RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000625364.1

PPA1-206, Transcript of pyrophosphatase (inorganic) 1, human

TSL 5 BASIC

Gene PPA1, Length 644 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus, Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
PPA1-206	ENST00000625364	IPO11	Q9UI26	975 aa	Known RBP	14.75	□□□□□ -0.05
PPA1-206	ENST00000625364	KLF15	Q9UIH9	416 aa		14.75	□□□□□ -0.05
PPA1-206	ENST00000625364	VPS28	Q9UK41	221 aa		14.75	□□□□□ -0.05
PPA1-206	ENST00000625364	UNC13C	Q8NB66	2214 aa		14.75	□□□□□ -0.05
PPA1-206	ENST00000625364	SCN8A	Q9UQD0	1980 aa		14.74	□□□□□ -0.05
PPA1-206	ENST00000625364	KCNU1	A8MYU2	1149 aa		14.74	□□□□□ -0.05
PPA1-206	ENST00000625364	PPFIA2	O75334	1257 aa		14.74	□□□□□ -0.05
PPA1-206	ENST00000625364	RHOBTB3	O94955	611 aa		14.74	□□□□□ -0.05
PPA1-206	ENST00000625364	GP1BB	P13224	206 aa		14.74	□□□□□ -0.05
PPA1-206	ENST00000625364	RABIF	P47224	123 aa		14.74	□□□□□ -0.05
PPA1-206	ENST00000625364	CENPC	Q03188	943 aa		14.74	□□□□□ -0.05
PPA1-206	ENST00000625364	LRMP	Q12912	555 aa		14.74	□□□□□ -0.05
PPA1-206	ENST00000625364	EIF3I	Q13347	325 aa	Known RBP	14.74	□□□□□ -0.05
PPA1-206	ENST00000625364	PDE1C	Q14123	709 aa	Predicted RBP	14.74	□□□□□ -0.05
PPA1-206	ENST00000625364	UBAP2L	Q14157	1087 aa	Known RBP	14.74	□□□□□ -0.05
PPA1-206	ENST00000625364	STIL	Q15468	1287 aa		14.74	□□□□□ -0.05
PPA1-206	ENST00000625364	ZCWPW2	Q504Y3	356 aa		14.74	□□□□□ -0.05
PPA1-206	ENST00000625364	TCERG1L	Q5VWI1	586 aa		14.74	□□□□□ -0.05
PPA1-206	ENST00000625364	SYPL2	Q5VXT5	272 aa		14.74	□□□□□ -0.05
PPA1-206	ENST00000625364	BEND5	Q7L4P6	421 aa		14.74	□□□□□ -0.05
PPA1-206	ENST00000625364	SLC35F3	Q8IY50	421 aa		14.74	□□□□□ -0.05
PPA1-206	ENST00000625364	GUF1	Q8N442	669 aa	Known RBP	14.74	□□□□□ -0.05
PPA1-206	ENST00000625364	FBXO39	Q8N4B4	442 aa		14.74	□□□□□ -0.05
PPA1-206	ENST00000625364	TMIE	Q8NEW7	156 aa		14.74	□□□□□ -0.05
PPA1-206	ENST00000625364	OR52K2	Q8NGK3	314 aa		14.74	□□□□□ -0.05
PPA1-206	ENST00000625364	RPRD1A	Q96P16	312 aa	Predicted RBP	14.74	□□□□□ -0.05
PPA1-206	ENST00000625364	CCDC3	Q9BQI4	270 aa		14.74	□□□□□ -0.05
PPA1-206	ENST00000625364	ZSWIM1	Q9BR11	485 aa		14.74	□□□□□ -0.05
PPA1-206	ENST00000625364	FEM1A	Q9BSK4	669 aa		14.74	□□□□□ -0.05
PPA1-206	ENST00000625364	BOC	Q9BWV1	1114 aa		14.74	□□□□□ -0.05
PPA1-206	ENST00000625364	EPB41L5	Q9HCM4	733 aa		14.74	□□□□□ -0.05
