RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000585291.5

NFE2L1-222, Transcript of nuclear factor, erythroid 2 like 1, human

TSL 1 (best) BASIC

Gene NFE2L1, Length 4,390 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
NFE2L1-222	ENST00000585291	TMA16	Q96EY4	203 aa	Known RBP	13	□□□□□ -0.33
NFE2L1-222	ENST00000585291	SLC39A8	Q9C0K1	460 aa		13	□□□□□ -0.33
NFE2L1-222	ENST00000585291	EML4	Q9HC35	981 aa	Known RBP	13	□□□□□ -0.33
NFE2L1-222	ENST00000585291	DNAJB4	Q9UDY4	337 aa		13	□□□□□ -0.33
NFE2L1-222	ENST00000585291	CDYL	Q9Y232	598 aa		13	□□□□□ -0.33
NFE2L1-222	ENST00000585291	RAD54B	Q9Y620	910 aa		13	□□□□□ -0.33
NFE2L1-222	ENST00000585291	MYO9B	Q13459	2157 aa		13	□□□□□ -0.33
NFE2L1-222	ENST00000585291	DDHD2	O94830	711 aa		12.99	□□□□□ -0.33
NFE2L1-222	ENST00000585291	CALB2	P22676	271 aa		12.99	□□□□□ -0.33
NFE2L1-222	ENST00000585291	ELF3	P78545	371 aa	Predicted RBP	12.99	□□□□□ -0.33
NFE2L1-222	ENST00000585291	USP41	Q3LFD5	358 aa		12.99	□□□□□ -0.33
NFE2L1-222	ENST00000585291	RELL1	Q8IUW5	271 aa		12.99	□□□□□ -0.33
NFE2L1-222	ENST00000585291	OR10T2	Q8NGX3	314 aa		12.99	□□□□□ -0.33
NFE2L1-222	ENST00000585291	TEKT5	Q96M29	485 aa		12.99	□□□□□ -0.33
NFE2L1-222	ENST00000585291	LRGUK	Q96M69	825 aa		12.99	□□□□□ -0.33
NFE2L1-222	ENST00000585291	AGAP2	Q99490	1192 aa		12.99	□□□□□ -0.33
NFE2L1-222	ENST00000585291	VCX3B	Q9H321	246 aa		12.99	□□□□□ -0.33
NFE2L1-222	ENST00000585291	EPS15L1	Q9UBC2	864 aa		12.99	□□□□□ -0.33
NFE2L1-222	ENST00000585291	UBA2	Q9UBT2	640 aa	Predicted RBP	12.99	□□□□□ -0.33
NFE2L1-222	ENST00000585291	DNMT3L	Q9UJW3	386 aa		12.99	□□□□□ -0.33
NFE2L1-222	ENST00000585291	GJD2	Q9UKL4	321 aa		12.99	□□□□□ -0.33
NFE2L1-222	ENST00000585291	TNS1	Q9HBL0	1735 aa	Known RBP	12.99	□□□□□ -0.33
NFE2L1-222	ENST00000585291	SRP72	O76094	671 aa	Known RBP	12.99	□□□□□ -0.33
NFE2L1-222	ENST00000585291	ATP6V1G2	O95670	118 aa		12.99	□□□□□ -0.33
NFE2L1-222	ENST00000585291	ITGB1	P05556	798 aa		12.99	□□□□□ -0.33
NFE2L1-222	ENST00000585291	CCND1	P24385	295 aa		12.99	□□□□□ -0.33
NFE2L1-222	ENST00000585291	PSEN1	P49768	467 aa		12.99	□□□□□ -0.33
NFE2L1-222	ENST00000585291	COPA	P53621	1224 aa		12.99	□□□□□ -0.33
NFE2L1-222	ENST00000585291	NCALD	P61601	193 aa		12.99	□□□□□ -0.33
NFE2L1-222	ENST00000585291	EML3	Q32P44	896 aa		12.99	□□□□□ -0.33
NFE2L1-222	ENST00000585291	PIWIL2	Q8TC59	973 aa	Known RBP	12.99	□□□□□ -0.33
