RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000577468.2

PTPRM-204, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type M, humanhuman

TSL 3

Gene PTPRM, Length 701 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRM-204ENST00000577468 SLC2A7Q6PXP3 512 aa3.15□□□□□ -1.91
PTPRM-204ENST00000577468 B3GNT9Q6UX72 402 aa3.15□□□□□ -1.91
PTPRM-204ENST00000577468 KDM7AQ6ZMT4 941 aa3.15□□□□□ -1.91
PTPRM-204ENST00000577468 CATSPERGQ6ZRH7 1159 aa3.15□□□□□ -1.91
PTPRM-204ENST00000577468 HTR3DQ70Z44 454 aa3.15□□□□□ -1.91
PTPRM-204ENST00000577468 CACNA2D4Q7Z3S7 1137 aa3.15□□□□□ -1.91
PTPRM-204ENST00000577468 KRT28Q7Z3Y7 464 aa3.15□□□□□ -1.91
PTPRM-204ENST00000577468 KRT27Q7Z3Y8 459 aa3.15□□□□□ -1.91
PTPRM-204ENST00000577468 PRPF39Q86UA1 669 aaKnown RBP3.15□□□□□ -1.91
PTPRM-204ENST00000577468 MTDHQ86UE4 582 aaKnown RBP3.15□□□□□ -1.91
PTPRM-204ENST00000577468 SLC51BQ86UW2 128 aa3.15□□□□□ -1.91
PTPRM-204ENST00000577468 PTRH1Q86Y79 214 aaKnown RBP3.15□□□□□ -1.91
PTPRM-204ENST00000577468 PSTKQ8IV42 348 aaKnown RBP3.15□□□□□ -1.91
PTPRM-204ENST00000577468 CCDC50Q8IVM0 306 aa3.15□□□□□ -1.91
PTPRM-204ENST00000577468 CMTR2Q8IYT2 770 aaKnown RBP3.15□□□□□ -1.91
PTPRM-204ENST00000577468 LRRC34Q8IZ02 419 aa3.15□□□□□ -1.91
PTPRM-204ENST00000577468 HDDC3Q8N4P3 179 aa3.15□□□□□ -1.91
PTPRM-204ENST00000577468 TCP11L2Q8N4U5 519 aa3.15□□□□□ -1.91
PTPRM-204ENST00000577468 DPP10Q8N608 796 aa3.15□□□□□ -1.91
PTPRM-204ENST00000577468 KCTD6Q8NC69 237 aa3.15□□□□□ -1.91
PTPRM-204ENST00000577468 PIK3C3Q8NEB9 887 aa3.15□□□□□ -1.91
PTPRM-204ENST00000577468 KLHDC4Q8TBB5 520 aa3.15□□□□□ -1.91
PTPRM-204ENST00000577468 SLC35G2Q8TBE7 412 aa3.15□□□□□ -1.91
PTPRM-204ENST00000577468 PROKR1Q8TCW9 393 aa3.15□□□□□ -1.91
PTPRM-204ENST00000577468 SCFD2Q8WU76 684 aa3.15□□□□□ -1.91
PTPRM-204ENST00000577468 OSCP1Q8WVF1 389 aa3.15□□□□□ -1.91
PTPRM-204ENST00000577468 MAIP1Q8WWC4 291 aa3.15□□□□□ -1.91
PTPRM-204ENST00000577468 IRGQQ8WZA9 623 aa3.15□□□□□ -1.91
PTPRM-204ENST00000577468 RFKQ969G6 155 aa3.15□□□□□ -1.91
PTPRM-204ENST00000577468 SPDL1Q96EA4 605 aa3.15□□□□□ -1.91
PTPRM-204ENST00000577468 MED30Q96HR3 178 aa3.15□□□□□ -1.91
PTPRM-204ENST00000577468 ABHD8Q96I13 439 aa3.15□□□□□ -1.91
PTPRM-204ENST00000577468 VCPIP1Q96JH7 1222 aa3.15□□□□□ -1.91
PTPRM-204ENST00000577468 PGBD1Q96JS3 809 aa3.15□□□□□ -1.91
PTPRM-204ENST00000577468 EXOC2Q96KP1 924 aa3.15□□□□□ -1.91
PTPRM-204ENST00000577468 CLUHP3Q96NS8 147 aa3.15□□□□□ -1.91
PTPRM-204ENST00000577468 CAMK1GQ96NX5 476 aa3.15□□□□□ -1.91
PTPRM-204ENST00000577468 FAM111AQ96PZ2 611 aa3.15□□□□□ -1.91
PTPRM-204ENST00000577468 MLST8Q9BVC4 326 aa3.15□□□□□ -1.91
PTPRM-204ENST00000577468 NUP85Q9BW27 656 aa3.15□□□□□ -1.91
PTPRM-204ENST00000577468 CDK19Q9BWU1 502 aa3.15□□□□□ -1.91
PTPRM-204ENST00000577468 AMNQ9BXJ7 453 aa3.15□□□□□ -1.91
PTPRM-204ENST00000577468 UNKQ9C0B0 810 aaKnown RBP3.15□□□□□ -1.91
PTPRM-204ENST00000577468 PITHD1Q9GZP4 211 aaPredicted RBP3.15□□□□□ -1.91
PTPRM-204ENST00000577468 SENP6Q9GZR1 1112 aaPredicted RBP3.15□□□□□ -1.91
PTPRM-204ENST00000577468 REXO4Q9GZR2 422 aaKnown RBP3.15□□□□□ -1.91
