RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000549815.1

GCN1-206, Transcript of GCN1, eIF2 alpha kinase activator homolog, human

TSL 3

Gene GCN1, Length 543 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus, Ribosome .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
GCN1-206	ENST00000549815	IQCH	Q86VS3	1027 aa		13.73	□□□□□ -0.21
GCN1-206	ENST00000549815	NLRP14	Q86W24	1093 aa		13.73	□□□□□ -0.21
GCN1-206	ENST00000549815	PROSER1	Q86XN7	944 aa		13.73	□□□□□ -0.21
GCN1-206	ENST00000549815	TMEM145	Q8NBT3	493 aa		13.73	□□□□□ -0.21
GCN1-206	ENST00000549815	VOPP1	Q96AW1	172 aa		13.73	□□□□□ -0.21
GCN1-206	ENST00000549815	ERGIC2	Q96RQ1	377 aa		13.73	□□□□□ -0.21
GCN1-206	ENST00000549815	MAGEB5	Q9BZ81	275 aa		13.73	□□□□□ -0.21
GCN1-206	ENST00000549815	CEP44	Q9C0F1	390 aa		13.73	□□□□□ -0.21
GCN1-206	ENST00000549815	OSBPL2	Q9H1P3	480 aa		13.73	□□□□□ -0.21
GCN1-206	ENST00000549815	ANO10	Q9NW15	660 aa		13.73	□□□□□ -0.21
GCN1-206	ENST00000549815	WASF2	Q9Y6W5	498 aa		13.73	□□□□□ -0.21
GCN1-206	ENST00000549815	ARID1B	Q8NFD5	2236 aa	Predicted RBP	13.73	□□□□□ -0.21
GCN1-206	ENST00000549815	DSP	P15924	2871 aa	Known RBP	13.73	□□□□□ -0.21
GCN1-206	ENST00000549815	ANKRD11	Q6UB99	2663 aa	Predicted RBP	13.72	□□□□□ -0.21
GCN1-206	ENST00000549815	TCRBV5S1A1T	A0A578	114 aa		13.72	□□□□□ -0.21
GCN1-206	ENST00000549815	FAM72C	H0Y354	149 aa		13.72	□□□□□ -0.21
GCN1-206	ENST00000549815	YKT6	O15498	198 aa		13.72	□□□□□ -0.21
GCN1-206	ENST00000549815	RNGTT	O60942	597 aa	Known RBP	13.72	□□□□□ -0.21
GCN1-206	ENST00000549815	PRNP	P04156	253 aa		13.72	□□□□□ -0.21
GCN1-206	ENST00000549815	TPM2	P07951	284 aa		13.72	□□□□□ -0.21
GCN1-206	ENST00000549815	SDC4	P31431	198 aa		13.72	□□□□□ -0.21
GCN1-206	ENST00000549815	RFC1	P35251	1148 aa	Predicted RBP	13.72	□□□□□ -0.21
GCN1-206	ENST00000549815	MYL5	Q02045	173 aa		13.72	□□□□□ -0.21
GCN1-206	ENST00000549815	SLC20A2	Q08357	652 aa		13.72	□□□□□ -0.21
GCN1-206	ENST00000549815	OVGP1	Q12889	678 aa		13.72	□□□□□ -0.21
GCN1-206	ENST00000549815	BNIP3	Q12983	259 aa		13.72	□□□□□ -0.21
GCN1-206	ENST00000549815	SMAD1	Q15797	465 aa	Known RBP	13.72	□□□□□ -0.21
GCN1-206	ENST00000549815	CDO1	Q16878	200 aa		13.72	□□□□□ -0.21
GCN1-206	ENST00000549815	CLEC16A	Q2KHT3	1053 aa		13.72	□□□□□ -0.21
GCN1-206	ENST00000549815	INAVA	Q3KP66	663 aa		13.72	□□□□□ -0.21
GCN1-206	ENST00000549815	ARSI	Q5FYB1	569 aa		13.72	□□□□□ -0.21