PPA1-206	ENST00000625364	ST7	Q9NRC1	585 aa		14.74	□□□□□ -0.05
PPA1-206	ENST00000625364	SLC12A6	Q9UHW9	1150 aa		14.74	□□□□□ -0.05
PPA1-206	ENST00000625364	COQ4	Q9Y3A0	265 aa		14.74	□□□□□ -0.05
PPA1-206	ENST00000625364	RAD51B	O15315	384 aa		14.73	□□□□□ -0.05
PPA1-206	ENST00000625364	NOBOX	O60393	691 aa		14.73	□□□□□ -0.05
PPA1-206	ENST00000625364	TRUB2	O95900	331 aa	Known RBP	14.73	□□□□□ -0.05
PPA1-206	ENST00000625364	IGLV3-25	P01717	112 aa		14.73	□□□□□ -0.05
PPA1-206	ENST00000625364	PRNP	P04156	253 aa		14.73	□□□□□ -0.05
PPA1-206	ENST00000625364	LIPC	P11150	499 aa		14.73	□□□□□ -0.05
PPA1-206	ENST00000625364	SRC	P12931	536 aa		14.73	□□□□□ -0.05
PPA1-206	ENST00000625364	UGT1A5	P35504	534 aa		14.73	□□□□□ -0.05
PPA1-206	ENST00000625364	RPS21	P63220	83 aa	Known RBP	14.73	□□□□□ -0.05
PPA1-206	ENST00000625364	FGL2	Q14314	439 aa		14.73	□□□□□ -0.05
PPA1-206	ENST00000625364	EDRF1	Q3B7T1	1238 aa		14.73	□□□□□ -0.05
PPA1-206	ENST00000625364	FOXD4L5	Q5VV16	416 aa	Predicted RBP	14.73	□□□□□ -0.05
PPA1-206	ENST00000625364	KIAA1161	Q6NSJ0	714 aa		14.73	□□□□□ -0.05
PPA1-206	ENST00000625364	FBXL22	Q6P050	247 aa		14.73	□□□□□ -0.05
PPA1-206	ENST00000625364	RAB11FIP2	Q7L804	512 aa		14.73	□□□□□ -0.05
PPA1-206	ENST00000625364	ATP11C	Q8NB49	1132 aa		14.73	□□□□□ -0.05
PPA1-206	ENST00000625364	OR2A12	Q8NGT7	310 aa		14.73	□□□□□ -0.05
PPA1-206	ENST00000625364	GRIN3A	Q8TCU5	1115 aa		14.73	□□□□□ -0.05
PPA1-206	ENST00000625364	FOXD4L4	Q8WXT5	416 aa	Predicted RBP	14.73	□□□□□ -0.05
PPA1-206	ENST00000625364	PPP1R16A	Q96I34	528 aa		14.73	□□□□□ -0.05
PPA1-206	ENST00000625364	HDAC8	Q9BY41	377 aa		14.73	□□□□□ -0.05
PPA1-206	ENST00000625364	SLC17A9	Q9BYT1	436 aa		14.73	□□□□□ -0.05
PPA1-206	ENST00000625364	SLTM	Q9NWH9	1034 aa	Known RBP eCLIP	14.73	□□□□□ -0.05
PPA1-206	ENST00000625364	SPAST	Q9UBP0	616 aa		14.73	□□□□□ -0.05
PPA1-206	ENST00000625364	ACSL6	Q9UKU0	697 aa		14.73	□□□□□ -0.05
PPA1-206	ENST00000625364	HS3ST2	Q9Y278	367 aa		14.73	□□□□□ -0.05
PPA1-206	ENST00000625364	PCDHB4	Q9Y5E5	795 aa		14.73	□□□□□ -0.05
PPA1-206	ENST00000625364	OR51B4	Q9Y5P0	310 aa		14.73	□□□□□ -0.05
PPA1-206	ENST00000625364	TEP1	Q99973	2627 aa	Known RBP	14.73	□□□□□ -0.05
PPA1-206	ENST00000625364	RP1L1	Q8IWN7	2480 aa	Predicted RBP	14.72	□□□□□ -0.05
PPA1-206	ENST00000625364	RNF103	O00237	685 aa		14.72	□□□□□ -0.05
PPA1-206	ENST00000625364	NTN3	O00634	580 aa	Predicted RBP	14.72	□□□□□ -0.05
