RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000560934.1

LINS1-210, Transcript of lines homolog 1, human

TSL 4

Gene LINS1, Length 562 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
LINS1-210	ENST00000560934	STAT2	P52630	851 aa		4.94	□□□□□ -1.62
LINS1-210	ENST00000560934	INHBC	P55103	352 aa		4.94	□□□□□ -1.62
LINS1-210	ENST00000560934	TPTE	P56180	551 aa		4.94	□□□□□ -1.62
LINS1-210	ENST00000560934	IK	Q13123	557 aa	Predicted RBP	4.94	□□□□□ -1.62
LINS1-210	ENST00000560934	CDC37	Q16543	378 aa	Predicted RBP	4.94	□□□□□ -1.62
LINS1-210	ENST00000560934	PFKFB3	Q16875	520 aa	Predicted RBP	4.94	□□□□□ -1.62
LINS1-210	ENST00000560934	PFKFB4	Q16877	469 aa		4.94	□□□□□ -1.62
LINS1-210	ENST00000560934	SLC5A9	Q2M3M2	681 aa		4.94	□□□□□ -1.62
LINS1-210	ENST00000560934	QRICH1	Q2TAL8	776 aa		4.94	□□□□□ -1.62
LINS1-210	ENST00000560934	CCDC38	Q502W7	563 aa		4.94	□□□□□ -1.62
LINS1-210	ENST00000560934	L1TD1	Q5T7N2	865 aa	Known RBP	4.94	□□□□□ -1.62
LINS1-210	ENST00000560934	TSTD2	Q5T7W7	516 aa		4.94	□□□□□ -1.62
LINS1-210	ENST00000560934	RGMB	Q6NW40	437 aa		4.94	□□□□□ -1.62
LINS1-210	ENST00000560934	FAM173B	Q6P4H8	233 aa		4.94	□□□□□ -1.62
LINS1-210	ENST00000560934	OLFML1	Q6UWY5	402 aa		4.94	□□□□□ -1.62
LINS1-210	ENST00000560934	FASTKD5	Q7L8L6	764 aa	Known RBP	4.94	□□□□□ -1.62
LINS1-210	ENST00000560934	FAM160B2	Q86V87	743 aa		4.94	□□□□□ -1.62
LINS1-210	ENST00000560934	KRT73	Q86Y46	540 aa		4.94	□□□□□ -1.62
LINS1-210	ENST00000560934	CPXCR1	Q8N123	301 aa		4.94	□□□□□ -1.62
LINS1-210	ENST00000560934	ATG16L2	Q8NAA4	619 aa		4.94	□□□□□ -1.62
LINS1-210	ENST00000560934	SUN3	Q8TAQ9	357 aa		4.94	□□□□□ -1.62
LINS1-210	ENST00000560934	ABHD5	Q8WTS1	349 aa		4.94	□□□□□ -1.62
LINS1-210	ENST00000560934	SLC9A6	Q92581	669 aa		4.94	□□□□□ -1.62
LINS1-210	ENST00000560934	TBC1D5	Q92609	795 aa		4.94	□□□□□ -1.62
LINS1-210	ENST00000560934	CTHRC1	Q96CG8	243 aa		4.94	□□□□□ -1.62
LINS1-210	ENST00000560934	RRP36	Q96EU6	259 aa	Known RBP	4.94	□□□□□ -1.62
LINS1-210	ENST00000560934	C8orf76	Q96K31	380 aa		4.94	□□□□□ -1.62
LINS1-210	ENST00000560934	LENG8	Q96PV6	779 aa	Predicted RBP	4.94	□□□□□ -1.62
LINS1-210	ENST00000560934	SLF1	Q9BQI6	1058 aa		4.94	□□□□□ -1.62
LINS1-210	ENST00000560934	ALG13	Q9NP73	1137 aa	Known RBP	4.94	□□□□□ -1.62
LINS1-210	ENST00000560934	NECTIN3	Q9NQS3	549 aa		4.94	□□□□□ -1.62
