RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000298527.10

CLEC1B-201, Transcript of C-type lectin domain family 1 member B, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene CLEC1B, Length 952 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLEC1B-201ENST00000298527 PERM1Q5SV97 790 aa16.5■□□□□ 0.23
CLEC1B-201ENST00000298527 ZNF658Q5TYW1 1059 aaPredicted RBP16.5■□□□□ 0.23
CLEC1B-201ENST00000298527 ZSCAN30Q86W11 494 aa16.5■□□□□ 0.23
CLEC1B-201ENST00000298527 DEFB106AQ8N104 65 aa16.5■□□□□ 0.23
CLEC1B-201ENST00000298527 CHST14Q8NCH0 376 aa16.5■□□□□ 0.23
CLEC1B-201ENST00000298527 OR2A12Q8NGT7 310 aa16.5■□□□□ 0.23
CLEC1B-201ENST00000298527 GRIN3AQ8TCU5 1115 aa16.5■□□□□ 0.23
CLEC1B-201ENST00000298527 LMX1AQ8TE12 382 aa16.5■□□□□ 0.23
CLEC1B-201ENST00000298527 FEM1CQ96JP0 617 aa16.5■□□□□ 0.23
CLEC1B-201ENST00000298527 SLC17A9Q9BYT1 436 aa16.5■□□□□ 0.23
CLEC1B-201ENST00000298527 THAP9Q9H5L6 903 aa16.5■□□□□ 0.23
CLEC1B-201ENST00000298527 SPASTQ9UBP0 616 aa16.5■□□□□ 0.23
CLEC1B-201ENST00000298527 OR51B4Q9Y5P0 310 aa16.5■□□□□ 0.23
CLEC1B-201ENST00000298527 TLN1Q9Y490 2541 aaKnown RBP16.5■□□□□ 0.23
CLEC1B-201ENST00000298527 DOPEY2Q9Y3R5 2298 aa16.49■□□□□ 0.23
CLEC1B-201ENST00000298527 POM121BA6NF01 834 aa16.49■□□□□ 0.23
CLEC1B-201ENST00000298527 K7ERQ8 282 aa16.49■□□□□ 0.23
CLEC1B-201ENST00000298527 NOBOXO60393 691 aa16.49■□□□□ 0.23
CLEC1B-201ENST00000298527 SNAP91O60641 907 aa16.49■□□□□ 0.23
CLEC1B-201ENST00000298527 PPFIA2O75334 1257 aa16.49■□□□□ 0.23
CLEC1B-201ENST00000298527 LETM1O95202 739 aaPredicted RBP16.49■□□□□ 0.23
CLEC1B-201ENST00000298527 FAM87AP0C7U9 286 aa16.49■□□□□ 0.23
CLEC1B-201ENST00000298527 GP1BBP13224 206 aa16.49■□□□□ 0.23
CLEC1B-201ENST00000298527 LRRC63Q05C16 580 aa16.49■□□□□ 0.23
CLEC1B-201ENST00000298527 EIF4EBP2Q13542 120 aaPredicted RBP16.49■□□□□ 0.23
CLEC1B-201ENST00000298527 FBXO39Q8N4B4 442 aa16.49■□□□□ 0.23
CLEC1B-201ENST00000298527 STK32AQ8WU08 396 aa16.49■□□□□ 0.23
CLEC1B-201ENST00000298527 CCDC3Q9BQI4 270 aa16.49■□□□□ 0.23
CLEC1B-201ENST00000298527 SYNDIG1Q9H7V2 258 aa16.49■□□□□ 0.23
CLEC1B-201ENST00000298527 SEPT10Q9P0V9 454 aa16.49■□□□□ 0.23
CLEC1B-201ENST00000298527 KLF15Q9UIH9 416 aa16.49■□□□□ 0.23
