RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000583153.2

PTPRM-214, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type M, humanhuman

TSL 3

Gene PTPRM, Length 713 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRM-214ENST00000583153 PPM1HQ9ULR3 514 aa8.51□□□□□ -1.05
PTPRM-214ENST00000583153 FZD4Q9ULV1 537 aa8.51□□□□□ -1.05
PTPRM-214ENST00000583153 HS3ST2Q9Y278 367 aa8.51□□□□□ -1.05
PTPRM-214ENST00000583153 PCDHB9Q9Y5E1 797 aa8.51□□□□□ -1.05
PTPRM-214ENST00000583153 ACACBO00763 2458 aa8.51□□□□□ -1.05
PTPRM-214ENST00000583153 PLK4O00444 970 aa8.5□□□□□ -1.05
PTPRM-214ENST00000583153 KCNK3O14649 394 aa8.5□□□□□ -1.05
PTPRM-214ENST00000583153 ALOX15BO15296 676 aa8.5□□□□□ -1.05
PTPRM-214ENST00000583153 DAPK3O43293 454 aa8.5□□□□□ -1.05
PTPRM-214ENST00000583153 SMAD6O43541 496 aaKnown RBP8.5□□□□□ -1.05
PTPRM-214ENST00000583153 RAMP2O60895 175 aa8.5□□□□□ -1.05
PTPRM-214ENST00000583153 RTN2O75298 545 aa8.5□□□□□ -1.05
PTPRM-214ENST00000583153 CER1O95813 267 aa8.5□□□□□ -1.05
PTPRM-214ENST00000583153 PRNPP04156 253 aa8.5□□□□□ -1.05
PTPRM-214ENST00000583153 GZMAP12544 262 aa8.5□□□□□ -1.05
PTPRM-214ENST00000583153 MAT2AP31153 395 aaKnown RBP8.5□□□□□ -1.05
PTPRM-214ENST00000583153 L1CAMP32004 1257 aa8.5□□□□□ -1.05
PTPRM-214ENST00000583153 ACVRL1P37023 503 aa8.5□□□□□ -1.05
PTPRM-214ENST00000583153 MAPKAPK2P49137 400 aa8.5□□□□□ -1.05
PTPRM-214ENST00000583153 RACK1P63244 317 aaKnown RBP8.5□□□□□ -1.05
PTPRM-214ENST00000583153 NRG1Q02297 640 aaPredicted RBP8.5□□□□□ -1.05
PTPRM-214ENST00000583153 ZNF252P-AS1Q0IIN9 211 aa8.5□□□□□ -1.05
PTPRM-214ENST00000583153 MAMLD1Q13495 774 aa8.5□□□□□ -1.05
PTPRM-214ENST00000583153 POLD3Q15054 466 aaPredicted RBP8.5□□□□□ -1.05
PTPRM-214ENST00000583153 KIF19Q2TAC6 998 aa8.5□□□□□ -1.05
PTPRM-214ENST00000583153 HLA-BQ31612 363 aa8.5□□□□□ -1.05
PTPRM-214ENST00000583153 ARSIQ5FYB1 569 aa8.5□□□□□ -1.05
PTPRM-214ENST00000583153 C22orf39Q6P5X5 142 aa8.5□□□□□ -1.05
PTPRM-214ENST00000583153 LEKR1Q6ZMV7 388 aa8.5□□□□□ -1.05
PTPRM-214ENST00000583153 PRPF39Q86UA1 669 aaKnown RBP8.5□□□□□ -1.05
PTPRM-214ENST00000583153 VPS36Q86VN1 386 aa8.5□□□□□ -1.05
PTPRM-214ENST00000583153 PYROXD2Q8N2H3 581 aa8.5□□□□□ -1.05