PTPRM-204ENST00000577468 SLC6A15Q9H2J7 730 aa3.15□□□□□ -1.91
PTPRM-204ENST00000577468 TASP1Q9H6P5 420 aa3.15□□□□□ -1.91
PTPRM-204ENST00000577468 SYNPO2LQ9H987 977 aa3.15□□□□□ -1.91
PTPRM-204ENST00000577468 COPS7BQ9H9Q2 264 aaPredicted RBP3.15□□□□□ -1.91
PTPRM-204ENST00000577468 C17orf75Q9HAS0 396 aa3.15□□□□□ -1.91
PTPRM-204ENST00000577468 SPACA1Q9HBV2 294 aa3.15□□□□□ -1.91
PTPRM-204ENST00000577468 TUFT1Q9NNX1 390 aa3.15□□□□□ -1.91
PTPRM-204ENST00000577468 MID1IP1Q9NPA3 183 aa3.15□□□□□ -1.91
PTPRM-204ENST00000577468 C12orf4Q9NQ89 552 aa3.15□□□□□ -1.91
PTPRM-204ENST00000577468 ST6GALNAC1Q9NSC7 600 aaPredicted RBP3.15□□□□□ -1.91
PTPRM-204ENST00000577468 SLC35D1Q9NTN3 355 aa3.15□□□□□ -1.91
PTPRM-204ENST00000577468 NUDT15Q9NV35 164 aa3.15□□□□□ -1.91
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PTPRM-204ENST00000577468 GRHPRQ9UBQ7 328 aa3.15□□□□□ -1.91
PTPRM-204ENST00000577468 CYTH4Q9UIA0 394 aa3.15□□□□□ -1.91
PTPRM-204ENST00000577468 SLC39A10Q9ULF5 831 aa3.15□□□□□ -1.91
PTPRM-204ENST00000577468 TMCO1Q9UM00 188 aa3.15□□□□□ -1.91
PTPRM-204ENST00000577468 MAGED2Q9UNF1 606 aaPredicted RBP3.15□□□□□ -1.91
PTPRM-204ENST00000577468 GAB2Q9UQC2 676 aa3.15□□□□□ -1.91
PTPRM-204ENST00000577468 APOBEC2Q9Y235 224 aaKnown RBP3.15□□□□□ -1.91
PTPRM-204ENST00000577468 PIN4Q9Y237 131 aaKnown RBP3.15□□□□□ -1.91
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PTPRM-204ENST00000577468 RUVBL1Q9Y265 456 aaKnown RBP3.15□□□□□ -1.91
PTPRM-204ENST00000577468 TNFSF13BQ9Y275 285 aa3.15□□□□□ -1.91
PTPRM-204ENST00000577468 SIK3Q9Y2K2 1263 aa3.15□□□□□ -1.91
PTPRM-204ENST00000577468 PCDHGA2Q9Y5H1 932 aa3.15□□□□□ -1.91
PTPRM-204ENST00000577468 ATXN2Q99700 1313 aaKnown RBP3.15□□□□□ -1.91
PTPRM-204ENST00000577468 COL4A3Q01955 1670 aa3.14□□□□□ -1.91
PTPRM-204ENST00000577468 GOLGA8QA0A0J9YX86 632 aa3.14□□□□□ -1.91
PTPRM-204ENST00000577468 PTPDC1A2A3K4 754 aa3.14□□□□□ -1.91
PTPRM-204ENST00000577468 GOLGA8OA6NCC3 632 aa3.14□□□□□ -1.91
PTPRM-204ENST00000577468 KIF28PB7ZC32 967 aa3.14□□□□□ -1.91
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PTPRM-204ENST00000577468 GOLGA8NF8WBI6 632 aa3.14□□□□□ -1.91
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PTPRM-204ENST00000577468 TAF4O00268 1085 aa3.14□□□□□ -1.91
PTPRM-204ENST00000577468 UBE2CO00762 179 aa3.14□□□□□ -1.91
PTPRM-204ENST00000577468 NEMP1O14524 444 aa3.14□□□□□ -1.91
PTPRM-204ENST00000577468 WNT9AO14904 365 aa3.14□□□□□ -1.91
PTPRM-204ENST00000577468 KIAA0355O15063 1070 aa3.14□□□□□ -1.91
PTPRM-204ENST00000577468 KMOO15229 486 aa3.14□□□□□ -1.91
PTPRM-204ENST00000577468 TP73O15350 636 aa3.14□□□□□ -1.91
PTPRM-204ENST00000577468 HNRNPRO43390 633 aaKnown RBP3.14□□□□□ -1.91
PTPRM-204ENST00000577468 AP1G1O43747 822 aa3.14□□□□□ -1.91
PTPRM-204ENST00000577468 ERAL1O75616 437 aaKnown RBP3.14□□□□□ -1.91
PTPRM-204ENST00000577468 DNAJC8O75937 253 aaPredicted RBP3.14□□□□□ -1.91
PTPRM-204ENST00000577468 RECQL4O94761 1208 aa3.14□□□□□ -1.91
PTPRM-204ENST00000577468 PRKD3O94806 890 aa3.14□□□□□ -1.91
PTPRM-204ENST00000577468 TOMM70O94826 608 aa3.14□□□□□ -1.91
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