RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000393537.4

ANKRD39-201, Transcript of ankyrin repeat domain 39, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene ANKRD39, Length 976 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ANKRD39-201ENST00000393537 YBEYP58557 167 aaPredicted RBP20.61■□□□□ 0.89
ANKRD39-201ENST00000393537 NFKBIBQ15653 356 aa20.61■□□□□ 0.89
ANKRD39-201ENST00000393537 KCNT1Q5JUK3 1230 aa20.61■□□□□ 0.89
ANKRD39-201ENST00000393537 ERMARDQ5T6L9 678 aa20.61■□□□□ 0.89
ANKRD39-201ENST00000393537 PRPF39Q86UA1 669 aaKnown RBP20.61■□□□□ 0.89
ANKRD39-201ENST00000393537 RYBPQ8N488 228 aaPredicted RBP20.61■□□□□ 0.89
ANKRD39-201ENST00000393537 RNF214Q8ND24 703 aa20.61■□□□□ 0.89
ANKRD39-201ENST00000393537 ISG20Q96AZ6 181 aaKnown RBP20.61■□□□□ 0.89
ANKRD39-201ENST00000393537 HMCESQ96FZ2 354 aa20.61■□□□□ 0.89
ANKRD39-201ENST00000393537 PPP1R16AQ96I34 528 aa20.61■□□□□ 0.89
ANKRD39-201ENST00000393537 SERAC1Q96JX3 654 aa20.61■□□□□ 0.89
ANKRD39-201ENST00000393537 TM7SF3Q9NS93 570 aa20.61■□□□□ 0.89
ANKRD39-201ENST00000393537 SPAARA0A1B0GVQ0 90 aa20.6■□□□□ 0.89
ANKRD39-201ENST00000393537 ZSCAN5CA6NGD5 496 aaPredicted RBP20.6■□□□□ 0.89
ANKRD39-201ENST00000393537 EIF3CLB5ME19 914 aaKnown RBP20.6■□□□□ 0.89
ANKRD39-201ENST00000393537 EEF2KO00418 725 aaKnown RBP20.6■□□□□ 0.89
ANKRD39-201ENST00000393537 KCNK3O14649 394 aa20.6■□□□□ 0.89
ANKRD39-201ENST00000393537 WNT9AO14904 365 aa20.6■□□□□ 0.89
ANKRD39-201ENST00000393537 VILLO15195 856 aa20.6■□□□□ 0.89
ANKRD39-201ENST00000393537 CBFA2T2O43439 604 aa20.6■□□□□ 0.89
ANKRD39-201ENST00000393537 BUB1O43683 1085 aa20.6■□□□□ 0.89
ANKRD39-201ENST00000393537 SH3BP5O60239 455 aa20.6■□□□□ 0.89
ANKRD39-201ENST00000393537 LRCH4O75427 683 aa20.6■□□□□ 0.89
ANKRD39-201ENST00000393537 ZNF883P0CG24 379 aa20.6■□□□□ 0.89
ANKRD39-201ENST00000393537 PMLP29590 882 aa20.6■□□□□ 0.89
ANKRD39-201ENST00000393537 C21orf59P57076 290 aa20.6■□□□□ 0.89
ANKRD39-201ENST00000393537 CCDC15Q0P6D6 951 aa20.6■□□□□ 0.89
ANKRD39-201ENST00000393537 ERN2Q76MJ5 926 aaKnown RBP20.6■□□□□ 0.89
ANKRD39-201ENST00000393537 TRIM69Q86WT6 500 aa20.6■□□□□ 0.89
ANKRD39-201ENST00000393537 UMODL1-AS1Q8N2C9 162 aa20.6■□□□□ 0.89
ANKRD39-201ENST00000393537 OR6K2Q8NGY2 324 aa20.6■□□□□ 0.89