CLEC1B-201ENST00000298527 HS3ST4Q9Y661 456 aa16.49■□□□□ 0.23
CLEC1B-201ENST00000298527 A0A1W2PQ27 194 aa16.48■□□□□ 0.23
CLEC1B-201ENST00000298527 A0A1W2PQ64 194 aa16.48■□□□□ 0.23
CLEC1B-201ENST00000298527 RNF103O00237 685 aa16.48■□□□□ 0.23
CLEC1B-201ENST00000298527 NTN3O00634 580 aaPredicted RBP16.48■□□□□ 0.23
CLEC1B-201ENST00000298527 FPGTO14772 594 aa16.48■□□□□ 0.23
CLEC1B-201ENST00000298527 THAP12O43422 761 aa16.48■□□□□ 0.23
CLEC1B-201ENST00000298527 MED7O43513 233 aa16.48■□□□□ 0.23
CLEC1B-201ENST00000298527 CLDN11O75508 207 aa16.48■□□□□ 0.23
CLEC1B-201ENST00000298527 PAK4O96013 591 aaPredicted RBP16.48■□□□□ 0.23
CLEC1B-201ENST00000298527 RHOCP08134 193 aa16.48■□□□□ 0.23
CLEC1B-201ENST00000298527 LIPCP11150 499 aa16.48■□□□□ 0.23
CLEC1B-201ENST00000298527 RRM1P23921 792 aa16.48■□□□□ 0.23
CLEC1B-201ENST00000298527 RECQLP46063 649 aaPredicted RBP16.48■□□□□ 0.23
CLEC1B-201ENST00000298527 GCNT1Q02742 428 aa16.48■□□□□ 0.23
CLEC1B-201ENST00000298527 NME3Q13232 169 aa16.48■□□□□ 0.23
CLEC1B-201ENST00000298527 PDE1CQ14123 709 aaPredicted RBP16.48■□□□□ 0.23
CLEC1B-201ENST00000298527 UBAP2LQ14157 1087 aaKnown RBP16.48■□□□□ 0.23
CLEC1B-201ENST00000298527 DRAP1Q14919 205 aaPredicted RBP16.48■□□□□ 0.23
CLEC1B-201ENST00000298527 ARSIQ5FYB1 569 aa16.48■□□□□ 0.23
CLEC1B-201ENST00000298527 TMEM110Q86TL2 294 aa16.48■□□□□ 0.23
CLEC1B-201ENST00000298527 ZSCAN1Q8NBB4 408 aa16.48■□□□□ 0.23
CLEC1B-201ENST00000298527 LMO3Q8TAP4 145 aa16.48■□□□□ 0.23
CLEC1B-201ENST00000298527 TBATAQ96M53 351 aa16.48■□□□□ 0.23
CLEC1B-201ENST00000298527 KREMEN1Q96MU8 473 aa16.48■□□□□ 0.23
CLEC1B-201ENST00000298527 LENG8Q96PV6 779 aaPredicted RBP16.48■□□□□ 0.23
CLEC1B-201ENST00000298527 C2orf49Q9BVC5 232 aaPredicted RBP16.48■□□□□ 0.23
CLEC1B-201ENST00000298527 STRADBQ9C0K7 418 aa16.48■□□□□ 0.23
CLEC1B-201ENST00000298527 SIK2Q9H0K1 926 aa16.48■□□□□ 0.23
CLEC1B-201ENST00000298527 TNKS2Q9H2K2 1166 aa16.48■□□□□ 0.23
CLEC1B-201ENST00000298527 IL36AQ9UHA7 158 aa16.48■□□□□ 0.23
CLEC1B-201ENST00000298527 VPS51Q9UID3 782 aa16.48■□□□□ 0.23
CLEC1B-201ENST00000298527 TBC1D30Q9Y2I9 924 aa16.48■□□□□ 0.23
CLEC1B-201ENST00000298527 SMAD6O43541 496 aaKnown RBP16.47■□□□□ 0.23
