RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000379215.8

ECHDC3-201, Transcript of enoyl-CoA hydratase domain containing 3, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene ECHDC3, Length 1,649 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ECHDC3-201ENST00000379215 MSS51Q4VC12 460 aa24.94■■□□□ 1.58
ECHDC3-201ENST00000379215 PALM2Q8IXS6 379 aa24.94■■□□□ 1.58
ECHDC3-201ENST00000379215 LRRC3BQ96PB8 259 aa24.94■■□□□ 1.58
ECHDC3-201ENST00000379215 CCDC77Q9BR77 488 aa24.94■■□□□ 1.58
ECHDC3-201ENST00000379215 MED4Q9NPJ6 270 aa24.94■■□□□ 1.58
ECHDC3-201ENST00000379215 CASS4Q9NQ75 786 aa24.94■■□□□ 1.58
ECHDC3-201ENST00000379215 A0A087WUV0 522 aaPredicted RBP24.93■■□□□ 1.58
ECHDC3-201ENST00000379215 GOLGA6L10A6NI86 522 aa24.93■■□□□ 1.58
ECHDC3-201ENST00000379215 SDR42E2A6NKP2 422 aa24.93■■□□□ 1.58
ECHDC3-201ENST00000379215 GSTA2P09210 222 aa24.93■■□□□ 1.58
ECHDC3-201ENST00000379215 ADH5P11766 374 aa24.93■■□□□ 1.58
ECHDC3-201ENST00000379215 GLDCP23378 1020 aa24.93■■□□□ 1.58
ECHDC3-201ENST00000379215 FCARP24071 287 aa24.93■■□□□ 1.58
ECHDC3-201ENST00000379215 ADGRE1Q14246 886 aa24.93■■□□□ 1.58
ECHDC3-201ENST00000379215 RALGPS1Q5JS13 557 aa24.93■■□□□ 1.58
ECHDC3-201ENST00000379215 ARMC3Q5W041 872 aa24.93■■□□□ 1.58
ECHDC3-201ENST00000379215 DDX51Q8N8A6 666 aaKnown RBP eCLIP24.93■■□□□ 1.58
ECHDC3-201ENST00000379215 DNAAF3Q8N9W5 541 aa24.93■■□□□ 1.58
ECHDC3-201ENST00000379215 LMLNQ96KR4 655 aa24.93■■□□□ 1.58
ECHDC3-201ENST00000379215 TBL1YQ9BQ87 522 aa24.93■■□□□ 1.58
ECHDC3-201ENST00000379215 ABCB8Q9NUT2 735 aa24.93■■□□□ 1.58
ECHDC3-201ENST00000379215 BFARQ9NZS9 450 aa24.93■■□□□ 1.58
ECHDC3-201ENST00000379215 SNAP91O60641 907 aa24.92■■□□□ 1.58
ECHDC3-201ENST00000379215 CYP17A1P05093 508 aa24.92■■□□□ 1.58
ECHDC3-201ENST00000379215 GBP2P32456 591 aaPredicted RBP24.92■■□□□ 1.58
ECHDC3-201ENST00000379215 CD70P32970 193 aa24.92■■□□□ 1.58
ECHDC3-201ENST00000379215 ELK3P41970 407 aa24.92■■□□□ 1.58
ECHDC3-201ENST00000379215 DLX2Q07687 328 aaPredicted RBP24.92■■□□□ 1.58
ECHDC3-201ENST00000379215 FASTKD3Q14CZ7 662 aaKnown RBP24.92■■□□□ 1.58
ECHDC3-201ENST00000379215 PITRM1Q5JRX3 1037 aa24.92■■□□□ 1.58
ECHDC3-201ENST00000379215 LEKR1Q6ZMV7 388 aa24.92■■□□□ 1.58
