RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000611151.4

RAB18-208, Transcript of RAB18, member RAS oncogene family, human

TSL 5 BASIC

Gene RAB18, Length 4,931 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
RAB18-208	ENST00000611151	TBL3	Q12788	808 aa	Known RBP	13.96	□□□□□ -0.17
RAB18-208	ENST00000611151	DYNC1I2	Q13409	638 aa	Known RBP	13.96	□□□□□ -0.17
RAB18-208	ENST00000611151	PAGE2B	Q5JRK9	111 aa		13.96	□□□□□ -0.17
RAB18-208	ENST00000611151	SPDYC	Q5MJ68	293 aa		13.96	□□□□□ -0.17
RAB18-208	ENST00000611151	ATAD3B	Q5T9A4	648 aa		13.96	□□□□□ -0.17
RAB18-208	ENST00000611151	PLPP4	Q5VZY2	271 aa		13.96	□□□□□ -0.17
RAB18-208	ENST00000611151	DNAJC14	Q6Y2X3	702 aa	Predicted RBP	13.96	□□□□□ -0.17
RAB18-208	ENST00000611151	ZNF786	Q8N393	782 aa		13.96	□□□□□ -0.17
RAB18-208	ENST00000611151	PIK3R5	Q8WYR1	880 aa		13.96	□□□□□ -0.17
RAB18-208	ENST00000611151	ZNF75CP	Q92670	426 aa	Predicted RBP	13.96	□□□□□ -0.17
RAB18-208	ENST00000611151	NSMCE2	Q96MF7	247 aa		13.96	□□□□□ -0.17
RAB18-208	ENST00000611151	ST6GALNAC4	Q9H4F1	302 aa		13.96	□□□□□ -0.17
RAB18-208	ENST00000611151	ALG9	Q9H6U8	611 aa		13.96	□□□□□ -0.17
RAB18-208	ENST00000611151	FBXO6	Q9NRD1	293 aa	Predicted RBP	13.96	□□□□□ -0.17
RAB18-208	ENST00000611151	MPP6	Q9NZW5	540 aa		13.96	□□□□□ -0.17
RAB18-208	ENST00000611151	CROT	Q9UKG9	612 aa		13.96	□□□□□ -0.17
RAB18-208	ENST00000611151	AGO1	Q9UL18	857 aa	Known RBP	13.96	□□□□□ -0.17
RAB18-208	ENST00000611151	TMEM191C	A6NGB0	347 aa		13.96	□□□□□ -0.17
RAB18-208	ENST00000611151	SPATA31D3	P0C874	917 aa		13.96	□□□□□ -0.17
RAB18-208	ENST00000611151	UBTFL6	P0CB48	400 aa	Predicted RBP	13.96	□□□□□ -0.17
RAB18-208	ENST00000611151	CCDC166	P0CW27	439 aa		13.96	□□□□□ -0.17
RAB18-208	ENST00000611151	PTPRN	Q16849	979 aa		13.96	□□□□□ -0.17
RAB18-208	ENST00000611151	PFKFB4	Q16877	469 aa		13.96	□□□□□ -0.17
RAB18-208	ENST00000611151	RAET1G	Q6H3X3	334 aa		13.96	□□□□□ -0.17
RAB18-208	ENST00000611151	SPATA31D4	Q6ZUB0	917 aa		13.96	□□□□□ -0.17
RAB18-208	ENST00000611151	KCTD14	Q9BQ13	255 aa	Predicted RBP	13.96	□□□□□ -0.17
RAB18-208	ENST00000611151	PDZD7	Q9H5P4	517 aa		13.96	□□□□□ -0.17
RAB18-208	ENST00000611151	DCLRE1B	Q9H816	532 aa		13.96	□□□□□ -0.17
RAB18-208	ENST00000611151	FSCN2	O14926	492 aa		13.96	□□□□□ -0.17
RAB18-208	ENST00000611151	CST3	P01034	146 aa	Predicted RBP	13.96	□□□□□ -0.17
RAB18-208	ENST00000611151	ADRA1B	P35368	520 aa		13.96	□□□□□ -0.17
