RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000331462.5

HOXD1-201, Transcript of homeobox D1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene HOXD1, Length 1,975 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXD1-201ENST00000331462 FSTL5Q8N475 847 aaPredicted RBP22.88■■□□□ 1.25
HOXD1-201ENST00000331462 CNTD1Q8N815 330 aa22.88■■□□□ 1.25
HOXD1-201ENST00000331462 CATSPER1Q8NEC5 780 aa22.88■■□□□ 1.25
HOXD1-201ENST00000331462 KCTD4Q8WVF5 259 aa22.88■■□□□ 1.25
HOXD1-201ENST00000331462 GPR78Q96P69 363 aa22.88■■□□□ 1.25
HOXD1-201ENST00000331462 AAR2Q9Y312 384 aaKnown RBP22.88■■□□□ 1.25
HOXD1-201ENST00000331462 NEMP1O14524 444 aa22.87■■□□□ 1.25
HOXD1-201ENST00000331462 PHGDHO43175 533 aaKnown RBP22.87■■□□□ 1.25
HOXD1-201ENST00000331462 NPHS1O60500 1241 aa22.87■■□□□ 1.25
HOXD1-201ENST00000331462 SRGAP2BP0DMP2 458 aa22.87■■□□□ 1.25
HOXD1-201ENST00000331462 CRYBB1P53674 252 aaPredicted RBP22.87■■□□□ 1.25
HOXD1-201ENST00000331462 ADGRE1Q14246 886 aa22.87■■□□□ 1.25
HOXD1-201ENST00000331462 RASIP1Q5U651 963 aa22.87■■□□□ 1.25
HOXD1-201ENST00000331462 GPR142Q7Z601 462 aa22.87■■□□□ 1.25
HOXD1-201ENST00000331462 TICAM1Q8IUC6 712 aa22.87■■□□□ 1.25
HOXD1-201ENST00000331462 PTCD2Q8WV60 388 aaKnown RBP22.87■■□□□ 1.25
HOXD1-201ENST00000331462 IRGQQ8WZA9 623 aa22.87■■□□□ 1.25
HOXD1-201ENST00000331462 DCUN1D1Q96GG9 259 aa22.87■■□□□ 1.25
HOXD1-201ENST00000331462 PCED1BQ96HM7 432 aa22.87■■□□□ 1.25
HOXD1-201ENST00000331462 MAELQ96JY0 434 aaKnown RBP22.87■■□□□ 1.25
HOXD1-201ENST00000331462 NUF2Q9BZD4 464 aa22.87■■□□□ 1.25
HOXD1-201ENST00000331462 WDCPQ9H6R7 721 aa22.87■■□□□ 1.25
HOXD1-201ENST00000331462 TMEM30AQ9NV96 361 aa22.87■■□□□ 1.25
HOXD1-201ENST00000331462 CAMSAP3Q9P1Y5 1249 aaPredicted RBP22.87■■□□□ 1.25
HOXD1-201ENST00000331462 RIMS3Q9UJD0 308 aa22.87■■□□□ 1.25
HOXD1-201ENST00000331462 ACOT9Q9Y305 439 aa22.87■■□□□ 1.25
HOXD1-201ENST00000331462 COMMD3-BMI1R4GMX3 469 aa22.87■■□□□ 1.25
HOXD1-201ENST00000331462 SMIM31A0A1B0GVY4 71 aa22.87■■□□□ 1.25
HOXD1-201ENST00000331462 PDHXO00330 501 aa22.87■■□□□ 1.25
HOXD1-201ENST00000331462 DLX3O60479 287 aa22.87■■□□□ 1.25
HOXD1-201ENST00000331462 AHSGP02765 367 aa22.87■■□□□ 1.25