LINS1-210	ENST00000560934	HOXC10	Q9NYD6	342 aa		4.94	□□□□□ -1.62
LINS1-210	ENST00000560934	CHMP5	Q9NZZ3	219 aa		4.94	□□□□□ -1.62
LINS1-210	ENST00000560934	VPS54	Q9P1Q0	977 aa		4.94	□□□□□ -1.62
LINS1-210	ENST00000560934	NKX1-2	Q9UD57	310 aa	Predicted RBP	4.94	□□□□□ -1.62
LINS1-210	ENST00000560934	STEAP1	Q9UHE8	339 aa		4.94	□□□□□ -1.62
LINS1-210	ENST00000560934	FEM1B	Q9UK73	627 aa		4.94	□□□□□ -1.62
LINS1-210	ENST00000560934	DMRT1	Q9Y5R6	373 aa		4.94	□□□□□ -1.62
LINS1-210	ENST00000560934	STK36	Q9NRP7	1315 aa		4.94	□□□□□ -1.62
LINS1-210	ENST00000560934	CCL15-CCL14	A0A0B4J2E2	113 aa		4.93	□□□□□ -1.62
LINS1-210	ENST00000560934	VPS37C	A5D8V6	355 aa	Predicted RBP	4.93	□□□□□ -1.62
LINS1-210	ENST00000560934	SMCO2	A6NFE2	343 aa		4.93	□□□□□ -1.62
LINS1-210	ENST00000560934	BTBD18	B2RXH4	712 aa		4.93	□□□□□ -1.62
LINS1-210	ENST00000560934	KIF28P	B7ZC32	967 aa		4.93	□□□□□ -1.62
LINS1-210	ENST00000560934	BTBD19	C9JJ37	291 aa		4.93	□□□□□ -1.62
LINS1-210	ENST00000560934		H3BQV1	296 aa		4.93	□□□□□ -1.62
LINS1-210	ENST00000560934	VWA5A	O00534	786 aa		4.93	□□□□□ -1.62
LINS1-210	ENST00000560934	NPC1	O15118	1278 aa		4.93	□□□□□ -1.62
LINS1-210	ENST00000560934	SPRY2	O43597	315 aa		4.93	□□□□□ -1.62
LINS1-210	ENST00000560934	SKAP2	O75563	359 aa	Predicted RBP	4.93	□□□□□ -1.62
LINS1-210	ENST00000560934	RHOBTB3	O94955	611 aa		4.93	□□□□□ -1.62
LINS1-210	ENST00000560934	TNFRSF6B	O95407	300 aa		4.93	□□□□□ -1.62
LINS1-210	ENST00000560934	PRKCB	P05771	671 aa		4.93	□□□□□ -1.62
LINS1-210	ENST00000560934	CETP	P11597	493 aa		4.93	□□□□□ -1.62
LINS1-210	ENST00000560934	CD19	P15391	556 aa		4.93	□□□□□ -1.62
LINS1-210	ENST00000560934	CREB1	P16220	341 aa		4.93	□□□□□ -1.62
LINS1-210	ENST00000560934	HTR7	P34969	479 aa		4.93	□□□□□ -1.62
LINS1-210	ENST00000560934	CHKA	P35790	457 aa		4.93	□□□□□ -1.62
LINS1-210	ENST00000560934	PBX1	P40424	430 aa		4.93	□□□□□ -1.62
LINS1-210	ENST00000560934	EEFSEC	P57772	596 aa	Known RBP	4.93	□□□□□ -1.62
LINS1-210	ENST00000560934	NUCB2	P80303	420 aa		4.93	□□□□□ -1.62
LINS1-210	ENST00000560934	NSUN2	Q08J23	767 aa	Known RBP eCLIP	4.93	□□□□□ -1.62
LINS1-210	ENST00000560934	GALNT1	Q10472	559 aa	Predicted RBP	4.93	□□□□□ -1.62
LINS1-210	ENST00000560934	ATP1A4	Q13733	1029 aa		4.93	□□□□□ -1.62
LINS1-210	ENST00000560934	SPARCL1	Q14515	664 aa		4.93	□□□□□ -1.62
LINS1-210	ENST00000560934	CCL15	Q16663	113 aa		4.93	□□□□□ -1.62
