RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000621870.4

GGA3-223, Transcript of golgi associated, gamma adaptin ear containing, ARF binding protein 3, human

TSL 1 (best)

Gene GGA3, Length 4,034 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytosol .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
GGA3-223	ENST00000621870	AKAP12	Q02952	1782 aa		9.37	□□□□□ -0.91
GGA3-223	ENST00000621870	PER2	O15055	1255 aa		9.37	□□□□□ -0.91
GGA3-223	ENST00000621870	LRIG2	O94898	1065 aa		9.37	□□□□□ -0.91
GGA3-223	ENST00000621870	TBX18	O95935	607 aa		9.37	□□□□□ -0.91
GGA3-223	ENST00000621870	APOD	P05090	189 aa		9.37	□□□□□ -0.91
GGA3-223	ENST00000621870	ELFN1	P0C7U0	828 aa		9.37	□□□□□ -0.91
GGA3-223	ENST00000621870	TNNI3	P19429	210 aa		9.37	□□□□□ -0.91
GGA3-223	ENST00000621870	SERPINB5	P36952	375 aa		9.37	□□□□□ -0.91
GGA3-223	ENST00000621870	AQP5	P55064	265 aa		9.37	□□□□□ -0.91
GGA3-223	ENST00000621870	CYP4F8	P98187	520 aa		9.37	□□□□□ -0.91
GGA3-223	ENST00000621870	INPP5A	Q14642	412 aa		9.37	□□□□□ -0.91
GGA3-223	ENST00000621870	SPANXN3	Q5MJ09	141 aa		9.37	□□□□□ -0.91
GGA3-223	ENST00000621870	C16orf46	Q6P387	395 aa		9.37	□□□□□ -0.91
GGA3-223	ENST00000621870	TRPM8	Q7Z2W7	1104 aa		9.37	□□□□□ -0.91
GGA3-223	ENST00000621870	XYLT1	Q86Y38	959 aa		9.37	□□□□□ -0.91
GGA3-223	ENST00000621870	HDAC10	Q969S8	669 aa		9.37	□□□□□ -0.91
GGA3-223	ENST00000621870	MAGED4	Q96JG8	741 aa		9.37	□□□□□ -0.91
GGA3-223	ENST00000621870	ZFP14	Q9HCL3	533 aa		9.37	□□□□□ -0.91
GGA3-223	ENST00000621870	RAD18	Q9NS91	495 aa		9.37	□□□□□ -0.91
GGA3-223	ENST00000621870	NOP53	Q9NZM5	478 aa	Known RBP	9.37	□□□□□ -0.91
GGA3-223	ENST00000621870	HECA	Q9UBI9	543 aa	Predicted RBP	9.37	□□□□□ -0.91
GGA3-223	ENST00000621870	PPEF2	O14830	753 aa		9.36	□□□□□ -0.91
GGA3-223	ENST00000621870	DYRK3	O43781	588 aa		9.36	□□□□□ -0.91
GGA3-223	ENST00000621870	TRIM13	O60858	407 aa		9.36	□□□□□ -0.91
GGA3-223	ENST00000621870	CPSF4	O95639	269 aa	Known RBP	9.36	□□□□□ -0.91
GGA3-223	ENST00000621870	HPGD	P15428	266 aa		9.36	□□□□□ -0.91
GGA3-223	ENST00000621870	TACR2	P21452	398 aa		9.36	□□□□□ -0.91
GGA3-223	ENST00000621870	LPO	P22079	712 aa	Predicted RBP	9.36	□□□□□ -0.91
GGA3-223	ENST00000621870	NUDT2	P50583	147 aa		9.36	□□□□□ -0.91
GGA3-223	ENST00000621870	STX5	Q13190	355 aa		9.36	□□□□□ -0.91
GGA3-223	ENST00000621870	PKN2	Q16513	984 aa	Known RBP	9.36	□□□□□ -0.91