HOXD1-201ENST00000331462 USP17L7P0C7H9 530 aa22.87■■□□□ 1.25
HOXD1-201ENST00000331462 GRIA2P42262 883 aa22.87■■□□□ 1.25
HOXD1-201ENST00000331462 RAB10P61026 200 aa22.87■■□□□ 1.25
HOXD1-201ENST00000331462 DYNC1I2Q13409 638 aaKnown RBP22.87■■□□□ 1.25
HOXD1-201ENST00000331462 FLOT2Q14254 428 aa22.87■■□□□ 1.25
HOXD1-201ENST00000331462 MFSD10Q14728 455 aa22.87■■□□□ 1.25
HOXD1-201ENST00000331462 SH2D4BQ5SQS7 431 aa22.87■■□□□ 1.25
HOXD1-201ENST00000331462 RARS2Q5T160 578 aaKnown RBP22.87■■□□□ 1.25
HOXD1-201ENST00000331462 ZC3H15Q8WU90 426 aaKnown RBP22.87■■□□□ 1.25
HOXD1-201ENST00000331462 RCN3Q96D15 328 aa22.87■■□□□ 1.25
HOXD1-201ENST00000331462 SENP8Q96LD8 212 aa22.87■■□□□ 1.25
HOXD1-201ENST00000331462 CDRT15Q96T59 188 aa22.87■■□□□ 1.25
HOXD1-201ENST00000331462 TKTL2Q9H0I9 626 aa22.87■■□□□ 1.25
HOXD1-201ENST00000331462 MRM3Q9HC36 420 aaKnown RBP22.87■■□□□ 1.25
HOXD1-201ENST00000331462 NDUFA13Q9P0J0 144 aa22.87■■□□□ 1.25
HOXD1-201ENST00000331462 RAB26Q9ULW5 256 aa22.87■■□□□ 1.25
HOXD1-201ENST00000331462 RUVBL2Q9Y230 463 aaKnown RBP22.87■■□□□ 1.25
HOXD1-201ENST00000331462 C15orf38-AP3S2A0A0A6YYH1 394 aa22.86■■□□□ 1.25
HOXD1-201ENST00000331462 GOLGA8TH3BQL2 631 aa22.86■■□□□ 1.25
HOXD1-201ENST00000331462 HSPA1AP0DMV8 641 aaKnown RBP22.86■■□□□ 1.25
HOXD1-201ENST00000331462 HSPA1BP0DMV9 641 aaKnown RBP22.86■■□□□ 1.25
HOXD1-201ENST00000331462 CCR10P46092 362 aa22.86■■□□□ 1.25
HOXD1-201ENST00000331462 ARPINQ7Z6K5 226 aa22.86■■□□□ 1.25
HOXD1-201ENST00000331462 SCYL1Q96KG9 808 aa22.86■■□□□ 1.25
HOXD1-201ENST00000331462 FCRL5Q96RD9 977 aa22.86■■□□□ 1.25
HOXD1-201ENST00000331462 OSBPL2Q9H1P3 480 aa22.86■■□□□ 1.25
HOXD1-201ENST00000331462 Q9H521 79 aa22.86■■□□□ 1.25
HOXD1-201ENST00000331462 XPR1Q9UBH6 696 aa22.86■■□□□ 1.25
HOXD1-201ENST00000331462 NEU3Q9UQ49 428 aa22.86■■□□□ 1.25
HOXD1-201ENST00000331462 CAPN8A6NHC0 703 aa22.85■■□□□ 1.25
HOXD1-201ENST00000331462 HAS3O00219 553 aa22.85■■□□□ 1.25
HOXD1-201ENST00000331462 PGK1P00558 417 aa22.85■■□□□ 1.25
HOXD1-201ENST00000331462 XRCC1P18887 633 aaPredicted RBP22.85■■□□□ 1.25
HOXD1-201ENST00000331462 CCNCP24863 283 aa22.85■■□□□ 1.25
HOXD1-201ENST00000331462 CYP2C18P33260 490 aa22.85■■□□□ 1.25
