RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000623495.1

LETMD1-238, Transcript of LETM1 domain containing 1, human

Gene LETMD1, Length 2,948 nt, Biotype TEC.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
LETMD1-238	ENST00000623495	SH3PXD2B	A1X283	911 aa		7.38	□□□□□ -1.23
LETMD1-238	ENST00000623495	NCK2	O43639	380 aa		7.38	□□□□□ -1.23
LETMD1-238	ENST00000623495	HNRNPCL1	O60812	293 aa	Known RBP	7.38	□□□□□ -1.23
LETMD1-238	ENST00000623495	MAP3K6	O95382	1288 aa		7.38	□□□□□ -1.23
LETMD1-238	ENST00000623495	SHBG	P04278	402 aa		7.38	□□□□□ -1.23
LETMD1-238	ENST00000623495	ARSA	P15289	507 aa		7.38	□□□□□ -1.23
LETMD1-238	ENST00000623495	RRM1	P23921	792 aa		7.38	□□□□□ -1.23
LETMD1-238	ENST00000623495	HOXC13	P31276	330 aa		7.38	□□□□□ -1.23
LETMD1-238	ENST00000623495	KIF11	P52732	1056 aa		7.38	□□□□□ -1.23
LETMD1-238	ENST00000623495	SEC13	P55735	322 aa		7.38	□□□□□ -1.23
LETMD1-238	ENST00000623495	YWHAG	P61981	247 aa	Known RBP eCLIP	7.38	□□□□□ -1.23
LETMD1-238	ENST00000623495	POU5F1	Q01860	360 aa	Known RBP	7.38	□□□□□ -1.23
LETMD1-238	ENST00000623495	MAMSTR	Q6ZN01	415 aa		7.38	□□□□□ -1.23
LETMD1-238	ENST00000623495	FAM183BP	Q6ZVS7	135 aa		7.38	□□□□□ -1.23
LETMD1-238	ENST00000623495	NEK10	Q6ZWH5	1172 aa		7.38	□□□□□ -1.23
LETMD1-238	ENST00000623495	CIR1	Q86X95	450 aa	Predicted RBP	7.38	□□□□□ -1.23
LETMD1-238	ENST00000623495	FAM71A	Q8IYT1	594 aa		7.38	□□□□□ -1.23
LETMD1-238	ENST00000623495	DEFB106A	Q8N104	65 aa		7.38	□□□□□ -1.23
LETMD1-238	ENST00000623495	EFHD2	Q96C19	240 aa	Predicted RBP	7.38	□□□□□ -1.23
LETMD1-238	ENST00000623495	C18orf8	Q96DM3	657 aa		7.38	□□□□□ -1.23
LETMD1-238	ENST00000623495	NSMCE3	Q96MG7	304 aa		7.38	□□□□□ -1.23
LETMD1-238	ENST00000623495	COL25A1	Q9BXS0	654 aa	Predicted RBP	7.38	□□□□□ -1.23
LETMD1-238	ENST00000623495	PACSIN1	Q9BY11	444 aa		7.38	□□□□□ -1.23
LETMD1-238	ENST00000623495	FOXQ1	Q9C009	403 aa		7.38	□□□□□ -1.23
LETMD1-238	ENST00000623495	GPR88	Q9GZN0	384 aa		7.38	□□□□□ -1.23
LETMD1-238	ENST00000623495	VRTN	Q9H8Y1	702 aa		7.38	□□□□□ -1.23
LETMD1-238	ENST00000623495	TLR8	Q9NR97	1041 aa	Known RBP	7.38	□□□□□ -1.23
LETMD1-238	ENST00000623495	TDP1	Q9NUW8	608 aa		7.38	□□□□□ -1.23
LETMD1-238	ENST00000623495		A0A087X0T9	212 aa		7.38	□□□□□ -1.23
LETMD1-238	ENST00000623495	TRAV19	A0A0A6YYK7	116 aa		7.38	□□□□□ -1.23
LETMD1-238	ENST00000623495	ZNF840P	A6NDX5	716 aa		7.38	□□□□□ -1.23