ANKRD39-201ENST00000393537 CAMK1GQ96NX5 476 aa20.6■□□□□ 0.89
ANKRD39-201ENST00000393537 KCTD15Q96SI1 283 aaPredicted RBP20.6■□□□□ 0.89
ANKRD39-201ENST00000393537 EIF3CQ99613 913 aaKnown RBP20.6■□□□□ 0.89
ANKRD39-201ENST00000393537 KLC2Q9H0B6 622 aa20.6■□□□□ 0.89
ANKRD39-201ENST00000393537 THAP2Q9H0W7 228 aa20.6■□□□□ 0.89
ANKRD39-201ENST00000393537 ZDHHC6Q9H6R6 413 aa20.6■□□□□ 0.89
ANKRD39-201ENST00000393537 PREBQ9HCU5 417 aa20.6■□□□□ 0.89
ANKRD39-201ENST00000393537 ARHGAP20Q9P2F6 1191 aa20.6■□□□□ 0.89
ANKRD39-201ENST00000393537 RNGTTO60942 597 aaKnown RBP20.59■□□□□ 0.89
ANKRD39-201ENST00000393537 WNT1P04628 370 aa20.59■□□□□ 0.89
ANKRD39-201ENST00000393537 CD38P28907 300 aa20.59■□□□□ 0.89
ANKRD39-201ENST00000393537 CTSKP43235 329 aa20.59■□□□□ 0.89
ANKRD39-201ENST00000393537 PARP15Q460N3 678 aa20.59■□□□□ 0.89
ANKRD39-201ENST00000393537 NAPEPLDQ6IQ20 393 aa20.59■□□□□ 0.89
ANKRD39-201ENST00000393537 CYP4V2Q6ZWL3 525 aaPredicted RBP20.59■□□□□ 0.89
ANKRD39-201ENST00000393537 NAXDQ8IW45 347 aa20.59■□□□□ 0.89
ANKRD39-201ENST00000393537 SKA1Q96BD8 255 aa20.59■□□□□ 0.89
ANKRD39-201ENST00000393537 HDAC8Q9BY41 377 aa20.59■□□□□ 0.89
ANKRD39-201ENST00000393537 A0A1W2PR77 199 aa20.58■□□□□ 0.89
ANKRD39-201ENST00000393537 H0Y8X5 98 aa20.58■□□□□ 0.89
ANKRD39-201ENST00000393537 TMCC1O94876 653 aa20.58■□□□□ 0.89
ANKRD39-201ENST00000393537 GSRP00390 522 aa20.58■□□□□ 0.89
ANKRD39-201ENST00000393537 ITGB7P26010 798 aa20.58■□□□□ 0.89
ANKRD39-201ENST00000393537 GKP32189 559 aa20.58■□□□□ 0.89
ANKRD39-201ENST00000393537 SNRPD1P62314 119 aaKnown RBP20.58■□□□□ 0.89
ANKRD39-201ENST00000393537 FAM193AP78312 1265 aa20.58■□□□□ 0.89
ANKRD39-201ENST00000393537 SIM1P81133 766 aaPredicted RBP20.58■□□□□ 0.89
ANKRD39-201ENST00000393537 SERINC3Q13530 473 aa20.58■□□□□ 0.89
ANKRD39-201ENST00000393537 PPP6R3Q5H9R7 873 aaPredicted RBP20.58■□□□□ 0.89
ANKRD39-201ENST00000393537 CCDC122Q5T0U0 273 aa20.58■□□□□ 0.89
ANKRD39-201ENST00000393537 ATXN7L2Q5T6C5 722 aaPredicted RBP20.58■□□□□ 0.89
ANKRD39-201ENST00000393537 SPECC1LQ69YQ0 1117 aa20.58■□□□□ 0.89
ANKRD39-201ENST00000393537 ALKBH5Q6P6C2 394 aaKnown RBP20.58■□□□□ 0.89
ANKRD39-201ENST00000393537 PLPP6Q8IY26 295 aa20.58■□□□□ 0.89
ANKRD39-201ENST00000393537 NETO2Q8NC67 525 aa20.58■□□□□ 0.89
