RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000550442.5

LETMD1-223, Transcript of LETM1 domain containing 1, human

TSL 4

Gene LETMD1, Length 469 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
LETMD1-223	ENST00000550442	NOMO2	Q5JPE7	1267 aa		12.03	□□□□□ -0.48
LETMD1-223	ENST00000550442	PCID2	Q5JVF3	399 aa		12.03	□□□□□ -0.48
LETMD1-223	ENST00000550442	BHLHA9	Q7RTU4	235 aa		12.03	□□□□□ -0.48
LETMD1-223	ENST00000550442	CLNK	Q7Z7G1	428 aa		12.03	□□□□□ -0.48
LETMD1-223	ENST00000550442	PRPF39	Q86UA1	669 aa	Known RBP	12.03	□□□□□ -0.48
LETMD1-223	ENST00000550442	NUP93	Q8N1F7	819 aa		12.03	□□□□□ -0.48
LETMD1-223	ENST00000550442	DNAAF3	Q8N9W5	541 aa		12.03	□□□□□ -0.48
LETMD1-223	ENST00000550442	DQX1	Q8TE96	717 aa	Known RBP	12.03	□□□□□ -0.48
LETMD1-223	ENST00000550442	NSMCE1	Q8WV22	266 aa		12.03	□□□□□ -0.48
LETMD1-223	ENST00000550442	SPOCK2	Q92563	424 aa		12.03	□□□□□ -0.48
LETMD1-223	ENST00000550442	ERP27	Q96DN0	273 aa		12.03	□□□□□ -0.48
LETMD1-223	ENST00000550442	NSL1	Q96IY1	281 aa		12.03	□□□□□ -0.48
LETMD1-223	ENST00000550442	SPATA17	Q96L03	361 aa		12.03	□□□□□ -0.48
LETMD1-223	ENST00000550442	FAM193B	Q96PV7	902 aa	Predicted RBP	12.03	□□□□□ -0.48
LETMD1-223	ENST00000550442	IL12RB2	Q99665	862 aa		12.03	□□□□□ -0.48
LETMD1-223	ENST00000550442	RTP3	Q9BQQ7	232 aa		12.03	□□□□□ -0.48
LETMD1-223	ENST00000550442	MRPL9	Q9BYD2	267 aa	Known RBP	12.03	□□□□□ -0.48
LETMD1-223	ENST00000550442	ADAM33	Q9BZ11	813 aa		12.03	□□□□□ -0.48
LETMD1-223	ENST00000550442	RAB6C	Q9H0N0	254 aa		12.03	□□□□□ -0.48
LETMD1-223	ENST00000550442	C1orf21	Q9H246	121 aa		12.03	□□□□□ -0.48
LETMD1-223	ENST00000550442	MLXIPL	Q9NP71	852 aa		12.03	□□□□□ -0.48
LETMD1-223	ENST00000550442	TLR9	Q9NR96	1032 aa		12.03	□□□□□ -0.48
LETMD1-223	ENST00000550442	TMEM161A	Q9NX61	479 aa		12.03	□□□□□ -0.48
LETMD1-223	ENST00000550442	HSFX1	Q9UBD0	423 aa		12.03	□□□□□ -0.48
LETMD1-223	ENST00000550442	CHKB	Q9Y259	395 aa		12.03	□□□□□ -0.48
LETMD1-223	ENST00000550442	INSL6	Q9Y581	213 aa		12.03	□□□□□ -0.48
LETMD1-223	ENST00000550442	RPS6KL1	Q9Y6S9	549 aa		12.03	□□□□□ -0.48
LETMD1-223	ENST00000550442	EPG5	Q9HCE0	2579 aa		12.02	□□□□□ -0.48
LETMD1-223	ENST00000550442	DCHS1	Q96JQ0	3298 aa		12.02	□□□□□ -0.48
LETMD1-223	ENST00000550442	WDR27	A2RRH5	827 aa		12.02	□□□□□ -0.49
LETMD1-223	ENST00000550442	KCNU1	A8MYU2	1149 aa		12.02	□□□□□ -0.49
LETMD1-223	ENST00000550442	TMEM114	B3SHH9	223 aa		12.02	□□□□□ -0.49
