RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000563200.5

PPP4C-205, Transcript of protein phosphatase 4 catalytic subunit, human

TSL 5

Gene PPP4C, Length 1,447 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
PPP4C-205	ENST00000563200	TBC1D31	Q96DN5	1066 aa		22.24	■■□□□ 1.15
PPP4C-205	ENST00000563200	EDEM3	Q9BZQ6	932 aa		22.24	■■□□□ 1.15
PPP4C-205	ENST00000563200	CEP44	Q9C0F1	390 aa		22.24	■■□□□ 1.15
PPP4C-205	ENST00000563200	TBC1D3D	A0A087WVF3	549 aa		22.23	■■□□□ 1.15
PPP4C-205	ENST00000563200	TBC1D3I	A0A087WXS9	549 aa		22.23	■■□□□ 1.15
PPP4C-205	ENST00000563200	TBC1D3E	A0A087X179	549 aa		22.23	■■□□□ 1.15
PPP4C-205	ENST00000563200	TBC1D3K	A0A087X1G2	549 aa		22.23	■■□□□ 1.15
PPP4C-205	ENST00000563200		A0A1W2PR77	199 aa		22.23	■■□□□ 1.15
PPP4C-205	ENST00000563200	TBC1D3F	A6NER0	549 aa	Predicted RBP	22.23	■■□□□ 1.15
PPP4C-205	ENST00000563200	TBC1D3L	B9A6J9	549 aa		22.23	■■□□□ 1.15
PPP4C-205	ENST00000563200	TBC1D3H	P0C7X1	549 aa		22.23	■■□□□ 1.15
PPP4C-205	ENST00000563200	MAMLD1	Q13495	774 aa		22.23	■■□□□ 1.15
PPP4C-205	ENST00000563200	ASIC2	Q16515	512 aa		22.23	■■□□□ 1.15
PPP4C-205	ENST00000563200	ZNF423	Q2M1K9	1284 aa		22.23	■■□□□ 1.15
PPP4C-205	ENST00000563200	FIGN	Q5HY92	759 aa		22.23	■■□□□ 1.15
PPP4C-205	ENST00000563200	PIP5KL1	Q5T9C9	394 aa		22.23	■■□□□ 1.15
PPP4C-205	ENST00000563200	TBC1D3G	Q6DHY5	549 aa		22.23	■■□□□ 1.15
PPP4C-205	ENST00000563200	TBC1D3C	Q6IPX1	549 aa		22.23	■■□□□ 1.15
PPP4C-205	ENST00000563200	PLEKHA7	Q6IQ23	1121 aa		22.23	■■□□□ 1.15
PPP4C-205	ENST00000563200	DPY19L3	Q6ZPD9	716 aa		22.23	■■□□□ 1.15
PPP4C-205	ENST00000563200	LUZP1	Q86V48	1076 aa		22.23	■■□□□ 1.15
PPP4C-205	ENST00000563200	TBC1D3	Q8IZP1	549 aa	Predicted RBP	22.23	■■□□□ 1.15
PPP4C-205	ENST00000563200	PYROXD2	Q8N2H3	581 aa		22.23	■■□□□ 1.15
PPP4C-205	ENST00000563200	ARHGEF2	Q92974	986 aa	Known RBP	22.23	■■□□□ 1.15
PPP4C-205	ENST00000563200	CCDC114	Q96M63	670 aa		22.23	■■□□□ 1.15
PPP4C-205	ENST00000563200	TNKS2	Q9H2K2	1166 aa		22.23	■■□□□ 1.15
PPP4C-205	ENST00000563200	DNAI1	Q9UI46	699 aa		22.23	■■□□□ 1.15
PPP4C-205	ENST00000563200	PCOLCE2	Q9UKZ9	415 aa		22.23	■■□□□ 1.15
PPP4C-205	ENST00000563200	FARP1	Q9Y4F1	1045 aa	Predicted RBP	22.23	■■□□□ 1.15
PPP4C-205	ENST00000563200	ANKRD62	A6NC57	917 aa		22.23	■■□□□ 1.15
PPP4C-205	ENST00000563200	TOP3B	O95985	862 aa	Known RBP	22.23	■■□□□ 1.15