LETMD1-238	ENST00000623495		M0QYT0	321 aa		7.38	□□□□□ -1.23
LETMD1-238	ENST00000623495	ZNF197	O14709	1029 aa		7.38	□□□□□ -1.23
LETMD1-238	ENST00000623495	PAPSS1	O43252	624 aa	Predicted RBP	7.38	□□□□□ -1.23
LETMD1-238	ENST00000623495	DCN	P07585	359 aa	Known RBP	7.38	□□□□□ -1.23
LETMD1-238	ENST00000623495	FAM228B	P0C875	321 aa		7.38	□□□□□ -1.23
LETMD1-238	ENST00000623495	UBTFL6	P0CB48	400 aa	Predicted RBP	7.38	□□□□□ -1.23
LETMD1-238	ENST00000623495	ATP5C1	P36542	298 aa	Known RBP	7.38	□□□□□ -1.23
LETMD1-238	ENST00000623495	GPD2	P43304	727 aa		7.38	□□□□□ -1.23
LETMD1-238	ENST00000623495	ZXDB	P98169	803 aa		7.38	□□□□□ -1.23
LETMD1-238	ENST00000623495	SMAD2	Q15796	467 aa	Known RBP	7.38	□□□□□ -1.23
LETMD1-238	ENST00000623495	CNGA2	Q16280	664 aa		7.38	□□□□□ -1.23
LETMD1-238	ENST00000623495	SMTNL2	Q2TAL5	461 aa		7.38	□□□□□ -1.23
LETMD1-238	ENST00000623495	CCDC14	Q49A88	953 aa		7.38	□□□□□ -1.23
LETMD1-238	ENST00000623495	BOLA3	Q53S33	107 aa		7.38	□□□□□ -1.23
LETMD1-238	ENST00000623495	C2orf27A	Q580R0	203 aa		7.38	□□□□□ -1.23
LETMD1-238	ENST00000623495	FAM209A	Q5JX71	171 aa		7.38	□□□□□ -1.23
LETMD1-238	ENST00000623495	SPDYA	Q5MJ70	313 aa		7.38	□□□□□ -1.23
LETMD1-238	ENST00000623495	C14orf80	Q86SX3	495 aa		7.38	□□□□□ -1.23
LETMD1-238	ENST00000623495	CMTM8	Q8IZV2	173 aa		7.38	□□□□□ -1.23
LETMD1-238	ENST00000623495	FITM2	Q8N6M3	262 aa		7.38	□□□□□ -1.23
LETMD1-238	ENST00000623495	PAF1	Q8N7H5	531 aa		7.38	□□□□□ -1.23
LETMD1-238	ENST00000623495	ZNF366	Q8N895	744 aa		7.38	□□□□□ -1.23
LETMD1-238	ENST00000623495	SPERT	Q8NA61	448 aa		7.38	□□□□□ -1.23
LETMD1-238	ENST00000623495	OR2W6P	Q8NHA6	318 aa		7.38	□□□□□ -1.23
LETMD1-238	ENST00000623495	GABPB2	Q8TAK5	448 aa	Predicted RBP	7.38	□□□□□ -1.23
LETMD1-238	ENST00000623495	MDM1	Q8TC05	714 aa		7.38	□□□□□ -1.23
LETMD1-238	ENST00000623495	ACMSD	Q8TDX5	336 aa		7.38	□□□□□ -1.23
LETMD1-238	ENST00000623495	RSPRY1	Q96DX4	576 aa		7.38	□□□□□ -1.23
LETMD1-238	ENST00000623495	FUBP3	Q96I24	572 aa	Known RBP eCLIP	7.38	□□□□□ -1.23
LETMD1-238	ENST00000623495	ERGIC2	Q96RQ1	377 aa		7.38	□□□□□ -1.23
LETMD1-238	ENST00000623495	AGPAT1	Q99943	283 aa		7.38	□□□□□ -1.23
LETMD1-238	ENST00000623495	CENPO	Q9BU64	300 aa		7.38	□□□□□ -1.23
LETMD1-238	ENST00000623495	MAGEB5	Q9BZ81	275 aa		7.38	□□□□□ -1.23
LETMD1-238	ENST00000623495	STMN4	Q9H169	189 aa	Predicted RBP	7.38	□□□□□ -1.23
LETMD1-238	ENST00000623495	AIPL1	Q9NZN9	384 aa		7.38	□□□□□ -1.23