ECHDC3-201ENST00000379215 SMRP1Q8NCR6 262 aa24.92■■□□□ 1.58
ECHDC3-201ENST00000379215 IPMKQ8NFU5 416 aa24.92■■□□□ 1.58
ECHDC3-201ENST00000379215 SPATA22Q8NHS9 363 aa24.92■■□□□ 1.58
ECHDC3-201ENST00000379215 ELSPBP1Q96BH3 223 aa24.92■■□□□ 1.58
ECHDC3-201ENST00000379215 CDH22Q9UJ99 828 aa24.92■■□□□ 1.58
ECHDC3-201ENST00000379215 GGA2Q9UJY4 613 aa24.92■■□□□ 1.58
ECHDC3-201ENST00000379215 AVILO75366 819 aa24.91■■□□□ 1.58
ECHDC3-201ENST00000379215 TMCC1O94876 653 aa24.91■■□□□ 1.58
ECHDC3-201ENST00000379215 MT-CYBP00156 380 aaPredicted RBP24.91■■□□□ 1.58
ECHDC3-201ENST00000379215 IVLP07476 585 aa24.91■■□□□ 1.58
ECHDC3-201ENST00000379215 SERPINF2P08697 491 aa24.91■■□□□ 1.58
ECHDC3-201ENST00000379215 PABPC1P11940 636 aaKnown RBP24.91■■□□□ 1.58
ECHDC3-201ENST00000379215 HLA-FP30511 346 aa24.91■■□□□ 1.58
ECHDC3-201ENST00000379215 LTBRP36941 435 aa24.91■■□□□ 1.58
ECHDC3-201ENST00000379215 NPY2RP49146 381 aa24.91■■□□□ 1.58
ECHDC3-201ENST00000379215 MAXP61244 160 aa24.91■■□□□ 1.58
ECHDC3-201ENST00000379215 FAM193AP78312 1265 aa24.91■■□□□ 1.58
ECHDC3-201ENST00000379215 NSUN2Q08J23 767 aaKnown RBP eCLIP24.91■■□□□ 1.58
ECHDC3-201ENST00000379215 FCHO2Q0JRZ9 810 aa24.91■■□□□ 1.58
ECHDC3-201ENST00000379215 ANKMY2Q8IV38 441 aa24.91■■□□□ 1.58
ECHDC3-201ENST00000379215 MFSD6LQ8IWD5 586 aa24.91■■□□□ 1.58
ECHDC3-201ENST00000379215 YAF2Q8IY57 180 aa24.91■■□□□ 1.58
ECHDC3-201ENST00000379215 APCDD1Q8J025 514 aa24.91■■□□□ 1.58
ECHDC3-201ENST00000379215 AHI1Q8N157 1196 aa24.91■■□□□ 1.58
ECHDC3-201ENST00000379215 PGBD5Q8N414 524 aa24.91■■□□□ 1.58
ECHDC3-201ENST00000379215 ARRDC2Q8TBH0 407 aa24.91■■□□□ 1.58
ECHDC3-201ENST00000379215 TADA1Q96BN2 335 aa24.91■■□□□ 1.58
ECHDC3-201ENST00000379215 SEMA3CQ99985 751 aa24.91■■□□□ 1.58
ECHDC3-201ENST00000379215 VPS37BQ9H9H4 285 aa24.91■■□□□ 1.58
ECHDC3-201ENST00000379215 PPCSQ9HAB8 311 aa24.91■■□□□ 1.58
ECHDC3-201ENST00000379215 LRRC4CQ9HCJ2 640 aa24.91■■□□□ 1.58
ECHDC3-201ENST00000379215 UBP1Q9NZI7 540 aa24.91■■□□□ 1.58
ECHDC3-201ENST00000379215 CLEC4EQ9ULY5 219 aa24.91■■□□□ 1.58
ECHDC3-201ENST00000379215 CHMP2BQ9UQN3 213 aa24.91■■□□□ 1.58
ECHDC3-201ENST00000379215 NFS1Q9Y697 457 aa24.91■■□□□ 1.58
