RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000562011.1

CTU2-203, Transcript of cytosolic thiouridylase subunit 2, humanhuman

TSL 2

Gene CTU2, Length 324 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTU2-203ENST00000562011 RAB6CQ9H0N0 254 aa14.63□□□□□ -0.07
CTU2-203ENST00000562011 SYNCQ9H7C4 482 aa14.63□□□□□ -0.07
CTU2-203ENST00000562011 KLHL11Q9NVR0 708 aa14.63□□□□□ -0.07
CTU2-203ENST00000562011 FASTKD2Q9NYY8 710 aaKnown RBP eCLIP14.63□□□□□ -0.07
CTU2-203ENST00000562011 U3KQA8 63 aa14.63□□□□□ -0.07
CTU2-203ENST00000562011 COL27A1Q8IZC6 1860 aaPredicted RBP14.63□□□□□ -0.07
CTU2-203ENST00000562011 MGAQ8IWI9 3026 aa14.62□□□□□ -0.07
CTU2-203ENST00000562011 RAD51BO15315 384 aa14.62□□□□□ -0.07
CTU2-203ENST00000562011 LEFTY1O75610 366 aa14.62□□□□□ -0.07
CTU2-203ENST00000562011 PIAS2O75928 621 aa14.62□□□□□ -0.07
CTU2-203ENST00000562011 NEBLO76041 1014 aa14.62□□□□□ -0.07
CTU2-203ENST00000562011 FGFR1OPO95684 399 aaKnown RBP14.62□□□□□ -0.07
CTU2-203ENST00000562011 DAB2P98082 770 aa14.62□□□□□ -0.07
CTU2-203ENST00000562011 DEUP1Q05D60 604 aa14.62□□□□□ -0.07
CTU2-203ENST00000562011 TMEM259Q4ZIN3 620 aa14.62□□□□□ -0.07
CTU2-203ENST00000562011 ERN2Q76MJ5 926 aaKnown RBP14.62□□□□□ -0.07
CTU2-203ENST00000562011 ERICH1Q86X53 443 aa14.62□□□□□ -0.07
CTU2-203ENST00000562011 FGF11Q92914 225 aa14.62□□□□□ -0.07
CTU2-203ENST00000562011 BMFQ96LC9 184 aa14.62□□□□□ -0.07
CTU2-203ENST00000562011 C2orf49Q9BVC5 232 aaPredicted RBP14.62□□□□□ -0.07
CTU2-203ENST00000562011 ZNF212Q9UDV6 495 aa14.62□□□□□ -0.07
CTU2-203ENST00000562011 WASF2Q9Y6W5 498 aa14.62□□□□□ -0.07
CTU2-203ENST00000562011 POM121BA6NF01 834 aa14.61□□□□□ -0.07
CTU2-203ENST00000562011 RRP8O43159 456 aaKnown RBP14.61□□□□□ -0.07
CTU2-203ENST00000562011 OPA1O60313 960 aa14.61□□□□□ -0.07
CTU2-203ENST00000562011 SRGAP2O75044 1071 aa14.61□□□□□ -0.07
CTU2-203ENST00000562011 ZMPSTE24O75844 475 aa14.61□□□□□ -0.07
CTU2-203ENST00000562011 HNRNPA2B1P22626 353 aaKnown RBP14.61□□□□□ -0.07
CTU2-203ENST00000562011 AKT2P31751 481 aa14.61□□□□□ -0.07
CTU2-203ENST00000562011 FLT3P36888 993 aa14.61□□□□□ -0.07
CTU2-203ENST00000562011 MTIF2P46199 727 aaKnown RBP14.61□□□□□ -0.07
CTU2-203ENST00000562011 MAPK8IP2Q13387 824 aaPredicted RBP14.61□□□□□ -0.07
CTU2-203ENST00000562011 HSP90AA4PQ58FG1 418 aa14.61□□□□□ -0.07
CTU2-203ENST00000562011 BRMS1LQ5PSV4 323 aa14.61□□□□□ -0.07
CTU2-203ENST00000562011 TPRG1LQ5T0D9 272 aa14.61□□□□□ -0.07
CTU2-203ENST00000562011 TAF3Q5VWG9 929 aa14.61□□□□□ -0.07
CTU2-203ENST00000562011 NEK5Q6P3R8 708 aa14.61□□□□□ -0.07
CTU2-203ENST00000562011 Q6ZSR6 202 aa14.61□□□□□ -0.07
CTU2-203ENST00000562011 ABI3BPQ7Z7G0 1075 aa14.61□□□□□ -0.07
CTU2-203ENST00000562011 SETD3Q86TU7 594 aaPredicted RBP14.61□□□□□ -0.07
CTU2-203ENST00000562011 XYLT1Q86Y38 959 aa14.61□□□□□ -0.07
CTU2-203ENST00000562011 FAM71AQ8IYT1 594 aa14.61□□□□□ -0.07
CTU2-203ENST00000562011 DCAF4L2Q8NA75 395 aa14.61□□□□□ -0.07
CTU2-203ENST00000562011 SLC39A7Q92504 469 aa14.61□□□□□ -0.07
CTU2-203ENST00000562011 NAF1Q96HR8 494 aaKnown RBP14.61□□□□□ -0.07
CTU2-203ENST00000562011 FAM81BQ96LP2 452 aa14.61□□□□□ -0.07
CTU2-203ENST00000562011 APOLD1Q96LR9 279 aa14.61□□□□□ -0.07
CTU2-203ENST00000562011 SPON2Q9BUD6 331 aa14.61□□□□□ -0.07
