RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000597671.5

USF2-209, Transcript of upstream transcription factor 2, c-fos interacting, humanhuman

TSL 5

Gene USF2, Length 464 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytosol .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USF2-209ENST00000597671 RP1P56715 2156 aa6.64□□□□□ -1.35
USF2-209ENST00000597671 C2orf72A6NCS6 295 aa6.64□□□□□ -1.35
USF2-209ENST00000597671 PRRT4C9JH25 899 aa6.64□□□□□ -1.35
USF2-209ENST00000597671 OPA1O60313 960 aa6.64□□□□□ -1.35
USF2-209ENST00000597671 SDC3O75056 442 aa6.64□□□□□ -1.35
USF2-209ENST00000597671 GRAP2O75791 330 aa6.64□□□□□ -1.35
USF2-209ENST00000597671 FSBPO95073 299 aa6.64□□□□□ -1.35
USF2-209ENST00000597671 GJB6O95452 261 aa6.64□□□□□ -1.35
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USF2-209ENST00000597671 ANAPC2Q9UJX6 822 aa6.64□□□□□ -1.35
USF2-209ENST00000597671 TMEM59LQ9UK28 342 aa6.64□□□□□ -1.35
USF2-209ENST00000597671 ITGB1BP2Q9UKP3 347 aa6.64□□□□□ -1.35
USF2-209ENST00000597671 ITIH6Q6UXX5 1313 aa6.64□□□□□ -1.35
USF2-209ENST00000597671 VPS13CQ709C8 3753 aa6.64□□□□□ -1.35
USF2-209ENST00000597671 SHANK1Q9Y566 2161 aa6.64□□□□□ -1.35
USF2-209ENST00000597671 TCRBV5S1A1TA0A578 114 aa6.63□□□□□ -1.35
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USF2-209ENST00000597671 DDX3XO00571 662 aaKnown RBP eCLIP6.63□□□□□ -1.35
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USF2-209ENST00000597671 MSI1O43347 362 aaKnown RBP6.63□□□□□ -1.35
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USF2-209ENST00000597671 STC2O76061 302 aa6.63□□□□□ -1.35
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USF2-209ENST00000597671 HMBSP08397 361 aa6.63□□□□□ -1.35
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USF2-209ENST00000597671 ADKP55263 362 aaKnown RBP6.63□□□□□ -1.35
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USF2-209ENST00000597671 KCNAB2Q13303 367 aa6.63□□□□□ -1.35
USF2-209ENST00000597671 ARID5BQ14865 1188 aa6.63□□□□□ -1.35
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USF2-209ENST00000597671 ASIC2Q16515 512 aa6.63□□□□□ -1.35
USF2-209ENST00000597671 ANO4Q32M45 955 aa6.63□□□□□ -1.35
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USF2-209ENST00000597671 EFHC1Q5JVL4 640 aa6.63□□□□□ -1.35
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USF2-209ENST00000597671 MSANTD2Q6P1R3 559 aa6.63□□□□□ -1.35
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USF2-209ENST00000597671 Q6ZNB5 142 aa6.63□□□□□ -1.35
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USF2-209ENST00000597671 ARHGAP18Q8N392 663 aa6.63□□□□□ -1.35
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USF2-209ENST00000597671 SYN2Q92777 582 aaPredicted RBP6.63□□□□□ -1.35
USF2-209ENST00000597671 SIPA1Q96FS4 1042 aa6.63□□□□□ -1.35
USF2-209ENST00000597671 SLC39A13Q96H72 371 aa6.63□□□□□ -1.35
USF2-209ENST00000597671 SLC2A13Q96QE2 648 aa6.63□□□□□ -1.35
USF2-209ENST00000597671 CHP1Q99653 195 aa6.63□□□□□ -1.35
USF2-209ENST00000597671 ANP32EQ9BTT0 268 aa6.63□□□□□ -1.35
USF2-209ENST00000597671 ACE2Q9BYF1 805 aaPredicted RBP6.63□□□□□ -1.35
USF2-209ENST00000597671 TRIM5Q9C035 493 aa6.63□□□□□ -1.35
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