RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000590124.5

EFTUD2-217, Transcript of elongation factor Tu GTP binding domain containing 2, humanhuman

TSL 3

Gene EFTUD2, Length 899 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EFTUD2-217ENST00000590124 ZCCHC9Q8N567 271 aaKnown RBP20.3■□□□□ 0.84
EFTUD2-217ENST00000590124 PCDH20Q8N6Y1 951 aaKnown RBP20.3■□□□□ 0.84
EFTUD2-217ENST00000590124 NIPA2Q8N8Q9 360 aa20.3■□□□□ 0.84
EFTUD2-217ENST00000590124 CHST14Q8NCH0 376 aa20.3■□□□□ 0.84
EFTUD2-217ENST00000590124 CCDC114Q96M63 670 aa20.3■□□□□ 0.84
EFTUD2-217ENST00000590124 KCTD15Q96SI1 283 aaPredicted RBP20.3■□□□□ 0.84
EFTUD2-217ENST00000590124 NUP85Q9BW27 656 aa20.3■□□□□ 0.84
EFTUD2-217ENST00000590124 MIR1-1HGQ9H1L0 117 aa20.3■□□□□ 0.84
EFTUD2-217ENST00000590124 TNKS2Q9H2K2 1166 aa20.3■□□□□ 0.84
EFTUD2-217ENST00000590124 DHX35Q9H5Z1 703 aaKnown RBP20.3■□□□□ 0.84
EFTUD2-217ENST00000590124 C1QTNF3-AMACRE9PGA6 284 aa20.29■□□□□ 0.84
EFTUD2-217ENST00000590124 RNF103O00237 685 aa20.29■□□□□ 0.84
EFTUD2-217ENST00000590124 PLK4O00444 970 aa20.29■□□□□ 0.84
EFTUD2-217ENST00000590124 ARHGAP33O14559 1287 aa20.29■□□□□ 0.84
EFTUD2-217ENST00000590124 BCAT2O15382 392 aaPredicted RBP20.29■□□□□ 0.84
EFTUD2-217ENST00000590124 SLC7A4O43246 635 aa20.29■□□□□ 0.84
EFTUD2-217ENST00000590124 TCF4P15884 667 aa20.29■□□□□ 0.84
EFTUD2-217ENST00000590124 IL1R2P27930 398 aa20.29■□□□□ 0.84
EFTUD2-217ENST00000590124 PIGHQ14442 188 aaPredicted RBP20.29■□□□□ 0.84
EFTUD2-217ENST00000590124 RAB11FIP1Q6WKZ4 1283 aaPredicted RBP20.29■□□□□ 0.84
EFTUD2-217ENST00000590124 DPY19L3Q6ZPD9 716 aa20.29■□□□□ 0.84
EFTUD2-217ENST00000590124 TMIEQ8NEW7 156 aa20.29■□□□□ 0.84
EFTUD2-217ENST00000590124 OR2T34Q8NGX1 318 aa20.29■□□□□ 0.84
EFTUD2-217ENST00000590124 ISG20Q96AZ6 181 aaKnown RBP20.29■□□□□ 0.84
EFTUD2-217ENST00000590124 KLC2Q9H0B6 622 aa20.29■□□□□ 0.84
EFTUD2-217ENST00000590124 OSGEPQ9NPF4 335 aa20.29■□□□□ 0.84
EFTUD2-217ENST00000590124 HPCAL4Q9UM19 191 aa20.29■□□□□ 0.84
EFTUD2-217ENST00000590124 FCF1Q9Y324 198 aaKnown RBP20.29■□□□□ 0.84
EFTUD2-217ENST00000590124 FARP1Q9Y4F1 1045 aaPredicted RBP20.29■□□□□ 0.84
EFTUD2-217ENST00000590124 PLXNA2O75051 1894 aa20.28■□□□□ 0.84
