RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000589825.5

EFTUD2-215, Transcript of elongation factor Tu GTP binding domain containing 2, humanhuman

TSL 2

Gene EFTUD2, Length 600 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EFTUD2-215ENST00000589825 NLRP14Q86W24 1093 aa16.43■□□□□ 0.22
EFTUD2-215ENST00000589825 PYROXD2Q8N2H3 581 aa16.43■□□□□ 0.22
EFTUD2-215ENST00000589825 RYBPQ8N488 228 aaPredicted RBP16.43■□□□□ 0.22
EFTUD2-215ENST00000589825 PCDH20Q8N6Y1 951 aaKnown RBP16.43■□□□□ 0.22
EFTUD2-215ENST00000589825 TMIEQ8NEW7 156 aa16.43■□□□□ 0.22
EFTUD2-215ENST00000589825 OR2A12Q8NGT7 310 aa16.43■□□□□ 0.22
EFTUD2-215ENST00000589825 C1orf216Q8TAB5 229 aa16.43■□□□□ 0.22
EFTUD2-215ENST00000589825 SYN2Q92777 582 aaPredicted RBP16.43■□□□□ 0.22
EFTUD2-215ENST00000589825 ARHGEF2Q92974 986 aaKnown RBP16.43■□□□□ 0.22
EFTUD2-215ENST00000589825 NCAPGQ9BPX3 1015 aa16.43■□□□□ 0.22
EFTUD2-215ENST00000589825 MAGEB5Q9BZ81 275 aa16.43■□□□□ 0.22
EFTUD2-215ENST00000589825 MYO1AQ9UBC5 1043 aa16.43■□□□□ 0.22
EFTUD2-215ENST00000589825 IL36AQ9UHA7 158 aa16.43■□□□□ 0.22
EFTUD2-215ENST00000589825 ANKRD6Q9Y2G4 727 aa16.43■□□□□ 0.22
EFTUD2-215ENST00000589825 UCHL5Q9Y5K5 329 aaKnown RBP eCLIP16.43■□□□□ 0.224e-7■□□□□ 11
EFTUD2-215ENST00000589825 CXorf51AA0A1B0GTR3 108 aa16.42■□□□□ 0.22
EFTUD2-215ENST00000589825 PLK4O00444 970 aa16.42■□□□□ 0.22
EFTUD2-215ENST00000589825 DDX3XO00571 662 aaKnown RBP eCLIP16.42■□□□□ 0.222e-10■■□□□ 11.7
EFTUD2-215ENST00000589825 GIPC1O14908 333 aa16.42■□□□□ 0.22
EFTUD2-215ENST00000589825 FGF10O15520 208 aaPredicted RBP16.42■□□□□ 0.22
EFTUD2-215ENST00000589825 DAPK3O43293 454 aa16.42■□□□□ 0.22
EFTUD2-215ENST00000589825 CBFA2T2O43439 604 aa16.42■□□□□ 0.22
EFTUD2-215ENST00000589825 PLRG1O43660 514 aaKnown RBP16.42■□□□□ 0.22
EFTUD2-215ENST00000589825 SERPING1P05155 500 aa16.42■□□□□ 0.22
EFTUD2-215ENST00000589825 ACVRL1P37023 503 aa16.42■□□□□ 0.22
EFTUD2-215ENST00000589825 TPI1P60174 286 aa16.42■□□□□ 0.22
EFTUD2-215ENST00000589825 ARF5P84085 180 aa16.42■□□□□ 0.22
EFTUD2-215ENST00000589825 SUZ12Q15022 739 aaKnown RBP16.42■□□□□ 0.22
EFTUD2-215ENST00000589825 NFKBIBQ15653 356 aa16.42■□□□□ 0.22
EFTUD2-215ENST00000589825 CARD16Q5EG05 197 aa16.42■□□□□ 0.22
