RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000264896.7

SCARB2-201, Transcript of scavenger receptor class B member 2, humanhuman

APPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC

Gene SCARB2, Length 4,792 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Endoplasmic reticulum, Nucleus, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCARB2-201ENST00000264896 CHI3L1P36222 383 aaPredicted RBP17.81■□□□□ 0.44
SCARB2-201ENST00000264896 PSEN1P49768 467 aa17.81■□□□□ 0.44
SCARB2-201ENST00000264896 ANXA11P50995 505 aaKnown RBP17.81■□□□□ 0.44
SCARB2-201ENST00000264896 SQLEQ14534 574 aa17.81■□□□□ 0.44
SCARB2-201ENST00000264896 LPPQ93052 612 aa17.81■□□□□ 0.44
SCARB2-201ENST00000264896 SHISA4Q96DD7 197 aa17.81■□□□□ 0.44
SCARB2-201ENST00000264896 ZMAT2Q96NC0 199 aaKnown RBP17.81■□□□□ 0.44
SCARB2-201ENST00000264896 NDNQ99608 321 aa17.81■□□□□ 0.44
SCARB2-201ENST00000264896 NMUR2Q9GZQ4 415 aa17.81■□□□□ 0.44
SCARB2-201ENST00000264896 OPTCQ9UBM4 332 aa17.81■□□□□ 0.44
SCARB2-201ENST00000264896 GIT1Q9Y2X7 761 aa17.81■□□□□ 0.44
SCARB2-201ENST00000264896 MDM4O15151 490 aa17.81■□□□□ 0.44
SCARB2-201ENST00000264896 PIK3CGP48736 1102 aa17.81■□□□□ 0.44
SCARB2-201ENST00000264896 IL5RAQ01344 420 aa17.81■□□□□ 0.44
SCARB2-201ENST00000264896 INSCQ1MX18 579 aa17.81■□□□□ 0.44
SCARB2-201ENST00000264896 ANKRD22Q5VYY1 191 aa17.81■□□□□ 0.44
SCARB2-201ENST00000264896 IL27RAQ6UWB1 636 aa17.81■□□□□ 0.44
SCARB2-201ENST00000264896 DEFB128Q7Z7B8 93 aa17.81■□□□□ 0.44
SCARB2-201ENST00000264896 SPOCK2Q92563 424 aa17.81■□□□□ 0.44
SCARB2-201ENST00000264896 MARK4Q96L34 752 aa17.81■□□□□ 0.44
SCARB2-201ENST00000264896 IGSF6O95976 241 aa17.81■□□□□ 0.44
SCARB2-201ENST00000264896 RRM2P31350 389 aa17.81■□□□□ 0.44
SCARB2-201ENST00000264896 BRMS1LQ5PSV4 323 aa17.81■□□□□ 0.44
SCARB2-201ENST00000264896 PMF1Q6P1K2 205 aa17.81■□□□□ 0.44
SCARB2-201ENST00000264896 ZDHHC24Q6UX98 284 aa17.81■□□□□ 0.44
SCARB2-201ENST00000264896 EID3Q8N140 333 aa17.81■□□□□ 0.44
SCARB2-201ENST00000264896 TMEM159Q96B96 161 aa17.81■□□□□ 0.44
SCARB2-201ENST00000264896 FAM124BQ9H5Z6 455 aaPredicted RBP17.81■□□□□ 0.44
SCARB2-201ENST00000264896 FAM105AQ9NUU6 356 aa17.81■□□□□ 0.44
SCARB2-201ENST00000264896 PNPOQ9NVS9 261 aa17.81■□□□□ 0.44
SCARB2-201ENST00000264896 ZMYM5Q9UJ78 669 aa17.81■□□□□ 0.44
SCARB2-201ENST00000264896 SNED1Q8TER0 1413 aa17.81■□□□□ 0.44
SCARB2-201ENST00000264896 SMIM35A0A1B0GVV1 85 aa17.8■□□□□ 0.44
SCARB2-201ENST00000264896 FOXO6A8MYZ6 492 aa17.8■□□□□ 0.44
SCARB2-201ENST00000264896 GSC2O15499 205 aa17.8■□□□□ 0.44
SCARB2-201ENST00000264896 WFS1O76024 890 aa17.8■□□□□ 0.44
SCARB2-201ENST00000264896 USP4Q13107 963 aa17.8■□□□□ 0.44
SCARB2-201ENST00000264896 BOP1Q14137 746 aaKnown RBP17.8■□□□□ 0.44
SCARB2-201ENST00000264896 TEX44Q53QW1 395 aa17.8■□□□□ 0.44
SCARB2-201ENST00000264896 CAMK1DQ8IU85 385 aa17.8■□□□□ 0.44
SCARB2-201ENST00000264896 GLMNQ92990 594 aa17.8■□□□□ 0.44
SCARB2-201ENST00000264896 FCRL2Q96LA5 508 aaPredicted RBP17.8■□□□□ 0.44
SCARB2-201ENST00000264896 A0A087WXM4 84 aa17.8■□□□□ 0.44
SCARB2-201ENST00000264896 RGS14O43566 566 aa17.8■□□□□ 0.44
SCARB2-201ENST00000264896 CD48P09326 243 aa17.8■□□□□ 0.44
SCARB2-201ENST00000264896 PBLDP30039 288 aaPredicted RBP17.8■□□□□ 0.44
SCARB2-201ENST00000264896 WNT3AP56704 352 aa17.8■□□□□ 0.44
SCARB2-201ENST00000264896 TRPC4APQ8TEL6 797 aa17.8■□□□□ 0.44