EFTUD2-217ENST00000590124 LRRC72A6NJI9 287 aa20.28■□□□□ 0.84
EFTUD2-217ENST00000590124 RASA4BC9J798 803 aa20.28■□□□□ 0.84
EFTUD2-217ENST00000590124 EEF2KO00418 725 aaKnown RBP20.28■□□□□ 0.84
EFTUD2-217ENST00000590124 RASA4O43374 803 aa20.28■□□□□ 0.84
EFTUD2-217ENST00000590124 FSBPO95073 299 aa20.28■□□□□ 0.84
EFTUD2-217ENST00000590124 TPM1P09493 284 aa20.28■□□□□ 0.84
EFTUD2-217ENST00000590124 CD27P26842 260 aa20.28■□□□□ 0.84
EFTUD2-217ENST00000590124 ADKP55263 362 aaKnown RBP20.28■□□□□ 0.84
EFTUD2-217ENST00000590124 GEMIN4P57678 1058 aaKnown RBP20.28■□□□□ 0.84
EFTUD2-217ENST00000590124 CNTN1Q12860 1018 aa20.28■□□□□ 0.84
EFTUD2-217ENST00000590124 PARP15Q460N3 678 aa20.28■□□□□ 0.84
EFTUD2-217ENST00000590124 AGBL4Q5VU57 503 aa20.28■□□□□ 0.84
EFTUD2-217ENST00000590124 PLPP6Q8IY26 295 aa20.28■□□□□ 0.84
EFTUD2-217ENST00000590124 SNX19Q92543 992 aa20.28■□□□□ 0.84
EFTUD2-217ENST00000590124 HMCESQ96FZ2 354 aa20.28■□□□□ 0.84
EFTUD2-217ENST00000590124 BTBD6Q96KE9 485 aa20.28■□□□□ 0.84
EFTUD2-217ENST00000590124 CHP1Q99653 195 aa20.28■□□□□ 0.84
EFTUD2-217ENST00000590124 LRRC19Q9H756 370 aa20.28■□□□□ 0.84
EFTUD2-217ENST00000590124 ZNHIT6Q9NWK9 470 aaKnown RBP20.28■□□□□ 0.84
EFTUD2-217ENST00000590124 IP6K2Q9UHH9 426 aa20.28■□□□□ 0.84
EFTUD2-217ENST00000590124 ANAPC7Q9UJX3 599 aa20.28■□□□□ 0.84
EFTUD2-217ENST00000590124 WASF2Q9Y6W5 498 aa20.28■□□□□ 0.84
EFTUD2-217ENST00000590124 ZSCAN5CA6NGD5 496 aaPredicted RBP20.27■□□□□ 0.84
EFTUD2-217ENST00000590124 FAM47DPA6NHR8 397 aa20.27■□□□□ 0.84
EFTUD2-217ENST00000590124 PLRG1O43660 514 aaKnown RBP20.27■□□□□ 0.84
EFTUD2-217ENST00000590124 PRNPP04156 253 aa20.27■□□□□ 0.84
EFTUD2-217ENST00000590124 MAPK8P45983 427 aa20.27■□□□□ 0.84
EFTUD2-217ENST00000590124 HCAR3P49019 387 aa20.27■□□□□ 0.84
EFTUD2-217ENST00000590124 CCR5P51681 352 aa20.27■□□□□ 0.84
EFTUD2-217ENST00000590124 ZNF135P52742 658 aaPredicted RBP20.27■□□□□ 0.84
EFTUD2-217ENST00000590124 BNC1Q01954 994 aa20.27■□□□□ 0.84
EFTUD2-217ENST00000590124 SERINC3Q13530 473 aa20.27■□□□□ 0.84
EFTUD2-217ENST00000590124 POM121L1PQ3SYA9 428 aa20.27■□□□□ 0.84
EFTUD2-217ENST00000590124 CARD16Q5EG05 197 aa20.27■□□□□ 0.84
EFTUD2-217ENST00000590124 RFX8Q6ZV50 586 aa20.27■□□□□ 0.84
EFTUD2-217ENST00000590124 OR14C36Q8NHC7 312 aa20.27■□□□□ 0.84