LETMD1-223	ENST00000550442	TNFRSF10B	O14763	440 aa		12.02	□□□□□ -0.49
LETMD1-223	ENST00000550442	MBTPS2	O43462	519 aa		12.02	□□□□□ -0.49
LETMD1-223	ENST00000550442	SIN3B	O75182	1162 aa		12.02	□□□□□ -0.49
LETMD1-223	ENST00000550442	LRIG2	O94898	1065 aa		12.02	□□□□□ -0.49
LETMD1-223	ENST00000550442	HAUS5	O94927	633 aa		12.02	□□□□□ -0.49
LETMD1-223	ENST00000550442	PAPSS2	O95340	614 aa	Predicted RBP	12.02	□□□□□ -0.49
LETMD1-223	ENST00000550442	ATP6V1G2	O95670	118 aa		12.02	□□□□□ -0.49
LETMD1-223	ENST00000550442	SERPINE1	P05121	402 aa		12.02	□□□□□ -0.49
LETMD1-223	ENST00000550442	CES1	P23141	567 aa		12.02	□□□□□ -0.49
LETMD1-223	ENST00000550442	BDNF	P23560	247 aa		12.02	□□□□□ -0.49
LETMD1-223	ENST00000550442	PSMB4	P28070	264 aa		12.02	□□□□□ -0.49
LETMD1-223	ENST00000550442	TYK2	P29597	1187 aa		12.02	□□□□□ -0.49
LETMD1-223	ENST00000550442	AVPR2	P30518	371 aa		12.02	□□□□□ -0.49
LETMD1-223	ENST00000550442	ADSL	P30566	484 aa	Predicted RBP	12.02	□□□□□ -0.49
LETMD1-223	ENST00000550442	GRIK1	P39086	918 aa		12.02	□□□□□ -0.49
LETMD1-223	ENST00000550442	NUBP1	P53384	320 aa		12.02	□□□□□ -0.49
LETMD1-223	ENST00000550442	LIMK2	P53671	638 aa		12.02	□□□□□ -0.49
LETMD1-223	ENST00000550442	ATXN1	P54253	815 aa	Known RBP	12.02	□□□□□ -0.49
LETMD1-223	ENST00000550442	YBEY	P58557	167 aa	Predicted RBP	12.02	□□□□□ -0.49
LETMD1-223	ENST00000550442	TMPRSS15	P98073	1019 aa		12.02	□□□□□ -0.49
LETMD1-223	ENST00000550442	OCRL	Q01968	901 aa		12.02	□□□□□ -0.49
LETMD1-223	ENST00000550442	RING1	Q06587	406 aa		12.02	□□□□□ -0.49
LETMD1-223	ENST00000550442	MPP3	Q13368	585 aa		12.02	□□□□□ -0.49
LETMD1-223	ENST00000550442	GPM6B	Q13491	265 aa		12.02	□□□□□ -0.49
LETMD1-223	ENST00000550442	COL19A1	Q14993	1142 aa		12.02	□□□□□ -0.49
LETMD1-223	ENST00000550442	EFTUD2	Q15029	972 aa	Known RBP eCLIP	12.02	□□□□□ -0.49
LETMD1-223	ENST00000550442	ZRSR2	Q15696	482 aa	Known RBP	12.02	□□□□□ -0.49
LETMD1-223	ENST00000550442	ANKRD20A4	Q4UJ75	823 aa		12.02	□□□□□ -0.49
LETMD1-223	ENST00000550442	MANEAL	Q5VSG8	457 aa		12.02	□□□□□ -0.49
LETMD1-223	ENST00000550442	AFMID	Q63HM1	303 aa		12.02	□□□□□ -0.49
LETMD1-223	ENST00000550442	UMODL1-AS1	Q8N2C9	162 aa		12.02	□□□□□ -0.49
LETMD1-223	ENST00000550442	PYROXD2	Q8N2H3	581 aa		12.02	□□□□□ -0.49
LETMD1-223	ENST00000550442	ATPAF2	Q8N5M1	289 aa		12.02	□□□□□ -0.49
LETMD1-223	ENST00000550442	RTL3	Q8N8U3	475 aa	Known RBP	12.02	□□□□□ -0.49