PPP4C-205	ENST00000563200	SERPINC1	P01008	464 aa		22.23	■■□□□ 1.15
PPP4C-205	ENST00000563200	ETFB	P38117	255 aa		22.23	■■□□□ 1.15
PPP4C-205	ENST00000563200	PBX1	P40424	430 aa		22.23	■■□□□ 1.15
PPP4C-205	ENST00000563200	FOXC1	Q12948	553 aa		22.23	■■□□□ 1.15
PPP4C-205	ENST00000563200	TRIP6	Q15654	476 aa	Known RBP	22.23	■■□□□ 1.15
PPP4C-205	ENST00000563200	SFMBT2	Q5VUG0	894 aa		22.23	■■□□□ 1.15
PPP4C-205	ENST00000563200	DCUN1D2	Q6PH85	259 aa		22.23	■■□□□ 1.15
PPP4C-205	ENST00000563200	TRIM69	Q86WT6	500 aa		22.23	■■□□□ 1.15
PPP4C-205	ENST00000563200	BAHD1	Q8TBE0	780 aa	Predicted RBP	22.23	■■□□□ 1.15
PPP4C-205	ENST00000563200	ARRDC3	Q96B67	414 aa		22.23	■■□□□ 1.15
PPP4C-205	ENST00000563200	MAGEH1	Q9H213	219 aa		22.23	■■□□□ 1.15
PPP4C-205	ENST00000563200	FZD10	Q9ULW2	581 aa		22.23	■■□□□ 1.15
PPP4C-205	ENST00000563200	ACTL7A	Q9Y615	435 aa		22.23	■■□□□ 1.15
PPP4C-205	ENST00000563200	WASF2	Q9Y6W5	498 aa		22.23	■■□□□ 1.15
PPP4C-205	ENST00000563200	FREM2	Q5SZK8	3169 aa		22.22	■■□□□ 1.15
PPP4C-205	ENST00000563200	TMCO5B	A8MYB1	307 aa		22.22	■■□□□ 1.15
PPP4C-205	ENST00000563200	KCNK3	O14649	394 aa		22.22	■■□□□ 1.15
PPP4C-205	ENST00000563200	PRNP	P04156	253 aa		22.22	■■□□□ 1.15
PPP4C-205	ENST00000563200	GZMA	P12544	262 aa		22.22	■■□□□ 1.15
PPP4C-205	ENST00000563200	AIF1	P55008	147 aa		22.22	■■□□□ 1.15
PPP4C-205	ENST00000563200	PCDH20	Q8N6Y1	951 aa	Known RBP	22.22	■■□□□ 1.15
PPP4C-205	ENST00000563200	NOL6	Q9H6R4	1146 aa	Known RBP	22.22	■■□□□ 1.15
PPP4C-205	ENST00000563200	PARVA	Q9NVD7	372 aa		22.22	■■□□□ 1.15
PPP4C-205	ENST00000563200	IL36A	Q9UHA7	158 aa		22.22	■■□□□ 1.15
PPP4C-205	ENST00000563200	ZZEF1	O43149	2961 aa		22.21	■■□□□ 1.15
PPP4C-205	ENST00000563200		H0Y8X5	98 aa		22.21	■■□□□ 1.15
PPP4C-205	ENST00000563200	KPNA3	O00505	521 aa	Predicted RBP	22.21	■■□□□ 1.15
PPP4C-205	ENST00000563200	DDX3X	O00571	662 aa	Known RBP eCLIP	22.21	■■□□□ 1.15	1e-8	■■■□□ 16.5
PPP4C-205	ENST00000563200	CD38	P28907	300 aa		22.21	■■□□□ 1.15
PPP4C-205	ENST00000563200	FANCC	Q00597	558 aa		22.21	■■□□□ 1.15
PPP4C-205	ENST00000563200	ARSI	Q5FYB1	569 aa		22.21	■■□□□ 1.15
PPP4C-205	ENST00000563200	EFHC2	Q5JST6	749 aa		22.21	■■□□□ 1.15
PPP4C-205	ENST00000563200	SCYL2	Q6P3W7	929 aa		22.21	■■□□□ 1.15
PPP4C-205	ENST00000563200	TMC6	Q7Z403	805 aa		22.21	■■□□□ 1.15
PPP4C-205	ENST00000563200	ADAT2	Q7Z6V5	191 aa	Known RBP	22.21	■■□□□ 1.15
