RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000264779.6

GPBP1-201, Transcript of GC-rich promoter binding protein 1, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC

Gene GPBP1, Length 1,786 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GPBP1-201ENST00000264779 ACAD9Q9H845 621 aa3.3□□□□□ -1.88
GPBP1-201ENST00000264779 CCDC180Q9P1Z9 1646 aa3.3□□□□□ -1.88
GPBP1-201ENST00000264779 TAGLN3Q9UI15 199 aa3.3□□□□□ -1.88
GPBP1-201ENST00000264779 FBXO2Q9UK22 296 aaPredicted RBP3.3□□□□□ -1.88
GPBP1-201ENST00000264779 BAG5Q9UL15 447 aa3.3□□□□□ -1.88
GPBP1-201ENST00000264779 TMCC3Q9ULS5 477 aa3.3□□□□□ -1.88
GPBP1-201ENST00000264779 C19orf53Q9UNZ5 99 aaPredicted RBP3.3□□□□□ -1.88
GPBP1-201ENST00000264779 ICKQ9UPZ9 632 aa3.3□□□□□ -1.88
GPBP1-201ENST00000264779 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP3.29□□□□□ -1.88
GPBP1-201ENST00000264779 NPIPB13A6NJU9 1138 aa3.29□□□□□ -1.88
GPBP1-201ENST00000264779 TRIM64CA6NLI5 447 aa3.29□□□□□ -1.88
GPBP1-201ENST00000264779 NPIPB5A8MRT5 1133 aa3.29□□□□□ -1.88
GPBP1-201ENST00000264779 NPIPB4C9JG80 1138 aa3.29□□□□□ -1.88
GPBP1-201ENST00000264779 IPO8O15397 1037 aaKnown RBP3.29□□□□□ -1.88
GPBP1-201ENST00000264779 TCEA3O75764 348 aa3.29□□□□□ -1.88
GPBP1-201ENST00000264779 CYP21A2P08686 494 aa3.29□□□□□ -1.88
GPBP1-201ENST00000264779 CASQ1P31415 396 aa3.29□□□□□ -1.88
GPBP1-201ENST00000264779 PPP3CCP48454 512 aa3.29□□□□□ -1.88
GPBP1-201ENST00000264779 EIF5P55010 431 aaKnown RBP3.29□□□□□ -1.88
GPBP1-201ENST00000264779 GEMIN4P57678 1058 aaKnown RBP3.29□□□□□ -1.88
GPBP1-201ENST00000264779 DSCR9P59020 149 aa3.29□□□□□ -1.88
GPBP1-201ENST00000264779 IFT88Q13099 833 aa3.29□□□□□ -1.88
GPBP1-201ENST00000264779 TOMM20Q15388 145 aa3.29□□□□□ -1.88
GPBP1-201ENST00000264779 DUSP6Q16828 381 aa3.29□□□□□ -1.88
GPBP1-201ENST00000264779 PLK5Q496M5 336 aa3.29□□□□□ -1.88
GPBP1-201ENST00000264779 HYIQ5T013 277 aa3.29□□□□□ -1.88
GPBP1-201ENST00000264779 DGAT2L7PQ6IED9 249 aa3.29□□□□□ -1.88
GPBP1-201ENST00000264779 SULT6B1Q6IMI4 303 aa3.29□□□□□ -1.88
GPBP1-201ENST00000264779 CCDC117Q8IWD4 279 aaPredicted RBP3.29□□□□□ -1.88
GPBP1-201ENST00000264779 C2CD4CQ8TF44 421 aa3.29□□□□□ -1.88
GPBP1-201ENST00000264779 FAM84BQ96KN1 310 aaPredicted RBP3.29□□□□□ -1.88
GPBP1-201ENST00000264779 LMLNQ96KR4 655 aa3.29□□□□□ -1.88
GPBP1-201ENST00000264779 NPAS1Q99742 590 aa3.29□□□□□ -1.88
GPBP1-201ENST00000264779 IFT27Q9BW83 186 aa3.29□□□□□ -1.88
GPBP1-201ENST00000264779 RANBP17Q9H2T7 1088 aaKnown RBP3.29□□□□□ -1.88
GPBP1-201ENST00000264779 ZDHHC7Q9NXF8 308 aa3.29□□□□□ -1.88
GPBP1-201ENST00000264779 LUZP4Q9P127 313 aa3.29□□□□□ -1.88
GPBP1-201ENST00000264779 KCND3Q9UK17 655 aa3.29□□□□□ -1.88
GPBP1-201ENST00000264779 EME2A4GXA9 379 aaPredicted RBP3.28□□□□□ -1.88
GPBP1-201ENST00000264779 MS4A18H0YCH9 400 aa3.28□□□□□ -1.88
GPBP1-201ENST00000264779 ACOT8O14734 319 aa3.28□□□□□ -1.88
GPBP1-201ENST00000264779 FIBPO43427 364 aa3.28□□□□□ -1.88
GPBP1-201ENST00000264779 TMCC1O94876 653 aa3.28□□□□□ -1.88
GPBP1-201ENST00000264779 HLA-DQA2P01906 255 aa3.28□□□□□ -1.88
GPBP1-201ENST00000264779 FCGR2AP12318 317 aa3.28□□□□□ -1.88
GPBP1-201ENST00000264779 HOXD3P31249 432 aaPredicted RBP3.28□□□□□ -1.88
GPBP1-201ENST00000264779 SERPINF1P36955 418 aa3.28□□□□□ -1.88
GPBP1-201ENST00000264779 AVPR1AP37288 418 aa3.28□□□□□ -1.88