LETMD1-223	ENST00000550442	ATP6V0D2	Q8N8Y2	350 aa		12.02	□□□□□ -0.49
LETMD1-223	ENST00000550442	PPP1R14C	Q8TAE6	165 aa		12.02	□□□□□ -0.49
LETMD1-223	ENST00000550442	SPPL2B	Q8TCT7	592 aa		12.02	□□□□□ -0.49
LETMD1-223	ENST00000550442	MRRF	Q96E11	262 aa	Known RBP	12.02	□□□□□ -0.49
LETMD1-223	ENST00000550442	RMDN2	Q96LZ7	410 aa		12.02	□□□□□ -0.49
LETMD1-223	ENST00000550442	KCNK16	Q96T55	309 aa		12.02	□□□□□ -0.49
LETMD1-223	ENST00000550442	RBBP8	Q99708	897 aa		12.02	□□□□□ -0.49
LETMD1-223	ENST00000550442	TMEM175	Q9BSA9	504 aa		12.02	□□□□□ -0.49
LETMD1-223	ENST00000550442	MAGEB5	Q9BZ81	275 aa		12.02	□□□□□ -0.49
LETMD1-223	ENST00000550442	PLAC1	Q9HBJ0	212 aa		12.02	□□□□□ -0.49
LETMD1-223	ENST00000550442	ARNT2	Q9HBZ2	717 aa		12.02	□□□□□ -0.49
LETMD1-223	ENST00000550442	IPO11	Q9UI26	975 aa	Known RBP	12.02	□□□□□ -0.49
LETMD1-223	ENST00000550442	PCDHB5	Q9Y5E4	795 aa		12.02	□□□□□ -0.49
LETMD1-223	ENST00000550442	CDY1	Q9Y6F8	540 aa		12.02	□□□□□ -0.49
LETMD1-223	ENST00000550442	COL4A6	Q14031	1691 aa		12.02	□□□□□ -0.49
LETMD1-223	ENST00000550442	MYO15A	Q9UKN7	3530 aa		12.02	□□□□□ -0.49
LETMD1-223	ENST00000550442	CCDC189	A1A4V9	331 aa		12.01	□□□□□ -0.49
LETMD1-223	ENST00000550442	CASTOR2	A6NHX0	329 aa		12.01	□□□□□ -0.49
LETMD1-223	ENST00000550442	CXorf49	A8MYA2	514 aa	Predicted RBP	12.01	□□□□□ -0.49
LETMD1-223	ENST00000550442	SLC22A2	O15244	555 aa		12.01	□□□□□ -0.49
LETMD1-223	ENST00000550442	CSH1	P0DML2	217 aa		12.01	□□□□□ -0.49
LETMD1-223	ENST00000550442	CSH2	P0DML3	217 aa		12.01	□□□□□ -0.49
LETMD1-223	ENST00000550442	RHOQ	P17081	205 aa		12.01	□□□□□ -0.49
LETMD1-223	ENST00000550442	MGAT1	P26572	445 aa		12.01	□□□□□ -0.49
LETMD1-223	ENST00000550442	CRABP2	P29373	138 aa		12.01	□□□□□ -0.49
LETMD1-223	ENST00000550442	SLC26A3	P40879	764 aa		12.01	□□□□□ -0.49
LETMD1-223	ENST00000550442	CCNG1	P51959	295 aa		12.01	□□□□□ -0.49
LETMD1-223	ENST00000550442	RPL10A	P62906	217 aa	Known RBP	12.01	□□□□□ -0.49
LETMD1-223	ENST00000550442	SIGLEC14	Q08ET2	396 aa		12.01	□□□□□ -0.49
LETMD1-223	ENST00000550442	SMAD4	Q13485	552 aa	Known RBP	12.01	□□□□□ -0.49
LETMD1-223	ENST00000550442	IKBKE	Q14164	716 aa		12.01	□□□□□ -0.49
LETMD1-223	ENST00000550442	KCTD19	Q17RG1	926 aa	Predicted RBP	12.01	□□□□□ -0.49
LETMD1-223	ENST00000550442	DNAL1	Q4LDG9	190 aa		12.01	□□□□□ -0.49
LETMD1-223	ENST00000550442	WLS	Q5T9L3	541 aa		12.01	□□□□□ -0.49

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