PPA1-206	ENST00000625364	CETN3	O15182	167 aa		14.72	□□□□□ -0.05
PPA1-206	ENST00000625364	PAK4	O96013	591 aa	Predicted RBP	14.72	□□□□□ -0.05
PPA1-206	ENST00000625364	PRR29	P0C7W0	189 aa		14.72	□□□□□ -0.05
PPA1-206	ENST00000625364	IRAK1	P51617	712 aa		14.72	□□□□□ -0.05
PPA1-206	ENST00000625364	TBR1	Q16650	682 aa		14.72	□□□□□ -0.05
PPA1-206	ENST00000625364	MANEA	Q5SRI9	462 aa		14.72	□□□□□ -0.05
PPA1-206	ENST00000625364	TPRG1L	Q5T0D9	272 aa		14.72	□□□□□ -0.05
PPA1-206	ENST00000625364	B3GNT8	Q7Z7M8	397 aa		14.72	□□□□□ -0.05
PPA1-206	ENST00000625364	RBFA	Q8N0V3	343 aa		14.72	□□□□□ -0.05
PPA1-206	ENST00000625364	CHST14	Q8NCH0	376 aa		14.72	□□□□□ -0.05
PPA1-206	ENST00000625364	BTN2A2	Q8WVV5	523 aa		14.72	□□□□□ -0.05
PPA1-206	ENST00000625364	SRRT	Q9BXP5	876 aa	Known RBP	14.72	□□□□□ -0.05
PPA1-206	ENST00000625364	STRADB	Q9C0K7	418 aa		14.72	□□□□□ -0.05
PPA1-206	ENST00000625364	MUC3B	Q9H195	1237 aa		14.72	□□□□□ -0.05
PPA1-206	ENST00000625364	FAM204A	Q9H8W3	233 aa		14.72	□□□□□ -0.05
PPA1-206	ENST00000625364	SEPT10	Q9P0V9	454 aa		14.72	□□□□□ -0.05
PPA1-206	ENST00000625364	APOBEC3B	Q9UH17	382 aa	Known RBP	14.72	□□□□□ -0.05
PPA1-206	ENST00000625364	USP25	Q9UHP3	1055 aa		14.72	□□□□□ -0.05
PPA1-206	ENST00000625364	PCDHGA4	Q9Y5G9	962 aa		14.72	□□□□□ -0.05
PPA1-206	ENST00000625364	ICE1	Q9Y2F5	2266 aa		14.71	□□□□□ -0.05
PPA1-206	ENST00000625364	TMX2-CTNND1	H3BSU7	103 aa		14.71	□□□□□ -0.05
PPA1-206	ENST00000625364	FPGT	O14772	594 aa		14.71	□□□□□ -0.05
PPA1-206	ENST00000625364	SPINT1	O43278	529 aa		14.71	□□□□□ -0.05
PPA1-206	ENST00000625364	MT-CO1	P00395	513 aa		14.71	□□□□□ -0.05
PPA1-206	ENST00000625364	CALCA	P01258	141 aa		14.71	□□□□□ -0.05
PPA1-206	ENST00000625364	ANXA6	P08133	673 aa		14.71	□□□□□ -0.05
PPA1-206	ENST00000625364	PFKFB1	P16118	471 aa		14.71	□□□□□ -0.05
PPA1-206	ENST00000625364	RPL34	P49207	117 aa	Known RBP	14.71	□□□□□ -0.05
PPA1-206	ENST00000625364	NEK3	P51956	506 aa		14.71	□□□□□ -0.05
PPA1-206	ENST00000625364	PITX1	P78337	314 aa	Predicted RBP	14.71	□□□□□ -0.05
PPA1-206	ENST00000625364	KRT83	P78385	493 aa		14.71	□□□□□ -0.05
PPA1-206	ENST00000625364	EIF2B5	Q13144	721 aa	Known RBP	14.71	□□□□□ -0.05
PPA1-206	ENST00000625364	PRRT3	Q5FWE3	981 aa		14.71	□□□□□ -0.05
PPA1-206	ENST00000625364	VASH2	Q86V25	355 aa		14.71	□□□□□ -0.05

Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 35 ms