RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000550655.5

CS-219, Transcript of citrate synthase, humanhuman

TSL 2

Gene CS, Length 589 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CS-219ENST00000550655 VSTM4Q8IW00 320 aa18.1■□□□□ 0.49
CS-219ENST00000550655 PCDH20Q8N6Y1 951 aaKnown RBP18.1■□□□□ 0.49
CS-219ENST00000550655 OR14C36Q8NHC7 312 aa18.1■□□□□ 0.49
CS-219ENST00000550655 CCDC114Q96M63 670 aa18.1■□□□□ 0.49
CS-219ENST00000550655 EBF2Q9HAK2 575 aa18.1■□□□□ 0.49
CS-219ENST00000550655 MRPL47Q9HD33 250 aaKnown RBP18.1■□□□□ 0.49
CS-219ENST00000550655 TM9SF3Q9HD45 589 aa18.1■□□□□ 0.49
CS-219ENST00000550655 OSGEPQ9NPF4 335 aa18.1■□□□□ 0.49
CS-219ENST00000550655 DNAAF2Q9NVR5 837 aaKnown RBP18.1■□□□□ 0.49
CS-219ENST00000550655 PCSK1NQ9UHG2 260 aa18.1■□□□□ 0.49
CS-219ENST00000550655 FCF1Q9Y324 198 aaKnown RBP18.1■□□□□ 0.49
CS-219ENST00000550655 CNOT1A5YKK6 2376 aaKnown RBP18.1■□□□□ 0.49
CS-219ENST00000550655 SPTBN2O15020 2390 aa18.1■□□□□ 0.49
CS-219ENST00000550655 FGF10O15520 208 aaPredicted RBP18.09■□□□□ 0.49
CS-219ENST00000550655 SLC7A4O43246 635 aa18.09■□□□□ 0.49
CS-219ENST00000550655 PLRG1O43660 514 aaKnown RBP18.09■□□□□ 0.49
CS-219ENST00000550655 RNF8O76064 485 aa18.09■□□□□ 0.49
CS-219ENST00000550655 HTR7P34969 479 aa18.09■□□□□ 0.49
CS-219ENST00000550655 CCR5P51681 352 aa18.09■□□□□ 0.49
CS-219ENST00000550655 ATXN3P54252 364 aaPredicted RBP18.09■□□□□ 0.49
CS-219ENST00000550655 TPI1P60174 286 aa18.09■□□□□ 0.49
CS-219ENST00000550655 PPP2CBP62714 309 aa18.09■□□□□ 0.49
CS-219ENST00000550655 PPP2CAP67775 309 aa18.09■□□□□ 0.49
CS-219ENST00000550655 TRIM14Q14142 442 aa18.09■□□□□ 0.49
CS-219ENST00000550655 POLD3Q15054 466 aaPredicted RBP18.09■□□□□ 0.49
CS-219ENST00000550655 UAP1L1Q3KQV9 507 aa18.09■□□□□ 0.49
CS-219ENST00000550655 PIP5KL1Q5T9C9 394 aa18.09■□□□□ 0.49
CS-219ENST00000550655 RAB11FIP1Q6WKZ4 1283 aaPredicted RBP18.09■□□□□ 0.49
CS-219ENST00000550655 DPY19L3Q6ZPD9 716 aa18.09■□□□□ 0.49
CS-219ENST00000550655 TMIEQ8NEW7 156 aa18.09■□□□□ 0.49
CS-219ENST00000550655 ARRDC3Q96B67 414 aa18.09■□□□□ 0.49
CS-219ENST00000550655 ARHGEF26Q96DR7 871 aa18.09■□□□□ 0.49
CS-219ENST00000550655 KCTD15Q96SI1 283 aaPredicted RBP18.09■□□□□ 0.49
CS-219ENST00000550655 DNAJC7Q99615 494 aa18.09■□□□□ 0.49
CS-219ENST00000550655 ZDHHC5Q9C0B5 715 aa18.09■□□□□ 0.49
CS-219ENST00000550655 KLC2Q9H0B6 622 aa18.09■□□□□ 0.49
CS-219ENST00000550655 DHX35Q9H5Z1 703 aaKnown RBP18.09■□□□□ 0.49
CS-219ENST00000550655 CATSPERBQ9H7T0 1116 aa18.09■□□□□ 0.49
CS-219ENST00000550655 WASF2Q9Y6W5 498 aa18.09■□□□□ 0.49
CS-219ENST00000550655 NCOR2Q9Y618 2525 aa18.09■□□□□ 0.49
CS-219ENST00000550655 A0A1W2PPC4 97 aa18.08■□□□□ 0.48
CS-219ENST00000550655 EIF3CLB5ME19 914 aaKnown RBP18.08■□□□□ 0.48
CS-219ENST00000550655 KCNK5O95279 499 aa18.08■□□□□ 0.48
CS-219ENST00000550655 CYP1A2P05177 515 aa18.08■□□□□ 0.48
CS-219ENST00000550655 AFF3P51826 1226 aaKnown RBP18.08■□□□□ 0.48
CS-219ENST00000550655 TAS2R38P59533 333 aa18.08■□□□□ 0.48
CS-219ENST00000550655 ERMARDQ5T6L9 678 aa18.08■□□□□ 0.48
CS-219ENST00000550655 ALKBH5Q6P6C2 394 aaKnown RBP18.08■□□□□ 0.48
CS-219ENST00000550655 LAYNQ6UX15 382 aa18.08■□□□□ 0.48