EFTUD2-215ENST00000589825 E4F1Q66K89 784 aaPredicted RBP16.42■□□□□ 0.22
EFTUD2-215ENST00000589825 RTL3Q8N8U3 475 aaKnown RBP16.42■□□□□ 0.22
EFTUD2-215ENST00000589825 GRIN3AQ8TCU5 1115 aa16.42■□□□□ 0.22
EFTUD2-215ENST00000589825 SERAC1Q96JX3 654 aa16.42■□□□□ 0.22
EFTUD2-215ENST00000589825 NDFIP2Q9NV92 336 aa16.42■□□□□ 0.22
EFTUD2-215ENST00000589825 CAPN11Q9UMQ6 739 aa16.42■□□□□ 0.22
EFTUD2-215ENST00000589825 FCF1Q9Y324 198 aaKnown RBP16.42■□□□□ 0.22
EFTUD2-215ENST00000589825 TMEM191CA6NGB0 347 aa16.41■□□□□ 0.22
EFTUD2-215ENST00000589825 ZSCAN5CA6NGD5 496 aaPredicted RBP16.41■□□□□ 0.22
EFTUD2-215ENST00000589825 EIF3CLB5ME19 914 aaKnown RBP16.41■□□□□ 0.22
EFTUD2-215ENST00000589825 BUB1O43683 1085 aa16.41■□□□□ 0.22
EFTUD2-215ENST00000589825 PRPSAP2O60256 369 aa16.41■□□□□ 0.22
EFTUD2-215ENST00000589825 ZMPSTE24O75844 475 aa16.41■□□□□ 0.22
EFTUD2-215ENST00000589825 HTR7P34969 479 aa16.41■□□□□ 0.22
EFTUD2-215ENST00000589825 NUDT1P36639 197 aa16.41■□□□□ 0.22
EFTUD2-215ENST00000589825 PBX1P40424 430 aa16.41■□□□□ 0.22
EFTUD2-215ENST00000589825 METAP1P53582 386 aa16.41■□□□□ 0.22
EFTUD2-215ENST00000589825 YBEYP58557 167 aaPredicted RBP16.41■□□□□ 0.22
EFTUD2-215ENST00000589825 OGDHQ02218 1023 aa16.41■□□□□ 0.22
EFTUD2-215ENST00000589825 KIF19Q2TAC6 998 aa16.41■□□□□ 0.22
EFTUD2-215ENST00000589825 ARSIQ5FYB1 569 aa16.41■□□□□ 0.22
EFTUD2-215ENST00000589825 ERMARDQ5T6L9 678 aa16.41■□□□□ 0.22
EFTUD2-215ENST00000589825 DPY19L3Q6ZPD9 716 aa16.41■□□□□ 0.22
EFTUD2-215ENST00000589825 DNAAF5Q86Y56 855 aa16.41■□□□□ 0.22
EFTUD2-215ENST00000589825 CHST14Q8NCH0 376 aa16.41■□□□□ 0.22
EFTUD2-215ENST00000589825 SETD7Q8WTS6 366 aaKnown RBP16.41■□□□□ 0.22
EFTUD2-215ENST00000589825 SLC6A18Q96N87 628 aa16.41■□□□□ 0.22
EFTUD2-215ENST00000589825 EIF3CQ99613 913 aaKnown RBP16.41■□□□□ 0.22
EFTUD2-215ENST00000589825 HEPHQ9BQS7 1158 aa16.41■□□□□ 0.22
EFTUD2-215ENST00000589825 TSPY26PQ9H489 355 aa16.41■□□□□ 0.22
EFTUD2-215ENST00000589825 DHX35Q9H5Z1 703 aaKnown RBP16.41■□□□□ 0.22
EFTUD2-215ENST00000589825 TM7SF3Q9NS93 570 aa16.41■□□□□ 0.22
EFTUD2-215ENST00000589825 PCSK1NQ9UHG2 260 aa16.41■□□□□ 0.22
EFTUD2-215ENST00000589825 ANGPTL2Q9UKU9 493 aa16.41■□□□□ 0.22
EFTUD2-215ENST00000589825 AP4E1Q9UPM8 1137 aa16.41■□□□□ 0.22
