.42
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C6orf48-208ENST00000395788 ZNF567Q8N184 647 aa6.16□□□□□ -1.42
C6orf48-208ENST00000395788 STKLD1Q8NE28 680 aa6.16□□□□□ -1.42
C6orf48-208ENST00000395788 PDZD8Q8NEN9 1154 aa6.16□□□□□ -1.42
C6orf48-208ENST00000395788 GIMAP7Q8NHV1 300 aa6.16□□□□□ -1.42
C6orf48-208ENST00000395788 PYROXD1Q8WU10 500 aa6.16□□□□□ -1.42
C6orf48-208ENST00000395788 TMEM169Q96HH4 297 aa6.16□□□□□ -1.42
C6orf48-208ENST00000395788 BTN2A3PQ96KV6 586 aa6.16□□□□□ -1.42
C6orf48-208ENST00000395788 TEKT5Q96M29 485 aa6.16□□□□□ -1.42
C6orf48-208ENST00000395788 IL12RB2Q99665 862 aa6.16□□□□□ -1.42
C6orf48-208ENST00000395788 SEPT5Q99719 369 aaPredicted RBP6.16□□□□□ -1.42
C6orf48-208ENST00000395788 FERMT1Q9BQL6 677 aa6.16□□□□□ -1.42
C6orf48-208ENST00000395788 GORASP1Q9BQQ3 440 aa6.16□□□□□ -1.42
C6orf48-208ENST00000395788 CCDC77Q9BR77 488 aa6.16□□□□□ -1.42
C6orf48-208ENST00000395788 NOL6Q9H6R4 1146 aaKnown RBP6.16□□□□□ -1.42
C6orf48-208ENST00000395788 CATSPERBQ9H7T0 1116 aa6.16□□□□□ -1.42
C6orf48-208ENST00000395788 CNOT10Q9H9A5 744 aaKnown RBP6.16□□□□□ -1.42
C6orf48-208ENST00000395788 XAB2Q9HCS7 855 aaKnown RBP6.16□□□□□ -1.42
C6orf48-208ENST00000395788 APOBEC3CQ9NRW3 190 aaKnown RBP eCLIP6.16□□□□□ -1.42
C6orf48-208ENST00000395788 TMEM248Q9NWD8 314 aa6.16□□□□□ -1.42
C6orf48-208ENST00000395788 KCNK4Q9NYG8 393 aa6.16□□□□□ -1.42
C6orf48-208ENST00000395788 GREB1Q4ZG55 1949 aa6.16□□□□□ -1.42
C6orf48-208ENST00000395788 GOLGA8MH3BSY2 632 aa6.15□□□□□ -1.42
C6orf48-208ENST00000395788 TLR5O60602 858 aa6.15□□□□□ -1.42
C6orf48-208ENST00000395788 MAFKO60675 156 aa6.15□□□□□ -1.42
C6orf48-208ENST00000395788 BANF1O75531 89 aa6.15□□□□□ -1.42
C6orf48-208ENST00000395788 ALDH1A2O94788 518 aa6.15□□□□□ -1.42
C6orf48-208ENST00000395788 STK10O94804 968 aaKnown RBP6.15□□□□□ -1.42
C6orf48-208ENST00000395788 GJB5O95377 273 aa6.15□□□□□ -1.42
C6orf48-208ENST00000395788 AP2A1O95782 977 aa6.15□□□□□ -1.42
C6orf48-208ENST00000395788 OLFM2O95897 454 aa6.15□□□□□ -1.42
C6orf48-208ENST00000395788 TBX18O95935 607 aa6.15□□□□□ -1.42
C6orf48-208ENST00000395788 PEX11BO96011 259 aa6.15□□□□□ -1.42
C6orf48-208ENST00000395788 APRTP07741 180 aa6.15□□□□□ -1.42
C6orf48-208ENST00000395788 CSH1P0DML2 217 aa6.15□□□□□ -1.42
C6orf48-208ENST00000395788 CSH2P0DML3 217 aa6.15□□□□□ -1.42
C6orf48-208ENST00000395788 CTSAP10619 480 aa6.15□□□□□ -1.42
C6orf48-208ENST00000395788 RPL17P18621 184 aaKnown RBP6.15□□□□□ -1.42
C6orf48-208ENST00000395788 PRKCHP24723 683 aa6.15□□□□□ -1.42
C6orf48-208ENST00000395788 ATP5DP30049 168 aa6.15□□□□□ -1.42
C6orf48-208ENST00000395788 PHBP35232 272 aa6.15□□□□□ -1.42