SCARB2-201ENST00000264896 MAML3Q96JK9 1138 aa17.8■□□□□ 0.44
SCARB2-201ENST00000264896 DNM1LO00429 736 aa17.8■□□□□ 0.44
SCARB2-201ENST00000264896 TRAFD1O14545 582 aaPredicted RBP17.8■□□□□ 0.44
SCARB2-201ENST00000264896 PGK1P00558 417 aa17.8■□□□□ 0.44
SCARB2-201ENST00000264896 OR56A5P0C7T3 313 aa17.8■□□□□ 0.44
SCARB2-201ENST00000264896 AAGABQ6PD74 315 aa17.8■□□□□ 0.44
SCARB2-201ENST00000264896 ITFG1Q8TB96 612 aa17.8■□□□□ 0.44
SCARB2-201ENST00000264896 PDZD7Q9H5P4 517 aa17.8■□□□□ 0.44
SCARB2-201ENST00000264896 ZDHHC18Q9NUE0 388 aa17.8■□□□□ 0.44
SCARB2-201ENST00000264896 SH3BP4Q9P0V3 963 aa17.8■□□□□ 0.44
SCARB2-201ENST00000264896 IPPQ9Y573 584 aa17.8■□□□□ 0.44
SCARB2-201ENST00000264896 SLIT2O94813 1529 aa17.8■□□□□ 0.44
SCARB2-201ENST00000264896 TULP2O00295 520 aa17.8■□□□□ 0.44
SCARB2-201ENST00000264896 STAU1O95793 577 aaKnown RBP17.8■□□□□ 0.44
SCARB2-201ENST00000264896 PCNAP12004 261 aa17.8■□□□□ 0.44
SCARB2-201ENST00000264896 TMED10P49755 219 aaKnown RBP17.8■□□□□ 0.44
SCARB2-201ENST00000264896 NRF1Q16656 503 aa17.8■□□□□ 0.44
SCARB2-201ENST00000264896 ZDHHC13Q8IUH4 622 aa17.8■□□□□ 0.44
SCARB2-201ENST00000264896 FAM126AQ9BYI3 521 aaPredicted RBP17.8■□□□□ 0.44
SCARB2-201ENST00000264896 MPP6Q9NZW5 540 aa17.8■□□□□ 0.44
SCARB2-201ENST00000264896 COPG2Q9UBF2 871 aa17.8■□□□□ 0.44
SCARB2-201ENST00000264896 TGDSO95455 350 aa17.79■□□□□ 0.44
SCARB2-201ENST00000264896 POU1F1P28069 291 aa17.79■□□□□ 0.44
SCARB2-201ENST00000264896 PPIDQ08752 370 aaKnown RBP17.79■□□□□ 0.44
SCARB2-201ENST00000264896 SUPV3L1Q8IYB8 786 aaKnown RBP eCLIP17.79■□□□□ 0.44
SCARB2-201ENST00000264896 FBXW8Q8N3Y1 598 aa17.79■□□□□ 0.44
SCARB2-201ENST00000264896 SSU72Q9NP77 194 aaKnown RBP17.79■□□□□ 0.44
SCARB2-201ENST00000264896 RHBDL2Q9NX52 303 aa17.79■□□□□ 0.44
SCARB2-201ENST00000264896 ANAPC2Q9UJX6 822 aa17.79■□□□□ 0.44
SCARB2-201ENST00000264896 ATRNL1Q5VV63 1379 aa17.79■□□□□ 0.44
SCARB2-201ENST00000264896 STK25O00506 426 aa17.79■□□□□ 0.44
SCARB2-201ENST00000264896 TRIM38O00635 465 aa17.79■□□□□ 0.44
SCARB2-201ENST00000264896 FAM155BO75949 473 aa17.79■□□□□ 0.44
SCARB2-201ENST00000264896 PTPN9P43378 593 aa17.79■□□□□ 0.44
SCARB2-201ENST00000264896 SLC44A4Q53GD3 710 aa17.79■□□□□ 0.44
SCARB2-201ENST00000264896 CERCAMQ5T4B2 595 aa17.79■□□□□ 0.44
SCARB2-201ENST00000264896 TTC7BQ86TV6 843 aa17.79■□□□□ 0.44
SCARB2-201ENST00000264896 RCN3Q96D15 328 aa17.79■□□□□ 0.44
SCARB2-201ENST00000264896 GOLGA2P5Q9HBQ8 144 aa17.79■□□□□ 0.44
SCARB2-201ENST00000264896 ZNF180Q9UJW8 692 aa17.79■□□□□ 0.44
SCARB2-201ENST00000264896 PRPF19Q9UMS4 504 aaKnown RBP17.79■□□□□ 0.44
SCARB2-201ENST00000264896 H3BMM5 538 aa17.79■□□□□ 0.44
SCARB2-201ENST00000264896 PEX11AO75192 247 aa17.79■□□□□ 0.44
SCARB2-201ENST00000264896 EPB42P16452 691 aa17.79■□□□□ 0.44
SCARB2-201ENST00000264896 S100A3P33764 101 aa17.79■□□□□ 0.44
SCARB2-201ENST00000264896 STARD3Q14849 445 aa17.79■□□□□ 0.44
SCARB2-201ENST00000264896 CLVS1Q8IUQ0 354 aaPredicted RBP17.79■□□□□ 0.44
SCARB2-201ENST00000264896 C7orf26Q96N11 449 aa17.79■□□□□ 0.44
SCARB2-201ENST00000264896 CDH19Q9H159 772 aa17.79■□□□□ 0.44
SCARB2-201ENST00000264896 SDCBP2Q9H190 292 aa17.79■□□□□ 0.44
SCARB2-201ENST00000264896 SPAG4Q9NPE6 437 aa17.79■□□□□ 0.44
SCARB2-201ENST00000264896 UXTQ9UBK9 157 aaPredicted RBP17.79■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 36.2 ms