RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000356384.4

RXRA-201, Transcript of retinoid X receptor alpha, humanhuman

TSL 5

Gene RXRA, Length 5,770 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RXRA-201ENST00000356384 ZMPSTE24O75844 475 aa16.24■□□□□ 0.19
RXRA-201ENST00000356384 SEC24AO95486 1093 aa16.24■□□□□ 0.19
RXRA-201ENST00000356384 CATP04040 527 aaKnown RBP16.24■□□□□ 0.19
RXRA-201ENST00000356384 ANXA5P08758 320 aa16.24■□□□□ 0.19
RXRA-201ENST00000356384 ZSCAN5DPP0CG00 497 aa16.24■□□□□ 0.19
RXRA-201ENST00000356384 SLC25A3Q00325 362 aa16.24■□□□□ 0.19
RXRA-201ENST00000356384 PGM5Q15124 567 aa16.24■□□□□ 0.19
RXRA-201ENST00000356384 NEPROQ6NW34 567 aa16.24■□□□□ 0.19
RXRA-201ENST00000356384 GCNT7Q6ZNI0 430 aa16.24■□□□□ 0.19
RXRA-201ENST00000356384 TTC7BQ86TV6 843 aa16.24■□□□□ 0.19
RXRA-201ENST00000356384 BRSK2Q8IWQ3 736 aa16.24■□□□□ 0.19
RXRA-201ENST00000356384 ZNF655Q8N720 491 aaPredicted RBP16.24■□□□□ 0.19
RXRA-201ENST00000356384 CHST7Q9NS84 486 aa16.24■□□□□ 0.19
RXRA-201ENST00000356384 AHCYL1O43865 530 aa16.24■□□□□ 0.19
RXRA-201ENST00000356384 LTA4HP09960 611 aaKnown RBP16.24■□□□□ 0.19
RXRA-201ENST00000356384 SERPINA4P29622 427 aa16.24■□□□□ 0.19
RXRA-201ENST00000356384 RGS21Q2M5E4 152 aa16.24■□□□□ 0.19
RXRA-201ENST00000356384 SLC30A10Q6XR72 485 aa16.24■□□□□ 0.19
RXRA-201ENST00000356384 ARHGAP36Q6ZRI8 547 aa16.24■□□□□ 0.19
RXRA-201ENST00000356384 TAF8Q7Z7C8 310 aa16.24■□□□□ 0.19
RXRA-201ENST00000356384 FBXW8Q8N3Y1 598 aa16.24■□□□□ 0.19
RXRA-201ENST00000356384 POC5Q8NA72 575 aa16.24■□□□□ 0.19
RXRA-201ENST00000356384 CHID1Q9BWS9 393 aa16.24■□□□□ 0.19
RXRA-201ENST00000356384 ELOVL4Q9GZR5 314 aa16.24■□□□□ 0.19
RXRA-201ENST00000356384 ETNK2Q9NVF9 386 aa16.24■□□□□ 0.19
RXRA-201ENST00000356384 PACSIN3Q9UKS6 424 aa16.24■□□□□ 0.19
RXRA-201ENST00000356384 SNX6Q9UNH7 406 aa16.24■□□□□ 0.19
RXRA-201ENST00000356384 E5RJQ4 531 aa16.23■□□□□ 0.19
RXRA-201ENST00000356384 FFAR3O14843 346 aa16.23■□□□□ 0.19
RXRA-201ENST00000356384 GPR42O15529 346 aa16.23■□□□□ 0.19
RXRA-201ENST00000356384 BUD23O43709 281 aaKnown RBP16.23■□□□□ 0.19
RXRA-201ENST00000356384 KRT33AO76009 404 aa16.23■□□□□ 0.19
RXRA-201ENST00000356384 CHN2P52757 468 aa16.23■□□□□ 0.19
RXRA-201ENST00000356384 ACAP1Q15027 740 aa16.23■□□□□ 0.19
RXRA-201ENST00000356384 ZNF540Q8NDQ6 660 aa16.23■□□□□ 0.19
RXRA-201ENST00000356384 GRIN3AQ8TCU5 1115 aa16.23■□□□□ 0.19
RXRA-201ENST00000356384 EXO5Q9H790 373 aa16.23■□□□□ 0.19
RXRA-201ENST00000356384 DNAJC18Q9H819 358 aa16.23■□□□□ 0.19
RXRA-201ENST00000356384 POPDC2Q9HBU9 364 aa16.23■□□□□ 0.19
RXRA-201ENST00000356384 WWP2O00308 870 aa16.23■□□□□ 0.19
RXRA-201ENST00000356384 ABATP80404 500 aa16.23■□□□□ 0.19
RXRA-201ENST00000356384 TTC27Q6P3X3 843 aa16.23■□□□□ 0.19
RXRA-201ENST00000356384 ZCCHC9Q8N567 271 aaKnown RBP16.23■□□□□ 0.19
RXRA-201ENST00000356384 GMCL1P1Q8NEA9 526 aa16.23■□□□□ 0.19
RXRA-201ENST00000356384 ETNPPLQ8TBG4 499 aa16.23■□□□□ 0.19
RXRA-201ENST00000356384 DNAJB14Q8TBM8 379 aa16.23■□□□□ 0.19
RXRA-201ENST00000356384 GMCL1Q96IK5 515 aa16.23■□□□□ 0.19
RXRA-201ENST00000356384 VCPIP1Q96JH7 1222 aa16.23■□□□□ 0.19
RXRA-201ENST00000356384 PSME2Q9UL46 239 aa16.23■□□□□ 0.19
