RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000552222.5

CS-231, Transcript of citrate synthase, human

TSL 4

Gene CS, Length 555 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytosol .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
CS-231	ENST00000552222	RFWD3	Q6PCD5	774 aa		14.2	□□□□□ -0.14
CS-231	ENST00000552222	KLHDC10	Q6PID8	442 aa		14.2	□□□□□ -0.14
CS-231	ENST00000552222	MMS22L	Q6ZRQ5	1243 aa		14.2	□□□□□ -0.14
CS-231	ENST00000552222	FAM183BP	Q6ZVS7	135 aa		14.2	□□□□□ -0.14
CS-231	ENST00000552222	MON1B	Q7L1V2	547 aa		14.2	□□□□□ -0.14
CS-231	ENST00000552222	VPS36	Q86VN1	386 aa		14.2	□□□□□ -0.14
CS-231	ENST00000552222	XYLT1	Q86Y38	959 aa		14.2	□□□□□ -0.14
CS-231	ENST00000552222	ZDHHC17	Q8IUH5	632 aa		14.2	□□□□□ -0.14
CS-231	ENST00000552222	OR14C36	Q8NHC7	312 aa		14.2	□□□□□ -0.14
CS-231	ENST00000552222	ABCC13	Q9NSE7	274 aa		14.2	□□□□□ -0.14
CS-231	ENST00000552222	TAS2R14	Q9NYV8	317 aa		14.2	□□□□□ -0.14
CS-231	ENST00000552222	MARCH2	Q9P0N8	246 aa		14.2	□□□□□ -0.14
CS-231	ENST00000552222	IMPACT	Q9P2X3	320 aa		14.2	□□□□□ -0.14
CS-231	ENST00000552222	NCKAP1	Q9Y2A7	1128 aa		14.2	□□□□□ -0.14
CS-231	ENST00000552222		U3KQA8	63 aa		14.2	□□□□□ -0.14
CS-231	ENST00000552222	BSN	Q9UPA5	3926 aa		14.19	□□□□□ -0.14
CS-231	ENST00000552222	SSU72P8	A0A1W2PR75	194 aa		14.19	□□□□□ -0.14
CS-231	ENST00000552222	TIMM44	O43615	452 aa		14.19	□□□□□ -0.14
CS-231	ENST00000552222	DXO	O77932	396 aa	Known RBP	14.19	□□□□□ -0.14
CS-231	ENST00000552222	FYN	P06241	537 aa		14.19	□□□□□ -0.14
CS-231	ENST00000552222	GLI1	P08151	1106 aa		14.19	□□□□□ -0.14
CS-231	ENST00000552222	RALA	P11233	206 aa		14.19	□□□□□ -0.14
CS-231	ENST00000552222	VAV1	P15498	845 aa		14.19	□□□□□ -0.14
CS-231	ENST00000552222	SCNN1A	P37088	669 aa		14.19	□□□□□ -0.14
CS-231	ENST00000552222	EIF4A3	P38919	411 aa	Known RBP	14.19	□□□□□ -0.14
CS-231	ENST00000552222	SLC6A3	Q01959	620 aa		14.19	□□□□□ -0.14
CS-231	ENST00000552222	C1QBP	Q07021	282 aa	Known RBP	14.19	□□□□□ -0.14
CS-231	ENST00000552222	MAPK8IP2	Q13387	824 aa	Predicted RBP	14.19	□□□□□ -0.14
CS-231	ENST00000552222	TAF5	Q15542	800 aa		14.19	□□□□□ -0.14
CS-231	ENST00000552222	TGIF1	Q15583	401 aa		14.19	□□□□□ -0.14
CS-231	ENST00000552222	ASTE1	Q2TB18	679 aa	Predicted RBP	14.19	□□□□□ -0.14