RAB18-208	ENST00000611151	CLCN5	P51795	746 aa		13.96	□□□□□ -0.17
RAB18-208	ENST00000611151	RAD23A	P54725	363 aa		13.96	□□□□□ -0.17
RAB18-208	ENST00000611151	AIF1	P55008	147 aa		13.96	□□□□□ -0.17
RAB18-208	ENST00000611151	CDK18	Q07002	472 aa		13.96	□□□□□ -0.17
RAB18-208	ENST00000611151	TMEM154	Q6P9G4	183 aa		13.96	□□□□□ -0.17
RAB18-208	ENST00000611151	IYD	Q6PHW0	289 aa		13.96	□□□□□ -0.17
RAB18-208	ENST00000611151	ATG16L2	Q8NAA4	619 aa		13.96	□□□□□ -0.17
RAB18-208	ENST00000611151	C12orf42	Q96LP6	360 aa		13.96	□□□□□ -0.17
RAB18-208	ENST00000611151	BBS4	Q96RK4	519 aa		13.96	□□□□□ -0.17
RAB18-208	ENST00000611151	BATF3	Q9NR55	127 aa		13.96	□□□□□ -0.17
RAB18-208	ENST00000611151	PCDHB9	Q9Y5E1	797 aa		13.96	□□□□□ -0.17
RAB18-208	ENST00000611151	LOC107983988	A0A1B0GUW6	1196 aa	Predicted RBP	13.96	□□□□□ -0.18
RAB18-208	ENST00000611151	GPR25	O00155	361 aa		13.96	□□□□□ -0.18
RAB18-208	ENST00000611151	NFKBIE	O00221	500 aa		13.96	□□□□□ -0.18
RAB18-208	ENST00000611151	TPP1	O14773	563 aa		13.96	□□□□□ -0.18
RAB18-208	ENST00000611151	RGS14	O43566	566 aa		13.96	□□□□□ -0.18
RAB18-208	ENST00000611151	TSPAN1	O60635	241 aa		13.96	□□□□□ -0.18
RAB18-208	ENST00000611151	ATP6V1B1	P15313	513 aa		13.96	□□□□□ -0.18
RAB18-208	ENST00000611151	ACADS	P16219	412 aa		13.96	□□□□□ -0.18
RAB18-208	ENST00000611151	CCT8	P50990	548 aa		13.96	□□□□□ -0.18
RAB18-208	ENST00000611151	TRAF2	Q12933	501 aa		13.96	□□□□□ -0.18
RAB18-208	ENST00000611151	IRF2BP1	Q8IU81	584 aa		13.96	□□□□□ -0.18
RAB18-208	ENST00000611151	MAB21L3	Q8N8X9	362 aa		13.96	□□□□□ -0.18
RAB18-208	ENST00000611151	C1orf127	Q8N9H9	656 aa		13.96	□□□□□ -0.18
RAB18-208	ENST00000611151	RIN3	Q8TB24	985 aa		13.96	□□□□□ -0.18
RAB18-208	ENST00000611151	TLE6	Q9H808	572 aa		13.96	□□□□□ -0.18
RAB18-208	ENST00000611151	ZNF229	Q9UJW7	825 aa		13.96	□□□□□ -0.18
RAB18-208	ENST00000611151	ZNF214	Q9UL59	606 aa	Predicted RBP	13.96	□□□□□ -0.18
RAB18-208	ENST00000611151	IGKV6D-41	A0A0C4DH26	115 aa		13.95	□□□□□ -0.18
RAB18-208	ENST00000611151		A0A0U1RQJ8	604 aa		13.95	□□□□□ -0.18
RAB18-208	ENST00000611151	MRAS	O14807	208 aa		13.95	□□□□□ -0.18
RAB18-208	ENST00000611151	CILP	O75339	1184 aa		13.95	□□□□□ -0.18
RAB18-208	ENST00000611151	OR4Q2	P0C623	313 aa		13.95	□□□□□ -0.18
RAB18-208	ENST00000611151	UBE3A	Q05086	875 aa		13.95	□□□□□ -0.18
RAB18-208	ENST00000611151	AFTPH	Q6ULP2	937 aa		13.95	□□□□□ -0.18
