RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000592483.5

CAPNS1-214, Transcript of calpain small subunit 1, humanhuman

TSL 5

Gene CAPNS1, Length 431 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAPNS1-214ENST00000592483 MPPE1Q53F39 396 aa24.21■■□□□ 1.47
CAPNS1-214ENST00000592483 EMC10Q5UCC4 262 aa24.21■■□□□ 1.47
CAPNS1-214ENST00000592483 ZNF557Q8N988 423 aaPredicted RBP24.21■■□□□ 1.47
CAPNS1-214ENST00000592483 KRT35Q92764 455 aa24.21■■□□□ 1.47
CAPNS1-214ENST00000592483 TBC1D31Q96DN5 1066 aa24.21■■□□□ 1.47
CAPNS1-214ENST00000592483 KCTD15Q96SI1 283 aaPredicted RBP24.21■■□□□ 1.47
CAPNS1-214ENST00000592483 TMPRSS4Q9NRS4 437 aa24.21■■□□□ 1.47
CAPNS1-214ENST00000592483 STIM2Q9P246 746 aa24.21■■□□□ 1.47
CAPNS1-214ENST00000592483 PCOLCE2Q9UKZ9 415 aa24.21■■□□□ 1.47
CAPNS1-214ENST00000592483 LRRD1A4D1F6 860 aa24.2■■□□□ 1.46
CAPNS1-214ENST00000592483 EEF2KO00418 725 aaKnown RBP24.2■■□□□ 1.46
CAPNS1-214ENST00000592483 ADH1CP00326 375 aa24.2■■□□□ 1.46
CAPNS1-214ENST00000592483 APODP05090 189 aa24.2■■□□□ 1.46
CAPNS1-214ENST00000592483 SLC6A4P31645 630 aa24.2■■□□□ 1.46
CAPNS1-214ENST00000592483 EIF2DP41214 584 aaKnown RBP24.2■■□□□ 1.46
CAPNS1-214ENST00000592483 SLC6A11P48066 632 aa24.2■■□□□ 1.46
CAPNS1-214ENST00000592483 TPI1P60174 286 aa24.2■■□□□ 1.46
CAPNS1-214ENST00000592483 PLEKHG6Q3KR16 790 aa24.2■■□□□ 1.46
CAPNS1-214ENST00000592483 ATP13A4Q4VNC1 1196 aa24.2■■□□□ 1.46
CAPNS1-214ENST00000592483 FBXL22Q6P050 247 aa24.2■■□□□ 1.46
CAPNS1-214ENST00000592483 ZNF683Q8IZ20 524 aa24.2■■□□□ 1.46
CAPNS1-214ENST00000592483 ADGRG2Q8IZP9 1017 aa24.2■■□□□ 1.46
CAPNS1-214ENST00000592483 LGI2Q8N0V4 545 aa24.2■■□□□ 1.46
CAPNS1-214ENST00000592483 LSM14AQ8ND56 463 aaKnown RBP24.2■■□□□ 1.46
CAPNS1-214ENST00000592483 TSC1Q92574 1164 aa24.2■■□□□ 1.46
CAPNS1-214ENST00000592483 TMA16Q96EY4 203 aaKnown RBP24.2■■□□□ 1.46
CAPNS1-214ENST00000592483 RPRD1AQ96P16 312 aaPredicted RBP24.2■■□□□ 1.46
CAPNS1-214ENST00000592483 NAPGQ99747 312 aaPredicted RBP24.2■■□□□ 1.46
CAPNS1-214ENST00000592483 TLR10Q9BXR5 811 aa24.2■■□□□ 1.46
CAPNS1-214ENST00000592483 CARD9Q9H257 536 aa24.2■■□□□ 1.46
CAPNS1-214ENST00000592483 CATSPERBQ9H7T0 1116 aa24.2■■□□□ 1.46