NFE2L1-222	ENST00000585291	KCTD4	Q8WVF5	259 aa		12.99	□□□□□ -0.33
NFE2L1-222	ENST00000585291	OMD	Q99983	421 aa		12.99	□□□□□ -0.33
NFE2L1-222	ENST00000585291	VCX	Q9H320	206 aa		12.99	□□□□□ -0.33
NFE2L1-222	ENST00000585291	TMEM161A	Q9NX61	479 aa		12.99	□□□□□ -0.33
NFE2L1-222	ENST00000585291	KIAA0100	Q14667	2235 aa	Known RBP	12.99	□□□□□ -0.33
NFE2L1-222	ENST00000585291	C2	P06681	752 aa		12.99	□□□□□ -0.33
NFE2L1-222	ENST00000585291	GLUD2	P49448	558 aa		12.99	□□□□□ -0.33
NFE2L1-222	ENST00000585291	GATM	P50440	423 aa		12.99	□□□□□ -0.33
NFE2L1-222	ENST00000585291	CSE1L	P55060	971 aa	Known RBP	12.99	□□□□□ -0.33
NFE2L1-222	ENST00000585291	RAD51	Q06609	339 aa		12.99	□□□□□ -0.33
NFE2L1-222	ENST00000585291	LRRC36	Q1X8D7	754 aa		12.99	□□□□□ -0.33
NFE2L1-222	ENST00000585291	SEL1L3	Q68CR1	1132 aa		12.99	□□□□□ -0.33
NFE2L1-222	ENST00000585291	C10orf107	Q8IVU9	208 aa		12.99	□□□□□ -0.33
NFE2L1-222	ENST00000585291	FBXO5	Q9UKT4	447 aa		12.99	□□□□□ -0.33
NFE2L1-222	ENST00000585291	SLC8A2	Q9UPR5	921 aa		12.99	□□□□□ -0.33
NFE2L1-222	ENST00000585291	NCF1B	A6NI72	391 aa	Predicted RBP	12.99	□□□□□ -0.33
NFE2L1-222	ENST00000585291	NCF1C	A8MVU1	366 aa	Predicted RBP	12.99	□□□□□ -0.33
NFE2L1-222	ENST00000585291	KCNU1	A8MYU2	1149 aa		12.99	□□□□□ -0.33
NFE2L1-222	ENST00000585291		F8W810	466 aa		12.99	□□□□□ -0.33
NFE2L1-222	ENST00000585291	CCL22	O00626	93 aa		12.99	□□□□□ -0.33
NFE2L1-222	ENST00000585291	PDHA1	P08559	390 aa		12.99	□□□□□ -0.33
NFE2L1-222	ENST00000585291	SPATA31D3	P0C874	917 aa		12.99	□□□□□ -0.33
NFE2L1-222	ENST00000585291	MYL4	P12829	197 aa		12.99	□□□□□ -0.33
NFE2L1-222	ENST00000585291	NCF1	P14598	390 aa	Predicted RBP	12.99	□□□□□ -0.33
NFE2L1-222	ENST00000585291	SPATA31D4	Q6ZUB0	917 aa		12.99	□□□□□ -0.33
NFE2L1-222	ENST00000585291	BTN2A3P	Q96KV6	586 aa		12.99	□□□□□ -0.33
NFE2L1-222	ENST00000585291	HACD3	Q9P035	362 aa		12.99	□□□□□ -0.33
NFE2L1-222	ENST00000585291	PKP3	Q9Y446	797 aa		12.99	□□□□□ -0.33
NFE2L1-222	ENST00000585291	TLL2	Q9Y6L7	1015 aa		12.99	□□□□□ -0.33
NFE2L1-222	ENST00000585291	ZNF623	O75123	536 aa		12.98	□□□□□ -0.33
NFE2L1-222	ENST00000585291	BPGM	P07738	259 aa		12.98	□□□□□ -0.33
NFE2L1-222	ENST00000585291	FAM163B	P0C2L3	166 aa		12.98	□□□□□ -0.33
NFE2L1-222	ENST00000585291	NMBR	P28336	390 aa		12.98	□□□□□ -0.33
NFE2L1-222	ENST00000585291	CHRNA4	P43681	627 aa		12.98	□□□□□ -0.33
NFE2L1-222	ENST00000585291	PTRHD1	Q6GMV3	140 aa	Known RBP	12.98	□□□□□ -0.33