GGA3-223	ENST00000621870	TAC4	Q86UU9	113 aa		9.36	□□□□□ -0.91
GGA3-223	ENST00000621870	CIR1	Q86X95	450 aa	Predicted RBP	9.36	□□□□□ -0.91
GGA3-223	ENST00000621870	MIER2	Q8N344	545 aa		9.36	□□□□□ -0.91
GGA3-223	ENST00000621870	C12orf50	Q8NA57	414 aa	Predicted RBP	9.36	□□□□□ -0.91
GGA3-223	ENST00000621870	TCP10L	Q8TDR4	215 aa		9.36	□□□□□ -0.91
GGA3-223	ENST00000621870	LRRC39	Q96DD0	335 aa		9.36	□□□□□ -0.91
GGA3-223	ENST00000621870	CXorf40B	Q96DE9	158 aa		9.36	□□□□□ -0.91
GGA3-223	ENST00000621870	NRBF2	Q96F24	287 aa		9.36	□□□□□ -0.91
GGA3-223	ENST00000621870	PWWP2A	Q96N64	755 aa		9.36	□□□□□ -0.91
GGA3-223	ENST00000621870	RGS17	Q9UGC6	210 aa	Predicted RBP	9.36	□□□□□ -0.91
GGA3-223	ENST00000621870	ZMYM5	Q9UJ78	669 aa		9.36	□□□□□ -0.91
GGA3-223	ENST00000621870	ARHGAP26	Q9UNA1	814 aa		9.36	□□□□□ -0.91
GGA3-223	ENST00000621870	GPSM3	Q9Y4H4	160 aa		9.36	□□□□□ -0.91
GGA3-223	ENST00000621870	AFDN	P55196	1824 aa	Known RBP	9.36	□□□□□ -0.91
GGA3-223	ENST00000621870	PAPSS1	O43252	624 aa	Predicted RBP	9.36	□□□□□ -0.91
GGA3-223	ENST00000621870	ACSL4	O60488	711 aa		9.36	□□□□□ -0.91
GGA3-223	ENST00000621870	RNASEH2A	O75792	299 aa	Known RBP	9.36	□□□□□ -0.91
GGA3-223	ENST00000621870	CYP7B1	O75881	506 aa		9.36	□□□□□ -0.91
GGA3-223	ENST00000621870	BAIAP3	O94812	1187 aa		9.36	□□□□□ -0.91
GGA3-223	ENST00000621870	CYP1A1	P04798	512 aa	Predicted RBP	9.36	□□□□□ -0.91
GGA3-223	ENST00000621870	EIF2S1	P05198	315 aa	Known RBP	9.36	□□□□□ -0.91
GGA3-223	ENST00000621870	SLC2A4	P14672	509 aa		9.36	□□□□□ -0.91
GGA3-223	ENST00000621870	GRK2	P25098	689 aa		9.36	□□□□□ -0.91
GGA3-223	ENST00000621870	HNF4A	P41235	474 aa		9.36	□□□□□ -0.91
GGA3-223	ENST00000621870	NCALD	P61601	193 aa		9.36	□□□□□ -0.91
GGA3-223	ENST00000621870	IRF8	Q02556	426 aa		9.36	□□□□□ -0.91
GGA3-223	ENST00000621870	CTBP1	Q13363	440 aa		9.36	□□□□□ -0.91
GGA3-223	ENST00000621870	SOWAHA	Q2M3V2	549 aa		9.36	□□□□□ -0.91
GGA3-223	ENST00000621870	TMC3	Q7Z5M5	1100 aa		9.36	□□□□□ -0.91
GGA3-223	ENST00000621870	DNAJB7	Q7Z6W7	309 aa	Predicted RBP	9.36	□□□□□ -0.91
GGA3-223	ENST00000621870	C11orf74	Q86VG3	221 aa		9.36	□□□□□ -0.91
GGA3-223	ENST00000621870	CLEC4F	Q8N1N0	589 aa		9.36	□□□□□ -0.91
GGA3-223	ENST00000621870	STK40	Q8N2I9	435 aa		9.36	□□□□□ -0.91
GGA3-223	ENST00000621870	GKN1	Q9NS71	199 aa		9.36	□□□□□ -0.91