HOXD1-201ENST00000331462 ARCN1P48444 511 aaKnown RBP22.85■■□□□ 1.25
HOXD1-201ENST00000331462 SH3BGRP55822 239 aaPredicted RBP22.85■■□□□ 1.25
HOXD1-201ENST00000331462 CEACAM7Q14002 265 aa22.85■■□□□ 1.25
HOXD1-201ENST00000331462 KDM1BQ8NB78 822 aa22.85■■□□□ 1.25
HOXD1-201ENST00000331462 ADCY4Q8NFM4 1077 aa22.85■■□□□ 1.25
HOXD1-201ENST00000331462 TBL1YQ9BQ87 522 aa22.85■■□□□ 1.25
HOXD1-201ENST00000331462 CSNK1G1Q9HCP0 422 aa22.85■■□□□ 1.25
HOXD1-201ENST00000331462 SLC38A7Q9NVC3 462 aa22.85■■□□□ 1.25
HOXD1-201ENST00000331462 UBP1Q9NZI7 540 aa22.85■■□□□ 1.25
HOXD1-201ENST00000331462 MAGED2Q9UNF1 606 aaPredicted RBP22.85■■□□□ 1.25
HOXD1-201ENST00000331462 SNX10Q9Y5X0 201 aa22.85■■□□□ 1.25
HOXD1-201ENST00000331462 MYBPHLA2RUH7 354 aa22.85■■□□□ 1.25
HOXD1-201ENST00000331462 BCAS2O75934 225 aaPredicted RBP22.85■■□□□ 1.25
HOXD1-201ENST00000331462 DNAJB13P59910 316 aa22.85■■□□□ 1.25
HOXD1-201ENST00000331462 IRF5Q13568 498 aa22.85■■□□□ 1.25
HOXD1-201ENST00000331462 TLR1Q15399 786 aa22.85■■□□□ 1.25
HOXD1-201ENST00000331462 OTOP3Q7RTS5 596 aa22.85■■□□□ 1.25
HOXD1-201ENST00000331462 PIWIL4Q7Z3Z4 852 aaKnown RBP22.85■■□□□ 1.25
HOXD1-201ENST00000331462 SLC41A1Q8IVJ1 513 aa22.85■■□□□ 1.25
HOXD1-201ENST00000331462 SCML4Q8N228 414 aa22.85■■□□□ 1.25
HOXD1-201ENST00000331462 SMARCD1Q96GM5 515 aa22.85■■□□□ 1.25
HOXD1-201ENST00000331462 PPP1R2P1Q96PQ5 205 aa22.85■■□□□ 1.25
HOXD1-201ENST00000331462 TSPYL2Q9H2G4 693 aaPredicted RBP22.85■■□□□ 1.25
HOXD1-201ENST00000331462 WDR41Q9HAD4 459 aa22.85■■□□□ 1.25
HOXD1-201ENST00000331462 EFCAB1Q9HAE3 211 aa22.85■■□□□ 1.25
HOXD1-201ENST00000331462 MRGBPQ9NV56 204 aa22.85■■□□□ 1.25
HOXD1-201ENST00000331462 CDH9Q9ULB4 789 aa22.85■■□□□ 1.25
HOXD1-201ENST00000331462 GNEQ9Y223 722 aaKnown RBP22.85■■□□□ 1.25
HOXD1-201ENST00000331462 PRSS51A0A1B0GVH4 220 aa22.84■■□□□ 1.25
HOXD1-201ENST00000331462 DYNC1LI2O43237 492 aaPredicted RBP22.84■■□□□ 1.25
HOXD1-201ENST00000331462 ANXA9O76027 345 aa22.84■■□□□ 1.25
HOXD1-201ENST00000331462 SMIM18P0DKX4 95 aa22.84■■□□□ 1.25
HOXD1-201ENST00000331462 ARNTP27540 789 aa22.84■■□□□ 1.25
HOXD1-201ENST00000331462 RABGGTBP53611 331 aa22.84■■□□□ 1.25
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