RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000624145.3

ANKRD28-215, Transcript of ankyrin repeat domain 28, humanhuman

TSL 2 BASIC

Gene ANKRD28, Length 6,383 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ANKRD28-215ENST00000624145 GTF2A2P52657 109 aa4.09□□□□□ -1.75
ANKRD28-215ENST00000624145 ATN1P54259 1190 aaPredicted RBP4.09□□□□□ -1.75
ANKRD28-215ENST00000624145 SLC34A1Q06495 639 aa4.09□□□□□ -1.75
ANKRD28-215ENST00000624145 PDCD4Q53EL6 469 aaKnown RBP4.09□□□□□ -1.75
ANKRD28-215ENST00000624145 KLHDC7AQ5VTJ3 777 aa4.09□□□□□ -1.75
ANKRD28-215ENST00000624145 SULT1C3Q6IMI6 304 aa4.09□□□□□ -1.75
ANKRD28-215ENST00000624145 TTC27Q6P3X3 843 aa4.09□□□□□ -1.75
ANKRD28-215ENST00000624145 KIAA1324Q6UXG2 1013 aaKnown RBP4.09□□□□□ -1.75
ANKRD28-215ENST00000624145 CYP2R1Q6VVX0 501 aa4.09□□□□□ -1.75
ANKRD28-215ENST00000624145 SMIM5Q71RC9 77 aa4.09□□□□□ -1.75
ANKRD28-215ENST00000624145 SP8Q8IXZ3 490 aa4.09□□□□□ -1.75
ANKRD28-215ENST00000624145 MB21D2Q8IYB1 491 aaPredicted RBP4.09□□□□□ -1.75
ANKRD28-215ENST00000624145 ADSSL1Q8N142 457 aa4.09□□□□□ -1.75
ANKRD28-215ENST00000624145 NKX2-3Q8TAU0 364 aa4.09□□□□□ -1.75
ANKRD28-215ENST00000624145 DLG3Q92796 817 aa4.09□□□□□ -1.75
ANKRD28-215ENST00000624145 SYT15Q9BQS2 421 aa4.09□□□□□ -1.75
ANKRD28-215ENST00000624145 ABCG4Q9H172 646 aa4.09□□□□□ -1.75
ANKRD28-215ENST00000624145 IGFLR1Q9H665 355 aa4.09□□□□□ -1.75
ANKRD28-215ENST00000624145 STARD7Q9NQZ5 370 aa4.09□□□□□ -1.75
ANKRD28-215ENST00000624145 AASDHPPTQ9NRN7 309 aa4.09□□□□□ -1.75
ANKRD28-215ENST00000624145 GNPTGQ9UJJ9 305 aa4.09□□□□□ -1.75
ANKRD28-215ENST00000624145 BAIAP2Q9UQB8 552 aa4.09□□□□□ -1.75
ANKRD28-215ENST00000624145 MRPS33Q9Y291 106 aaKnown RBP4.09□□□□□ -1.75
ANKRD28-215ENST00000624145 PCDHB9Q9Y5E1 797 aa4.09□□□□□ -1.75
ANKRD28-215ENST00000624145 PCDHGB5Q9Y5G0 923 aa4.09□□□□□ -1.75
ANKRD28-215ENST00000624145 ZNF780BQ9Y6R6 833 aa4.09□□□□□ -1.75
ANKRD28-215ENST00000624145 METP08581 1390 aa4.09□□□□□ -1.75
ANKRD28-215ENST00000624145 WDR62O43379 1518 aa4.09□□□□□ -1.75
ANKRD28-215ENST00000624145 RGSL1A5PLK6 1076 aa4.09□□□□□ -1.75
ANKRD28-215ENST00000624145 FAM172BPA6NC97 362 aa4.09□□□□□ -1.75
ANKRD28-215ENST00000624145 GRXCR2A6NFK2 248 aa4.09□□□□□ -1.75