CS-231	ENST00000552222	C2CD6	Q53TS8	623 aa		14.19	□□□□□ -0.14
CS-231	ENST00000552222	ZNF542P	Q5EBM4	170 aa		14.19	□□□□□ -0.14
CS-231	ENST00000552222	EFHC1	Q5JVL4	640 aa		14.19	□□□□□ -0.14
CS-231	ENST00000552222	OR6B2	Q6IFH4	312 aa		14.19	□□□□□ -0.14
CS-231	ENST00000552222	PPP1R2P3	Q6NXS1	205 aa		14.19	□□□□□ -0.14
CS-231	ENST00000552222	CCDC81	Q6ZN84	652 aa		14.19	□□□□□ -0.14
CS-231	ENST00000552222	BEND5	Q7L4P6	421 aa		14.19	□□□□□ -0.14
CS-231	ENST00000552222	SLC26A9	Q7LBE3	791 aa		14.19	□□□□□ -0.14
CS-231	ENST00000552222	CACTIN-AS1	Q8N1I8	211 aa		14.19	□□□□□ -0.14
CS-231	ENST00000552222	CPXM2	Q8N436	756 aa		14.19	□□□□□ -0.14
CS-231	ENST00000552222	OR2T34	Q8NGX1	318 aa		14.19	□□□□□ -0.14
CS-231	ENST00000552222	KLK6	Q92876	244 aa		14.19	□□□□□ -0.14
CS-231	ENST00000552222	PANX2	Q96RD6	677 aa		14.19	□□□□□ -0.14
CS-231	ENST00000552222	CDK5RAP1	Q96SZ6	601 aa	Known RBP	14.19	□□□□□ -0.14
CS-231	ENST00000552222	CHP1	Q99653	195 aa		14.19	□□□□□ -0.14
CS-231	ENST00000552222	OMD	Q99983	421 aa		14.19	□□□□□ -0.14
CS-231	ENST00000552222	ASNSD1	Q9NWL6	643 aa		14.19	□□□□□ -0.14
CS-231	ENST00000552222	ADAM22	Q9P0K1	906 aa		14.19	□□□□□ -0.14
CS-231	ENST00000552222	SFMBT1	Q9UHJ3	866 aa		14.19	□□□□□ -0.14
CS-231	ENST00000552222	INTS6	Q9UL03	887 aa	Known RBP	14.19	□□□□□ -0.14
CS-231	ENST00000552222	DOCK9	Q9BZ29	2069 aa		14.19	□□□□□ -0.14
CS-231	ENST00000552222	NBPF19	A0A087WUL8	3843 aa		14.19	□□□□□ -0.14
CS-231	ENST00000552222		A0A087X0T9	212 aa		14.18	□□□□□ -0.14
CS-231	ENST00000552222	AGRP	O00253	132 aa		14.18	□□□□□ -0.14
CS-231	ENST00000552222	MSI1	O43347	362 aa	Known RBP	14.18	□□□□□ -0.14
CS-231	ENST00000552222	SUV39H1	O43463	412 aa		14.18	□□□□□ -0.14
CS-231	ENST00000552222	RTN2	O75298	545 aa		14.18	□□□□□ -0.14
CS-231	ENST00000552222	NEBL	O76041	1014 aa		14.18	□□□□□ -0.14
CS-231	ENST00000552222	CALB1	P05937	261 aa		14.18	□□□□□ -0.14
CS-231	ENST00000552222	DLD	P09622	509 aa	Known RBP	14.18	□□□□□ -0.14
CS-231	ENST00000552222	FAM228B	P0C875	321 aa		14.18	□□□□□ -0.14
CS-231	ENST00000552222	TGM2	P21980	687 aa		14.18	□□□□□ -0.14
CS-231	ENST00000552222	DGKA	P23743	735 aa		14.18	□□□□□ -0.14
CS-231	ENST00000552222	SLC8A1	P32418	973 aa		14.18	□□□□□ -0.14
CS-231	ENST00000552222	ADPRH	P54922	357 aa		14.18	□□□□□ -0.14
CS-231	ENST00000552222	GSC	P56915	257 aa	Predicted RBP	14.18	□□□□□ -0.14
