RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000392415.6

UBE2E3-201, Transcript of ubiquitin conjugating enzyme E2 E3, humanhuman

APPRIS P1 TSL 3 BASIC

Gene UBE2E3, Length 1,347 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBE2E3-201ENST00000392415 FAM228BP0C875 321 aa20.97■□□□□ 0.95
UBE2E3-201ENST00000392415 HNRNPH3P31942 346 aaKnown RBP20.97■□□□□ 0.95
UBE2E3-201ENST00000392415 NUDT1P36639 197 aa20.97■□□□□ 0.95
UBE2E3-201ENST00000392415 DNA2P51530 1060 aa20.97■□□□□ 0.95
UBE2E3-201ENST00000392415 CCNHP51946 323 aaPredicted RBP20.97■□□□□ 0.95
UBE2E3-201ENST00000392415 TPI1P60174 286 aa20.97■□□□□ 0.95
UBE2E3-201ENST00000392415 ACAP1Q15027 740 aa20.97■□□□□ 0.95
UBE2E3-201ENST00000392415 CA9Q16790 459 aa20.97■□□□□ 0.95
UBE2E3-201ENST00000392415 PARP15Q460N3 678 aa20.97■□□□□ 0.95
UBE2E3-201ENST00000392415 KCNT1Q5JUK3 1230 aa20.97■□□□□ 0.95
UBE2E3-201ENST00000392415 CYP4V2Q6ZWL3 525 aaPredicted RBP20.97■□□□□ 0.95
UBE2E3-201ENST00000392415 ADAT2Q7Z6V5 191 aaKnown RBP20.97■□□□□ 0.95
UBE2E3-201ENST00000392415 PRPF39Q86UA1 669 aaKnown RBP20.97■□□□□ 0.95
UBE2E3-201ENST00000392415 TRIM69Q86WT6 500 aa20.97■□□□□ 0.95
UBE2E3-201ENST00000392415 PSTKQ8IV42 348 aaKnown RBP20.97■□□□□ 0.95
UBE2E3-201ENST00000392415 GRIN3AQ8TCU5 1115 aa20.97■□□□□ 0.95
UBE2E3-201ENST00000392415 PPP1R16AQ96I34 528 aa20.97■□□□□ 0.95
UBE2E3-201ENST00000392415 SNRNP25Q9BV90 132 aaKnown RBP20.97■□□□□ 0.95
UBE2E3-201ENST00000392415 HDAC8Q9BY41 377 aa20.97■□□□□ 0.95
UBE2E3-201ENST00000392415 DHX35Q9H5Z1 703 aaKnown RBP20.97■□□□□ 0.95
UBE2E3-201ENST00000392415 PREBQ9HCU5 417 aa20.97■□□□□ 0.95
UBE2E3-201ENST00000392415 DYRK4Q9NR20 520 aa20.97■□□□□ 0.95
UBE2E3-201ENST00000392415 TM7SF3Q9NS93 570 aa20.97■□□□□ 0.95
UBE2E3-201ENST00000392415 FNDC3AQ9Y2H6 1198 aaKnown RBP20.97■□□□□ 0.95
UBE2E3-201ENST00000392415 ACACBO00763 2458 aa20.96■□□□□ 0.95
UBE2E3-201ENST00000392415 CHD8Q9HCK8 2581 aa20.96■□□□□ 0.95
UBE2E3-201ENST00000392415 RASA4BC9J798 803 aa20.96■□□□□ 0.95
UBE2E3-201ENST00000392415 RASA4O43374 803 aa20.96■□□□□ 0.95
UBE2E3-201ENST00000392415 CBFA2T2O43439 604 aa20.96■□□□□ 0.95
UBE2E3-201ENST00000392415 PRPSAP2O60256 369 aa20.96■□□□□ 0.95
UBE2E3-201ENST00000392415 CD38P28907 300 aa20.96■□□□□ 0.95