CAPNS1-214ENST00000592483 SPHK2Q9NRA0 654 aa24.2■■□□□ 1.46
CAPNS1-214ENST00000592483 RAI2Q9Y5P3 530 aa24.2■■□□□ 1.46
CAPNS1-214ENST00000592483 MYO18AQ92614 2054 aaKnown RBP24.19■■□□□ 1.46
CAPNS1-214ENST00000592483 CTAGE9A4FU28 777 aa24.19■■□□□ 1.46
CAPNS1-214ENST00000592483 TRABD2BA6NFA1 517 aa24.19■■□□□ 1.46
CAPNS1-214ENST00000592483 LRIG2O94898 1065 aa24.19■■□□□ 1.46
CAPNS1-214ENST00000592483 CYP17A1P05093 508 aa24.19■■□□□ 1.46
CAPNS1-214ENST00000592483 PTPN7P35236 360 aa24.19■■□□□ 1.46
CAPNS1-214ENST00000592483 TNFRSF4P43489 277 aa24.19■■□□□ 1.46
CAPNS1-214ENST00000592483 MARCKSL1P49006 195 aa24.19■■□□□ 1.46
CAPNS1-214ENST00000592483 MESP2Q0VG99 397 aa24.19■■□□□ 1.46
CAPNS1-214ENST00000592483 DPYSL3Q14195 570 aa24.19■■□□□ 1.46
CAPNS1-214ENST00000592483 PPP2R5EQ16537 467 aa24.19■■□□□ 1.46
CAPNS1-214ENST00000592483 PPP6R3Q5H9R7 873 aaPredicted RBP24.19■■□□□ 1.46
CAPNS1-214ENST00000592483 CHST9Q7L1S5 443 aa24.19■■□□□ 1.46
CAPNS1-214ENST00000592483 SLC41A1Q8IVJ1 513 aa24.19■■□□□ 1.46
CAPNS1-214ENST00000592483 PYROXD2Q8N2H3 581 aa24.19■■□□□ 1.46
CAPNS1-214ENST00000592483 ZDHHC5Q9C0B5 715 aa24.19■■□□□ 1.46
CAPNS1-214ENST00000592483 ZYG11BQ9C0D3 744 aa24.19■■□□□ 1.46
CAPNS1-214ENST00000592483 SUSD2Q9UGT4 822 aa24.19■■□□□ 1.46
CAPNS1-214ENST00000592483 VANGL2Q9ULK5 521 aa24.19■■□□□ 1.46
CAPNS1-214ENST00000592483 PACSIN2Q9UNF0 486 aaPredicted RBP24.19■■□□□ 1.46
CAPNS1-214ENST00000592483 EFR3BQ9Y2G0 817 aa24.19■■□□□ 1.46
CAPNS1-214ENST00000592483 GOLGA6L7A0A1B0GV03 622 aa24.18■■□□□ 1.46
CAPNS1-214ENST00000592483 CREB3O43889 395 aa24.18■■□□□ 1.46
CAPNS1-214ENST00000592483 RHOQP17081 205 aa24.18■■□□□ 1.46
CAPNS1-214ENST00000592483 GRIA2P42262 883 aa24.18■■□□□ 1.46
CAPNS1-214ENST00000592483 ABCG1P45844 678 aa24.18■■□□□ 1.46
CAPNS1-214ENST00000592483 TAZQ16635 292 aa24.18■■□□□ 1.46
CAPNS1-214ENST00000592483 RFX8Q6ZV50 586 aa24.18■■□□□ 1.46
CAPNS1-214ENST00000592483 C14orf80Q86SX3 495 aa24.18■■□□□ 1.46
CAPNS1-214ENST00000592483 RAPGEF5Q92565 580 aa24.18■■□□□ 1.46
CAPNS1-214ENST00000592483 ALG3Q92685 438 aa24.18■■□□□ 1.46
CAPNS1-214ENST00000592483 FAF2Q96CS3 445 aa24.18■■□□□ 1.46
CAPNS1-214ENST00000592483 CALN1Q9BXU9 219 aa24.18■■□□□ 1.46
