RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000264640.8

SMARCE1-201, Transcript of SWI/SNF related, matrix associated, actin dependent regulator of chromatin, subfamily e, member 1, humanhuman

TSL 3

Gene SMARCE1, Length 631 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMARCE1-201ENST00000264640 SMG9Q9H0W8 520 aaKnown RBP7.22□□□□□ -1.25
SMARCE1-201ENST00000264640 XYLT2Q9H1B5 865 aa7.22□□□□□ -1.25
SMARCE1-201ENST00000264640 ZWILCHQ9H900 591 aa7.22□□□□□ -1.25
SMARCE1-201ENST00000264640 DNAJC17Q9NVM6 304 aaKnown RBP7.22□□□□□ -1.25
SMARCE1-201ENST00000264640 PAK5Q9P286 719 aa7.22□□□□□ -1.25
SMARCE1-201ENST00000264640 HESX1Q9UBX0 185 aa7.22□□□□□ -1.25
SMARCE1-201ENST00000264640 STARD13Q9Y3M8 1113 aa7.22□□□□□ -1.25
SMARCE1-201ENST00000264640 C2CD2Q9Y426 696 aa7.22□□□□□ -1.25
SMARCE1-201ENST00000264640 USH1CQ9Y6N9 552 aa7.22□□□□□ -1.25
SMARCE1-201ENST00000264640 TRBV21OR9-2A0A075B6F4 123 aaPredicted RBP7.21□□□□□ -1.26
SMARCE1-201ENST00000264640 OTOL1A6NHN0 477 aaPredicted RBP7.21□□□□□ -1.26
SMARCE1-201ENST00000264640 LACTBL1A8MY62 500 aa7.21□□□□□ -1.26
SMARCE1-201ENST00000264640 ZNF487B1APH4 448 aa7.21□□□□□ -1.26
SMARCE1-201ENST00000264640 H7C0C1 242 aa7.21□□□□□ -1.26
SMARCE1-201ENST00000264640 TMEM189-UBE2V1I3L0A0 370 aa7.21□□□□□ -1.26
SMARCE1-201ENST00000264640 M0QYV0 167 aa7.21□□□□□ -1.26
SMARCE1-201ENST00000264640 TM9SF1O15321 606 aa7.21□□□□□ -1.26
SMARCE1-201ENST00000264640 ATG13O75143 517 aa7.21□□□□□ -1.26
SMARCE1-201ENST00000264640 ATP2C2O75185 946 aa7.21□□□□□ -1.26
SMARCE1-201ENST00000264640 LRCH4O75427 683 aa7.21□□□□□ -1.26
SMARCE1-201ENST00000264640 OAS1P00973 400 aaKnown RBP7.21□□□□□ -1.26
SMARCE1-201ENST00000264640 CXCL8P10145 99 aa7.21□□□□□ -1.26
SMARCE1-201ENST00000264640 KRT10P13645 584 aa7.21□□□□□ -1.26
SMARCE1-201ENST00000264640 TGM2P21980 687 aa7.21□□□□□ -1.26
SMARCE1-201ENST00000264640 CA4P22748 312 aa7.21□□□□□ -1.26
SMARCE1-201ENST00000264640 RFC1P35251 1148 aaPredicted RBP7.21□□□□□ -1.26
SMARCE1-201ENST00000264640 ATP5OP48047 213 aa7.21□□□□□ -1.26
SMARCE1-201ENST00000264640 ZNF143P52747 638 aaPredicted RBP7.21□□□□□ -1.26
SMARCE1-201ENST00000264640 YARSP54577 528 aaKnown RBP7.21□□□□□ -1.26
SMARCE1-201ENST00000264640 RAD23BP54727 409 aa7.21□□□□□ -1.26