CS-231	ENST00000552222	ERVPABLB-1	P60509	514 aa		14.18	□□□□□ -0.14
CS-231	ENST00000552222	YWHAZ	P63104	245 aa	Known RBP	14.18	□□□□□ -0.14
CS-231	ENST00000552222	E2F1	Q01094	437 aa		14.18	□□□□□ -0.14
CS-231	ENST00000552222	ZBTB16	Q05516	673 aa		14.18	□□□□□ -0.14
CS-231	ENST00000552222	IGFBP7	Q16270	282 aa		14.18	□□□□□ -0.14
CS-231	ENST00000552222	C9orf64	Q5T6V5	341 aa		14.18	□□□□□ -0.14
CS-231	ENST00000552222	RAB11FIP1	Q6WKZ4	1283 aa	Predicted RBP	14.18	□□□□□ -0.14
CS-231	ENST00000552222	KIAA0907	Q7Z7F0	614 aa	Predicted RBP	14.18	□□□□□ -0.14
CS-231	ENST00000552222	TADA2B	Q86TJ2	420 aa		14.18	□□□□□ -0.14
CS-231	ENST00000552222	FAM217A	Q8IXS0	508 aa		14.18	□□□□□ -0.14
CS-231	ENST00000552222	MCOLN2	Q8IZK6	566 aa		14.18	□□□□□ -0.14
CS-231	ENST00000552222	STK40	Q8N2I9	435 aa		14.18	□□□□□ -0.14
CS-231	ENST00000552222	SPC24	Q8NBT2	197 aa		14.18	□□□□□ -0.14
CS-231	ENST00000552222	EDEM1	Q92611	657 aa		14.18	□□□□□ -0.14
CS-231	ENST00000552222	GOLGA1	Q92805	767 aa		14.18	□□□□□ -0.14
CS-231	ENST00000552222	ARRDC3	Q96B67	414 aa		14.18	□□□□□ -0.14
CS-231	ENST00000552222	FAM149B1	Q96BN6	582 aa		14.18	□□□□□ -0.14
CS-231	ENST00000552222	MRGPRX3	Q96LB0	322 aa		14.18	□□□□□ -0.14
CS-231	ENST00000552222	FAM129B	Q96TA1	746 aa		14.18	□□□□□ -0.14
CS-231	ENST00000552222	C11orf70	Q9BRQ4	267 aa		14.18	□□□□□ -0.14
CS-231	ENST00000552222	TRIM62	Q9BVG3	475 aa		14.18	□□□□□ -0.14
CS-231	ENST00000552222	SLC2A11	Q9BYW1	496 aa		14.18	□□□□□ -0.14
CS-231	ENST00000552222	DPH1	Q9BZG8	443 aa		14.18	□□□□□ -0.14
CS-231	ENST00000552222	ISCU	Q9H1K1	167 aa		14.18	□□□□□ -0.14
CS-231	ENST00000552222	POPDC2	Q9HBU9	364 aa		14.18	□□□□□ -0.14
CS-231	ENST00000552222	OLA1	Q9NTK5	396 aa	Known RBP	14.18	□□□□□ -0.14
CS-231	ENST00000552222	STIM2	Q9P246	746 aa		14.18	□□□□□ -0.14
CS-231	ENST00000552222	STRIP2	Q9ULQ0	834 aa		14.18	□□□□□ -0.14
CS-231	ENST00000552222	NENF	Q9UMX5	172 aa		14.18	□□□□□ -0.14
CS-231	ENST00000552222	ZNF510	Q9Y2H8	683 aa		14.18	□□□□□ -0.14
CS-231	ENST00000552222	USP9X	Q93008	2570 aa	Predicted RBP	14.18	□□□□□ -0.14
CS-231	ENST00000552222	COL27A1	Q8IZC6	1860 aa	Predicted RBP	14.17	□□□□□ -0.14
CS-231	ENST00000552222	TBC1D3D	A0A087WVF3	549 aa		14.17	□□□□□ -0.14

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