RXRA-201ENST00000356384 SLC12A4Q9UP95 1085 aa16.23■□□□□ 0.19
RXRA-201ENST00000356384 PALM2-AKAP2B1ALY0 433 aaPredicted RBP16.23■□□□□ 0.19
RXRA-201ENST00000356384 LIN7AO14910 233 aaPredicted RBP16.23■□□□□ 0.19
RXRA-201ENST00000356384 ITGA3P26006 1051 aa16.23■□□□□ 0.19
RXRA-201ENST00000356384 RFX5P48382 616 aaPredicted RBP16.23■□□□□ 0.19
RXRA-201ENST00000356384 THOP1P52888 689 aa16.23■□□□□ 0.19
RXRA-201ENST00000356384 CRADDP78560 199 aa16.23■□□□□ 0.19
RXRA-201ENST00000356384 MAP1SQ66K74 1059 aaPredicted RBP16.23■□□□□ 0.19
RXRA-201ENST00000356384 FAM171BQ6P995 826 aa16.23■□□□□ 0.19
RXRA-201ENST00000356384 SPESP1Q6UW49 350 aa16.23■□□□□ 0.19
RXRA-201ENST00000356384 STAG3L4Q8TBR4 150 aa16.23■□□□□ 0.19
RXRA-201ENST00000356384 TRAPPC12Q8WVT3 735 aa16.23■□□□□ 0.19
RXRA-201ENST00000356384 KAT5Q92993 513 aa16.23■□□□□ 0.19
RXRA-201ENST00000356384 SKA1Q96BD8 255 aa16.23■□□□□ 0.19
RXRA-201ENST00000356384 PLEKHG4BQ96PX9 1271 aa16.23■□□□□ 0.19
RXRA-201ENST00000356384 RRAGCQ9HB90 399 aa16.23■□□□□ 0.19
RXRA-201ENST00000356384 FAM237BA0A1B0GVD1 139 aa16.23■□□□□ 0.19
RXRA-201ENST00000356384 APOC4-APOC2K7ER74 178 aa16.23■□□□□ 0.19
RXRA-201ENST00000356384 BTN3A3O00478 584 aa16.23■□□□□ 0.19
RXRA-201ENST00000356384 SGTAO43765 313 aa16.23■□□□□ 0.19
RXRA-201ENST00000356384 PSIP1O75475 530 aaKnown RBP16.23■□□□□ 0.19
RXRA-201ENST00000356384 APOC2P02655 101 aa16.23■□□□□ 0.19
RXRA-201ENST00000356384 EPS8Q12929 822 aa16.23■□□□□ 0.19
RXRA-201ENST00000356384 RRP1BQ14684 758 aaKnown RBP16.23■□□□□ 0.19
RXRA-201ENST00000356384 NR1D2Q14995 579 aa16.23■□□□□ 0.19
RXRA-201ENST00000356384 QPRTQ15274 297 aa16.23■□□□□ 0.19
RXRA-201ENST00000356384 PARP6Q2NL67 630 aa16.23■□□□□ 0.19
RXRA-201ENST00000356384 PPM1LQ5SGD2 360 aa16.23■□□□□ 0.19
RXRA-201ENST00000356384 BROXQ5VW32 411 aa16.23■□□□□ 0.19
RXRA-201ENST00000356384 PGBD2Q6P3X8 592 aa16.23■□□□□ 0.19
RXRA-201ENST00000356384 PTGR2Q8N8N7 351 aaPredicted RBP16.23■□□□□ 0.19
RXRA-201ENST00000356384 OR52K1Q8NGK4 314 aa16.23■□□□□ 0.19
RXRA-201ENST00000356384 PSMA8Q8TAA3 256 aa16.23■□□□□ 0.19
RXRA-201ENST00000356384 C1QTNF7Q9BXJ2 289 aa16.23■□□□□ 0.19
RXRA-201ENST00000356384 FBXO6Q9NRD1 293 aaPredicted RBP16.23■□□□□ 0.19
RXRA-201ENST00000356384 A0A0B4J269 797 aa16.23■□□□□ 0.19
RXRA-201ENST00000356384 CCDC166P0CW27 439 aa16.23■□□□□ 0.19
RXRA-201ENST00000356384 PSMB4P28070 264 aa16.23■□□□□ 0.19
RXRA-201ENST00000356384 GPR1P46091 355 aa16.23■□□□□ 0.19
RXRA-201ENST00000356384 MYBPC1Q00872 1141 aa16.23■□□□□ 0.19
RXRA-201ENST00000356384 OLFML2AQ68BL7 652 aa16.23■□□□□ 0.19
RXRA-201ENST00000356384 ATG14Q6ZNE5 492 aa16.23■□□□□ 0.19
RXRA-201ENST00000356384 SAMD3Q8N6K7 520 aa16.23■□□□□ 0.19
RXRA-201ENST00000356384 CSGALNACT1Q8TDX6 532 aa16.23■□□□□ 0.19
RXRA-201ENST00000356384 LENG9Q96B70 501 aa16.23■□□□□ 0.19
RXRA-201ENST00000356384 VAT1Q99536 393 aa16.23■□□□□ 0.19
RXRA-201ENST00000356384 FAM192AQ9GZU8 254 aa16.23■□□□□ 0.19
RXRA-201ENST00000356384 IGFLR1Q9H665 355 aa16.23■□□□□ 0.19
RXRA-201ENST00000356384 TMX2Q9Y320 296 aa16.23■□□□□ 0.19
RXRA-201ENST00000356384 SPATA31A6Q5VVP1 1343 aa16.22■□□□□ 0.19
RXRA-201ENST00000356384 NKRFO15226 690 aaKnown RBP eCLIP16.22■□□□□ 0.191e-6■■■□□ 17
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 30.5 ms