EFTUD2-217ENST00000590124 VOPP1Q96AW1 172 aa20.27■□□□□ 0.84
EFTUD2-217ENST00000590124 ARRDC3Q96B67 414 aa20.27■□□□□ 0.84
EFTUD2-217ENST00000590124 PACSIN1Q9BY11 444 aa20.27■□□□□ 0.84
EFTUD2-217ENST00000590124 RBSNQ9H1K0 784 aa20.27■□□□□ 0.84
EFTUD2-217ENST00000590124 KDM4CQ9H3R0 1056 aa20.27■□□□□ 0.84
EFTUD2-217ENST00000590124 EBF2Q9HAK2 575 aa20.27■□□□□ 0.84
EFTUD2-217ENST00000590124 IL36AQ9UHA7 158 aa20.27■□□□□ 0.84
EFTUD2-217ENST00000590124 CACNA1AO00555 2505 aa20.27■□□□□ 0.84
EFTUD2-217ENST00000590124 CACNA1EQ15878 2313 aa20.26■□□□□ 0.83
EFTUD2-217ENST00000590124 A0A1W2PPC4 97 aa20.26■□□□□ 0.83
EFTUD2-217ENST00000590124 SYPP08247 313 aa20.26■□□□□ 0.83
EFTUD2-217ENST00000590124 RECQLP46063 649 aaPredicted RBP20.26■□□□□ 0.83
EFTUD2-217ENST00000590124 CCNHP51946 323 aaPredicted RBP20.26■□□□□ 0.83
EFTUD2-217ENST00000590124 NDST2P52849 883 aa20.26■□□□□ 0.83
EFTUD2-217ENST00000590124 GRIK2Q13002 908 aa20.26■□□□□ 0.83
EFTUD2-217ENST00000590124 DPYSQ14117 519 aa20.26■□□□□ 0.83
EFTUD2-217ENST00000590124 DPYSL2Q16555 572 aa20.26■□□□□ 0.83
EFTUD2-217ENST00000590124 BOLA3Q53S33 107 aa20.26■□□□□ 0.83
EFTUD2-217ENST00000590124 ARSIQ5FYB1 569 aa20.26■□□□□ 0.83
EFTUD2-217ENST00000590124 PPP6R3Q5H9R7 873 aaPredicted RBP20.26■□□□□ 0.83
EFTUD2-217ENST00000590124 PIP5KL1Q5T9C9 394 aa20.26■□□□□ 0.83
EFTUD2-217ENST00000590124 AFMIDQ63HM1 303 aa20.26■□□□□ 0.83
EFTUD2-217ENST00000590124 TXNRD3NBQ6F5E7 133 aa20.26■□□□□ 0.83
EFTUD2-217ENST00000590124 LEKR1Q6ZMV7 388 aa20.26■□□□□ 0.83
EFTUD2-217ENST00000590124 MINDY1Q8N5J2 469 aa20.26■□□□□ 0.83
EFTUD2-217ENST00000590124 GTPBP2Q9BX10 602 aaKnown RBP20.26■□□□□ 0.83
EFTUD2-217ENST00000590124 TRIM5Q9C035 493 aa20.26■□□□□ 0.83
EFTUD2-217ENST00000590124 TM9SF3Q9HD45 589 aa20.26■□□□□ 0.83
EFTUD2-217ENST00000590124 DONSONQ9NYP3 566 aa20.26■□□□□ 0.83
EFTUD2-217ENST00000590124 CWC15Q9P013 229 aaKnown RBP20.26■□□□□ 0.83
EFTUD2-217ENST00000590124 KPNA3O00505 521 aaPredicted RBP20.25■□□□□ 0.83
EFTUD2-217ENST00000590124 LATO43561 262 aa20.25■□□□□ 0.83
EFTUD2-217ENST00000590124 LEFTY1O75610 366 aa20.25■□□□□ 0.83
EFTUD2-217ENST00000590124 GJB3O75712 270 aa20.25■□□□□ 0.83
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 32.1 ms