CTU2-203ENST00000562011 OSBPL2Q9H1P3 480 aa14.61□□□□□ -0.07
CTU2-203ENST00000562011 KIAA1468Q9P260 1216 aa14.61□□□□□ -0.07
CTU2-203ENST00000562011 IL36AQ9UHA7 158 aa14.61□□□□□ -0.07
CTU2-203ENST00000562011 FARP1Q9Y4F1 1045 aaPredicted RBP14.61□□□□□ -0.07
CTU2-203ENST00000562011 IGLV3-10A0A075B6K4 115 aa14.6□□□□□ -0.07
CTU2-203ENST00000562011 GTPBP10A4D1E9 387 aaKnown RBP14.6□□□□□ -0.07
CTU2-203ENST00000562011 GOLGA8SH3BPF8 625 aa14.6□□□□□ -0.07
CTU2-203ENST00000562011 ATXN7O15265 892 aaPredicted RBP14.6□□□□□ -0.07
CTU2-203ENST00000562011 CD160O95971 181 aa14.6□□□□□ -0.07
CTU2-203ENST00000562011 PRNPP04156 253 aa14.6□□□□□ -0.07
CTU2-203ENST00000562011 MPOP05164 745 aa14.6□□□□□ -0.07
CTU2-203ENST00000562011 OR1E1P30953 314 aa14.6□□□□□ -0.07
CTU2-203ENST00000562011 GKP32189 559 aa14.6□□□□□ -0.07
CTU2-203ENST00000562011 GABRB2P47870 512 aa14.6□□□□□ -0.07
CTU2-203ENST00000562011 E2F1Q01094 437 aa14.6□□□□□ -0.07
CTU2-203ENST00000562011 TLE3Q04726 772 aa14.6□□□□□ -0.07
CTU2-203ENST00000562011 BECN1Q14457 450 aa14.6□□□□□ -0.07
CTU2-203ENST00000562011 TBC1D25Q3MII6 688 aa14.6□□□□□ -0.07
CTU2-203ENST00000562011 FAM102AQ5T9C2 384 aaPredicted RBP14.6□□□□□ -0.07
CTU2-203ENST00000562011 CDCP2Q5VXM1 449 aa14.6□□□□□ -0.07
CTU2-203ENST00000562011 PCSK4Q6UW60 755 aa14.6□□□□□ -0.07
CTU2-203ENST00000562011 PTAR1Q7Z6K3 402 aaPredicted RBP14.6□□□□□ -0.07
CTU2-203ENST00000562011 SPACA3Q8IXA5 215 aa14.6□□□□□ -0.07
CTU2-203ENST00000562011 CACTIN-AS1Q8N1I8 211 aa14.6□□□□□ -0.07
CTU2-203ENST00000562011 PGAP3Q96FM1 320 aaPredicted RBP14.6□□□□□ -0.07
CTU2-203ENST00000562011 CCDC114Q96M63 670 aa14.6□□□□□ -0.07
CTU2-203ENST00000562011 CFAP57Q96MR6 1250 aa14.6□□□□□ -0.07
CTU2-203ENST00000562011 HDAC8Q9BY41 377 aa14.6□□□□□ -0.07
CTU2-203ENST00000562011 MAGEB5Q9BZ81 275 aa14.6□□□□□ -0.07
CTU2-203ENST00000562011 DYRK4Q9NR20 520 aa14.6□□□□□ -0.07
CTU2-203ENST00000562011 DNAJC28Q9NX36 388 aa14.6□□□□□ -0.07
CTU2-203ENST00000562011 KLF15Q9UIH9 416 aa14.6□□□□□ -0.07
CTU2-203ENST00000562011 GGT7Q9UJ14 662 aa14.6□□□□□ -0.07
CTU2-203ENST00000562011 FCF1Q9Y324 198 aaKnown RBP14.6□□□□□ -0.07
CTU2-203ENST00000562011 ATMQ13315 3056 aa14.6□□□□□ -0.07
CTU2-203ENST00000562011 CASC3O15234 703 aaKnown RBP14.59□□□□□ -0.07
CTU2-203ENST00000562011 PAK4O96013 591 aaPredicted RBP14.59□□□□□ -0.07
CTU2-203ENST00000562011 CKMT1AP12532 417 aa14.59□□□□□ -0.07
CTU2-203ENST00000562011 CDH5P33151 784 aaPredicted RBP14.59□□□□□ -0.07
CTU2-203ENST00000562011 ACTN2P35609 894 aa14.59□□□□□ -0.07
CTU2-203ENST00000562011 DNA2P51530 1060 aa14.59□□□□□ -0.07
CTU2-203ENST00000562011 ARF5P84085 180 aa14.59□□□□□ -0.07
CTU2-203ENST00000562011 MTA1Q13330 715 aa14.59□□□□□ -0.07
CTU2-203ENST00000562011 FZD2Q14332 565 aa14.59□□□□□ -0.07
CTU2-203ENST00000562011 DRAP1Q14919 205 aaPredicted RBP14.59□□□□□ -0.07
CTU2-203ENST00000562011 SLC25A52Q3SY17 297 aa14.59□□□□□ -0.07
CTU2-203ENST00000562011 MIIPQ5JXC2 388 aa14.59□□□□□ -0.07
CTU2-203ENST00000562011 LRRC31Q6UY01 552 aa14.59□□□□□ -0.07
CTU2-203ENST00000562011 FAM131BQ86XD5 332 aa14.59□□□□□ -0.07
CTU2-203ENST00000562011 DRC7Q8IY82 874 aa14.59□□□□□ -0.07
CTU2-203ENST00000562011 BAP1Q92560 729 aa14.59□□□□□ -0.07
CTU2-203ENST00000562011 VOPP1Q96AW1 172 aa14.59□□□□□ -0.07
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 31 ms