UBE2E3-201ENST00000392415 CTSKP43235 329 aa20.96■□□□□ 0.95
UBE2E3-201ENST00000392415 HNRNPDQ14103 355 aaKnown RBP20.96■□□□□ 0.95
UBE2E3-201ENST00000392415 NEK5Q6P3R8 708 aa20.96■□□□□ 0.95
UBE2E3-201ENST00000392415 DBX2Q6ZNG2 339 aa20.96■□□□□ 0.95
UBE2E3-201ENST00000392415 ERN2Q76MJ5 926 aaKnown RBP20.96■□□□□ 0.95
UBE2E3-201ENST00000392415 CASKIN2Q8WXE0 1202 aa20.96■□□□□ 0.95
UBE2E3-201ENST00000392415 SKA1Q96BD8 255 aa20.96■□□□□ 0.95
UBE2E3-201ENST00000392415 HMCESQ96FZ2 354 aa20.96■□□□□ 0.95
UBE2E3-201ENST00000392415 TM6SF2Q9BZW4 377 aa20.96■□□□□ 0.95
UBE2E3-201ENST00000392415 PCDHGB2Q9Y5G2 931 aa20.96■□□□□ 0.95
UBE2E3-201ENST00000392415 A0A1W2PR77 199 aa20.95■□□□□ 0.94
UBE2E3-201ENST00000392415 EEF2KO00418 725 aaKnown RBP20.95■□□□□ 0.94
UBE2E3-201ENST00000392415 WNT9AO14904 365 aa20.95■□□□□ 0.94
UBE2E3-201ENST00000392415 BUB1O43683 1085 aa20.95■□□□□ 0.94
UBE2E3-201ENST00000392415 SH3BP5O60239 455 aa20.95■□□□□ 0.94
UBE2E3-201ENST00000392415 GSRP00390 522 aa20.95■□□□□ 0.94
UBE2E3-201ENST00000392415 WNT1P04628 370 aa20.95■□□□□ 0.94
UBE2E3-201ENST00000392415 PCK1P35558 622 aa20.95■□□□□ 0.94
UBE2E3-201ENST00000392415 C21orf59P57076 290 aa20.95■□□□□ 0.94
UBE2E3-201ENST00000392415 SNRPD1P62314 119 aaKnown RBP20.95■□□□□ 0.94
UBE2E3-201ENST00000392415 SERINC3Q13530 473 aa20.95■□□□□ 0.94
UBE2E3-201ENST00000392415 ZNF423Q2M1K9 1284 aa20.95■□□□□ 0.94
UBE2E3-201ENST00000392415 INO80DQ53TQ3 878 aaPredicted RBP20.95■□□□□ 0.94
UBE2E3-201ENST00000392415 ALKBH5Q6P6C2 394 aaKnown RBP20.95■□□□□ 0.94
UBE2E3-201ENST00000392415 ZNF354CQ86Y25 554 aa20.95■□□□□ 0.94
UBE2E3-201ENST00000392415 OR2AP1Q8NGE2 309 aa20.95■□□□□ 0.94
UBE2E3-201ENST00000392415 LRIG1Q96JA1 1093 aa20.95■□□□□ 0.94
UBE2E3-201ENST00000392415 SERAC1Q96JX3 654 aa20.95■□□□□ 0.94
UBE2E3-201ENST00000392415 KCTD15Q96SI1 283 aaPredicted RBP20.95■□□□□ 0.94
UBE2E3-201ENST00000392415 KLC2Q9H0B6 622 aa20.95■□□□□ 0.94
UBE2E3-201ENST00000392415 THAP2Q9H0W7 228 aa20.95■□□□□ 0.94
UBE2E3-201ENST00000392415 AASDHPPTQ9NRN7 309 aa20.95■□□□□ 0.94
UBE2E3-201ENST00000392415 DMTF1Q9Y222 760 aa20.95■□□□□ 0.94
UBE2E3-201ENST00000392415 CEP295Q9C0D2 2601 aa20.95■□□□□ 0.94
UBE2E3-201ENST00000392415 ITGB7P26010 798 aa20.94■□□□□ 0.94