GCN1-206	ENST00000549815	FAM72A	Q5TYM5	149 aa		13.72	□□□□□ -0.21
GCN1-206	ENST00000549815	SFMBT2	Q5VUG0	894 aa		13.72	□□□□□ -0.21
GCN1-206	ENST00000549815	FAM72D	Q6L9T8	149 aa		13.72	□□□□□ -0.21
GCN1-206	ENST00000549815	RETSAT	Q6NUM9	610 aa		13.72	□□□□□ -0.21
GCN1-206	ENST00000549815	NEK5	Q6P3R8	708 aa		13.72	□□□□□ -0.21
GCN1-206	ENST00000549815	SASS6	Q6UVJ0	657 aa		13.72	□□□□□ -0.21
GCN1-206	ENST00000549815	FAM72B	Q86X60	149 aa		13.72	□□□□□ -0.21
GCN1-206	ENST00000549815	PHF13	Q86YI8	300 aa	Predicted RBP	13.72	□□□□□ -0.21
GCN1-206	ENST00000549815	CCDC185	Q8N715	623 aa		13.72	□□□□□ -0.21
GCN1-206	ENST00000549815	CCDC114	Q96M63	670 aa		13.72	□□□□□ -0.21
GCN1-206	ENST00000549815	GBP4	Q96PP9	640 aa		13.72	□□□□□ -0.21
GCN1-206	ENST00000549815	HDAC8	Q9BY41	377 aa		13.72	□□□□□ -0.21
GCN1-206	ENST00000549815	TNKS2	Q9H2K2	1166 aa		13.72	□□□□□ -0.21
GCN1-206	ENST00000549815	ATP13A1	Q9HD20	1204 aa		13.72	□□□□□ -0.21
GCN1-206	ENST00000549815	TMEM248	Q9NWD8	314 aa		13.72	□□□□□ -0.21
GCN1-206	ENST00000549815	OR12D3	Q9UGF7	316 aa		13.72	□□□□□ -0.21
GCN1-206	ENST00000549815	IL36A	Q9UHA7	158 aa		13.72	□□□□□ -0.21
GCN1-206	ENST00000549815	CA5B	Q9Y2D0	317 aa		13.72	□□□□□ -0.21
GCN1-206	ENST00000549815	FARP1	Q9Y4F1	1045 aa	Predicted RBP	13.72	□□□□□ -0.21
GCN1-206	ENST00000549815	ACTL7A	Q9Y615	435 aa		13.72	□□□□□ -0.21
GCN1-206	ENST00000549815	FAM208B	Q5VWN6	2430 aa		13.72	□□□□□ -0.21
GCN1-206	ENST00000549815	CXorf51A	A0A1B0GTR3	108 aa		13.71	□□□□□ -0.21
GCN1-206	ENST00000549815		A0A1W2PQU0	124 aa		13.71	□□□□□ -0.21
GCN1-206	ENST00000549815	GOLGA8CP	A6NN73	597 aa		13.71	□□□□□ -0.21
GCN1-206	ENST00000549815	PRAMEF26	H0Y7S4	382 aa		13.71	□□□□□ -0.21
GCN1-206	ENST00000549815	CBX4	O00257	560 aa		13.71	□□□□□ -0.21
GCN1-206	ENST00000549815	KPNA3	O00505	521 aa	Predicted RBP	13.71	□□□□□ -0.21
GCN1-206	ENST00000549815	ITGAV	P06756	1048 aa		13.71	□□□□□ -0.21
GCN1-206	ENST00000549815	KRT3	P12035	628 aa		13.71	□□□□□ -0.21
GCN1-206	ENST00000549815	RHOQ	P17081	205 aa		13.71	□□□□□ -0.21
GCN1-206	ENST00000549815	ACVRL1	P37023	503 aa		13.71	□□□□□ -0.21
GCN1-206	ENST00000549815	CAMK2B	Q13554	666 aa		13.71	□□□□□ -0.21
GCN1-206	ENST00000549815	STX1A	Q16623	288 aa		13.71	□□□□□ -0.21
GCN1-206	ENST00000549815	ZNF284	Q2VY69	593 aa		13.71	□□□□□ -0.21
GCN1-206	ENST00000549815	ARL13B	Q3SXY8	428 aa		13.71	□□□□□ -0.21