ECHDC3-201ENST00000379215 LAMP2P13473 410 aa24.9■■□□□ 1.58
ECHDC3-201ENST00000379215 CD86P42081 329 aa24.9■■□□□ 1.58
ECHDC3-201ENST00000379215 SERPINH1P50454 418 aaKnown RBP24.9■■□□□ 1.58
ECHDC3-201ENST00000379215 DSC2Q02487 901 aa24.9■■□□□ 1.58
ECHDC3-201ENST00000379215 NR1H3Q13133 447 aa24.9■■□□□ 1.58
ECHDC3-201ENST00000379215 SPARCL1Q14515 664 aa24.9■■□□□ 1.58
ECHDC3-201ENST00000379215 STAT4Q14765 748 aa24.9■■□□□ 1.58
ECHDC3-201ENST00000379215 CYTH1Q15438 398 aa24.9■■□□□ 1.58
ECHDC3-201ENST00000379215 MTSS1LQ765P7 747 aa24.9■■□□□ 1.58
ECHDC3-201ENST00000379215 PRPF39Q86UA1 669 aaKnown RBP24.9■■□□□ 1.58
ECHDC3-201ENST00000379215 SIGLEC10Q96LC7 697 aa24.9■■□□□ 1.58
ECHDC3-201ENST00000379215 MYADMQ96S97 322 aa24.9■■□□□ 1.58
ECHDC3-201ENST00000379215 EBNA1BP2Q99848 306 aaKnown RBP24.9■■□□□ 1.58
ECHDC3-201ENST00000379215 FAM83CQ9BQN1 747 aa24.9■■□□□ 1.58
ECHDC3-201ENST00000379215 TMEM109Q9BVC6 243 aa24.9■■□□□ 1.58
ECHDC3-201ENST00000379215 ROPN1BQ9BZX4 212 aaPredicted RBP24.9■■□□□ 1.58
ECHDC3-201ENST00000379215 IL22Q9GZX6 179 aa24.9■■□□□ 1.58
ECHDC3-201ENST00000379215 ROPN1Q9HAT0 212 aaPredicted RBP24.9■■□□□ 1.58
ECHDC3-201ENST00000379215 ZC3H7BQ9UGR2 993 aaKnown RBP24.9■■□□□ 1.58
ECHDC3-201ENST00000379215 DYNC1LI1Q9Y6G9 523 aaKnown RBP24.9■■□□□ 1.58
ECHDC3-201ENST00000379215 MYO9BQ13459 2157 aa24.9■■□□□ 1.58
ECHDC3-201ENST00000379215 PMPCBO75439 489 aa24.9■■□□□ 1.58
ECHDC3-201ENST00000379215 GRIA1P42261 906 aa24.9■■□□□ 1.58
ECHDC3-201ENST00000379215 WNT3AP56704 352 aa24.9■■□□□ 1.58
ECHDC3-201ENST00000379215 NIPAL4Q0D2K0 466 aa24.9■■□□□ 1.58
ECHDC3-201ENST00000379215 TANGO2Q6ICL3 276 aa24.9■■□□□ 1.58
ECHDC3-201ENST00000379215 KDELC1Q6UW63 502 aa24.9■■□□□ 1.58
ECHDC3-201ENST00000379215 OR52K1Q8NGK4 314 aa24.9■■□□□ 1.58
ECHDC3-201ENST00000379215 WFIKKN2Q8TEU8 576 aa24.9■■□□□ 1.58
ECHDC3-201ENST00000379215 STAMBPL1Q96FJ0 436 aa24.9■■□□□ 1.58
ECHDC3-201ENST00000379215 NUDCD1Q96RS6 583 aa24.9■■□□□ 1.58
ECHDC3-201ENST00000379215 SAMD15Q9P1V8 674 aa24.9■■□□□ 1.58
ECHDC3-201ENST00000379215 CD207Q9UJ71 328 aa24.9■■□□□ 1.58
ECHDC3-201ENST00000379215 SLC25A13Q9UJS0 675 aa24.9■■□□□ 1.58
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 38.7 ms