PTPRM-214ENST00000583153 GRIN3AQ8TCU5 1115 aa8.5□□□□□ -1.05
PTPRM-214ENST00000583153 SETD7Q8WTS6 366 aaKnown RBP8.5□□□□□ -1.05
PTPRM-214ENST00000583153 NTAN1Q96AB6 310 aa8.5□□□□□ -1.05
PTPRM-214ENST00000583153 ZNF653Q96CK0 615 aa8.5□□□□□ -1.05
PTPRM-214ENST00000583153 EPAS1Q99814 870 aa8.5□□□□□ -1.05
PTPRM-214ENST00000583153 ACE2Q9BYF1 805 aaPredicted RBP8.5□□□□□ -1.05
PTPRM-214ENST00000583153 MAGEH1Q9H213 219 aa8.5□□□□□ -1.05
PTPRM-214ENST00000583153 RETREG1Q9H6L5 497 aa8.5□□□□□ -1.05
PTPRM-214ENST00000583153 CATSPERBQ9H7T0 1116 aa8.5□□□□□ -1.05
PTPRM-214ENST00000583153 MRPL47Q9HD33 250 aaKnown RBP8.5□□□□□ -1.05
PTPRM-214ENST00000583153 NDFIP2Q9NV92 336 aa8.5□□□□□ -1.05
PTPRM-214ENST00000583153 DNAAF2Q9NVR5 837 aaKnown RBP8.5□□□□□ -1.05
PTPRM-214ENST00000583153 TMEM248Q9NWD8 314 aa8.5□□□□□ -1.05
PTPRM-214ENST00000583153 IL36AQ9UHA7 158 aa8.5□□□□□ -1.05
PTPRM-214ENST00000583153 PCSK1NQ9UHG2 260 aa8.5□□□□□ -1.05
PTPRM-214ENST00000583153 ADAMTS1Q9UHI8 967 aa8.5□□□□□ -1.05
PTPRM-214ENST00000583153 SARDHQ9UL12 918 aa8.5□□□□□ -1.05
PTPRM-214ENST00000583153 FZD10Q9ULW2 581 aa8.5□□□□□ -1.05
PTPRM-214ENST00000583153 FCF1Q9Y324 198 aaKnown RBP8.5□□□□□ -1.05
PTPRM-214ENST00000583153 LUC7L2Q9Y383 392 aaKnown RBP8.5□□□□□ -1.05
PTPRM-214ENST00000583153 BZW2Q9Y6E2 419 aaKnown RBP8.5□□□□□ -1.05
PTPRM-214ENST00000583153 TPRP12270 2363 aaKnown RBP8.5□□□□□ -1.05
PTPRM-214ENST00000583153 CEP295Q9C0D2 2601 aa8.5□□□□□ -1.05
PTPRM-214ENST00000583153 MAP1BP46821 2468 aaKnown RBP8.49□□□□□ -1.05
PTPRM-214ENST00000583153 FRYQ5TBA9 3013 aa8.49□□□□□ -1.05
PTPRM-214ENST00000583153 A0A1W2PPC4 97 aa8.49□□□□□ -1.05
PTPRM-214ENST00000583153 TCRBV5S1A1TA0A578 114 aa8.49□□□□□ -1.05
PTPRM-214ENST00000583153 DDX3XO00571 662 aaKnown RBP eCLIP8.49□□□□□ -1.05
PTPRM-214ENST00000583153 SLC7A4O43246 635 aa8.49□□□□□ -1.05
PTPRM-214ENST00000583153 BUB1O43683 1085 aa8.49□□□□□ -1.05
PTPRM-214ENST00000583153 SH3BP5O60239 455 aa8.49□□□□□ -1.05
PTPRM-214ENST00000583153 PRPSAP2O60256 369 aa8.49□□□□□ -1.05
PTPRM-214ENST00000583153 IGHV4-34P06331 123 aa8.49□□□□□ -1.05
PTPRM-214ENST00000583153 MYBL1P10243 752 aa8.49□□□□□ -1.05