LINS1-210	ENST00000560934	FAM153C	Q494X1	144 aa		4.93	□□□□□ -1.62
LINS1-210	ENST00000560934	EARS2	Q5JPH6	523 aa	Known RBP	4.93	□□□□□ -1.62
LINS1-210	ENST00000560934	PCID2	Q5JVF3	399 aa		4.93	□□□□□ -1.62
LINS1-210	ENST00000560934	ANKRD16	Q6P6B7	361 aa		4.93	□□□□□ -1.62
LINS1-210	ENST00000560934	WDR53	Q7Z5U6	358 aa	Predicted RBP	4.93	□□□□□ -1.62
LINS1-210	ENST00000560934	SIRT6	Q8N6T7	355 aa		4.93	□□□□□ -1.62
LINS1-210	ENST00000560934	ABHD11	Q8NFV4	315 aa		4.93	□□□□□ -1.62
LINS1-210	ENST00000560934	MBD3L2	Q8NHZ7	208 aa	Predicted RBP	4.93	□□□□□ -1.62
LINS1-210	ENST00000560934	RP9	Q8TA86	221 aa	Known RBP	4.93	□□□□□ -1.62
LINS1-210	ENST00000560934	CAGE1	Q8TC20	777 aa		4.93	□□□□□ -1.62
LINS1-210	ENST00000560934	WASF1	Q92558	559 aa		4.93	□□□□□ -1.62
LINS1-210	ENST00000560934	RSPRY1	Q96DX4	576 aa		4.93	□□□□□ -1.62
LINS1-210	ENST00000560934	CHFR	Q96EP1	664 aa		4.93	□□□□□ -1.62
LINS1-210	ENST00000560934	WDYHV1	Q96HA8	205 aa		4.93	□□□□□ -1.62
LINS1-210	ENST00000560934	PRPF18	Q99633	342 aa	Known RBP	4.93	□□□□□ -1.62
LINS1-210	ENST00000560934	RANBP17	Q9H2T7	1088 aa	Known RBP	4.93	□□□□□ -1.62
LINS1-210	ENST00000560934	TMPRSS5	Q9H3S3	457 aa		4.93	□□□□□ -1.62
LINS1-210	ENST00000560934	R3HDML	Q9H3Y0	253 aa		4.93	□□□□□ -1.62
LINS1-210	ENST00000560934	PPCS	Q9HAB8	311 aa		4.93	□□□□□ -1.62
LINS1-210	ENST00000560934	SLC38A10	Q9HBR0	1119 aa		4.93	□□□□□ -1.62
LINS1-210	ENST00000560934	RAVER2	Q9HCJ3	691 aa	Known RBP	4.93	□□□□□ -1.62
LINS1-210	ENST00000560934	ASB6	Q9NWX5	421 aa		4.93	□□□□□ -1.62
LINS1-210	ENST00000560934	BARHL2	Q9NY43	387 aa		4.93	□□□□□ -1.62
LINS1-210	ENST00000560934	LRFN1	Q9P244	771 aa		4.93	□□□□□ -1.62
LINS1-210	ENST00000560934	MGAT4C	Q9UBM8	478 aa		4.93	□□□□□ -1.62
LINS1-210	ENST00000560934	ABT1	Q9ULW3	272 aa	Known RBP	4.93	□□□□□ -1.62
LINS1-210	ENST00000560934	GABRQ	Q9UN88	632 aa		4.93	□□□□□ -1.62
LINS1-210	ENST00000560934	AGTPBP1	Q9UPW5	1226 aa		4.93	□□□□□ -1.62
LINS1-210	ENST00000560934	DTNA	Q9Y4J8	743 aa		4.93	□□□□□ -1.62
LINS1-210	ENST00000560934	RIPK3	Q9Y572	518 aa		4.93	□□□□□ -1.62
LINS1-210	ENST00000560934	MYH8	P13535	1937 aa		4.93	□□□□□ -1.62
LINS1-210	ENST00000560934	MYH4	Q9Y623	1939 aa		4.92	□□□□□ -1.62
LINS1-210	ENST00000560934	PDHX	O00330	501 aa		4.92	□□□□□ -1.62
LINS1-210	ENST00000560934	KIAA0355	O15063	1070 aa		4.92	□□□□□ -1.62

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