ANKRD28-215ENST00000624145 SLC33A1O00400 549 aaPredicted RBP4.09□□□□□ -1.75
ANKRD28-215ENST00000624145 PDE2AO00408 941 aaPredicted RBP4.09□□□□□ -1.75
ANKRD28-215ENST00000624145 XKRYO14609 159 aa4.09□□□□□ -1.75
ANKRD28-215ENST00000624145 CCNDBP1O95273 360 aa4.09□□□□□ -1.75
ANKRD28-215ENST00000624145 DBTP11182 482 aaKnown RBP4.09□□□□□ -1.75
ANKRD28-215ENST00000624145 CYP2F1P24903 491 aa4.09□□□□□ -1.75
ANKRD28-215ENST00000624145 ITPKBP27987 946 aa4.09□□□□□ -1.75
ANKRD28-215ENST00000624145 ADSSP30520 456 aa4.09□□□□□ -1.75
ANKRD28-215ENST00000624145 IRAK1P51617 712 aa4.09□□□□□ -1.75
ANKRD28-215ENST00000624145 SLC7A2P52569 658 aa4.09□□□□□ -1.75
ANKRD28-215ENST00000624145 POU5F1Q01860 360 aaKnown RBP4.09□□□□□ -1.75
ANKRD28-215ENST00000624145 IRF8Q02556 426 aa4.09□□□□□ -1.75
ANKRD28-215ENST00000624145 MCL1Q07820 350 aa4.09□□□□□ -1.75
ANKRD28-215ENST00000624145 ORC1Q13415 861 aa4.09□□□□□ -1.75
ANKRD28-215ENST00000624145 IL18R1Q13478 541 aa4.09□□□□□ -1.75
ANKRD28-215ENST00000624145 NAB1Q13506 487 aa4.09□□□□□ -1.75
ANKRD28-215ENST00000624145 PIK3R6Q5UE93 754 aa4.09□□□□□ -1.75
ANKRD28-215ENST00000624145 SPOCD1Q6ZMY3 1216 aa4.09□□□□□ -1.75
ANKRD28-215ENST00000624145 FAM131BQ86XD5 332 aa4.09□□□□□ -1.75
ANKRD28-215ENST00000624145 ZNF540Q8NDQ6 660 aa4.09□□□□□ -1.75
ANKRD28-215ENST00000624145 PIK3C3Q8NEB9 887 aa4.09□□□□□ -1.75
ANKRD28-215ENST00000624145 BPIFB6Q8NFQ5 453 aa4.09□□□□□ -1.75
ANKRD28-215ENST00000624145 HASPINQ8TF76 798 aa4.09□□□□□ -1.75
ANKRD28-215ENST00000624145 TBATAQ96M53 351 aa4.09□□□□□ -1.75
ANKRD28-215ENST00000624145 SERPINB11Q96P15 392 aa4.09□□□□□ -1.75
ANKRD28-215ENST00000624145 HIST1H2AAQ96QV6 131 aa4.09□□□□□ -1.75
ANKRD28-215ENST00000624145 ZNF607Q96SK3 696 aa4.09□□□□□ -1.75
ANKRD28-215ENST00000624145 CHP1Q99653 195 aa4.09□□□□□ -1.75
ANKRD28-215ENST00000624145 SLC4A5Q9BY07 1137 aa4.09□□□□□ -1.75
ANKRD28-215ENST00000624145 EHD1Q9H4M9 534 aa4.09□□□□□ -1.75
ANKRD28-215ENST00000624145 VCPKMTQ9H867 229 aa4.09□□□□□ -1.75
ANKRD28-215ENST00000624145 PLEKHA1Q9HB21 404 aa4.09□□□□□ -1.75
ANKRD28-215ENST00000624145 PNPLA8Q9NP80 782 aa4.09□□□□□ -1.75
ANKRD28-215ENST00000624145 ZKSCAN7Q9P0L1 754 aaPredicted RBP4.09□□□□□ -1.75
ANKRD28-215ENST00000624145 TUBE1Q9UJT0 475 aa4.09□□□□□ -1.75