GGA3-223	ENST00000621870	TRPC4	Q9UBN4	977 aa		9.36	□□□□□ -0.91
GGA3-223	ENST00000621870	FBXO5	Q9UKT4	447 aa		9.36	□□□□□ -0.91
GGA3-223	ENST00000621870	NAGLU	P54802	743 aa		9.36	□□□□□ -0.91
GGA3-223	ENST00000621870	GJA9	P57773	515 aa		9.36	□□□□□ -0.91
GGA3-223	ENST00000621870	DAOA	P59103	153 aa		9.36	□□□□□ -0.91
GGA3-223	ENST00000621870	GRAMD4	Q6IC98	578 aa		9.36	□□□□□ -0.91
GGA3-223	ENST00000621870	PLEKHA7	Q6IQ23	1121 aa		9.36	□□□□□ -0.91
GGA3-223	ENST00000621870	CNKSR3	Q6P9H4	555 aa		9.36	□□□□□ -0.91
GGA3-223	ENST00000621870	FOXR1	Q6PIV2	292 aa		9.36	□□□□□ -0.91
GGA3-223	ENST00000621870	CNST	Q6PJW8	725 aa		9.36	□□□□□ -0.91
GGA3-223	ENST00000621870	DNAJC14	Q6Y2X3	702 aa	Predicted RBP	9.36	□□□□□ -0.91
GGA3-223	ENST00000621870	ZCCHC23	Q6ZST2	131 aa		9.36	□□□□□ -0.91
GGA3-223	ENST00000621870	SETD3	Q86TU7	594 aa	Predicted RBP	9.36	□□□□□ -0.91
GGA3-223	ENST00000621870	GPSM1	Q86YR5	675 aa		9.36	□□□□□ -0.91
GGA3-223	ENST00000621870	FAM162A	Q96A26	154 aa		9.36	□□□□□ -0.91
GGA3-223	ENST00000621870	RIPOR3	Q96MK2	946 aa		9.36	□□□□□ -0.91
GGA3-223	ENST00000621870	COPS8	Q99627	209 aa		9.36	□□□□□ -0.91
GGA3-223	ENST00000621870	RBBP8	Q99708	897 aa		9.36	□□□□□ -0.91
GGA3-223	ENST00000621870	ACAT2	Q9BWD1	397 aa		9.36	□□□□□ -0.91
GGA3-223	ENST00000621870	YY1AP1	Q9H869	796 aa		9.36	□□□□□ -0.91
GGA3-223	ENST00000621870	MRGBP	Q9NV56	204 aa		9.36	□□□□□ -0.91
GGA3-223	ENST00000621870	AKAP7	Q9P0M2	348 aa	Predicted RBP	9.36	□□□□□ -0.91
GGA3-223	ENST00000621870	SCOC	Q9UIL1	159 aa		9.36	□□□□□ -0.91
GGA3-223	ENST00000621870	PADI4	Q9UM07	663 aa		9.36	□□□□□ -0.91
GGA3-223	ENST00000621870	SNX10	Q9Y5X0	201 aa		9.36	□□□□□ -0.91
GGA3-223	ENST00000621870	NOL4	O94818	638 aa		9.35	□□□□□ -0.91
GGA3-223	ENST00000621870	SEC24D	O94855	1032 aa	Predicted RBP	9.35	□□□□□ -0.91
GGA3-223	ENST00000621870	RPN2	P04844	631 aa		9.35	□□□□□ -0.91
GGA3-223	ENST00000621870	TGM3	Q08188	693 aa		9.35	□□□□□ -0.91
GGA3-223	ENST00000621870	CBX2	Q14781	532 aa	Predicted RBP	9.35	□□□□□ -0.91
GGA3-223	ENST00000621870	PGS1	Q32NB8	556 aa		9.35	□□□□□ -0.91
GGA3-223	ENST00000621870	DNAL1	Q4LDG9	190 aa		9.35	□□□□□ -0.91
GGA3-223	ENST00000621870	C2orf27A	Q580R0	203 aa		9.35	□□□□□ -0.91
GGA3-223	ENST00000621870	GRTP1	Q5TC63	336 aa		9.35	□□□□□ -0.91
GGA3-223	ENST00000621870	FAM151B	Q6UXP7	276 aa		9.35	□□□□□ -0.91

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