EFTUD2-215ENST00000589825 SNX11Q9Y5W9 270 aa16.41■□□□□ 0.22
EFTUD2-215ENST00000589825 EEF2KO00418 725 aaKnown RBP16.4■□□□□ 0.22
EFTUD2-215ENST00000589825 KDELR3O43731 214 aa16.4■□□□□ 0.22
EFTUD2-215ENST00000589825 SH3BP5O60239 455 aa16.4■□□□□ 0.22
EFTUD2-215ENST00000589825 DFNA5O60443 496 aa16.4■□□□□ 0.22
EFTUD2-215ENST00000589825 LEFTY1O75610 366 aa16.4■□□□□ 0.22
EFTUD2-215ENST00000589825 CTSLP07711 333 aa16.4■□□□□ 0.22
EFTUD2-215ENST00000589825 ZNF883P0CG24 379 aa16.4■□□□□ 0.22
EFTUD2-215ENST00000589825 CD59P13987 128 aa16.4■□□□□ 0.22
EFTUD2-215ENST00000589825 CD38P28907 300 aa16.4■□□□□ 0.22
EFTUD2-215ENST00000589825 MAT2AP31153 395 aaKnown RBP16.4■□□□□ 0.22
EFTUD2-215ENST00000589825 SNRPD1P62314 119 aaKnown RBP16.4■□□□□ 0.22
EFTUD2-215ENST00000589825 SIM1P81133 766 aaPredicted RBP16.4■□□□□ 0.22
EFTUD2-215ENST00000589825 SETMARQ53H47 684 aaPredicted RBP16.4■□□□□ 0.22
EFTUD2-215ENST00000589825 ARTNQ5T4W7 220 aa16.4■□□□□ 0.22
EFTUD2-215ENST00000589825 AGBL4Q5VU57 503 aa16.4■□□□□ 0.22
EFTUD2-215ENST00000589825 PIP4P1Q86T03 277 aa16.4■□□□□ 0.22
EFTUD2-215ENST00000589825 NAXDQ8IW45 347 aa16.4■□□□□ 0.22
EFTUD2-215ENST00000589825 FNIP1Q8TF40 1166 aa16.4■□□□□ 0.22
EFTUD2-215ENST00000589825 ISG20Q96AZ6 181 aaKnown RBP16.4■□□□□ 0.22
EFTUD2-215ENST00000589825 TM6SF2Q9BZW4 377 aa16.4■□□□□ 0.22
EFTUD2-215ENST00000589825 XPO4Q9C0E2 1151 aaKnown RBP16.4■□□□□ 0.22
EFTUD2-215ENST00000589825 ISCUQ9H1K1 167 aa16.4■□□□□ 0.22
EFTUD2-215ENST00000589825 ZDHHC6Q9H6R6 413 aa16.4■□□□□ 0.22
EFTUD2-215ENST00000589825 PREBQ9HCU5 417 aa16.4■□□□□ 0.22
EFTUD2-215ENST00000589825 HECAQ9UBI9 543 aaPredicted RBP16.4■□□□□ 0.22
EFTUD2-215ENST00000589825 DMTF1Q9Y222 760 aa16.4■□□□□ 0.22
EFTUD2-215ENST00000589825 SLCO1B1Q9Y6L6 691 aa16.4■□□□□ 0.22
EFTUD2-215ENST00000589825 PLXNA2O75051 1894 aa16.39■□□□□ 0.22
EFTUD2-215ENST00000589825 NCOR2Q9Y618 2525 aa16.39■□□□□ 0.21
EFTUD2-215ENST00000589825 VILLO15195 856 aa16.39■□□□□ 0.21
EFTUD2-215ENST00000589825 MAGEC1O60732 1142 aa16.39■□□□□ 0.21
EFTUD2-215ENST00000589825 GJB3O75712 270 aa16.39■□□□□ 0.21
EFTUD2-215ENST00000589825 PCDH8O95206 1070 aa16.39■□□□□ 0.21
EFTUD2-215ENST00000589825 TPM1P09493 284 aa16.39■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 21.7 ms