ANKRD28-215ENST00000624145 LRCH1Q9Y2L9 728 aa4.09□□□□□ -1.75
ANKRD28-215ENST00000624145 MAST1Q9Y2H9 1570 aa4.09□□□□□ -1.75
ANKRD28-215ENST00000624145 C1QTNF3-AMACRE9PGA6 284 aa4.09□□□□□ -1.76
ANKRD28-215ENST00000624145 OR10H3O60404 316 aa4.09□□□□□ -1.76
ANKRD28-215ENST00000624145 SNAP91O60641 907 aa4.09□□□□□ -1.76
ANKRD28-215ENST00000624145 SERPINB7O75635 380 aa4.09□□□□□ -1.76
ANKRD28-215ENST00000624145 OGNP20774 298 aaKnown RBP4.09□□□□□ -1.76
ANKRD28-215ENST00000624145 LRPAP1P30533 357 aa4.09□□□□□ -1.76
ANKRD28-215ENST00000624145 FMO4P31512 558 aa4.09□□□□□ -1.76
ANKRD28-215ENST00000624145 GP5P40197 560 aa4.09□□□□□ -1.76
ANKRD28-215ENST00000624145 TAS2R41P59536 307 aa4.09□□□□□ -1.76
ANKRD28-215ENST00000624145 PSME3P61289 254 aa4.09□□□□□ -1.76
ANKRD28-215ENST00000624145 SPIBQ01892 262 aa4.09□□□□□ -1.76
ANKRD28-215ENST00000624145 ZNF543Q08ER8 600 aa4.09□□□□□ -1.76
ANKRD28-215ENST00000624145 BMPR2Q13873 1038 aa4.09□□□□□ -1.76
ANKRD28-215ENST00000624145 ALX1Q15699 326 aa4.09□□□□□ -1.76
ANKRD28-215ENST00000624145 HECTD3Q5T447 861 aa4.09□□□□□ -1.76
ANKRD28-215ENST00000624145 CES5AQ6NT32 575 aa4.09□□□□□ -1.76
ANKRD28-215ENST00000624145 RNF19BQ6ZMZ0 732 aa4.09□□□□□ -1.76
ANKRD28-215ENST00000624145 DEFB128Q7Z7B8 93 aa4.09□□□□□ -1.76
ANKRD28-215ENST00000624145 OR2L3Q8NG85 312 aa4.09□□□□□ -1.76
ANKRD28-215ENST00000624145 PSMA8Q8TAA3 256 aa4.09□□□□□ -1.76
ANKRD28-215ENST00000624145 SELENOMQ8WWX9 145 aa4.09□□□□□ -1.76
ANKRD28-215ENST00000624145 ACOT12Q8WYK0 555 aa4.09□□□□□ -1.76
ANKRD28-215ENST00000624145 AKAP1Q92667 903 aaKnown RBP eCLIP4.09□□□□□ -1.76
ANKRD28-215ENST00000624145 SEMA4DQ92854 862 aa4.09□□□□□ -1.76
ANKRD28-215ENST00000624145 DGCR14Q96DF8 476 aaKnown RBP4.09□□□□□ -1.76
ANKRD28-215ENST00000624145 ZHX1-C8orf76Q96EF9 292 aa4.09□□□□□ -1.76
ANKRD28-215ENST00000624145 MMADHCQ9H3L0 296 aaPredicted RBP4.09□□□□□ -1.76
ANKRD28-215ENST00000624145 RXFP1Q9HBX9 757 aa4.09□□□□□ -1.76
ANKRD28-215ENST00000624145 SPON1Q9HCB6 807 aa4.09□□□□□ -1.76
ANKRD28-215ENST00000624145 TMEM51Q9NW97 253 aa4.09□□□□□ -1.76
ANKRD28-215ENST00000624145 TRHDEQ9UKU6 1024 aa4.09□□□□□ -1.76
ANKRD28-215ENST00000624145 MFHAS1Q9Y4C4 1052 aa4.09□□□□□ -1.76
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 37.6 ms