CLEC1B-201ENST00000298527 GRAP2O75791 330 aa16.47■□□□□ 0.23
CLEC1B-201ENST00000298527 ENDOD1O94919 500 aa16.47■□□□□ 0.23
CLEC1B-201ENST00000298527 UGT1A5P35504 534 aa16.47■□□□□ 0.23
CLEC1B-201ENST00000298527 CLCN6P51797 869 aa16.47■□□□□ 0.23
CLEC1B-201ENST00000298527 NEK3P51956 506 aa16.47■□□□□ 0.23
CLEC1B-201ENST00000298527 CDH4P55283 916 aa16.47■□□□□ 0.23
CLEC1B-201ENST00000298527 TLE1Q04724 770 aa16.47■□□□□ 0.23
CLEC1B-201ENST00000298527 COBLL1Q53SF7 1204 aa16.47■□□□□ 0.23
CLEC1B-201ENST00000298527 ESRP1Q6NXG1 681 aaKnown RBP16.47■□□□□ 0.23
CLEC1B-201ENST00000298527 LINGO4Q6UY18 593 aa16.47■□□□□ 0.23
CLEC1B-201ENST00000298527 RAB11FIP2Q7L804 512 aa16.47■□□□□ 0.23
CLEC1B-201ENST00000298527 JAMLQ86YT9 394 aa16.47■□□□□ 0.23
CLEC1B-201ENST00000298527 SLC35F3Q8IY50 421 aa16.47■□□□□ 0.23
CLEC1B-201ENST00000298527 PSMB7Q99436 277 aa16.47■□□□□ 0.23
CLEC1B-201ENST00000298527 GTPBP4Q9BZE4 634 aaKnown RBP16.47■□□□□ 0.23
CLEC1B-201ENST00000298527 SLC25A18Q9H1K4 315 aa16.47■□□□□ 0.23
CLEC1B-201ENST00000298527 PADI4Q9UM07 663 aa16.47■□□□□ 0.23
CLEC1B-201ENST00000298527 FLNCQ14315 2725 aa16.46■□□□□ 0.23
CLEC1B-201ENST00000298527 LMO7DNF2Z398 122 aa16.46■□□□□ 0.23
CLEC1B-201ENST00000298527 PMM2O15305 246 aa16.46■□□□□ 0.23
CLEC1B-201ENST00000298527 RAD51BO15315 384 aa16.46■□□□□ 0.23
CLEC1B-201ENST00000298527 NVLO15381 856 aaKnown RBP16.46■□□□□ 0.23
CLEC1B-201ENST00000298527 PAGE1O75459 146 aa16.46■□□□□ 0.23
CLEC1B-201ENST00000298527 LEFTY1O75610 366 aa16.46■□□□□ 0.23
CLEC1B-201ENST00000298527 CNTN5O94779 1100 aa16.46■□□□□ 0.23
CLEC1B-201ENST00000298527 ANXA6P08133 673 aa16.46■□□□□ 0.23
CLEC1B-201ENST00000298527 GNA15P30679 374 aa16.46■□□□□ 0.23
CLEC1B-201ENST00000298527 SGCGQ13326 291 aa16.46■□□□□ 0.23
CLEC1B-201ENST00000298527 PDCLQ13371 301 aa16.46■□□□□ 0.23
CLEC1B-201ENST00000298527 PTK2BQ14289 1009 aa16.46■□□□□ 0.23
CLEC1B-201ENST00000298527 FGL2Q14314 439 aa16.46■□□□□ 0.23
CLEC1B-201ENST00000298527 C22orf39Q6P5X5 142 aa16.46■□□□□ 0.23
CLEC1B-201ENST00000298527 EHBP1Q8NDI1 1231 aa16.46■□□□□ 0.23
CLEC1B-201ENST00000298527 ZNF606Q8WXB4 792 aa16.46■□□□□ 0.23
CLEC1B-201ENST00000298527 SLC2A13Q96QE2 648 aa16.46■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 22.4 ms