RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000368001.1

USP21-202, Transcript of ubiquitin specific peptidase 21, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene USP21, Length 2,095 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP21-202ENST00000368001 A0A087WUV0 522 aaPredicted RBP22.1■■□□□ 1.13
USP21-202ENST00000368001 ERI2A8K979 691 aaKnown RBP22.1■■□□□ 1.13
USP21-202ENST00000368001 CD70P32970 193 aa22.1■■□□□ 1.13
USP21-202ENST00000368001 DLX2Q07687 328 aaPredicted RBP22.1■■□□□ 1.13
USP21-202ENST00000368001 LMAN2Q12907 356 aa22.1■■□□□ 1.13
USP21-202ENST00000368001 PCSK7Q16549 785 aa22.1■■□□□ 1.13
USP21-202ENST00000368001 SKIDA1Q1XH10 827 aa22.1■■□□□ 1.13
USP21-202ENST00000368001 FAM78AQ5JUQ0 283 aa22.1■■□□□ 1.13
USP21-202ENST00000368001 MPP7Q5T2T1 576 aa22.1■■□□□ 1.13
USP21-202ENST00000368001 TMEM184AQ6ZMB5 413 aa22.1■■□□□ 1.13
USP21-202ENST00000368001 EFHBQ8N7U6 833 aa22.1■■□□□ 1.13
USP21-202ENST00000368001 FBF1Q8TES7 1133 aa22.1■■□□□ 1.13
USP21-202ENST00000368001 EXOC2Q96KP1 924 aa22.1■■□□□ 1.13
USP21-202ENST00000368001 EBNA1BP2Q99848 306 aaKnown RBP22.1■■□□□ 1.13
USP21-202ENST00000368001 FICDQ9BVA6 458 aa22.1■■□□□ 1.13
USP21-202ENST00000368001 RABGEF1Q9UJ41 708 aa22.1■■□□□ 1.13
USP21-202ENST00000368001 AAR2Q9Y312 384 aaKnown RBP22.1■■□□□ 1.13
USP21-202ENST00000368001 TCRBV9S1A1TA0A576 114 aa22.1■■□□□ 1.13
USP21-202ENST00000368001 CPP00450 1065 aa22.1■■□□□ 1.13
USP21-202ENST00000368001 TPH1P17752 444 aa22.1■■□□□ 1.13
USP21-202ENST00000368001 FSHRP23945 695 aa22.1■■□□□ 1.13
USP21-202ENST00000368001 ADRA1AP35348 466 aa22.1■■□□□ 1.13
USP21-202ENST00000368001 ZNF235Q14590 738 aa22.1■■□□□ 1.13
USP21-202ENST00000368001 CERCAMQ5T4B2 595 aa22.1■■□□□ 1.13
USP21-202ENST00000368001 DENND5AQ6IQ26 1287 aa22.1■■□□□ 1.13
USP21-202ENST00000368001 ANKRD54Q6NXT1 300 aa22.1■■□□□ 1.13
USP21-202ENST00000368001 KDELC1Q6UW63 502 aa22.1■■□□□ 1.13
USP21-202ENST00000368001 UNC5AQ6ZN44 842 aa22.1■■□□□ 1.13
USP21-202ENST00000368001 RNF135Q8IUD6 432 aa22.1■■□□□ 1.13
USP21-202ENST00000368001 PPP2R3CQ969Q6 453 aa22.1■■□□□ 1.13
USP21-202ENST00000368001 ZNF599Q96NL3 588 aa22.1■■□□□ 1.13
USP21-202ENST00000368001 XPO6Q96QU8 1125 aaKnown RBP22.1■■□□□ 1.13
USP21-202ENST00000368001 TMEM109Q9BVC6 243 aa22.1■■□□□ 1.13
USP21-202ENST00000368001 VPS51Q9UID3 782 aa22.1■■□□□ 1.13
USP21-202ENST00000368001 FOXO6A8MYZ6 492 aa22.09■■□□□ 1.13
USP21-202ENST00000368001 NEDD8-MDP1E9PL57 170 aa22.09■■□□□ 1.13
USP21-202ENST00000368001 RASGRF2O14827 1237 aa22.09■■□□□ 1.13
USP21-202ENST00000368001 ANXA9O76027 345 aa22.09■■□□□ 1.13
USP21-202ENST00000368001 CHRNA4P43681 627 aa22.09■■□□□ 1.13
USP21-202ENST00000368001 CYTH1Q15438 398 aa22.09■■□□□ 1.13
USP21-202ENST00000368001 ASTLQ6HA08 431 aaPredicted RBP22.09■■□□□ 1.13
USP21-202ENST00000368001 ZNF783Q6ZMS7 281 aa22.09■■□□□ 1.13
USP21-202ENST00000368001 DNAAF3Q8N9W5 541 aa22.09■■□□□ 1.13
USP21-202ENST00000368001 LRRC39Q96DD0 335 aa22.09■■□□□ 1.13
USP21-202ENST00000368001 ASIC4Q96FT7 647 aa22.09■■□□□ 1.13
USP21-202ENST00000368001 SEMA3CQ99985 751 aa22.09■■□□□ 1.13
USP21-202ENST00000368001 BCCIPQ9P287 314 aaKnown RBP eCLIP22.09■■□□□ 1.13
USP21-202ENST00000368001 INTS6Q9UL03 887 aaKnown RBP22.09■■□□□ 1.13