CAPNS1-214ENST00000592483 A0A1B0GVM2 712 aa24.17■■□□□ 1.46
CAPNS1-214ENST00000592483 TCAF2A6NFQ2 919 aa24.17■■□□□ 1.46
CAPNS1-214ENST00000592483 WASH4PA8MWX3 477 aa24.17■■□□□ 1.46
CAPNS1-214ENST00000592483 FAM72CH0Y354 149 aa24.17■■□□□ 1.46
CAPNS1-214ENST00000592483 SCAMP3O14828 347 aaKnown RBP24.17■■□□□ 1.46
CAPNS1-214ENST00000592483 HOXC11O43248 304 aaPredicted RBP24.17■■□□□ 1.46
CAPNS1-214ENST00000592483 DAPK3O43293 454 aa24.17■■□□□ 1.46
CAPNS1-214ENST00000592483 CLDN11O75508 207 aa24.17■■□□□ 1.46
CAPNS1-214ENST00000592483 PENKP01210 267 aaPredicted RBP24.17■■□□□ 1.46
CAPNS1-214ENST00000592483 GABRG2P18507 467 aa24.17■■□□□ 1.46
CAPNS1-214ENST00000592483 EPHB2P29323 1055 aa24.17■■□□□ 1.46
CAPNS1-214ENST00000592483 CDH4P55283 916 aa24.17■■□□□ 1.46
CAPNS1-214ENST00000592483 GAD2Q05329 585 aa24.17■■□□□ 1.46
CAPNS1-214ENST00000592483 DHCR24Q15392 516 aa24.17■■□□□ 1.46
CAPNS1-214ENST00000592483 FAM72AQ5TYM5 149 aa24.17■■□□□ 1.46
CAPNS1-214ENST00000592483 FAM72DQ6L9T8 149 aa24.17■■□□□ 1.46
CAPNS1-214ENST00000592483 RFWD3Q6PCD5 774 aa24.17■■□□□ 1.46
CAPNS1-214ENST00000592483 SPOCD1Q6ZMY3 1216 aa24.17■■□□□ 1.46
CAPNS1-214ENST00000592483 FAM72BQ86X60 149 aa24.17■■□□□ 1.46
CAPNS1-214ENST00000592483 HSPA12BQ96MM6 686 aa24.17■■□□□ 1.46
CAPNS1-214ENST00000592483 PRICKLE1Q96MT3 831 aaPredicted RBP24.17■■□□□ 1.46
CAPNS1-214ENST00000592483 CSPG4P5Q96PW8 444 aa24.17■■□□□ 1.46
CAPNS1-214ENST00000592483 WDR24Q96S15 920 aa24.17■■□□□ 1.46
CAPNS1-214ENST00000592483 ZDHHC4Q9NPG8 344 aa24.17■■□□□ 1.46
CAPNS1-214ENST00000592483 ARHGEF4Q9NR80 690 aa24.17■■□□□ 1.46
CAPNS1-214ENST00000592483 CWC15Q9P013 229 aaKnown RBP24.17■■□□□ 1.46
CAPNS1-214ENST00000592483 SNX10Q9Y5X0 201 aa24.17■■□□□ 1.46
CAPNS1-214ENST00000592483 IGHV1OR15-9A0A0B4J2B8 117 aa24.16■■□□□ 1.46
CAPNS1-214ENST00000592483 C3orf70A6NLC5 250 aaPredicted RBP24.16■■□□□ 1.46
CAPNS1-214ENST00000592483 CES2O00748 559 aa24.16■■□□□ 1.46
CAPNS1-214ENST00000592483 SRGAP2O75044 1071 aa24.16■■□□□ 1.46
CAPNS1-214ENST00000592483 ZNF217O75362 1048 aa24.16■■□□□ 1.46
CAPNS1-214ENST00000592483 DKK1O94907 266 aa24.16■■□□□ 1.46
CAPNS1-214ENST00000592483 GNSP15586 552 aa24.16■■□□□ 1.46
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