CS-219ENST00000550655 UMODL1-AS1Q8N2C9 162 aa18.08■□□□□ 0.48
CS-219ENST00000550655 GRIN3AQ8TCU5 1115 aa18.08■□□□□ 0.48
CS-219ENST00000550655 VOPP1Q96AW1 172 aa18.08■□□□□ 0.48
CS-219ENST00000550655 ISG20Q96AZ6 181 aaKnown RBP18.08■□□□□ 0.48
CS-219ENST00000550655 HMCESQ96FZ2 354 aa18.08■□□□□ 0.48
CS-219ENST00000550655 EIF3CQ99613 913 aaKnown RBP18.08■□□□□ 0.48
CS-219ENST00000550655 KDM4CQ9H3R0 1056 aa18.08■□□□□ 0.48
CS-219ENST00000550655 IL36AQ9UHA7 158 aa18.08■□□□□ 0.48
CS-219ENST00000550655 FARP1Q9Y4F1 1045 aaPredicted RBP18.08■□□□□ 0.48
CS-219ENST00000550655 A0A1B0GVT2 93 aa18.07■□□□□ 0.48
CS-219ENST00000550655 RASA4BC9J798 803 aa18.07■□□□□ 0.48
CS-219ENST00000550655 KPNA3O00505 521 aaPredicted RBP18.07■□□□□ 0.48
CS-219ENST00000550655 RASA4O43374 803 aa18.07■□□□□ 0.48
CS-219ENST00000550655 LATO43561 262 aa18.07■□□□□ 0.48
CS-219ENST00000550655 KDELR3O43731 214 aa18.07■□□□□ 0.48
CS-219ENST00000550655 PRPSAP2O60256 369 aa18.07■□□□□ 0.48
CS-219ENST00000550655 PRNPP04156 253 aa18.07■□□□□ 0.48
CS-219ENST00000550655 TCF4P15884 667 aa18.07■□□□□ 0.48
CS-219ENST00000550655 CSRP1P21291 193 aaKnown RBP18.07■□□□□ 0.48
CS-219ENST00000550655 IL1R2P27930 398 aa18.07■□□□□ 0.48
CS-219ENST00000550655 PCK1P35558 622 aa18.07■□□□□ 0.48
CS-219ENST00000550655 EIF4A3P38919 411 aaKnown RBP18.07■□□□□ 0.48
CS-219ENST00000550655 GRIA4P48058 902 aa18.07■□□□□ 0.48
CS-219ENST00000550655 CSNK1EP49674 416 aaKnown RBP18.07■□□□□ 0.48
CS-219ENST00000550655 CCNHP51946 323 aaPredicted RBP18.07■□□□□ 0.48
CS-219ENST00000550655 GEMIN4P57678 1058 aaKnown RBP18.07■□□□□ 0.48
CS-219ENST00000550655 YBEYP58557 167 aaPredicted RBP18.07■□□□□ 0.48
CS-219ENST00000550655 ACAP1Q15027 740 aa18.07■□□□□ 0.48
CS-219ENST00000550655 ASTE1Q2TB18 679 aaPredicted RBP18.07■□□□□ 0.48
CS-219ENST00000550655 CARD16Q5EG05 197 aa18.07■□□□□ 0.48
CS-219ENST00000550655 CCDC122Q5T0U0 273 aa18.07■□□□□ 0.48
CS-219ENST00000550655 PSAPL1Q6NUJ1 521 aa18.07■□□□□ 0.48
CS-219ENST00000550655 LEKR1Q6ZMV7 388 aa18.07■□□□□ 0.48
CS-219ENST00000550655 PIP4P1Q86T03 277 aa18.07■□□□□ 0.48
CS-219ENST00000550655 PSTKQ8IV42 348 aaKnown RBP18.07■□□□□ 0.48
CS-219ENST00000550655 NIPA2Q8N8Q9 360 aa18.07■□□□□ 0.48
CS-219ENST00000550655 SLC6A18Q96N87 628 aa18.07■□□□□ 0.48
CS-219ENST00000550655 TM6SF2Q9BZW4 377 aa18.07■□□□□ 0.48
CS-219ENST00000550655 LRRC19Q9H756 370 aa18.07■□□□□ 0.48
CS-219ENST00000550655 HPCAL4Q9UM19 191 aa18.07■□□□□ 0.48
CS-219ENST00000550655 ANKRD36A6QL64 1941 aa18.06■□□□□ 0.48
CS-219ENST00000550655 ZSCAN5CA6NGD5 496 aaPredicted RBP18.06■□□□□ 0.48
CS-219ENST00000550655 UPK3BL1B0FP48 263 aa18.06■□□□□ 0.48
CS-219ENST00000550655 UPK3BL2E5RIL1 263 aa18.06■□□□□ 0.48
CS-219ENST00000550655 EEF2KO00418 725 aaKnown RBP18.06■□□□□ 0.48
CS-219ENST00000550655 GIPC1O14908 333 aa18.06■□□□□ 0.48
CS-219ENST00000550655 OPHN1O60890 802 aa18.06■□□□□ 0.48
CS-219ENST00000550655 LEFTY1O75610 366 aa18.06■□□□□ 0.48
CS-219ENST00000550655 ADRB1P08588 477 aa18.06■□□□□ 0.48
CS-219ENST00000550655 CD59P13987 128 aa18.06■□□□□ 0.48
CS-219ENST00000550655 KCNA4P22459 653 aa18.06■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 75.8 ms