USP21-202ENST00000368001 SDR42E2A6NKP2 422 aa22.08■■□□□ 1.13
USP21-202ENST00000368001 MT-CO1P00395 513 aa22.08■■□□□ 1.13
USP21-202ENST00000368001 C1QAP02745 245 aa22.08■■□□□ 1.13
USP21-202ENST00000368001 TCF3P15923 654 aa22.08■■□□□ 1.13
USP21-202ENST00000368001 LY6G5CQ5SRR4 150 aa22.08■■□□□ 1.13
USP21-202ENST00000368001 TRIM68Q6AZZ1 485 aa22.08■■□□□ 1.13
USP21-202ENST00000368001 CASC4Q6P4E1 433 aa22.08■■□□□ 1.13
USP21-202ENST00000368001 ADGRG2Q8IZP9 1017 aa22.08■■□□□ 1.13
USP21-202ENST00000368001 MRRFQ96E11 262 aaKnown RBP22.08■■□□□ 1.13
USP21-202ENST00000368001 LMLNQ96KR4 655 aa22.08■■□□□ 1.13
USP21-202ENST00000368001 ATP6V1G3Q96LB4 118 aa22.08■■□□□ 1.13
USP21-202ENST00000368001 ASB16Q96NS5 453 aa22.08■■□□□ 1.13
USP21-202ENST00000368001 TBL1YQ9BQ87 522 aa22.08■■□□□ 1.13
USP21-202ENST00000368001 CLEC1BQ9P126 229 aa22.08■■□□□ 1.13
USP21-202ENST00000368001 VPS18Q9P253 973 aa22.08■■□□□ 1.13
USP21-202ENST00000368001 ZMYM5Q9UJ78 669 aa22.08■■□□□ 1.13
USP21-202ENST00000368001 MYLKQ15746 1914 aa22.08■■□□□ 1.13
USP21-202ENST00000368001 EXOC1LA0A1B0GW35 172 aa22.08■■□□□ 1.12
USP21-202ENST00000368001 GOLGA6L10A6NI86 522 aa22.08■■□□□ 1.12
USP21-202ENST00000368001 GOLGA8KD6RF30 607 aa22.08■■□□□ 1.12
USP21-202ENST00000368001 PENKP01210 267 aaPredicted RBP22.08■■□□□ 1.12
USP21-202ENST00000368001 HLA-FP30511 346 aa22.08■■□□□ 1.12
USP21-202ENST00000368001 GEMP55040 296 aa22.08■■□□□ 1.12
USP21-202ENST00000368001 WNT3AP56704 352 aa22.08■■□□□ 1.12
USP21-202ENST00000368001 SKOR1P84550 965 aa22.08■■□□□ 1.12
USP21-202ENST00000368001 TRMT10BQ6PF06 316 aaKnown RBP22.08■■□□□ 1.12
USP21-202ENST00000368001 CES3Q6UWW8 571 aa22.08■■□□□ 1.12
USP21-202ENST00000368001 UNC5BQ8IZJ1 945 aa22.08■■□□□ 1.12
USP21-202ENST00000368001 FIBINQ8TAL6 211 aa22.08■■□□□ 1.12
USP21-202ENST00000368001 IRF7Q92985 503 aa22.08■■□□□ 1.12
USP21-202ENST00000368001 TADA1Q96BN2 335 aa22.08■■□□□ 1.12
USP21-202ENST00000368001 STAMBPL1Q96FJ0 436 aa22.08■■□□□ 1.12
USP21-202ENST00000368001 PSKH2Q96QS6 385 aa22.08■■□□□ 1.12
USP21-202ENST00000368001 MGME1Q9BQP7 344 aa22.08■■□□□ 1.12
USP21-202ENST00000368001 BBS2Q9BXC9 721 aa22.08■■□□□ 1.12
USP21-202ENST00000368001 POLR1EQ9GZS1 481 aaKnown RBP22.08■■□□□ 1.12
USP21-202ENST00000368001 SPHK2Q9NRA0 654 aa22.08■■□□□ 1.12
USP21-202ENST00000368001 TRIOBPQ9H2D6 2365 aa22.07■■□□□ 1.12
USP21-202ENST00000368001 K7ERQ8 282 aa22.07■■□□□ 1.12
USP21-202ENST00000368001 STAT4Q14765 748 aa22.07■■□□□ 1.12
USP21-202ENST00000368001 NAPEPLDQ6IQ20 393 aa22.07■■□□□ 1.12
USP21-202ENST00000368001 CELF5Q8N6W0 485 aaKnown RBP22.07■■□□□ 1.12
USP21-202ENST00000368001 TTYH1Q9H313 450 aaPredicted RBP22.07■■□□□ 1.12
USP21-202ENST00000368001 ABCB8Q9NUT2 735 aa22.07■■□□□ 1.12
USP21-202ENST00000368001 EURLQ9NYK6 297 aa22.07■■□□□ 1.12
USP21-202ENST00000368001 POC1B-GALNT4F8VUJ3 575 aa22.07■■□□□ 1.12
USP21-202ENST00000368001 TRIM24O15164 1050 aa22.07■■□□□ 1.12
USP21-202ENST00000368001 TBX10O75333 385 aa22.07■■□□□ 1.12
USP21-202ENST00000368001 TCEA3O75764 348 aa22.07■■□□□ 1.12
USP21-202ENST00000368001 TMCC1O94876 653 aa22.07■■□□□ 1.12
USP21-202ENST00000368001 CYBBP04839 570 aa22.07■■□□□ 1.12
USP21-202ENST00000368001 SMAD1Q15797 465 aaKnown RBP22.07■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 31.8 ms