UBE2E3-201ENST00000392415 MAT2AP31153 395 aaKnown RBP20.94■□□□□ 0.94
UBE2E3-201ENST00000392415 ZNF135P52742 658 aaPredicted RBP20.94■□□□□ 0.94
UBE2E3-201ENST00000392415 NDST2P52849 883 aa20.94■□□□□ 0.94
UBE2E3-201ENST00000392415 NFKBIBQ15653 356 aa20.94■□□□□ 0.94
UBE2E3-201ENST00000392415 SPECC1LQ69YQ0 1117 aa20.94■□□□□ 0.94
UBE2E3-201ENST00000392415 NAPEPLDQ6IQ20 393 aa20.94■□□□□ 0.94
UBE2E3-201ENST00000392415 LEKR1Q6ZMV7 388 aa20.94■□□□□ 0.94
UBE2E3-201ENST00000392415 NAXDQ8IW45 347 aa20.94■□□□□ 0.94
UBE2E3-201ENST00000392415 VOPP1Q96AW1 172 aa20.94■□□□□ 0.94
UBE2E3-201ENST00000392415 CAMK1GQ96NX5 476 aa20.94■□□□□ 0.94
UBE2E3-201ENST00000392415 TRPM6Q9BX84 2022 aa20.94■□□□□ 0.94
UBE2E3-201ENST00000392415 ZDHHC6Q9H6R6 413 aa20.94■□□□□ 0.94
UBE2E3-201ENST00000392415 LRRC19Q9H756 370 aa20.94■□□□□ 0.94
UBE2E3-201ENST00000392415 KCNK3O14649 394 aa20.93■□□□□ 0.94
UBE2E3-201ENST00000392415 RNGTTO60942 597 aaKnown RBP20.93■□□□□ 0.94
UBE2E3-201ENST00000392415 TMCC1O94876 653 aa20.93■□□□□ 0.94
UBE2E3-201ENST00000392415 CYP1A2P05177 515 aa20.93■□□□□ 0.94
UBE2E3-201ENST00000392415 NEK3P51956 506 aa20.93■□□□□ 0.94
UBE2E3-201ENST00000392415 FAM193AP78312 1265 aa20.93■□□□□ 0.94
UBE2E3-201ENST00000392415 SHC2P98077 582 aa20.93■□□□□ 0.94
UBE2E3-201ENST00000392415 TRIM14Q14142 442 aa20.93■□□□□ 0.94
UBE2E3-201ENST00000392415 PIGHQ14442 188 aaPredicted RBP20.93■□□□□ 0.94
UBE2E3-201ENST00000392415 SETMARQ53H47 684 aaPredicted RBP20.93■□□□□ 0.94
UBE2E3-201ENST00000392415 CCDC122Q5T0U0 273 aa20.93■□□□□ 0.94
UBE2E3-201ENST00000392415 RFX8Q6ZV50 586 aa20.93■□□□□ 0.94
UBE2E3-201ENST00000392415 RYBPQ8N488 228 aaPredicted RBP20.93■□□□□ 0.94
UBE2E3-201ENST00000392415 NENFQ9UMX5 172 aa20.93■□□□□ 0.94
UBE2E3-201ENST00000392415 H0Y8X5 98 aa20.92■□□□□ 0.94
UBE2E3-201ENST00000392415 DFNA5O60443 496 aa20.92■□□□□ 0.94
UBE2E3-201ENST00000392415 CBFA2T3O75081 653 aa20.92■□□□□ 0.94
UBE2E3-201ENST00000392415 POP4O95707 220 aaKnown RBP20.92■□□□□ 0.94
UBE2E3-201ENST00000392415 ADRB3P13945 408 aa20.92■□□□□ 0.94
UBE2E3-201ENST00000392415 IL1R2P27930 398 aa20.92■□□□□ 0.94
UBE2E3-201ENST00000392415 GKP32189 559 aa20.92■□□□□ 0.94
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 33.9 ms