PPP4C-205	ENST00000563200	GLRX5	Q86SX6	157 aa		22.21	■■□□□ 1.15
PPP4C-205	ENST00000563200	DNAAF5	Q86Y56	855 aa		22.21	■■□□□ 1.15
PPP4C-205	ENST00000563200	PLPP6	Q8IY26	295 aa		22.21	■■□□□ 1.15
PPP4C-205	ENST00000563200	RTL3	Q8N8U3	475 aa	Known RBP	22.21	■■□□□ 1.15
PPP4C-205	ENST00000563200	VOPP1	Q96AW1	172 aa		22.21	■■□□□ 1.15
PPP4C-205	ENST00000563200	ISG20	Q96AZ6	181 aa	Known RBP	22.21	■■□□□ 1.15
PPP4C-205	ENST00000563200	SERAC1	Q96JX3	654 aa		22.21	■■□□□ 1.15
PPP4C-205	ENST00000563200	HDAC8	Q9BY41	377 aa		22.21	■■□□□ 1.15
PPP4C-205	ENST00000563200	FCF1	Q9Y324	198 aa	Known RBP	22.21	■■□□□ 1.15
PPP4C-205	ENST00000563200	ATMIN	O43313	823 aa	Predicted RBP	22.2	■■□□□ 1.14
PPP4C-205	ENST00000563200	PCDHGA12	O60330	932 aa		22.2	■■□□□ 1.14
PPP4C-205	ENST00000563200	RAMP2	O60895	175 aa		22.2	■■□□□ 1.14
PPP4C-205	ENST00000563200	NUDT1	P36639	197 aa		22.2	■■□□□ 1.14
PPP4C-205	ENST00000563200	CARD16	Q5EG05	197 aa		22.2	■■□□□ 1.14
PPP4C-205	ENST00000563200	NAPEPLD	Q6IQ20	393 aa		22.2	■■□□□ 1.14
PPP4C-205	ENST00000563200	ARFGAP1	Q8N6T3	406 aa		22.2	■■□□□ 1.14
PPP4C-205	ENST00000563200	GRIN3A	Q8TCU5	1115 aa		22.2	■■□□□ 1.14
PPP4C-205	ENST00000563200	PREB	Q9HCU5	417 aa		22.2	■■□□□ 1.14
PPP4C-205	ENST00000563200	AASDHPPT	Q9NRN7	309 aa		22.2	■■□□□ 1.14
PPP4C-205	ENST00000563200	TMEM191C	A6NGB0	347 aa		22.19	■■□□□ 1.14
PPP4C-205	ENST00000563200	FLRT2	O43155	660 aa		22.19	■■□□□ 1.14
PPP4C-205	ENST00000563200	LEFTY1	O75610	366 aa		22.19	■■□□□ 1.14
PPP4C-205	ENST00000563200	FTL	P02792	175 aa	Predicted RBP	22.19	■■□□□ 1.14
PPP4C-205	ENST00000563200	SPINK2	P20155	84 aa		22.19	■■□□□ 1.14
PPP4C-205	ENST00000563200	EPHB2	P29323	1055 aa		22.19	■■□□□ 1.14
PPP4C-205	ENST00000563200	RECQL	P46063	649 aa	Predicted RBP	22.19	■■□□□ 1.14
PPP4C-205	ENST00000563200	C21orf59	P57076	290 aa		22.19	■■□□□ 1.14
PPP4C-205	ENST00000563200	KLHL30	Q0D2K2	578 aa		22.19	■■□□□ 1.14
PPP4C-205	ENST00000563200	POLD3	Q15054	466 aa	Predicted RBP	22.19	■■□□□ 1.14
PPP4C-205	ENST00000563200	NEK5	Q6P3R8	708 aa		22.19	■■□□□ 1.14
PPP4C-205	ENST00000563200	ERN2	Q76MJ5	926 aa	Known RBP	22.19	■■□□□ 1.14
PPP4C-205	ENST00000563200	PRPF39	Q86UA1	669 aa	Known RBP	22.19	■■□□□ 1.14
PPP4C-205	ENST00000563200	DMTF1	Q9Y222	760 aa		22.19	■■□□□ 1.14
PPP4C-205	ENST00000563200	BTBD3	Q9Y2F9	522 aa		22.19	■■□□□ 1.14

Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 35.2 ms