SMARCE1-201ENST00000264640 EPHA5P54756 1037 aa7.21□□□□□ -1.26
SMARCE1-201ENST00000264640 EIF3EP60228 445 aaKnown RBP7.21□□□□□ -1.26
SMARCE1-201ENST00000264640 SARNPP82979 210 aaKnown RBP7.21□□□□□ -1.26
SMARCE1-201ENST00000264640 OTUD4Q01804 1114 aaKnown RBP7.21□□□□□ -1.26
SMARCE1-201ENST00000264640 SLC25A11Q02978 314 aaKnown RBP7.21□□□□□ -1.26
SMARCE1-201ENST00000264640 SOX4Q06945 474 aaPredicted RBP7.21□□□□□ -1.26
SMARCE1-201ENST00000264640 GRSF1Q12849 480 aaKnown RBP eCLIP7.21□□□□□ -1.26
SMARCE1-201ENST00000264640 RIPK1Q13546 671 aa7.21□□□□□ -1.26
SMARCE1-201ENST00000264640 ITPRIPL2Q3MIP1 535 aa7.21□□□□□ -1.26
SMARCE1-201ENST00000264640 PTPN20Q4JDL3 420 aa7.21□□□□□ -1.26
SMARCE1-201ENST00000264640 CTXN3Q4LDR2 81 aa7.21□□□□□ -1.26
SMARCE1-201ENST00000264640 SEZ6Q53EL9 994 aa7.21□□□□□ -1.26
SMARCE1-201ENST00000264640 TMEM196Q5HYL7 178 aa7.21□□□□□ -1.26
SMARCE1-201ENST00000264640 EFHC2Q5JST6 749 aa7.21□□□□□ -1.26
SMARCE1-201ENST00000264640 SPDYAQ5MJ70 313 aa7.21□□□□□ -1.26
SMARCE1-201ENST00000264640 FAM102AQ5T9C2 384 aaPredicted RBP7.21□□□□□ -1.26
SMARCE1-201ENST00000264640 TRIM68Q6AZZ1 485 aa7.21□□□□□ -1.26
SMARCE1-201ENST00000264640 JADE1Q6IE81 842 aa7.21□□□□□ -1.26
SMARCE1-201ENST00000264640 OR6B2Q6IFH4 312 aa7.21□□□□□ -1.26
SMARCE1-201ENST00000264640 CYB5D1Q6P9G0 228 aa7.21□□□□□ -1.26
SMARCE1-201ENST00000264640 DARS2Q6PI48 645 aaKnown RBP7.21□□□□□ -1.26
SMARCE1-201ENST00000264640 LCLAT1Q6UWP7 414 aa7.21□□□□□ -1.26
SMARCE1-201ENST00000264640 BZW1Q7L1Q6 419 aaKnown RBP7.21□□□□□ -1.26
SMARCE1-201ENST00000264640 TTC30AQ86WT1 665 aa7.21□□□□□ -1.26
SMARCE1-201ENST00000264640 TMC8Q8IU68 726 aa7.21□□□□□ -1.26
SMARCE1-201ENST00000264640 FUKQ8N0W3 1084 aa7.21□□□□□ -1.26
SMARCE1-201ENST00000264640 CAMKK1Q8N5S9 505 aa7.21□□□□□ -1.26
SMARCE1-201ENST00000264640 PNPLA1Q8N8W4 532 aa7.21□□□□□ -1.26
SMARCE1-201ENST00000264640 ARMC2Q8NEN0 867 aa7.21□□□□□ -1.26
SMARCE1-201ENST00000264640 BEST2Q8NFU1 509 aa7.21□□□□□ -1.26
SMARCE1-201ENST00000264640 GDAP1Q8TB36 358 aa7.21□□□□□ -1.26
SMARCE1-201ENST00000264640 ACTL9Q8TC94 416 aa7.21□□□□□ -1.26
SMARCE1-201ENST00000264640 ZNF398Q8TD17 642 aa7.21□□□□□ -1.26
SMARCE1-201ENST00000264640 TEKT4Q8WW24 435 aa7.21□□□□□ -1.26
SMARCE1-201ENST00000264640 MAML1Q92585 1016 aa7.21□□□□□ -1.26