LETMD1-238	ENST00000623495	STK39	Q9UEW8	545 aa		7.38	□□□□□ -1.23
LETMD1-238	ENST00000623495	PRKAG3	Q9UGI9	489 aa		7.38	□□□□□ -1.23
LETMD1-238	ENST00000623495	GOLGA8CP	A6NN73	597 aa		7.38	□□□□□ -1.23
LETMD1-238	ENST00000623495	FAM47E-STBD1	D6RA91	191 aa		7.38	□□□□□ -1.23
LETMD1-238	ENST00000623495	NEDD8-MDP1	E9PL57	170 aa		7.38	□□□□□ -1.23
LETMD1-238	ENST00000623495	TRAFD1	O14545	582 aa	Predicted RBP	7.38	□□□□□ -1.23
LETMD1-238	ENST00000623495	MAGEB3	O15480	346 aa		7.38	□□□□□ -1.23
LETMD1-238	ENST00000623495	GALR2	O43603	387 aa	Predicted RBP	7.38	□□□□□ -1.23
LETMD1-238	ENST00000623495	RALA	P11233	206 aa		7.38	□□□□□ -1.23
LETMD1-238	ENST00000623495	RPL7A	P62424	266 aa	Known RBP	7.38	□□□□□ -1.23
LETMD1-238	ENST00000623495	FMO1	Q01740	532 aa		7.38	□□□□□ -1.23
LETMD1-238	ENST00000623495	ZP2	Q05996	745 aa		7.38	□□□□□ -1.23
LETMD1-238	ENST00000623495	KDSR	Q06136	332 aa		7.38	□□□□□ -1.23
LETMD1-238	ENST00000623495	LRP8	Q14114	963 aa		7.38	□□□□□ -1.23
LETMD1-238	ENST00000623495	HLTF	Q14527	1009 aa	Known RBP eCLIP	7.38	□□□□□ -1.23
LETMD1-238	ENST00000623495	KCNT1	Q5JUK3	1230 aa		7.38	□□□□□ -1.23
LETMD1-238	ENST00000623495	LCLAT1	Q6UWP7	414 aa		7.38	□□□□□ -1.23
LETMD1-238	ENST00000623495	ENOSF1	Q7L5Y1	443 aa		7.38	□□□□□ -1.23
LETMD1-238	ENST00000623495	TFAP2D	Q7Z6R9	452 aa		7.38	□□□□□ -1.23
LETMD1-238	ENST00000623495	VPS36	Q86VN1	386 aa		7.38	□□□□□ -1.23
LETMD1-238	ENST00000623495	DDX42	Q86XP3	938 aa	Known RBP eCLIP	7.38	□□□□□ -1.23
LETMD1-238	ENST00000623495	WDTC1	Q8N5D0	677 aa		7.38	□□□□□ -1.23
LETMD1-238	ENST00000623495	RIN3	Q8TB24	985 aa		7.38	□□□□□ -1.23
LETMD1-238	ENST00000623495	DDI1	Q8WTU0	396 aa		7.38	□□□□□ -1.23
LETMD1-238	ENST00000623495	UBLCP1	Q8WVY7	318 aa	Predicted RBP	7.38	□□□□□ -1.23
LETMD1-238	ENST00000623495	USP13	Q92995	863 aa	Predicted RBP	7.38	□□□□□ -1.23
LETMD1-238	ENST00000623495	GRAMD1A	Q96CP6	724 aa		7.38	□□□□□ -1.23
LETMD1-238	ENST00000623495	TRMT61B	Q9BVS5	477 aa	Known RBP	7.38	□□□□□ -1.23
LETMD1-238	ENST00000623495	LACRT	Q9GZZ8	138 aa		7.38	□□□□□ -1.23
LETMD1-238	ENST00000623495	EPHX3	Q9H6B9	360 aa		7.38	□□□□□ -1.23
LETMD1-238	ENST00000623495	GPATCH2L	Q9NWQ4	482 aa		7.38	□□□□□ -1.23
LETMD1-238	ENST00000623495	TRIM33	Q9UPN9	1127 aa		7.38	□□□□□ -1.23
LETMD1-238	ENST00000623495		A0A088AWK7	358 aa		7.37	□□□□□ -1.23
LETMD1-238	ENST00000623495	ESYT3	A0FGR9	886 aa		7.37	□□□□□ -1.23

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