PTPRM-214ENST00000583153 DRD3P35462 400 aa8.49□□□□□ -1.05
PTPRM-214ENST00000583153 PRKCIP41743 596 aa8.49□□□□□ -1.05
PTPRM-214ENST00000583153 GRIA4P48058 902 aa8.49□□□□□ -1.05
PTPRM-214ENST00000583153 SERPINH1P50454 418 aaKnown RBP8.49□□□□□ -1.05
PTPRM-214ENST00000583153 CCR5P51681 352 aa8.49□□□□□ -1.05
PTPRM-214ENST00000583153 METAP1P53582 386 aa8.49□□□□□ -1.05
PTPRM-214ENST00000583153 ADPRHP54922 357 aa8.49□□□□□ -1.05
PTPRM-214ENST00000583153 AIF1P55008 147 aa8.49□□□□□ -1.05
PTPRM-214ENST00000583153 GEMIN4P57678 1058 aaKnown RBP8.49□□□□□ -1.05
PTPRM-214ENST00000583153 TPI1P60174 286 aa8.49□□□□□ -1.05
PTPRM-214ENST00000583153 SIM1P81133 766 aaPredicted RBP8.49□□□□□ -1.05
PTPRM-214ENST00000583153 ARF5P84085 180 aa8.49□□□□□ -1.05
PTPRM-214ENST00000583153 ZBED6P86452 979 aa8.49□□□□□ -1.05
PTPRM-214ENST00000583153 OGDHQ02218 1023 aa8.49□□□□□ -1.05
PTPRM-214ENST00000583153 CNTN1Q12860 1018 aa8.49□□□□□ -1.05
PTPRM-214ENST00000583153 FOXC1Q12948 553 aa8.49□□□□□ -1.05
PTPRM-214ENST00000583153 SEMA3BQ13214 749 aa8.49□□□□□ -1.05
PTPRM-214ENST00000583153 SLC14A1Q13336 389 aa8.49□□□□□ -1.05
PTPRM-214ENST00000583153 STAT4Q14765 748 aa8.49□□□□□ -1.05
PTPRM-214ENST00000583153 SUZ12Q15022 739 aaKnown RBP8.49□□□□□ -1.05
PTPRM-214ENST00000583153 SLC45A4Q5BKX6 768 aa8.49□□□□□ -1.05
PTPRM-214ENST00000583153 CARD16Q5EG05 197 aa8.49□□□□□ -1.05
PTPRM-214ENST00000583153 FIGNQ5HY92 759 aa8.49□□□□□ -1.05
PTPRM-214ENST00000583153 PPP1R15BQ5SWA1 713 aa8.49□□□□□ -1.05
PTPRM-214ENST00000583153 MANEALQ5VSG8 457 aa8.49□□□□□ -1.05
PTPRM-214ENST00000583153 E4F1Q66K89 784 aaPredicted RBP8.49□□□□□ -1.05
PTPRM-214ENST00000583153 PLEKHA7Q6IQ23 1121 aa8.49□□□□□ -1.05
PTPRM-214ENST00000583153 LAYNQ6UX15 382 aa8.49□□□□□ -1.05
PTPRM-214ENST00000583153 DPY19L3Q6ZPD9 716 aa8.49□□□□□ -1.05
PTPRM-214ENST00000583153 NLRP14Q86W24 1093 aa8.49□□□□□ -1.05
PTPRM-214ENST00000583153 PCDH20Q8N6Y1 951 aaKnown RBP8.49□□□□□ -1.05
PTPRM-214ENST00000583153 CHST14Q8NCH0 376 aa8.49□□□□□ -1.05
PTPRM-214ENST00000583153 OR2A12Q8NGT7 310 aa8.49□□□□□ -1.05
PTPRM-214ENST00000583153 ARHGEF2Q92974 986 aaKnown RBP8.49□□□□□ -1.05
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 22.4 ms