GPBP1-201ENST00000264779 TNNT2P45379 298 aaPredicted RBP3.28□□□□□ -1.88
GPBP1-201ENST00000264779 ZBED6P86452 979 aa3.28□□□□□ -1.88
GPBP1-201ENST00000264779 DCTN1Q14203 1278 aa3.28□□□□□ -1.88
GPBP1-201ENST00000264779 FAM133BQ5BKY9 247 aaKnown RBP3.28□□□□□ -1.88
GPBP1-201ENST00000264779 FSCBQ5H9T9 825 aa3.28□□□□□ -1.88
GPBP1-201ENST00000264779 FAM83BQ5T0W9 1011 aa3.28□□□□□ -1.88
GPBP1-201ENST00000264779 CFAP161Q6P656 301 aa3.28□□□□□ -1.88
GPBP1-201ENST00000264779 DLK2Q6UY11 383 aa3.28□□□□□ -1.88
GPBP1-201ENST00000264779 ZNF367Q7RTV3 350 aa3.28□□□□□ -1.88
GPBP1-201ENST00000264779 LCA5Q86VQ0 697 aa3.28□□□□□ -1.88
GPBP1-201ENST00000264779 SCN4BQ8IWT1 228 aa3.28□□□□□ -1.88
GPBP1-201ENST00000264779 SPICE1Q8N0Z3 855 aa3.28□□□□□ -1.88
GPBP1-201ENST00000264779 PPHLN1Q8NEY8 458 aaKnown RBP3.28□□□□□ -1.88
GPBP1-201ENST00000264779 CEP76Q8TAP6 659 aa3.28□□□□□ -1.88
GPBP1-201ENST00000264779 SKA1Q96BD8 255 aa3.28□□□□□ -1.88
GPBP1-201ENST00000264779 CFAP53Q96M91 514 aa3.28□□□□□ -1.88
GPBP1-201ENST00000264779 FAM210AQ96ND0 272 aa3.28□□□□□ -1.88
GPBP1-201ENST00000264779 KLHL31Q9H511 634 aa3.28□□□□□ -1.88
GPBP1-201ENST00000264779 CD93Q9NPY3 652 aa3.28□□□□□ -1.88
GPBP1-201ENST00000264779 DACT1Q9NYF0 836 aa3.28□□□□□ -1.88
GPBP1-201ENST00000264779 NDUFAF4Q9P032 175 aa3.28□□□□□ -1.88
GPBP1-201ENST00000264779 STK26Q9P289 416 aa3.28□□□□□ -1.88
GPBP1-201ENST00000264779 CDH22Q9UJ99 828 aa3.28□□□□□ -1.88
GPBP1-201ENST00000264779 ZNF112Q9UJU3 913 aa3.28□□□□□ -1.88
GPBP1-201ENST00000264779 GTF2A1LQ9UNN4 478 aa3.28□□□□□ -1.88
GPBP1-201ENST00000264779 UNC13AQ9UPW8 1703 aa3.28□□□□□ -1.88
GPBP1-201ENST00000264779 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa3.28□□□□□ -1.88
GPBP1-201ENST00000264779 HMX3A6NHT5 357 aa3.28□□□□□ -1.89
GPBP1-201ENST00000264779 IFITM10A6NMD0 228 aa3.28□□□□□ -1.89
GPBP1-201ENST00000264779 IPO5O00410 1097 aaKnown RBP3.28□□□□□ -1.89
GPBP1-201ENST00000264779 CHL1O00533 1208 aa3.28□□□□□ -1.89
GPBP1-201ENST00000264779 SYN3O14994 580 aa3.28□□□□□ -1.89
GPBP1-201ENST00000264779 PSMA3P25788 255 aa3.28□□□□□ -1.89
GPBP1-201ENST00000264779 HOXC13P31276 330 aa3.28□□□□□ -1.89
GPBP1-201ENST00000264779 PIK3CAP42336 1068 aa3.28□□□□□ -1.89
GPBP1-201ENST00000264779 CD151P48509 253 aa3.28□□□□□ -1.89
GPBP1-201ENST00000264779 CDK7P50613 346 aa3.28□□□□□ -1.89
GPBP1-201ENST00000264779 RRP1P56182 461 aaKnown RBP3.28□□□□□ -1.89
GPBP1-201ENST00000264779 ICA1Q05084 483 aa3.28□□□□□ -1.89
GPBP1-201ENST00000264779 DMTNQ08495 405 aa3.28□□□□□ -1.89
GPBP1-201ENST00000264779 HNF4GQ14541 408 aa3.28□□□□□ -1.89
GPBP1-201ENST00000264779 IZUMO4Q1ZYL8 232 aa3.28□□□□□ -1.89
GPBP1-201ENST00000264779 SYTL3Q4VX76 610 aa3.28□□□□□ -1.89
GPBP1-201ENST00000264779 VWA5B1Q5TIE3 1220 aa3.28□□□□□ -1.89
GPBP1-201ENST00000264779 HEPHL1Q6MZM0 1159 aa3.28□□□□□ -1.89
GPBP1-201ENST00000264779 C16orf54Q6UWD8 224 aa3.28□□□□□ -1.89
GPBP1-201ENST00000264779 CCDC73Q6ZRK6 1079 aa3.28□□□□□ -1.89
GPBP1-201ENST00000264779 NR2C2APQ86WQ0 139 aa3.28□□□□□ -1.89
GPBP1-201ENST00000264779 CPXCR1Q8N123 301 aa3.28□□□□□ -1.89
GPBP1-201ENST00000264779 BICD2Q8TD16 824 aa3.28□□□□□ -1.89
GPBP1-201ENST00000264779 TBC1D20Q96BZ9 403 aa3.28□□□□□ -1.89
GPBP1-201ENST00000264779 TRAPPC9Q96Q05 1148 aa3.28□□□□□ -1.89
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 21.4 ms