ANKRD39-201ENST00000393537 OR2AP1Q8NGE2 309 aa20.58■□□□□ 0.89
ANKRD39-201ENST00000393537 SETD7Q8WTS6 366 aaKnown RBP20.58■□□□□ 0.89
ANKRD39-201ENST00000393537 NCAPGQ9BPX3 1015 aa20.58■□□□□ 0.89
ANKRD39-201ENST00000393537 DONSONQ9NYP3 566 aa20.58■□□□□ 0.89
ANKRD39-201ENST00000393537 DMTF1Q9Y222 760 aa20.58■□□□□ 0.89
ANKRD39-201ENST00000393537 A0A1W2PQU0 124 aa20.57■□□□□ 0.88
ANKRD39-201ENST00000393537 KRIT1O00522 736 aa20.57■□□□□ 0.88
ANKRD39-201ENST00000393537 DAPK3O43293 454 aa20.57■□□□□ 0.88
ANKRD39-201ENST00000393537 HNRNPH3P31942 346 aaKnown RBP20.57■□□□□ 0.88
ANKRD39-201ENST00000393537 PCK1P35558 622 aa20.57■□□□□ 0.88
ANKRD39-201ENST00000393537 NUDT1P36639 197 aa20.57■□□□□ 0.88
ANKRD39-201ENST00000393537 NEK3P51956 506 aa20.57■□□□□ 0.88
ANKRD39-201ENST00000393537 FOXC1Q12948 553 aa20.57■□□□□ 0.88
ANKRD39-201ENST00000393537 HNRNPDQ14103 355 aaKnown RBP20.57■□□□□ 0.88
ANKRD39-201ENST00000393537 ACAP1Q15027 740 aa20.57■□□□□ 0.88
ANKRD39-201ENST00000393537 ZNF423Q2M1K9 1284 aa20.57■□□□□ 0.88
ANKRD39-201ENST00000393537 SETMARQ53H47 684 aaPredicted RBP20.57■□□□□ 0.88
ANKRD39-201ENST00000393537 SLC45A4Q5BKX6 768 aa20.57■□□□□ 0.88
ANKRD39-201ENST00000393537 RFX8Q6ZV50 586 aa20.57■□□□□ 0.88
ANKRD39-201ENST00000393537 PSTKQ8IV42 348 aaKnown RBP20.57■□□□□ 0.88
ANKRD39-201ENST00000393537 CASKIN2Q8WXE0 1202 aa20.57■□□□□ 0.88
ANKRD39-201ENST00000393537 CELF6Q96J87 481 aaKnown RBP20.57■□□□□ 0.88
ANKRD39-201ENST00000393537 NUP85Q9BW27 656 aa20.57■□□□□ 0.88
ANKRD39-201ENST00000393537 LRRC19Q9H756 370 aa20.57■□□□□ 0.88
ANKRD39-201ENST00000393537 ANGPTL2Q9UKU9 493 aa20.57■□□□□ 0.88
ANKRD39-201ENST00000393537 PCDHB9Q9Y5E1 797 aa20.57■□□□□ 0.88
ANKRD39-201ENST00000393537 PCDHGB2Q9Y5G2 931 aa20.57■□□□□ 0.88
ANKRD39-201ENST00000393537 CABIN1Q9Y6J0 2220 aa20.57■□□□□ 0.88
ANKRD39-201ENST00000393537 PCDH8O95206 1070 aa20.56■□□□□ 0.88
ANKRD39-201ENST00000393537 CYP1A2P05177 515 aa20.56■□□□□ 0.88
ANKRD39-201ENST00000393537 ADRB3P13945 408 aa20.56■□□□□ 0.88
ANKRD39-201ENST00000393537 IL1R2P27930 398 aa20.56■□□□□ 0.88
ANKRD39-201ENST00000393537 EIF4A3P38919 411 aaKnown RBP20.56■□□□□ 0.88
ANKRD39-201ENST00000393537 CCT8P50990 548 aa20.56■□□□□ 0.88
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 26.5 ms