GCN1-206	ENST00000549815	SETMAR	Q53H47	684 aa	Predicted RBP	13.71	□□□□□ -0.21
GCN1-206	ENST00000549815	WDR59	Q6PJI9	974 aa		13.71	□□□□□ -0.21
GCN1-206	ENST00000549815	ERN2	Q76MJ5	926 aa	Known RBP	13.71	□□□□□ -0.21
GCN1-206	ENST00000549815	MON1B	Q7L1V2	547 aa		13.71	□□□□□ -0.21
GCN1-206	ENST00000549815	MARCH9	Q86YJ5	346 aa		13.71	□□□□□ -0.21
GCN1-206	ENST00000549815	DRC7	Q8IY82	874 aa		13.71	□□□□□ -0.21
GCN1-206	ENST00000549815	OXR1	Q8N573	874 aa		13.71	□□□□□ -0.21
GCN1-206	ENST00000549815	PCDH20	Q8N6Y1	951 aa	Known RBP	13.71	□□□□□ -0.21
GCN1-206	ENST00000549815	NEK11	Q8NG66	645 aa		13.71	□□□□□ -0.21
GCN1-206	ENST00000549815	FAM172A	Q8WUF8	416 aa		13.71	□□□□□ -0.21
GCN1-206	ENST00000549815	ARHGEF2	Q92974	986 aa	Known RBP	13.71	□□□□□ -0.21
GCN1-206	ENST00000549815	NTAN1	Q96AB6	310 aa		13.71	□□□□□ -0.21
GCN1-206	ENST00000549815	SPON2	Q9BUD6	331 aa		13.71	□□□□□ -0.21
GCN1-206	ENST00000549815	RETREG1	Q9H6L5	497 aa		13.71	□□□□□ -0.21
GCN1-206	ENST00000549815	ADAM22	Q9P0K1	906 aa		13.71	□□□□□ -0.21
GCN1-206	ENST00000549815	FTSJ1	Q9UET6	329 aa		13.71	□□□□□ -0.21
GCN1-206	ENST00000549815	RALY	Q9UKM9	306 aa	Known RBP	13.71	□□□□□ -0.21
GCN1-206	ENST00000549815	ZFR2	Q9UPR6	939 aa	Known RBP	13.71	□□□□□ -0.21
GCN1-206	ENST00000549815	FCF1	Q9Y324	198 aa	Known RBP	13.71	□□□□□ -0.21
GCN1-206	ENST00000549815	PCDHGA1	Q9Y5H4	931 aa		13.71	□□□□□ -0.21
GCN1-206	ENST00000549815	GOLGA4	Q13439	2230 aa	Known RBP	13.7	□□□□□ -0.22
GCN1-206	ENST00000549815	ENC1	O14682	589 aa		13.7	□□□□□ -0.22
GCN1-206	ENST00000549815	LEFTY1	O75610	366 aa		13.7	□□□□□ -0.22
GCN1-206	ENST00000549815	LRIG2	O94898	1065 aa		13.7	□□□□□ -0.22
GCN1-206	ENST00000549815	GPD1	P21695	349 aa		13.7	□□□□□ -0.22
GCN1-206	ENST00000549815	NSF	P46459	744 aa	Known RBP	13.7	□□□□□ -0.22
GCN1-206	ENST00000549815	MAPKAPK2	P49137	400 aa		13.7	□□□□□ -0.22
GCN1-206	ENST00000549815	ARRB1	P49407	418 aa	Predicted RBP	13.7	□□□□□ -0.22
GCN1-206	ENST00000549815	UBXN1	Q04323	297 aa		13.7	□□□□□ -0.22
GCN1-206	ENST00000549815	STAT4	Q14765	748 aa		13.7	□□□□□ -0.22
GCN1-206	ENST00000549815	TMEM259	Q4ZIN3	620 aa		13.7	□□□□□ -0.22
GCN1-206	ENST00000549815	CARD16	Q5EG05	197 aa		13.7	□□□□□ -0.22
GCN1-206	ENST00000549815	PPP1R15B	Q5SWA1	713 aa		13.7	□□□□□ -0.22
GCN1-206	ENST00000549815	HORMAD1	Q86X24	394 aa		13.7	□□□□□ -0.22

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