C6orf48-208ENST00000395788 BUD31P41223 144 aaPredicted RBP6.15□□□□□ -1.42
C6orf48-208ENST00000395788 ELK3P41970 407 aa6.15□□□□□ -1.42
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C6orf48-208ENST00000395788 EFEMP1Q12805 493 aa6.15□□□□□ -1.42
C6orf48-208ENST00000395788 IFRD2Q12894 506 aaPredicted RBP6.15□□□□□ -1.42
C6orf48-208ENST00000395788 ZBTB17Q13105 803 aa6.15□□□□□ -1.42
C6orf48-208ENST00000395788 PPIGQ13427 754 aaKnown RBP eCLIP6.15□□□□□ -1.422e-7■□□□□ 10.7
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C6orf48-208ENST00000395788 MS4A13Q5J8X5 152 aa6.15□□□□□ -1.42
C6orf48-208ENST00000395788 C10orf120Q5SQS8 335 aa6.15□□□□□ -1.42
C6orf48-208ENST00000395788 FAXCQ5TGI0 409 aa6.15□□□□□ -1.42
C6orf48-208ENST00000395788 ARMC3Q5W041 872 aa6.15□□□□□ -1.42
C6orf48-208ENST00000395788 NUGGCQ68CJ6 796 aa6.15□□□□□ -1.42
C6orf48-208ENST00000395788 ZNF449Q6P9G9 518 aa6.15□□□□□ -1.42
C6orf48-208ENST00000395788 C3orf62Q6ZUJ4 267 aa6.15□□□□□ -1.42
C6orf48-208ENST00000395788 TADA2BQ86TJ2 420 aa6.15□□□□□ -1.42
C6orf48-208ENST00000395788 CCNJLQ8IV13 435 aa6.15□□□□□ -1.42
C6orf48-208ENST00000395788 CNTD1Q8N815 330 aa6.15□□□□□ -1.42
C6orf48-208ENST00000395788 ATP6V0D2Q8N8Y2 350 aa6.15□□□□□ -1.42
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C6orf48-208ENST00000395788 GPR152Q8TDT2 470 aa6.15□□□□□ -1.42
C6orf48-208ENST00000395788 MZB1Q8WU39 189 aa6.15□□□□□ -1.42
C6orf48-208ENST00000395788 RNF34Q969K3 372 aa6.15□□□□□ -1.42
C6orf48-208ENST00000395788 EBNA1BP2Q99848 306 aaKnown RBP6.15□□□□□ -1.42
C6orf48-208ENST00000395788 CAPS2Q9BXY5 557 aa6.15□□□□□ -1.42
C6orf48-208ENST00000395788 SLC39A8Q9C0K1 460 aa6.15□□□□□ -1.42
C6orf48-208ENST00000395788 ZBP1Q9H171 429 aa6.15□□□□□ -1.42
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C6orf48-208ENST00000395788 MARCH2Q9P0N8 246 aa6.15□□□□□ -1.42
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C6orf48-208ENST00000395788 NUDT5Q9UKK9 219 aa6.15□□□□□ -1.42
C6orf48-208ENST00000395788 SSX2IPQ9Y2D8 614 aa6.15□□□□□ -1.42
C6orf48-208ENST00000395788 HIF3AQ9Y2N7 669 aa6.15□□□□□ -1.42
C6orf48-208ENST00000395788 TTLL3Q9Y4R7 772 aa6.15□□□□□ -1.42
C6orf48-208ENST00000395788 YIPF1Q9Y548 306 aa6.15□□□□□ -1.42
C6orf48-208ENST00000395788 NR2E3Q9Y5X4 410 aa6.15□□□□□ -1.42
C6orf48-208ENST00000395788 IRAK3Q9Y616 596 aa6.15□□□□□ -1.42
C6orf48-208ENST00000395788 DYNC1LI1Q9Y6G9 523 aaKnown RBP6.15□□□□□ -1.42
C6orf48-208ENST00000395788 EXOC1LA0A1B0GW35 172 aa6.14□□□□□ -1.43
C6orf48-208ENST00000395788 TCRBV9S1A1TA0A576 114 aa6.14□□□□□ -1.43
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