RAB18-208	ENST00000611151	IL27RA	Q6UWB1	636 aa		13.95	□□□□□ -0.18
RAB18-208	ENST00000611151	PLEKHM3	Q6ZWE6	761 aa		13.95	□□□□□ -0.18
RAB18-208	ENST00000611151	OTOP2	Q7RTS6	562 aa		13.95	□□□□□ -0.18
RAB18-208	ENST00000611151	SPPL2A	Q8TCT8	520 aa		13.95	□□□□□ -0.18
RAB18-208	ENST00000611151	RSPH1	Q8WYR4	309 aa		13.95	□□□□□ -0.18
RAB18-208	ENST00000611151	CPXM1	Q96SM3	734 aa		13.95	□□□□□ -0.18
RAB18-208	ENST00000611151	APOBEC3C	Q9NRW3	190 aa	Known RBP eCLIP	13.95	□□□□□ -0.18
RAB18-208	ENST00000611151	GNPTG	Q9UJJ9	305 aa		13.95	□□□□□ -0.18
RAB18-208	ENST00000611151	ANKDD1B	A6NHY2	528 aa		13.95	□□□□□ -0.18
RAB18-208	ENST00000611151	VPS4B	O75351	444 aa		13.95	□□□□□ -0.18
RAB18-208	ENST00000611151	PAGE1	O75459	146 aa		13.95	□□□□□ -0.18
RAB18-208	ENST00000611151	ALAD	P13716	330 aa		13.95	□□□□□ -0.18
RAB18-208	ENST00000611151	LPO	P22079	712 aa	Predicted RBP	13.95	□□□□□ -0.18
RAB18-208	ENST00000611151	RPS7	P62081	194 aa	Known RBP	13.95	□□□□□ -0.18
RAB18-208	ENST00000611151	FAM46C	Q5VWP2	391 aa		13.95	□□□□□ -0.18
RAB18-208	ENST00000611151	FAM45BP	Q6NSW5	357 aa		13.95	□□□□□ -0.18
RAB18-208	ENST00000611151	TMPRSS6	Q8IU80	811 aa		13.95	□□□□□ -0.18
RAB18-208	ENST00000611151	FAM45A	Q8TCE6	357 aa		13.95	□□□□□ -0.18
RAB18-208	ENST00000611151	SIKE1	Q9BRV8	207 aa		13.95	□□□□□ -0.18
RAB18-208	ENST00000611151	PCDH18	Q9HCL0	1135 aa		13.95	□□□□□ -0.18
RAB18-208	ENST00000611151	BPIFA1	Q9NP55	256 aa		13.95	□□□□□ -0.18
RAB18-208	ENST00000611151	SEMA4B	Q9NPR2	832 aa	Predicted RBP	13.95	□□□□□ -0.18
RAB18-208	ENST00000611151	CCDC167	Q9P0B6	97 aa		13.95	□□□□□ -0.18
RAB18-208	ENST00000611151		A0A088AWK7	358 aa		13.95	□□□□□ -0.18
RAB18-208	ENST00000611151	KPNA5	O15131	536 aa		13.95	□□□□□ -0.18
RAB18-208	ENST00000611151	DCX	O43602	365 aa		13.95	□□□□□ -0.18
RAB18-208	ENST00000611151	FCGR1A	P12314	374 aa		13.95	□□□□□ -0.18
RAB18-208	ENST00000611151	ZNF10	P21506	573 aa	Predicted RBP	13.95	□□□□□ -0.18
RAB18-208	ENST00000611151	ATL1	Q8WXF7	558 aa		13.95	□□□□□ -0.18
RAB18-208	ENST00000611151	LENG1	Q96BZ8	264 aa	Predicted RBP	13.95	□□□□□ -0.18
RAB18-208	ENST00000611151	ARMC7	Q9H6L4	198 aa		13.95	□□□□□ -0.18
RAB18-208	ENST00000611151	COMMD8	Q9NX08	183 aa		13.95	□□□□□ -0.18
RAB18-208	ENST00000611151	KL	Q9UEF7	1012 aa		13.95	□□□□□ -0.18
RAB18-208	ENST00000611151	CA12	O43570	354 aa		13.95	□□□□□ -0.18

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