SMARCE1-201ENST00000264640 PRCCQ92733 491 aaPredicted RBP7.21□□□□□ -1.26
SMARCE1-201ENST00000264640 E2F7Q96AV8 911 aa7.21□□□□□ -1.26
SMARCE1-201ENST00000264640 CAMK1GQ96NX5 476 aa7.21□□□□□ -1.26
SMARCE1-201ENST00000264640 PGLYRP2Q96PD5 576 aa7.21□□□□□ -1.26
SMARCE1-201ENST00000264640 HERPUD2Q9BSE4 406 aa7.21□□□□□ -1.26
SMARCE1-201ENST00000264640 GTPBP2Q9BX10 602 aaKnown RBP7.21□□□□□ -1.26
SMARCE1-201ENST00000264640 EBF3Q9H4W6 596 aa7.21□□□□□ -1.26
SMARCE1-201ENST00000264640 PDZD7Q9H5P4 517 aa7.21□□□□□ -1.26
SMARCE1-201ENST00000264640 ECT2Q9H8V3 914 aa7.21□□□□□ -1.26
SMARCE1-201ENST00000264640 PLEKHA5Q9HAU0 1116 aa7.21□□□□□ -1.26
SMARCE1-201ENST00000264640 FBRSL1Q9HCM7 1045 aaKnown RBP7.21□□□□□ -1.26
SMARCE1-201ENST00000264640 CYLDQ9NQC7 956 aa7.21□□□□□ -1.26
SMARCE1-201ENST00000264640 METTL5Q9NRN9 209 aaKnown RBP7.21□□□□□ -1.26
SMARCE1-201ENST00000264640 FGFR1OP2Q9NVK5 253 aa7.21□□□□□ -1.26
SMARCE1-201ENST00000264640 TBK1Q9UHD2 729 aa7.21□□□□□ -1.26
SMARCE1-201ENST00000264640 MBD1Q9UIS9 605 aaPredicted RBP7.21□□□□□ -1.26
SMARCE1-201ENST00000264640 WDR3Q9UNX4 943 aaKnown RBP eCLIP7.21□□□□□ -1.26
SMARCE1-201ENST00000264640 SLC12A4Q9UP95 1085 aa7.21□□□□□ -1.26
SMARCE1-201ENST00000264640 YIPF1Q9Y548 306 aa7.21□□□□□ -1.26
SMARCE1-201ENST00000264640 GOLGA4Q13439 2230 aaKnown RBP7.21□□□□□ -1.26
SMARCE1-201ENST00000264640 FAM221BA6H8Z2 402 aa7.2□□□□□ -1.26
SMARCE1-201ENST00000264640 E7ESA3 106 aa7.2□□□□□ -1.26
SMARCE1-201ENST00000264640 TP73O15350 636 aa7.2□□□□□ -1.26
SMARCE1-201ENST00000264640 MGRN1O60291 552 aa7.2□□□□□ -1.26
SMARCE1-201ENST00000264640 SOAT2O75908 522 aa7.2□□□□□ -1.26
SMARCE1-201ENST00000264640 MT-ND3P03897 115 aa7.2□□□□□ -1.26
SMARCE1-201ENST00000264640 ITGB3P05106 788 aa7.2□□□□□ -1.26
SMARCE1-201ENST00000264640 CFIP05156 583 aa7.2□□□□□ -1.26
SMARCE1-201ENST00000264640 EDN1P05305 212 aa7.2□□□□□ -1.26
SMARCE1-201ENST00000264640 INHBAP08476 426 aa7.2□□□□□ -1.26
SMARCE1-201ENST00000264640 OR4Q2P0C623 313 aa7.2□□□□□ -1.26
SMARCE1-201ENST00000264640 RBP3P10745 1247 aa7.2□□□□□ -1.26
SMARCE1-201ENST00000264640 CPB1P15086 417 aa7.2□□□□□ -1.26
SMARCE1-201ENST00000264640 NQO1P15559 274 aaKnown RBP7.2□□□□□ -1.26
SMARCE1-201ENST00000264640 PDGFRAP16234 1089 aa7.2□□□□□ -1.26
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