NFE2L1-222	ENST00000585291	TRPV1	Q8NER1	839 aa		12.98	□□□□□ -0.33
NFE2L1-222	ENST00000585291	ACMSD	Q8TDX5	336 aa		12.98	□□□□□ -0.33
NFE2L1-222	ENST00000585291	SIGLEC10	Q96LC7	697 aa		12.98	□□□□□ -0.33
NFE2L1-222	ENST00000585291	RGS18	Q9NS28	235 aa		12.98	□□□□□ -0.33
NFE2L1-222	ENST00000585291	IGSF9	Q9P2J2	1179 aa		12.98	□□□□□ -0.33
NFE2L1-222	ENST00000585291	PYGL	P06737	847 aa		12.98	□□□□□ -0.33
NFE2L1-222	ENST00000585291	NNMT	P40261	264 aa		12.98	□□□□□ -0.33
NFE2L1-222	ENST00000585291	GSC	P56915	257 aa	Predicted RBP	12.98	□□□□□ -0.33
NFE2L1-222	ENST00000585291	ALYREF	Q86V81	257 aa	Known RBP	12.98	□□□□□ -0.33
NFE2L1-222	ENST00000585291	SLAIN1	Q8ND83	568 aa		12.98	□□□□□ -0.33
NFE2L1-222	ENST00000585291	KCNN1	Q92952	543 aa		12.98	□□□□□ -0.33
NFE2L1-222	ENST00000585291	PHACTR1	Q9C0D0	580 aa		12.98	□□□□□ -0.33
NFE2L1-222	ENST00000585291	LATS2	Q9NRM7	1088 aa		12.98	□□□□□ -0.33
NFE2L1-222	ENST00000585291	UTP6	Q9NYH9	597 aa	Known RBP	12.98	□□□□□ -0.33
NFE2L1-222	ENST00000585291	NCKIPSD	Q9NZQ3	722 aa		12.98	□□□□□ -0.33
NFE2L1-222	ENST00000585291	SEPT3	Q9UH03	358 aa		12.98	□□□□□ -0.33
NFE2L1-222	ENST00000585291	ZNF180	Q9UJW8	692 aa		12.98	□□□□□ -0.33
NFE2L1-222	ENST00000585291	DNAJC6	O75061	913 aa		12.98	□□□□□ -0.33
NFE2L1-222	ENST00000585291	PIGN	O95427	931 aa		12.98	□□□□□ -0.33
NFE2L1-222	ENST00000585291	TCN1	P20061	433 aa	Predicted RBP	12.98	□□□□□ -0.33
NFE2L1-222	ENST00000585291	IL4R	P24394	825 aa		12.98	□□□□□ -0.33
NFE2L1-222	ENST00000585291	CXCR3	P49682	368 aa		12.98	□□□□□ -0.33
NFE2L1-222	ENST00000585291	DLG2	Q15700	870 aa		12.98	□□□□□ -0.33
NFE2L1-222	ENST00000585291	LAYN	Q6UX15	382 aa		12.98	□□□□□ -0.33
NFE2L1-222	ENST00000585291	CDK5RAP1	Q96SZ6	601 aa	Known RBP	12.98	□□□□□ -0.33
NFE2L1-222	ENST00000585291	TMEM106C	Q9BVX2	250 aa		12.98	□□□□□ -0.33
NFE2L1-222	ENST00000585291	ACE2	Q9BYF1	805 aa	Predicted RBP	12.98	□□□□□ -0.33
NFE2L1-222	ENST00000585291	NDE1	Q9NXR1	346 aa		12.98	□□□□□ -0.33
NFE2L1-222	ENST00000585291	MEI4	A8MW99	385 aa		12.97	□□□□□ -0.33
NFE2L1-222	ENST00000585291		F8W8V4	182 aa		12.97	□□□□□ -0.33
NFE2L1-222	ENST00000585291	ARVCF	O00192	962 aa		12.97	□□□□□ -0.33
NFE2L1-222	ENST00000585291	DCX	O43602	365 aa		12.97	□□□□□ -0.33
NFE2L1-222	ENST00000585291	MGEA5	O60502	916 aa		12.97	□□□□□ -0.33
NFE2L1-222	ENST00000585291	CRTAM	O95727	393 aa		12.97	□□□□□ -0.33

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